Herpesvirales — это отряд дцДНК- вирусов (балтиморская группа I) с животными-хозяевами, характеризующийся общей морфологией, состоящей из икосаэдрического капсида , заключенного в липидную оболочку, содержащую гликопротеин. Обычные инфекции у людей, вызываемые представителями этого отряда, включают герпес , генитальный герпес , ветряную оспу , опоясывающий лишай и железистую лихорадку . Herpesvirales — единственный отряд в классе Herviviricetes , который является единственным классом в типе Peploviricota .
Все представители отряда имеют структуру вириона, состоящую из ядра ДНК, окруженного икосаэдрическим капсидом, состоящим из 12 пятивалентных и 150 шестивалентных капсомеров (Т = 16). Капсид имеет диаметр ~110 нанометров (нм) и заключен в белковый матрикс, называемый тегументом , который, в свою очередь, окружен гликопротеинсодержащей липидной оболочкой диаметром около 200 нм. Геном ДНК линейный и двухцепочечный, его размеры находятся в диапазоне 125–290 т.п.н. [1] Геном содержит терминальные и внутренние повторяющиеся последовательности, их количество и расположение варьируются в зависимости от разных субкладов.
.jpg/1280px-Herpes(PHIL_1573_lores).jpg)
У всех видов этого отряда есть животные-хозяева. Malacoherpesviridae инфицируют моллюсков (морское ушко и устрицы), Alloherpesviridae инфицируют анамниотов ( лягушек и рыб), а Herpesviridae инфицируют амниотов (рептилий, птиц и млекопитающих). В семействе Herpesviridae роды Iltovirus и Mardivirus и род Scutavirus подсемейства Alphaherpesvirinae поражают птиц и рептилий соответственно. Все остальные роды Herpesviridae заражают только млекопитающих. [2]
По состоянию на 2020 год отряд состоит из трех семейств, трех подсемейств, 23 родов и 130 видов. Таксономия показана от семейства к подсемейству и роду ниже. [3]
Вирус герпеса был впервые выделен у голубого антилопы гну в 1960 году ветеринарным ученым Уолтером Пларайтом . [4] Род Herpesvirus был установлен в 1971 году в первом отчете Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). Этот род состоял из 23 вирусов и 4 групп вирусов. Во втором отчете ICTV в 1976 году этот род был возведен на уровень семейства — Herpetoviridae . Из-за возможной путаницы с вирусами, полученными от рептилий , это название было изменено в третьем отчете 1979 года на Herpesviridae . В этом сообщении семейство Herpesviridae было разделено на 3 подсемейства ( Alphaherpesvirinae , Betaherpesvirinae и Gammaherpesvirinae ) и 5 безымянных родов: был указан 21 вирус. В 2009 году семейство Herpesviridae было возведено в порядок Herpesvirales . Это повышение было вызвано открытием того, что герпесвирусы рыб и моллюсков имеют лишь отдаленное родство с вирусами птиц и млекопитающих . [5] Были созданы два новых семейства: семейство Alloherpesviridae , включающее вирусы костных рыб и лягушек, и семейство Malacoherpesviridae , включающее вирусы моллюсков.
Единственный белок с широко распространенной консервативностью среди всех членов отряда, хотя и только на уровне аминокислот, - это субъединица АТФазы ДНК-терминазы; [1] последний участвует в упаковке ДНК во время сборки вириона. [6]
Филогении, построенные с использованием консервативных областей АТФазной субъединицы ДНК-терминазы, позволяют предположить, что Alloherpesviridae являются базальной кладой отряда, а Herpesviridae и Malacoherpesviridae - сестринскими кладами. [7] Учитывая филогенетические расстояния между позвоночными и моллюсками, это позволяет предположить, что герпевирусы изначально были вирусами рыб и что они эволюционировали вместе со своими хозяевами, чтобы заражать других позвоночных. [ нужна цитата ]
Система наименования Herpesvirales возникла в 1973 году и с тех пор значительно усовершенствовалась. Все герпесвирусы, описанные с момента принятия этой системы, были названы в соответствии с ней. Рекомендуемая система именования предусматривает, что каждое название вида состоит из трех частей: первого слова, второго слова и, наконец, числа.
Первое слово должно происходить от таксона (семейства или подсемейства), к которому принадлежит его основной естественный хозяин. Название подсемейства используется для вирусов, принадлежащих к семейству Bovidae или приматов (название вируса заканчивается на –ine, например, бычий), а название семейства-хозяина для других вирусов (оканчивается на –id, например, equid). Вирусы человеческого герпеса рассматривались как исключение ( человеческого , а не гоминидного ). После термина, полученного от хозяина, к видам семейства Herpesviridae , которые разделены на подсемейства Alphaherpesvirinae , Betaherpesvirinae и Gammaherpesvirinae , будет добавлено слово альфагерпесвирус , бетагерпесвирус или гаммагерпесвирус соответственно. Виды Herpesviridae , которые не были отнесены к подсемейству, а также виды Alloherpesviridae и Malacoherpesviridae , вместо этого будут иметь герпесвирус после термина, полученного от хозяина. Наконец, добавляется арабское число ( 1 , 2 , 3 и т. д.). Номера присвоены в порядке наименования и не несут никакого подразумеваемого значения о таксономических или биологических свойствах вируса.
Примером такого названия является Canid Alphaherpesvirus 1 . Из этого названия можно установить, что основным естественным хозяином вируса является собака (т.е. представитель семейства Canidae ; собаки и т. д.), что он является членом семейства Herpesviridae и подсемейства Alphaherpesvirinae и что это первый вирус герпеса, в честь которого псовые служат первичными естественными хозяевами.
Ряд названий вирусов (например, вирус Эпштейна-Барра , также известный как гаммагерпесвирус человека 4 ) настолько широко используются, что может быть непрактично пытаться настаивать на их замене. Это привело к появлению в литературе двойной номенклатуры некоторых герпевирусов.
{{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
