stringtranslate.com

Фосфолипаза D

Фосфолипаза D (EC 3.1.4.4, липофосфодиэстераза II, лецитиназа D, холинфосфатаза, PLD ; систематическое название фосфатидилхолинфосфатидогидролаза ) — чувствительный к анестетикам [1] и механочувствительный [2] фермент суперсемейства фосфолипаз , который катализирует следующую реакцию:

фосфатидилхолин + H 2 O = холин + фосфатидат

Фосфолипазы широко распространены и могут быть обнаружены во многих организмах, включая бактерии, дрожжи, растения, животных и вирусы. [3] [4] Основным субстратом фосфолипазы D является фосфатидилхолин , который она гидролизует для получения сигнальной молекулы фосфатидной кислоты (PA) и растворимого холина в зависимом от холестерина процессе, называемом презентацией субстрата . [5] Растения содержат многочисленные гены, которые кодируют различные изоферменты PLD с молекулярным весом от 90 до 125 кДа . [6] Клетки млекопитающих кодируют две изоформы фосфолипазы D: PLD1 и PLD2 . [7] Фосфолипаза D играет важную роль во многих физиологических процессах, включая мембранный транспорт , реорганизацию цитоскелета , рецептор-опосредованный эндоцитоз , экзоцитоз и миграцию клеток . [8] Благодаря этим процессам он был дополнительно вовлечен в патофизиологию множества заболеваний : в частности, в прогрессирование болезней Паркинсона и Альцгеймера , а также различных видов рака . [6] [8] PLD также может помочь установить порог чувствительности к анестезии и механической силе. [9] [10]

Открытие

Активность типа PLD впервые была описана в 1947 году Дональдом Дж. Ханаханом и И. Л. Чайковым. [3] Однако гидролитический механизм действия был выяснен только в 1975 году в клетках млекопитающих . Растительные изоформы PLD были впервые очищены из капусты и клещевины ; PLDα в конечном итоге был клонирован и охарактеризован из различных растений, включая рис, кукурузу и томат. [3] Растительные PLD были клонированы в трех изоформах: PLDα, PLDβ и PLDγ. [11] Более полувека биохимических исследований показали, что активность фосфолипазы D и PA связана с широким спектром физиологических процессов и заболеваний , включая воспаление , диабет , фагоцитоз , нейрональную и сердечную сигнализацию и онкогенез . [12]

Функция

Строго говоря, фосфолипаза D является трансфосфатидилазой: она опосредует обмен полярными головными группами, ковалентно прикрепленными к мембраносвязанным липидам . Используя воду в качестве нуклеофила , этот фермент катализирует расщепление фосфодиэфирной связи в структурных фосфолипидах, таких как фосфатидилхолин и фосфатидилэтаноламин . [6] Продуктами этого гидролиза являются мембраносвязанный липид фосфатидная кислота (PA) и холин , который диффундирует в цитозоль . Поскольку холин обладает небольшой активностью вторичного мессенджера , активность PLD в основном трансдуцируется продукцией PA. [8] [13] PA активно участвует во внутриклеточной передаче сигнала . [14] Кроме того, некоторые члены суперсемейства PLD могут использовать первичные спирты , такие как этанол или 1-бутанол , при расщеплении фосфолипида , эффективно катализируя обмен полярной липидной головной группы . [6] [11] Другие члены этого семейства способны гидролизовать другие фосфолипидные субстраты, такие как кардиолипин , или даже фосфодиэфирную связь, составляющую основу ДНК . [7]

