Фибрилларин

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

рРНК 2'-O-метилтрансфераза фибрилларин — фермент , который у человека кодируется геном FBL . ^{[5] [6] [7]}

Функция

Этот генный продукт является компонентом ядрышковой малой ядерной рибонуклеопротеиновой частицы (snRNP), которая, как полагают, участвует в первом этапе обработки прерибосомальной (р)РНК. Она связана с малыми ядрышковыми РНК U3 , U8 и U13 и расположена в плотном фибриллярном компоненте (DFC) ядрышка . Кодируемый белок содержит N-концевой повторяющийся домен, который богат остатками глицина и аргинина, как фибрилларины у других видов. Его центральная область напоминает домен связывания РНК и содержит консенсусную последовательность RNP. Антисыворотки примерно от 8% людей с аутоиммунным заболеванием склеродермией распознают фибрилларин. ^[7]

Фибрилларин является компонентом нескольких рибонуклеопротеинов, включая ядрышковый малый ядерный рибонуклеопротеин ( SnRNP ) и один из двух классов малых ядрышковых рибонуклеопротеинов (snoRNP). SnRNA функционируют в сплайсинге РНК , тогда как snoRNP функционируют в рибосомальной процессинге РНК.

Фибрилларин связан с малыми ядерными РНК U3, U8 и U13 у млекопитающих и похож на дрожжевой белок NOP1. Фибрилларин имеет хорошо сохранившуюся последовательность из около 320 аминокислот и содержит 3 домена: N-концевой Gly/Arg-богатый регион; центральный домен, напоминающий другие РНК-связывающие белки и содержащий консенсусную последовательность, подобную RNP-2; и C-концевой альфа-спиральный домен. Эволюционно связанный белок пре-рРНК-процессинга, в котором отсутствует Gly/Arg-богатый домен, был обнаружен у различных архей.

Исследование Шульца и соавторов показало, что связывающий K-turn белок 15,5 кДа (называемый у дрожжей Snu13) взаимодействует с белками сплайсосомы hPRP31, hPRP3, hPRP4, CYPH и малыми ядрышковыми рибонуклеопротеинами NOP56 , NOP58 и фибрилларином. Белок 15,5 кДа имеет сходство последовательности с другими РНК-связывающими белками, такими как рибосомальные белки S12, L7a и L30 и белком snoRNP NHP2 . U4/U6 snRNP содержит белок 15,5 кДа. ^[8] Белок 15,5 кДа также существует в рибонуклеопротеиновом комплексе, который связывает мотив B/C коробки U3. Белок массой 15,5 кДа также является одним из четырех основных белков малого ядрышкового рибонуклеопротеина C/D , который опосредует метилирование прерибосомальных РНК.

Были рассмотрены структурные доказательства, подтверждающие идею о том, что фибрилларин является метилтрансферазой snoRNA. ^[9]

Взаимодействия

Было показано, что фибрилларин взаимодействует с DDX5 ^[10] и SMN1 . ^[11]

Ссылки

1. ENSG00000280548 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105202, ENSG00000280548 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000046865 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Aris JP, Blobel G (февраль 1991 г.). «cDNA cloning and sequencing of human fibrillarin, a conserved nucleolar protein recognize by autoimmune antisera». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (3): 931–5. Bibcode :1991PNAS...88..931A. doi : 10.1073/pnas.88.3.931 . PMC 50928. PMID  1846968 . 
6. Jansen RP, Hurt EC, Kern H, Lehtonen H, Carmo-Fonseca M, Lapeyre B, Tollervey D (май 1991). «Эволюционная консервация человеческого ядрышкового белка фибрилларина и его функциональная экспрессия в дрожжах». Журнал клеточной биологии . 113 (4): 715–29. doi :10.1083/jcb.113.4.715. PMC 2288999. PMID  2026646 . 
7. "Ген Энтреза: FBL фибрилларин".
8. Контакты белок-белок и белок-РНК способствуют опосредованной 15,5К сборке мяРНП U4/U6 и мяРНП Box C/D, авторы Аннемари Шульц, Стефани Ноттротт, Николас Джеймс Уоткинс и Райнхард Люрманн в «Молекулярной и клеточной биологии » (2006), том 26, страницы 5146–5154.
9. Структура и функция малых ядрышковых рибонуклеопротеинов Стива Л. Рейхова, Томоко Хаммы, Адриана Р. Ферре-Д'Амаре и Габриэле Варани в Nucleic Acids Research (2007) Том 35, страницы 1452–1464.
10. Nicol SM, Causevic M, Prescott AR, Fuller-Pace FV (июнь 2000 г.). «Ядерная DEAD box РНК-хеликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и локализуется специфически в зарождающихся ядрышках во время телофазы». Experimental Cell Research . 257 (2): 272–80. doi :10.1006/excr.2000.4886. PMID  10837141.
11. Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Выживание белка двигательных нейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Current Biology . 11 (14): 1079–88. Bibcode : 2001CBio...11.1079P. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00316-5 . PMID  11509230. S2CID  12392702.

