Молекулярный зажим — это полипептид, используемый для поддержания формы белков в некоторых экспериментальных вакцинах . На вирусе белки до слияния на их поверхности представляют собой привлекательную цель для иммунной реакции. Однако, если эти белки удаляются или производятся с помощью рекомбинантной технологии, они теряют свою форму и образуют то, что называется «формой после слияния». Будучи частью вируса, эти белки сохраняют свою форму, образуя четвертичную структуру с другими вирусными белками. Состояние белка до слияния является метастабильным состоянием с более высокой энергией. Дополнительная энергия используется для преодоления активационного барьера слияния с клеточной мембраной . [1] Вирусный белок (или его часть) в сочетании с полипептидом зажима называется химерным полипептидом. [2]
Предварительно синтезированные белки (или субъединицы) из следующих вирусов были стабилизированы в экспериментах с помощью метода молекулярного зажима: корь , ВИЧ , грипп , Эбола и RSV . [2] Зажим состоит из аминокислотных остатков в шаблоне, который повторяется через каждые семь остатков, и должен быть длиной не менее 14 остатков. Зажим самоорганизуется в двойную спираль, в которой одна нить идет вперед, а другая — назад. Спаривание аминокислот в нитях обеспечивается шаблоном гидрофобных и гидрофильных аминокислот. Шаблон организован таким образом, что ни один из зажимов не связывается с белком вируса. Зажим самоорганизуется в жесткий стержень. Зажим связан с желаемой частью вирусного белка с помощью линкера. Линкер может выполнять другие функции, например, позволяя очищать химерный белок из смеси. [3]
Исследователи из Университета Квинсленда начали производить вакцину с использованием этого метода для SARS-CoV-2 в 2020 году. [4] [5] Разработка финансировалась Коалицией за инновации в области готовности к эпидемиям , которая, в свою очередь, получила финансирование от Фонда Гейтса , а также правительств Норвегии, Японии и Германии. [6] Разработка вакцины была отменена 11 декабря 2020 года во время ее испытания фазы I после того, как было обнаружено, что ряд участников испытания дали ложноположительные результаты тестов на антитела к ВИЧ, когда на самом деле у них не было ВИЧ. [7] [8] Это было связано с тем, что молекулярный зажим был получен из фрагментов Gp41 , спайкового белка ВИЧ , что привело к «частичному ответу антител» на ВИЧ. Это нежелательный результат, поскольку он помешает будущим тестам на скрининг ВИЧ для затронутых участников. [9]
После того, как от вакцины против COVID отказались, зажим был перепроектирован для использования белков, не относящихся к ВИЧ. [10]