Фосфатидовая кислота

Многие из клеточных функций фосфолипазы D опосредованы ее основным продуктом, фосфатидной кислотой (PA). PA представляет собой отрицательно заряженный фосфолипид , чья небольшая головная группа способствует изгибу мембраны . [7] Таким образом, считается, что он облегчает слияние и деление мембранных везикул способом, аналогичным эндоцитозу, опосредованному клатрином . [7] PA также может рекрутировать белки , которые содержат ее соответствующий связывающий домен , область, характеризующуюся областями, богатыми основными аминокислотами . Кроме того, PA может быть преобразована в ряд других липидов , таких как лизофосфатидная кислота (лизо-PA) или диацилглицерол , сигнальные молекулы , которые оказывают множество эффектов на нисходящие клеточные пути . [11] PA и ее липидные производные участвуют во множестве процессов , которые включают внутриклеточный транспорт везикул , эндоцитоз , экзоцитоз , динамику актинового цитоскелета , дифференциацию пролиферации клеток и миграцию . [7]

Рисунок 1. Модель ARF -зависимой активации фосфолипазы D и предлагаемая схема эндоцитоза везикул . В этой модели ARF активирует фосфолипазу D ( PLD ), привлекая ее к плазматической мембране . Гидролиз фосфатидилхолина ( PC ) активированной ARF PLD производит фосфатидную кислоту ( PA ). PA впоследствии привлекает молекулы , которые формируют внутреннюю поверхность липидного бислоя , облегчая образование везикул . Локальное обогащение кислыми фосфолипидами помогает привлекать адаптерные белки ( AP ) и белки оболочки ( CP ) к мембране , инициируя почкование везикулы . Деление везикул в конечном итоге опосредуется динамином , который сам по себе является нисходящим эффектором PA .

PLD млекопитающих напрямую взаимодействует с киназами , такими как PKC , ERK , TYK , и контролирует передачу сигналов, указывая на то, что PLD активируется этими киназами. [15] Поскольку холин очень распространен в клетке, активность PLD не оказывает существенного влияния на уровень холина, и холин вряд ли играет какую-либо роль в передаче сигналов.

Фосфатидовая кислота является сигнальной молекулой и действует, чтобы привлечь SK1 к мембранам . PA чрезвычайно короткоживущая и быстро гидролизуется ферментом фосфатидатфосфатазой с образованием диацилглицерина (DAG). DAG также может быть преобразована в PA с помощью DAG-киназы . Хотя PA и DAG являются взаимопревращаемыми, они действуют по разным путям . Стимулы , которые активируют PLD, не активируют ферменты ниже по течению от DAG и наоборот.

Возможно, что, хотя PA и DAG являются взаимопревращаемыми, могут поддерживаться отдельные пулы сигнальных и несигнальных липидов . Исследования показали, что сигнализация DAG опосредована полиненасыщенным DAG, тогда как PA, полученный из PLD, является мононенасыщенным или насыщенным . Таким образом, функциональный насыщенный/мононенасыщенный PA может быть разрушен путем гидролиза с образованием нефункционального насыщенного/мононенасыщенного DAG, тогда как функциональный полиненасыщенный DAG может быть разрушен путем преобразования его в нефункциональный полиненасыщенный PA. [16] [17] [18]

Недавно было установлено, что лизофосфолипаза D, называемая аутотаксином, играет важную роль в пролиферации клеток благодаря своему продукту — лизофосфатидной кислоте (ЛФК).

Структура

Растительные и животные PLD имеют последовательную молекулярную структуру , характеризующуюся участками катализа , окруженными набором регуляторных последовательностей . [6] Активный центр PLD состоит из четырех высококонсервативных аминокислотных последовательностей ( I-IV), из которых мотивы II и IV особенно консервативны. Эти структурные домены содержат отличительную каталитическую последовательность HxKxxxxD (HKD), где H , K и D представляют собой аминокислоты гистидин (H), лизин (K), аспарагиновую кислоту (D), в то время как x представляет собой неконсервативные аминокислоты . [6] [7] Эти два мотива HKD придают PLD гидролитическую активность и имеют решающее значение для его ферментативной активности как in vitro , так и in vivo . [7] [12] Гидролиз фосфодиэфирной связи происходит, когда эти последовательности HKD находятся в правильной близости .