Клетки нейробластомы человека ( SH-SY5Y ), окрашенные антителом к ​​фибрилларину в зеленый цвет, антителом к ​​нейрофиламенту NF-H в красный цвет и ДНК в темно-синий цвет. Антитело к фибрилларину связывается с точками в ядре, соответствующими ядрышкам. Ядрышки также содержат ДНК и поэтому выглядят как бледно-голубые точки. Антитело к нейрофиламенту NF-H связывается с цитоплазматическим промежуточным продуктом или 10-нм нитями . Изображение, антитела и окрашивание от EnCor Biotechnology Inc.

Дальнейшее чтение

• Baserga SJ , Yang XD, Steitz JA (сентябрь 1991 г.). «Неповрежденная последовательность Box C в U3 snRNA необходима для связывания фибрилларина, белка, общего для основного семейства ядрышковых snRNP». The EMBO Journal . 10 (9): 2645–51. doi :10.1002/j.1460-2075.1991.tb07807.x. PMC  452965. PMID  1714385 .
• Okano Y, Steen VD, Medsger TA (январь 1992). «Аутоантитела к ядрышковому рибонуклеопротеину U3 (фибрилларину) у пациентов с системной склеродермией». Артрит и ревматизм . 35 (1): 95–100. doi : 10.1002/art.1780350114 . PMID  1731817.
• Lischwe MA, Ochs RL, Reddy R, Cook RG, Yeoman LC, Tan EM, Reichlin M, Busch H (ноябрь 1985 г.). «Очистка и частичная характеристика ядрышкового антигена склеродермии (Mr = 34 000; pI, 8,5), богатого NG,NG-диметиларгинином». Журнал биологической химии . 260 (26): 14304–10. doi : 10.1016/S0021-9258(17)38718-5 . PMID  2414294.
• Méhes G, Pajor L (июнь 1995 г.). «Экспрессия нуклеолина и фибрилларина в стимулированных лимфоцитах и ​​дифференцирующихся клетках HL-60. Анализ методом проточной цитометрии». Cell Proliferation . 28 (6): 329–36. doi :10.1111/j.1365-2184.1995.tb00074.x. PMID  7626687. S2CID  34753195.
• Лю Кью, Дрейфус Г. (июль 1996 г.). «Новая ядерная структура, содержащая белок выживания двигательных нейронов». Журнал EMBO . 15 (14): 3555–65. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00725.x. PMC  451956. PMID  8670859 .
• Magoulas C, Zatsepina OV, Jordan PW, Jordan EG, Fried M (февраль 1998 г.). «Белок SURF-6 является компонентом ядрышкового матрикса и обладает высокой связывающей способностью для нуклеиновых кислот in vitro». European Journal of Cell Biology . 75 (2): 174–83. doi :10.1016/s0171-9335(98)80059-9. PMID  9548374.
• Ai LS, Lin CH, Hsieh M, Li C (октябрь 1999 г.). «Аргининовое метилирование пептида, богатого глицином и аргинином, полученного из последовательностей человеческого FMRP и фибрилларина». Труды Национального научного совета Китайской Республики. Часть B, Науки о жизни . 23 (4): 175–80. PMID  10518318.
• Pintard L, Kressler D, Lapeyre B (февраль 2000 г.). "Spb1p — это дрожжевой ядрышковый белок, связанный с Nop1p и Nop58p, который способен связывать S-аденозил-L-метионин in vitro". Молекулярная и клеточная биология . 20 (4): 1370–81. doi : 10.1128/MCB.20.4.1370-1381.2000. PMC  85287. PMID  10648622.
• Nicol SM, Causevic M, Prescott AR, Fuller-Pace FV (июнь 2000 г.). «Ядерная DEAD box РНК-хеликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и локализуется специфически в зарождающихся ядрышках во время телофазы». Experimental Cell Research . 257 (2): 272–80. doi :10.1006/excr.2000.4886. PMID  10837141.
• Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Выживание белка двигательных нейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Current Biology . 11 (14): 1079–88. Bibcode :2001CBio...11.1079P. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00316-5 . PMID  11509230. S2CID  12392702.
• Zhou X, Tan FK, Xiong M, Milewicz DM, Feghali CA, Fritzler MJ, Reveille JD, Arnett FC (декабрь 2001 г.). «Системный склероз (склеродермия): специфические гены аутоантигенов избирательно сверхэкспрессируются в фибробластах склеродермии». Журнал иммунологии . 167 (12): 7126–33. doi : 10.4049/jimmunol.167.12.7126 . PMID  11739535.
• Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Current Biology . 12 (1): 1–11. Bibcode : 2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Cimato TR, Tang J, Xu Y, Guarnaccia C, Herschman HR, Pongor S, Aletta JM (февраль 2002 г.). «Увеличение метилирования белков, опосредованное фактором роста нервов, происходит преимущественно в местах метилирования аргинина I типа и включает метилтрансферазу белка аргинина 1». Journal of Neuroscience Research . 67 (4): 435–42. doi :10.1002/jnr.10123. PMID  11835310. S2CID  8041481.
• Fujiyama S, Yanagida M, Hayano T, Miura Y, Isobe T, Fujimori F, Uchida T, Takahashi N (июнь 2002 г.). «Выделение и протеомная характеристика комплексов прерибосомальных рибонуклеопротеинов, ассоциированных с парвулином человека». Журнал биологической химии . 277 (26): 23773–80. doi : 10.1074/jbc.M201181200 . PMID  11960984.
• Whitehead SE, Jones KW, Zhang X, Cheng X, Terns RM, Terns MP (декабрь 2002 г.). «Детерминанты взаимодействия белка SMN, вызывающего спинальную мышечную атрофию, с модифицированным диметиларгинином боксом H/ACA малым ядрышковым рибонуклеопротеином GAR1». Журнал биологической химии . 277 (50): 48087–93. doi : 10.1074/jbc.M204551200 . PMID  12244096.
• Эррера-Эспарса Р., Крузе Л., фон Эссен М., Кампос Л., Барбоса О., Боллен Х.Дж., Бадилло И., Авалос-Диас Э. (октябрь 2002 г.). «U3-snoRNP связывается с фибрилларином, компонентом комковатого ядрышкового домена склеродермии». Архив дерматологических исследований . 294 (7): 310–7. дои : 10.1007/s00403-002-0338-7. PMID  12373336. S2CID  10316081.
• Chen M, Rockel T, Steinweger G, Hemmerich P, Risch J, von Mikecz A (октябрь 2002 г.). «Субклеточное привлечение фибрилларина к нуклеоплазматическим протеасомам: последствия для обработки ядрышкового аутоантигена». Молекулярная биология клетки . 13 (10): 3576–87. doi :10.1091/mbc.02-05-0083. PMC  129967. PMID  12388758 .
• Watkins NJ, Dickmanns A, Lührmann R (декабрь 2002 г.). «Консервативный стебель II мотива C/D коробки необходим для локализации ядрышка и требуется, наряду с белком 15,5K, для иерархической сборки snoRNP коробки C/D». Молекулярная и клеточная биология . 22 (23): 8342–52. doi :10.1128/MCB.22.23.8342-8352.2002. PMC  134055. PMID  12417735 .