Сегрегирующие сайты — это позиции, которые показывают различия ( полиморфизмы ) между родственными генами в выравнивании последовательностей (не являются консервативными ). [1] Сегрегирующие сайты включают консервативные , полуконсервативные и неконсервативные мутации.
Доля сегрегирующих участков в гене является важной статистикой в популяционной генетике, поскольку ее можно использовать для оценки скорости мутации при отсутствии отбора . Например, ее используют для расчета статистики эволюции D-нейтральных генов Таджимы .
Выравнивание последовательностей , произведенное ClustalO , гистоновых белков млекопитающих .
Последовательности представляют собой аминокислоты для остатков 120-180 белков. Остатки, которые сохраняются во всех последовательностях, выделены серым цветом. Под последовательностями белков находится ключ, обозначающий консервативную последовательность (*), консервативные мутации (:), полуконсервативные мутации (.) и неконсервативные мутации ( ). [2]Смотрите также
Ссылки
- ^ Fu, YX (октябрь 1995 г.). «Статистические свойства участков сегрегации». Теоретическая популяционная биология . 48 (2): 172–97. doi :10.1006/tpbi.1995.1025. PMID 7482370.
- ^ "Clustal FAQ #Symbols". Clustal . Получено 8 декабря 2014 г. .