Человеческие белки, содержащие этот мотив, включают:

PC -гидролизующий PLD является гомологом кардиолипинсинтазы , [19] [20] фосфатидилсеринсинтазы , бактериальных PLD и вирусных белков . Каждый из них, по-видимому , обладает дупликацией домена , которая очевидна по наличию двух мотивов HKD, содержащих хорошо сохранившиеся остатки гистидина , лизина и аспарагина , которые могут способствовать образованию аспарагиновой кислоты активного центра . Эндонуклеаза Escherichia coli (nuc) и подобные белки, по-видимому, являются гомологами PLD, но обладают только одним из этих мотивов. [21] [22] [23] [24]

Гены PLD дополнительно кодируют высококонсервативные регуляторные домены : консенсусную последовательность phox (PX) , домен гомологии плекстрина (PH) и сайт связывания для фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата (PIP 2 ). [4]

Механизм катализа

PLD- катализируемый гидролиз , как предполагается, происходит в два этапа по механизму « пинг-понг ». В этой схеме остатки гистидина каждого мотива HKD последовательно атакуют фосфолипидный субстрат . Действуя как нуклеофилы , составляющие имидазольные фрагменты гистидинов образуют временные ковалентные связи с фосфолипидом , производя короткоживущий промежуточный продукт , который может быть легко гидролизован водой на последующем этапе . [6] [14]

Представление субстрата ; PLD (синий овал) секвестрируется в холестеринзависимые липидные домены (зеленые липиды) путем пальмитоилирования . PLD также связывает домены PIP2 (красный шестиугольник) (серая штриховка), расположенные в неупорядоченной области клетки с фосфатидилхолином (PC). Когда PIP2 увеличивается в клетке, PLD транслоцируется в PIP2, где он подвергается воздействию и гидролизует PC до фосфатидной кислоты (красный сферический липид).

Механизм активации

Презентация субстрата Для млекопитающих PLD2 молекулярной основой активации является презентация субстрата. Фермент находится в неактивном состоянии в липидных микродоменах, богатых сфингомиелином и обедненных субстратом PC. [25] Увеличение PIP2 или уменьшение холестерина заставляет фермент перемещаться в микродомены PIP2 вблизи его субстрата PC. Следовательно, PLD может в первую очередь активироваться локализацией внутри плазматической мембраны, а не конформационным изменением белка. Разрушение липидных доменов анестетиками. [26] или механической силой. [25] Белок также может претерпевать конформационные изменения при связывании PIP2, но это не было показано экспериментально и будет представлять собой механизм активации, отличный от презентации субстрата.

Изоформы

В клетках млекопитающих были идентифицированы две основные изоформы фосфолипазы D : PLD1 и PLD2 (53% гомологии последовательностей ), [27] каждая из которых кодируется различными генами . [7] Активность PLD, по-видимому, присутствует в большинстве типов клеток , за возможным исключением периферических лейкоцитов и других лимфоцитов . [12] Обе изоформы PLD требуют PIP 2 в качестве кофактора для активности . [7] PLD1 и PLD2 демонстрируют различные субклеточные локализации , которые динамически изменяются в ходе передачи сигнала . Активность PLD наблюдалась в плазматической мембране , цитозоле , ЭР и комплексе Гольджи . [12]

ПЛД1

PLD1 — это белок массой 120 кДа, который в основном находится на внутренних мембранах клеток. Он в основном присутствует в комплексе Гольджи , эндосомах , лизосомах и секреторных гранулах . [7] При связывании внеклеточного стимула PLD1 транспортируется к плазматической мембране . Однако базальная активность PLD1 низкая, и для передачи внеклеточного сигнала он должен быть сначала активирован такими белками, как Arf , Rho , Rac и протеинкиназа C. [ 7] [8] [13 ]

