Белок в клетках животных
Выживание двигательного нейрона или выживаемость двигательного нейрона ( SMN ) — это белок , который у человека кодируется генами SMN1 и SMN2 .
SMN находится в цитоплазме всех животных клеток, а также в ядерных кристаллах . Он участвует в регуляции транскрипции , регенерации теломеразы и клеточном трафике . [2] Дефицит SMN, в первую очередь из-за мутаций в SMN1 , приводит к распространенным дефектам сплайсинга , особенно в спинальных двигательных нейронах , и является одной из причин спинальной мышечной атрофии . Исследования также показали возможную роль SMN в миграции и/или дифференцировке нейронов . [3]
Функция
Белок SMN содержит домены GEMIN2- связывания, Tudor и YG-Box. [4] Он локализуется как в цитоплазме , так и в ядре . Внутри ядра белок локализуется в субъядерных тельцах, называемых gems, которые находятся около спиральных тел, содержащих высокие концентрации малых рибонуклеопротеинов (snRNP). Этот белок образует гетеромерные комплексы с такими белками, как GEMIN2 и GEMIN4 , а также взаимодействует с несколькими белками, которые , как известно, участвуют в биогенезе snRNP , такими как белок hnRNP U и белок, связывающий малую ядрышковую РНК. [5]
СМН комплекс
Комплекс SMN относится ко всему многобелковому комплексу, участвующему в сборке snRNP , основных компонентов сплайсосомного аппарата . [6] Комплекс, помимо «надлежащего» выживания белка двигательного нейрона, включает в себя по крайней мере шесть других белков ( гем-ассоциированные белки 2 , 3 , 4 , 5 , 6 и 7. [6 ]
Взаимодействия
Было показано, что SMN взаимодействует с:
- Bcl-2 , [7]
- Коилин , [8] [9]
- DDX20 , [10] [11] [12]
- DHX9 , [13]
- ФБЛ , [14]
- ФУБП1 , [15]
- ГАР1 , [14]
- GEMIN2 , [10] [16]
- GEMIN4 , [10]
- GEMIN5 , [17]
- GEMIN7 , [18] [19]
- HNRNPR , [20] [21]
- КПНБ1 , [22]
- С53 , [23]
- SNRPD1 , [10] [16] [24] и
- SNRPD2 . [10]
Эволюционная консервация
SMN эволюционно сохраняется, включая царство грибов , хотя только грибковые организмы с большим количеством интронов имеют ген Smn (или паралог фактора сплайсинга spf30 ). Удивительно, но это нитевидные грибы, которые имеют мицелий , что предполагает аналогию с нейрональными аксонами. [25]
Смотрите также
Ссылки
- ^
- ^ Singh NN, Shishimorova M, Cao LC, Gangwani L, Singh RN (2009). «Короткий антисмысловой олигонуклеотид, маскирующий уникальный интронный мотив, предотвращает пропуск критического экзона при спинальной мышечной атрофии». RNA Biology . 6 (3): 341–50. doi :10.4161/rna.6.3.8723. PMC 2734876 . PMID 19430205.
- ^ Giavazzi A, Setola V, Simonati A, Battaglia G (март 2006 г.). «Нейронно-специфические роли белка выживаемости двигательных нейронов: доказательства из паттернов экспрессии выживаемости двигательных нейронов в развивающейся центральной нервной системе человека». Журнал невропатологии и экспериментальной неврологии . 65 (3): 267–77. doi : 10.1097/01.jnen.0000205144.54457.a3 . PMID 16651888.
- ^ Мартин Р., Гупта К., Нинан Н.С., Перри К., Ван Дюйн Г.Д. (ноябрь 2012 г.). «Белок выживаемости двигательных нейронов образует растворимые олигомеры глициновой молнии». Структура . 20 (11): 1929–39. doi :10.1016/j.str.2012.08.024. PMC 3519385. PMID 23022347 .
- ^ «Ген Энтреза: выживание SMN1 двигательного нейрона 1, теломерного».
- ^ ab Gubitz AK, Feng W, Dreyfuss G (май 2004). «Комплекс SMN». Experimental Cell Research . 296 (1): 51–6. doi :10.1016/j.yexcr.2004.03.022. PMID 15120993.
- ^ Iwahashi H, Eguchi Y, Yasuhara N, Hanafusa T, Matsuzawa Y, Tsujimoto Y (ноябрь 1997 г.). «Синергическая антиапоптотическая активность между Bcl-2 и SMN, вовлеченная в спинальную мышечную атрофию». Nature . 390 (6658): 413–7. Bibcode :1997Natur.390..413I. doi :10.1038/37144. PMID 9389483.
- ^ Hebert MD, Shpargel KB, Ospina JK, Tucker KE, Matera AG (сентябрь 2002 г.). «Метилирование коилина регулирует формирование ядерного тельца». Developmental Cell . 3 (3): 329–37. doi : 10.1016/S1534-5807(02)00222-8 . PMID 12361597.
- ^ Hebert MD, Szymczyk PW, Shpargel KB, Matera AG (октябрь 2001 г.). «Коилин образует мост между тельцами Кахаля и SMN, белком спинальной мышечной атрофии». Genes & Development . 15 (20): 2720–9. doi :10.1101/gad.908401. PMC 312817 . PMID 11641277.
