Тип варианта признака последовательности ( SFVT) относится к определенной вариации последовательности (мутации) заданной особенности последовательности в белке . Рассмотрим белок, его аминокислотная последовательность определяет его структуру и функцию. Некоторые области последовательности в первую очередь связаны с укладкой белка , следовательно, со структурой, в то время как другие области связаны с функцией белка , такой как каталитический сайт фермента. Во многих родственных видах области в соответствующем белке будут оставаться консервативными от вида к виду, в то время как точная аминокислота в каждом месте может, и часто меняется, меняться. Чтобы наглядно проиллюстрировать как консервативную природу функциональных областей, так и точное изменение фактической аминокислоты, определен Тип варианта признака последовательности.
Последовательность признаков — это, по сути, набор аминокислот в белке, где набор может быть непрерывным диапазоном или некоторыми дискретными остатками. Большинство последовательностей признаков получены из экспериментальных результатов, но есть и такие, которые получены из вычислительного анализа.
Для каждой последовательности признаков существуют вариации между многими белками из разных родственных видов. Типы вариантов определяют точную аминокислоту в каждом месте для признака. Чем больше мутация в каждом месте для признака, тем больше число его типов вариантов. Для данного белка, как только его аминокислотная последовательность определена, определяется тип варианта его последовательности признаков.
SFVT можно использовать для изучения функций белков во многих родственных видах. Такие исследования были проведены на нескольких человеческих патогенах.
SFVT также доступны в базе данных исследований гриппа для белков гриппа и в базе данных патогенов вирусов и аналитическом ресурсе для вируса денге.