Регулирование

Активность фосфолипазы D широко регулируется гормонами , нейротрансмиттерами , липидами , небольшими мономерными ГТФазами и другими малыми молекулами, которые связываются с соответствующими им доменами фермента. [6] В большинстве случаев передача сигнала опосредуется посредством продукции фосфатидной кислоты , которая функционирует как вторичный мессенджер . [6 ]

Определенные фосфолипиды являются регуляторами активности PLD в растительных и животных клетках. [3] [6] Большинству PLD требуется фосфатидилинозитол 4,5-бисфосфат (PIP 2 ) в качестве кофактора для активности. [4] [6] PIP 2 и другие фосфоинозитиды являются важными модификаторами динамики цитоскелета и мембранного транспорта и могут транспортировать PLD к его субстрату PC. [28] PLD, регулируемые этими фосфолипидами, обычно участвуют во внутриклеточной передаче сигнала . [6] Их активность зависит от связывания этих фосфоинозитидов вблизи активного центра . [6] У растений и животных этот центр связывания характеризуется наличием консервативной последовательности основных и ароматических аминокислот . [6] [14] В таких растениях, как Arabidopsis thaliana , эта последовательность образована мотивом RxxxxxKxR вместе с его инвертированным повтором , где R — аргинин , а K — лизин . Его близость к активному центру обеспечивает высокий уровень активности PLD1 и PLD2 и способствует перемещению PLD1 к целевым мембранам в ответ на внеклеточные сигналы. [6]

Домен C2

Кальций действует как кофактор в изоформах PLD , содержащих домен C2 . Связывание Ca2 + с доменом C2 приводит к конформационным изменениям фермента, которые усиливают связывание фермента с субстратом , ослабляя при этом связь с фосфоинозитидами . В некоторых растительных изоферментах , таких как PLDβ, Ca2 + может связываться непосредственно с активным сайтом , косвенно увеличивая его сродство к субстрату за счет усиления связывания активатора PIP2 . [ 6 ]

Домен PX

Предполагается, что консенсусная последовательность pbox ( PX) опосредует связывание дополнительных фосфатидилинозитолфосфатов, в частности, фосфатидилинозитол5-фосфата (PtdIns5P), липида, который, как считается, необходим для эндоцитоза , и может способствовать реинтернализации PLD1 из плазматической мембраны . [3]

Домен PH

Высококонсервативный домен гомологии Плекстрина (PH) представляет собой структурный домен длиной около 120 аминокислот . Он связывает фосфатидилинозитолы , такие как фосфатидилинозитол (3,4,5)-трифосфат (PIP 3 ) и фосфатидилинозитол (4,5)-бисфосфат (PIP 2 ). Он также может связывать гетеротримерные G-белки через их βγ-субъединицу . Также считается, что связывание с этим доменом облегчает реинтернализацию белка за счет увеличения его сродства к эндоцитотическим липидным плотам . [3]

Взаимодействие с малыми ГТФазами

В клетках животных малые белковые факторы являются важными дополнительными регуляторами активности PLD. Эти малые мономерные ГТФазы являются членами семейств Rho и ARF суперсемейства Ras . Некоторые из этих белков, такие как Rac1 , Cdc42 и RhoA , аллостерически активируют PLD1 млекопитающих , напрямую увеличивая его активность. В частности, транслокация цитозольного фактора АДФ-рибозилирования (ARF) в плазматическую мембрану имеет важное значение для активации PLD. [3] [6]

Физиологические и патофизиологические роли

Алкогольное опьянение

Фосфолипаза D метаболизирует этанол в фосфатидилэтанол (PEtOH) в процессе, называемом трансфосфатидилированием. С помощью генетики мух было показано, что PEtOH опосредует гиперактивную реакцию на алкоголь у плодовых мушек. [29] И было показано, что трансфосфатидилирование этанола повышается у алкоголиков и членов их семей. [30] Этот механизм трансфосфатидилирования этанола недавно появился как альтернативная теория влияния алкоголя на ионные каналы. Многие ионные каналы регулируются анионными липидами. [31] и считается, что конкуренция PEtOH с эндогенными сигнальными липидами опосредует влияние этанола на ионные каналы в некоторых случаях, а не прямое связывание свободного этанола с каналом. [29]

