Файл кристаллографической информации макромолекул ( mmCIF ), также известный как PDBx/mmCIF, представляет собой стандартный текстовый формат файла для представления данных о структуре макромолекул, разработанный Международным союзом кристаллографии (IUCr) и Банком данных белков [1]. Он является расширением файла кристаллографической информации (CIF), специально предназначенным для данных макромолекул, таких как белки и нуклеиновые кислоты, и включает элементы из формата файла PDB .
mmCIF задуман как альтернатива формату Protein Data Bank (PDB) и в настоящее время является форматом по умолчанию, используемым Protein Data Bank . [2]
Формат mmCIF был разработан для устранения ограничений формата PDB с точки зрения емкости и гибкости, особенно с учетом увеличения размера и сложности определяемых макромолекулярных структур.
Формат является частью более крупной структуры кристаллографической информации — системы протоколов обмена, основанной на словарях данных и реляционных правилах, выражаемых в различных машиночитаемых проявлениях, включая, помимо прочего, исходный файл кристаллографической информации и XML .
Пример формата файла mmCIF в стиле «ключ-значение»: [2]
_cell.entry_id 4HHB_cell.length_a 63.150_cell.length_b 83.590_cell.length_c 53.800_cell.угол_альфа 90.00_cell.угол_бета 99,34_ячейка.угол_гамма 90.00_ячейка.Z_PDB 4