ЭИФ5Б

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор инициации эукариотической трансляции 5B — это белок , который у человека кодируется геном EIF5B . [ ^{5] [6] [7]}

Точная инициация трансляции у эукариот сложна и требует многих факторов, некоторые из которых состоят из нескольких субъединиц. Процесс проще у бактерий , у которых есть только три фактора инициации (IF1, IF2, IF3). Два из этих факторов сохраняются у эукариот: гомолог IF1 — eIF1A, а гомолог IF2 — eIF5B. Этот ген кодирует eIF5B. Факторы eIF1A и eIF5B взаимодействуют на рибосоме вместе с другими факторами инициации и GTP для позиционирования инициирующей метиониновой тРНК на стартовом кодоне мРНК , чтобы трансляция инициировалась точно. ^[7]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000158417 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026083 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Lee JH, Choi SK, Roll-Mecak A, Burley SK, Dever TE (май 1999). «Универсальная консервация в инициации трансляции, выявленная человеческими и архейными гомологами бактериального фактора инициации трансляции IF2». Proc Natl Acad Sci USA . 96 (8): 4342–7. Bibcode :1999PNAS...96.4342L. doi : 10.1073/pnas.96.8.4342 . PMC 16334 . PMID  10200264. 
6. Wilson SA, Sieiro-Vazquez C, Edwards NJ, Iourin O, Byles ED, Kotsopoulou E, Adamson CS, Kingsman SM, Kingsman AJ, Martin-Rendon E (октябрь 1999 г.). «Клонирование и характеристика hIF2, человеческого гомолога бактериального фактора инициации трансляции 2, и его взаимодействие с матрицей ВИЧ-1». Biochem J . 342. ( Pt 1) (Pt 1): 97–103. doi :10.1042/bj3420097. PMC 1220441 . PMID  10432305. 
7. "Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции EIF5B 5B".

Дальнейшее чтение

• Унбехаун А., Маринчев А., Ломакин ИБ и др. (2007). «Положение эукариотического фактора инициации eIF5B на рибосоме 80S, картированное с помощью направленного зондирования гидроксильных радикалов». EMBO J. 26 ( 13): 3109–23. doi :10.1038/sj.emboj.7601751. PMC  1914099. PMID  17568775 .
• Хаяши Р., Уэда Т., Фарвелл МА., Такеучи Н. (2007). «Ядерный респираторный фактор 2 активирует транскрипцию гена человеческого митохондриального фактора инициации трансляции 2». Mitochondrion . 7 (3): 195–203. doi :10.1016/j.mito.2006.10.005. PMID  17161026.
• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации участков». Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi :10.1038/nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Gevaert K, Staes A, Van Damme J, et al. (2006). «Глобальный фосфопротеомный анализ гепатоцитов человека HepG2 с использованием обращенно-фазовой диагональной ЖХ». Proteomics . 5 (14): 3589–99. doi :10.1002/pmic.200401217. PMID  16097034. S2CID  895879.
• Босолей СА, Едриховски М, Шварц Д и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Marintchev A, Kolupaeva VG, Pestova TV, Wagner G (2003). "Mapping the binding interface between human eukaryotic initiation factors 1A and 5B: a new interaction between old partners". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (4): 1535–40. Bibcode :2003PNAS..100.1535M. doi : 10.1073/pnas.0437845100 . PMC  149867 . PMID  12569173.
• Olsen DS, Savner EM, Mathew A и др. (2003). «Домены eIF1A, которые опосредуют связывание с eIF2, eIF3 и eIF5B и способствуют набору тройного комплекса in vivo». EMBO J . 22 (2): 193–204. doi :10.1093/emboj/cdg030. PMC  140105 . PMID  12514125.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Sørensen HP, Hedegaard J, Sperling-Petersen HU, Mortensen KK (2002). "Замечательная консервация факторов инициации трансляции: IF1/eIF1A и IF2/eIF5B являются универсально распространенными филогенетическими маркерами". IUBMB Life . 51 (5): 321–7. doi :10.1080/152165401317190842. PMID  11699879. S2CID  45654480.
• Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М. и др. (1999). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Res . 5 (5): 277–86. doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID  9872452.