Механосенсорика

PLD2 является механосенсором и напрямую чувствителен к механическому разрушению кластерных липидов GM1. [5] Механическое разрушение (сдвиг жидкости) затем подает сигнал клетке дифференцироваться. PLD2 также активирует каналы TREK-1, калиевый канал в анальгетическом пути. [32]

PLD2 находится выше Piezo2 и ингибирует канал. [33] Piezo2 является возбуждающим каналом, поэтому PLD ингибирует возбуждающий канал и активирует TREK-1, который является ингибирующим каналом. Каналы объединяются, чтобы снизить возбудимость нейронов.

При раке

Фосфолипаза D является регулятором нескольких критических клеточных процессов, включая транспорт везикул , эндоцитоз , экзоцитоз , миграцию клеток и митоз . [8] Нарушение регуляции этих процессов является обычным явлением в канцерогенезе , [8] и, в свою очередь, аномалии в экспрессии PLD были вовлечены в прогрессирование нескольких типов рака . [4] [7] Драйверная мутация, обеспечивающая повышенную активность PLD2, наблюдалась при нескольких злокачественных опухолях молочной железы . [7] Повышенная экспрессия PLD также коррелировала с размером опухоли при колоректальной карциноме , карциноме желудка и раке почки . [7] [8] Однако молекулярные пути , через которые PLD управляет прогрессированием рака, остаются неясными. [7] Одна из потенциальных гипотез отводит фосфолипазе D решающую роль в активации mTOR , супрессора апоптоза раковых клеток . [7] Способность PLD подавлять апоптоз в клетках с повышенной активностью тирозинкиназы делает его кандидатом на роль онкогена в раковых заболеваниях , где такая экспрессия типична. [8]

При нейродегенеративных заболеваниях

Фосфолипаза D также может играть важную патофизиологическую роль в прогрессировании нейродегенеративных заболеваний , в первую очередь за счет своей способности выступать в качестве передатчика сигналов в незаменимых клеточных процессах, таких как реорганизация цитоскелета и транспортировка везикул . [27] Было показано, что нарушение регуляции PLD белком α-синуклеином приводит к специфической потере дофаминергических нейронов у млекопитающих . α-синуклеин является основным структурным компонентом телец Леви , белковых агрегатов , которые являются отличительными признаками болезни Паркинсона . [7] Растормаживание PLD α-синуклеином может способствовать пагубному фенотипу болезни Паркинсона . [7]

Аномальная активность PLD также подозревается при болезни Альцгеймера , где было обнаружено ее взаимодействие с пресенилином 1 (PS-1), основным компонентом комплекса γ-секретазы, ответственного за ферментативное расщепление белка -предшественника амилоида (APP). Внеклеточные бляшки продукта β-амилоида являются определяющей чертой мозга , пораженного болезнью Альцгеймера . [7] Было показано, что действие PLD1 на PS-1 влияет на внутриклеточный трафик предшественника амилоида в этот комплекс . [7] [27] Фосфолипаза D3 (PLD3), неклассический и плохо охарактеризованный член суперсемейства PLD , также была связана с патогенезом этого заболевания. [34]

