stringtranslate.com

EIF4G

Фактор инициации эукариотической трансляции 4 G ( eIF4G ) — это белок, участвующий в инициации эукариотической трансляции и являющийся компонентом комплекса связывания кэпа eIF4F . Ортологи eIF4G были изучены у многих видов, включая людей , дрожжи и пшеницу . Однако eIF4G обнаружен исключительно в домене Eukarya , а не в доменах Bacteria или Archaea , которые не имеют кэпированной мРНК. Таким образом, структура и функция eIF4G могут различаться между видами, хотя человеческий EIF4G1 был в центре внимания обширных исследований. (Другие человеческие паралоги — EIF4G2 и EIF4G3 .)

У разных видов eIF4G тесно связан с eIF4E , белком, который напрямую связывает кэп мРНК. Вместе с белком РНК-хеликазы eIF4A они образуют комплекс eIF4F .

Внутри клетки eIF4G находится в основном в цитоплазме, обычно связан с eIF4E; однако он также находится в ядре, где его функция неизвестна. Он может играть роль в бессмысленно-опосредованном распаде .

История

eIF4G обозначает фактор инициации эукариот 4 гамма (в литературе гамма обычно заменяется на G). Первоначально он был выделен путем фракционирования , обнаружен во фракции 4 гамма и участвует в инициации трансляции эукариот .

Обязательные партнеры

Было обнаружено, что eIF4G ассоциируется со многими другими белками, помимо белков комплекса eIF4F , включая MNK-1, CBP80, CBP20, PABP и eIF3 . eIF4G также напрямую связывается с мРНК и имеет несколько положительно заряженных областей для этой функции. Несколько IRES также напрямую связывают eIF4G, как и BTE CITE .

В начале перевода

eIF4G является важным строительным блоком для комплекса eIF4F и помогает в привлечении рибосомальной субъединицы 40S к мРНК.

Существует три механизма, с помощью которых рибосома 40S может распознавать стартовый кодон: сканирование, внутренний вход и шунтирование . При сканировании рибосома 40S скользит вдоль РНК, пока не распознает стартовый сайт (обычно последовательность AUG в «хорошем контексте»). При внутреннем входе рибосома 40S не начинает с начала (5'-конца) мРНК, а вместо этого начинает где-то в середине. При шунтировании после того, как рибосома 40S начинает скользить вдоль мРНК, она «прыгает» или пропускает большие участки; механизм этого до сих пор неясен. eIF4G требуется для большинства типов инициации, за исключением особых случаев, таких как внутренняя инициация в IRES HCV или IRES Cripavirus .

eIF4G — это фактор инициации, участвующий в сборке комплекса инициации трансляции 43S и 48S. Этот конкретный фактор инициации связывается с PABPI (PolyA-связывающим белком I), который, в свою очередь, связывает поли(A)-хвост РНК- мессенджера и eIF3 , который связан с входящей малой рибосомной субъединицей (40S) . [1]

В болезни

eIF4G был вовлечен в рак груди. Он появляется в повышенных уровнях при определенных типах рака груди и увеличивает выработку мРНК, содержащих IRES ; эти мРНК производят белки, связанные с гипоксией и стрессом, которые способствуют инвазии кровеносных сосудов (что важно для онкогенеза).

Роль в старении

Регуляция инициации трансляции с помощью eIF4G жизненно важна для синтеза белка в развивающихся организмах, например, дрожжах и нематодах. Удаление eIF4G является летальным для дрожжей. [2] У круглого червя C. elegans нокаут eIF4G приводит к тому, что животные не могут развиваться после ранней личиночной стадии (L2) развития. [3] Критическая роль eIF4G в развитии, по-видимому, меняется на противоположную во взрослом возрасте, когда нарушение регуляции eIF4G отрицательно влияет на продолжительность жизни и увеличивает восприимчивость к определенным заболеваниям, связанным со старением (см. eIF4G при заболеваниях выше). Ингибирование eIF4G во взрослом возрасте у C. elegans радикально увеличивает продолжительность жизни, сопоставимую с увеличением продолжительности жизни, наблюдаемым при ограничении питания. [4] Кроме того, ингибирование eIF4G снижает общую трансляцию белка, при этом преимущественно транслируя мРНК генов, важных для реагирования на стресс, и против тех, которые связаны с ростом и размножением. [5] Таким образом, eIF4G, по-видимому, контролирует дифференциальную трансляцию мРНК во время периодов роста и стресса, что в конечном итоге может привести к возрастному ухудшению.