- ^ abcde Meister G, Bühler D, Laggerbauer B, Zobawa M, Lottspeich F, Fischer U (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и специфическое подмножество сплайсосомных белков Sm». Human Molecular Genetics . 9 (13): 1977–86. doi : 10.1093/hmg/9.13.1977 . PMID 10942426.
- ^ Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J , Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). «miRNP: новый класс рибонуклеопротеинов, содержащих многочисленные микроРНК». Genes & Development . 16 (6): 720–8. doi :10.1101/gad.974702. PMC 155365 . PMID 11914277.
- ^ Charroux B, Pellizzoni L, Perkinson RA, Shevchenko A, Mann M, Dreyfuss G (декабрь 1999 г.). "Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом gems". The Journal of Cell Biology . 147 (6): 1181–94. doi :10.1083/jcb.147.6.1181. PMC 2168095 . PMID 10601333.
- ^ Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (январь 2001 г.). «Функциональное взаимодействие между комплексом двигательных нейронов выживания и РНК-полимеразой II». Журнал клеточной биологии . 152 (1): 75–85. doi :10.1083/jcb.152.1.75. PMC 2193649. PMID 11149922.
- ^ ab Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Выживание белка двигательных нейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Current Biology . 11 (14): 1079–88. Bibcode :2001CBio...11.1079P. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00316-5 . PMID 11509230.
- ^ Williams BY, Hamilton SL, Sarkar HK (март 2000). «Белок выживаемости двигательных нейронов взаимодействует с трансактиваторным связывающим белком FUSE из человеческого эмбрионального мозга». FEBS Letters . 470 (2): 207–10. Bibcode : 2000FEBSL.470..207W. doi : 10.1016/S0014-5793(00)01320-X. PMID 10734235.
- ^ ab Liu Q, Fischer U, Wang F, Dreyfuss G (сентябрь 1997 г.). «Продукт гена спинальной мышечной атрофии, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP». Cell . 90 (6): 1013–21. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . PMID 9323129.
- ^ Gubitz AK, Mourelatos Z, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (февраль 2002 г.). "Gemin5, новый компонент белка WD-повтора комплекса SMN, который связывает белки Sm". Журнал биологической химии . 277 (7): 5631–6. doi : 10.1074/jbc.M109448200 . PMID 11714716.
- ^ Baccon J, Pellizzoni L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (август 2002 г.). «Идентификация и характеристика Gemin7, нового компонента выживания комплекса двигательных нейронов». Журнал биологической химии . 277 (35): 31957–62. doi : 10.1074/jbc.M203478200 . PMID 12065586.
- ^ Pellizzoni L, Baccon J, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). «Очистка нативного выживания комплексов двигательных нейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента». Журнал биологической химии . 277 (9): 7540–5. doi : 10.1074/jbc.M110141200 . PMID 11748230.
- ^ Mourelatos Z, Abel L, Yong J, Kataoka N, Dreyfuss G (октябрь 2001 г.). «SMN взаимодействует с новым семейством hnRNP и сплайсосомальных белков». The EMBO Journal . 20 (19): 5443–52. doi :10.1093/emboj/20.19.5443. PMC 125643. PMID 11574476 .
- ^ Rossoll W, Kröning AK, Ohndorf UM, Steegborn C, Jablonka S, Sendtner M (январь 2002 г.). «Специфическое взаимодействие Smn, продукта гена, определяющего спинальную мышечную атрофию, с hnRNP-R и gry-rbp/hnRNP-Q: роль Smn в обработке РНК в моторных аксонах?». Human Molecular Genetics . 11 (1): 93–105. doi : 10.1093/hmg/11.1.93 . PMID 11773003.
- ^ Narayanan U, Ospina JK, Frey MR, Hebert MD, Matera AG (июль 2002 г.). «SMN, белок спинальной мышечной атрофии, образует комплекс pre-import snRNP с snurportin1 и importin beta». Human Molecular Genetics . 11 (15): 1785–95. doi :10.1093/hmg/11.15.1785. PMC 1630493 . PMID 12095920.
- ^ Young PJ, Day PM, Zhou J, Androphy EJ, Morris GE, Lorson CL (январь 2002 г.). «Прямое взаимодействие между белком выживаемости двигательных нейронов и p53 и его связь со спинальной мышечной атрофией». Журнал биологической химии . 277 (4): 2852–9. doi : 10.1074/jbc.M108769200 . PMID 11704667.
- ^ Friesen WJ, Dreyfuss G (август 2000 г.). «Специфические последовательности белков Sm и Sm-подобных (Lsm) опосредуют их взаимодействие с генным продуктом заболевания спинальной мышечной атрофии (SMN)». Журнал биологической химии . 275 (34): 26370–5. doi : 10.1074/jbc.M003299200 . PMID 10851237.
- ^ Mier P, Pérez-Pulido AJ (январь 2012 г.). «Грибковые гомологи Smn и Spf30 в основном присутствуют в нитчатых грибах и геномах со многими интронами: последствия для спинальной мышечной атрофии». Gene . 491 (2): 135–41. doi :10.1016/j.gene.2011.10.006. PMID 22020225.
Внешние ссылки