Галерея

Ссылки

  1. ^ Павел, Махмуд Ариф; Петерсен, Э. Николас; Ван, Хао; Лернер, Ричард А.; Хансен, Скотт Б. (16 июня 2020 г.). «Исследования механизма общей анестезии». Труды Национальной академии наук . 117 (24): 13757–13766. Bibcode : 2020PNAS..11713757P. doi : 10.1073/pnas.2004259117 .
  2. ^ Петерсен, Э. Николас; Чунг, Хэ-Вон; Найебосадри, Арман; Хансен, Скотт Б. (15 декабря 2016 г.). «Кинетическое разрушение липидных рафтов является механосенсором для фосфолипазы D». Nature Communications . 7 (1): 13873. Bibcode :2016NatCo...713873P. doi :10.1038/ncomms13873. PMC 5171650 . PMID  27976674. 
  3. ^ abcdefg Jenkins GM, Frohman MA (октябрь 2005 г.). «Фосфолипаза D: обзор, ориентированный на липиды». Cellular and Molecular Life Sciences . 62 (19–20): 2305–16. doi :10.1007/s00018-005-5195-z. PMC 11139095 . PMID  16143829. S2CID  26447185. 
  4. ^ abcd Exton JH (2002). "Структура, регуляция и функция фосфолипазы D". Обзоры физиологии, биохимии и фармакологии . 144 : 1–94. doi :10.1007/BFb0116585. ISBN 978-3-540-42814-5. PMID  11987824.
  5. ^ ab Petersen EN, Chung HW, Nayebosadri A, Hansen SB (декабрь 2016 г.). «Кинетическое разрушение липидных рафтов является механосенсором для фосфолипазы D». Nature Communications . 7 (1): 13873. Bibcode :2016NatCo...713873P. doi :10.1038/ncomms13873. PMC 5171650 . PMID  27976674. 
  6. ^ abcdefghijklmnopqrs Колесников Ю.С., Нохрина КП, Кретынин СВ, Волотовский ИД, Мартинец Дж., Романов ГА, Кравец ВС (январь 2012). "Молекулярная структура фосфолипазы D и механизмы регуляции ее активности в растительных и животных клетках". Биохимия. Биохимия . 77 (1): 1–14. doi :10.1134/S0006297912010014. PMID  22339628. S2CID  14815405.
  7. ^ abcdefghijklmnopqrst Peng X, Frohman MA (февраль 2012 г.). "Физиологическая и патологическая роль фосфолипазы D млекопитающих". Acta Physiologica . 204 (2): 219–26. doi :10.1111/j.1748-1716.2011.02298.x. PMC 3137737. PMID  21447092 . 
  8. ^ abcdefghi Foster DA, Xu L (сентябрь 2003 г.). «Фосфолипаза D в пролиферации клеток и раке». Molecular Cancer Research . 1 (11): 789–800. PMID  14517341.
  9. ^ Petersen EN, Gudheti M, Pavel MA, Murphy KR, William WJ, Jorgensen EM, Hansen SB (5 сентября 2019 г.). «Фосфолипаза D передает силу на каналы TREK-1 в биологической мембране». bioRxiv : 758896. doi : 10.1101/758896 .
  10. ^ Павел MA, Петерсен EN, Ван H, Лернер RA, Хансен SB (июнь 2020 г.). «Исследования механизма общей анестезии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (24): 13757–13766. Bibcode : 2020PNAS..11713757P. bioRxiv 10.1101/313973 . doi : 10.1073/pnas.2004259117 . PMC 7306821. PMID  32467161 .  
  11. ^ abc Banno Y (март 2002 г.). «Регулирование и возможная роль млекопитающих фосфолипазы D в клеточных функциях». Журнал биохимии . 131 (3): 301–6. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a003103. PMID  11872157. S2CID  24389113.
  12. ^ abcd McDermott M, Wakelam MJ, Morris AJ (февраль 2004 г.). «Фосфолипаза D». Биохимия и клеточная биология . 82 (1): 225–53. doi :10.1139/o03-079. PMID  15052340.