Значение в вирусологии

Как упоминалось ранее, eIF4G связан с определенными IRES, которые были первоначально обнаружены в вирусах. Некоторые вирусные IRES напрямую связывают eIF4G и кооптируют его, чтобы получить доступ к рибосоме. Некоторые клеточные мРНК также содержат IRES (включая сам eIF4G). [6]

Некоторые вирусные протеазы отщепляют часть eIF4G, содержащую область связывания eIF4E. Это приводит к тому, что большинство клеточных мРНК не связываются с eIF4G; однако несколько клеточных мРНК с IRES все еще транслируются в этих условиях.

Одним из примеров сайта связывания eIF4G в вирусном IRES является EMCV IRES (нуклеотиды 746–949). [7]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Лодиш, Харви; Берк, Арнольд; Кайзер, Крис; Кригер, Монти; Бретшер, Энтони; Плоэг, Хидде; Амон, Анжелика; Скотт, Мэтью (2 мая 2012 г.). Молекулярная клеточная биология (7-е изд.). Нью-Йорк: WH Freeman and Company. ISBN 978-1-4292-3413-9.
  2. ^ Goyer C, Altmann M, Lee HS, Blanc A, Deshmukh M, Woolford JL Jr, Trachsel H, Sonenberg N (1993). "TIF4631 и TIF4632: два гена дрожжей, кодирующие высокомолекулярные субъединицы белкового комплекса, связывающего кэп (фактор инициации эукариот 4F), содержат последовательность, похожую на мотив распознавания РНК, и выполняют важную функцию". Молекулярная и клеточная биология . 13 (8): 4860–4874. doi :10.1128 / MCB.13.8.4860. PMC 360119. PMID  8336723. 
  3. ^ Contreras V, Richardson MA, Hao E, Keiper BD (2008). «Истощение изоформы фактора трансляции eIF4G, связанной с кэпом, индуцирует апоптоз зародышевой линии у C. elegans». Cell Death and Differentiation . 15 (8): 1232–1242. doi : 10.1038/cdd.2008.46 . PMID  18451872.
  4. ^ Kally Z. Pan; Julia E. Palter; Aric N. Rogers; Anders Olsen; Di Chen; Gordon J. Lithgow; Pankaj Kapahi (2007). «Ингибирование трансляции мРНК увеличивает продолжительность жизни Caenorhabditis elegans». Aging Cell . 6 (1): 111–119. doi : 10.1111/j.1474-9726.2006.00266.x. PMC 2745345. PMID  17266680. 
  5. ^ Rogers AN, Chen D, McColl G, Czerwieniec G, Felkey ​​K, Gibson BW, Hubbard A, Melov S, Lithgow GJ, Kapahi P (2011). «Продление срока жизни посредством ингибирования eIF4G опосредовано посттранскрипционным ремоделированием экспрессии генов ответа на стресс у C. elegans». Cell Metabolism . 14 (1): 55–66. doi :10.1016/j.cmet.2011.05.010. PMC 3220185 . PMID  21723504. 
  6. ^ Weiniu Gan; Michael La Celle & Robert E. Rhoads (1998). "Функциональная характеристика внутреннего сайта входа рибосомы eIF4G мРНК*". Журнал биологической химии . 273 (9): 5006–5012. doi : 10.1074/jbc.273.9.5006 . PMID  9478948.
  7. ^ Иван Б. Ломакин; Кристофер UT Хеллен и Татьяна В. Пестова (2000). «Физическая ассоциация эукариотического фактора инициации 4G (eIF4G) с eIF4A сильно усиливает связывание eIF4G с внутренним сайтом входа рибосомы вируса энцефаломиокардита и необходима для внутренней инициации трансляции». Mol Cell Biol . 20 (16): 6019–6029. doi :10.1128/MCB.20.16.6019-6029.2000. PMC 86078. PMID  10913184 .