  13. ^ ab Balboa MA, Firestein BL, Godson C, Bell KS, Insel PA (апрель 1994 г.). «Протеинкиназа C альфа опосредует активацию фосфолипазы D нуклеотидами и форболовым эфиром в клетках почек собак Madin-Darby. Стимуляция фосфолипазы D не зависит от активации полифосфоинозитид-специфической фосфолипазы C и фосфолипазы A2». Журнал биологической химии . 269 (14): 10511–6. doi : 10.1016/S0021-9258(17)34089-9 . PMID  8144636.
  14. ^ abc Leiros I, Secundo F, Zambonelli C, Servi S, Hough E (июнь 2000 г.). "Первая кристаллическая структура фосфолипазы D". Structure . 8 (6): 655–67. doi : 10.1016/S0969-2126(00)00150-7 . PMID  10873862.
  15. ^ Paruch S, El-Benna J, Djerdjouri B, Marullo S, Périanin A (январь 2006 г.). «Роль митоген-активируемых протеинкиназ p44/42 в активности фосфолипазы D, опосредованной формилпептидным рецептором, и продукции оксидантов». FASEB Journal . 20 (1): 142–4. doi : 10.1096/fj.05-3881fje . PMID  16253958. S2CID  28348537.
  16. ^ Bocckino SB, Blackmore PF, Wilson PB, Exton JH (ноябрь 1987 г.). «Накопление фосфатидата в обработанных гормоном гепатоцитах с помощью механизма фосфолипазы D». Журнал биологической химии . 262 (31): 15309–15. doi : 10.1016/S0021-9258(18)48176-8 . PMID  3117799.
  17. ^ Bocckino SB, Wilson PB, Exton JH (декабрь 1987 г.). «Ca2+-мобилизующие гормоны вызывают накопление фосфатидилэтанола посредством активации фосфолипазы D». FEBS Letters . 225 (1–2): 201–4. doi : 10.1016/0014-5793(87)81157-2 . PMID  3319693. S2CID  10674790.
  18. ^ Hodgkin MN, Pettitt TR, Martin A, Michell RH, Pemberton AJ, Wakelam MJ (июнь 1998 г.). «Диацилглицерины и фосфатидаты: какие молекулярные виды являются внутриклеточными мессенджерами?». Trends in Biochemical Sciences . 23 (6): 200–4. doi :10.1016/S0968-0004(98)01200-6. PMID  9644971.
  19. ^ Nowicki M, Müller F, Frentzen M (апрель 2005 г.). «Кардиолипинсинтаза Arabidopsis thaliana». FEBS Letters . 579 (10): 2161–5. doi : 10.1016/j.febslet.2005.03.007 . PMID  15811335. S2CID  21937549.
  20. ^ Nowicki M (2006). Характеристика кардиолипинсинтазы из Arabidopsis thaliana (диссертация на соискание ученой степени доктора философии). RWTH-Aachen University. Архивировано из оригинала 2011-10-05 . Получено 2011-07-11 .
  21. ^ Ponting CP, Kerr ID (май 1996). «Новое семейство гомологов фосфолипазы D, включающее фосфолипидсинтазы и предполагаемые эндонуклеазы: идентификация дублированных повторов и потенциальных остатков активного сайта». Protein Science . 5 (5): 914–22. doi :10.1002/pro.5560050513. PMC 2143407 . PMID  8732763. 
  22. ^ Кунин EV (июль 1996). «Дублированный каталитический мотив в новом суперсемействе фосфогидролаз и фосфолипидсинтаз, включающем белки оболочки поксвируса». Trends in Biochemical Sciences . 21 (7): 242–3. doi :10.1016/0968-0004(96)30024-8. PMID  8755242.
  23. ^ Ван X, Сюй L, Чжэн L (август 1994). «Клонирование и экспрессия фосфатидилхолин-гидролизующей фосфолипазы D из Ricinus communis L». Журнал биологической химии . 269 (32): 20312–7. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31993-2 . PMID  8051126.
  24. ^ Singer WD, Brown HA, Sternweis PC (1997). «Регуляция эукариотической фосфатидилинозитол-специфической фосфолипазы C и фосфолипазы D». Annual Review of Biochemistry . 66 : 475–509. doi :10.1146/annurev.biochem.66.1.475. PMID  9242915.
  25. ^ ab Petersen EN, Chung HW, Nayebosadri A, Hansen SB (декабрь 2016 г.). «Кинетическое разрушение липидных рафтов является механосенсором для фосфолипазы D». Nature Communications . 7 (13873): 13873. Bibcode :2016NatCo...713873P. doi :10.1038/ncomms13873. PMC 5171650 . PMID  27976674. 
  26. ^ Павел MA, Петерсен EN, Ван H, Лернер RA, Хансен SB (4 мая 2018 г.). «Исследования механизма общей анестезии». bioRxiv . 117 (24): 13757–13766. doi : 10.1101/313973 . PMC 7306821 . PMID  32467161. 
  27. ^ abc Lindsley CW, Brown HA (январь 2012 г.). «Фосфолипаза D как терапевтическая цель при расстройствах мозга». Neuropsychopharmacology . 37 (1): 301–2. doi :10.1038/npp.2011.178. PMC 3238067 . PMID  22157867. 
  28. ^ Petersen EN, Chung HW, Nayebosadri A, Hansen SB (декабрь 2016 г.). «Кинетическое разрушение липидных рафтов является механосенсором для фосфолипазы D». Nature Communications . 7 : 13873. Bibcode :2016NatCo...713873P. doi :10.1038/ncomms13873. PMC 5171650 . PMID  27976674. 
  29. ^ ab Chung HW, Petersen EN, Cabanos C, Murphy KR, Pavel MA, Hansen AS и др. (январь 2019 г.). «Молекулярная мишень для отсечки длины спиртовой цепи». Журнал молекулярной биологии . 431 (2): 196–209. doi :10.1016/j.jmb.2018.11.028. PMC 6360937. PMID 30529033  . 
  30. ^ Mueller GC, Fleming MF, LeMahieu MA, Lybrand GS, Barry KJ (декабрь 1988 г.). «Синтез фосфатидилэтанола — потенциальный маркер для взрослых мужчин с риском алкоголизма». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (24): 9778–82. Bibcode : 1988PNAS...85.9778M. doi : 10.1073/pnas.85.24.9778 . PMC 282864. PMID  3200856 . 
  31. ^ Hansen SB (май 2015). «Агонизм липидов: парадигма PIP2 лиганд-управляемых ионных каналов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (5): 620–8. doi :10.1016/j.bbalip.2015.01.011. PMC 4540326. PMID  25633344 . 
  32. ^ Comoglio Y, Levitz J, Kienzler MA, Lesage F, Isacoff EY, Sandoz G (сентябрь 2014 г.). «Фосфолипаза D2 специфически регулирует калиевые каналы TREK посредством прямого взаимодействия и локального производства фосфатидной кислоты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (37): 13547–52. Bibcode : 2014PNAS..11113547C. doi : 10.1073/pnas.1407160111 . PMC 4169921. PMID  25197053 . 
  33. ^ Габриэль, Мэтью; Юдин, Евгений; Ван, Юцзюэ; Су, Сяоян; Рохач, Тибор (15 августа 2024 г.). «Фосфатидовая кислота является эндогенным отрицательным регулятором каналов PIEZO2 и механической чувствительности». Nature Communications . 15 (1). doi :10.1038/s41467-024-51181-4.
  34. ^ Кручага С., Карч С.М., Джин С.К., Бенитес Б.А., Кай Ю., Геррейро Р. и др. (январь 2014 г.). «Редкие варианты кодирования гена фосфолипазы D3 повышают риск болезни Альцгеймера». Природа . 505 (7484): 550–554. Бибкод : 2014Natur.505..550.. doi :10.1038/nature12825. ПМК 4050701 . ПМИД  24336208. 

Внешние ссылки

В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR001734