Общие факторы транскрипции
Фактор транскрипции II D ( TF II D ) является одним из нескольких общих факторов транскрипции , которые составляют комплекс преинициации РНК-полимеразы II . Холофермент РНК-полимеразы II является формой эукариотической РНК-полимеразы II , которая рекрутируется на промоторы генов, кодирующих белок, в живых клетках. Он состоит из РНК-полимеразы II , подмножества общих факторов транскрипции и регуляторных белков, известных как белки SRB. Перед началом транскрипции комплекс фактора транскрипции II D (TF II D) связывается с основной промоторной ДНК гена посредством специфического распознавания мотивов промоторной последовательности, включая TATA-бокс , инициатор , нисходящий промотор , мотив Ten или нисходящие регуляторные элементы. [1]
Функции
- Координирует активность более 70 полипептидов, необходимых для инициации транскрипции РНК-полимеразой II.
- Связывается с основным промотором для правильного позиционирования полимеразы
- Служит основой для сборки остальной части транскрипционного комплекса.
- Действует как канал для регулирующих сигналов
Структура
Сам TF II D состоит из TBP и нескольких субъединиц , называемых факторами, ассоциированными с белком TATA-связывания ( факторы, ассоциированные с TBP , или TAF ). В пробирке для транскрипции на промоторах , содержащих бокс TATA , необходим только TBP . [2] Однако TAF добавляют селективность промотора, особенно если нет последовательности бокса TATA, с которой мог бы связываться TBP. [1] TAF входят в два отдельных комплекса: TF II D [3] и B-TF II D. [4] Комплекс TF II D состоит из TBP и более восьми TAF. Но большая часть TBP присутствует в комплексе B-TF II D, который состоит из TBP и TAFII170 ( BTAF1 ) в соотношении 1:1. [5] TF II D и B-TF II D не эквивалентны, поскольку реакции транскрипции, использующие TF II D, реагируют на ген-специфические факторы транскрипции, такие как SP1, в то время как реакции, воссозданные с помощью B-TF II D, — нет. [5]
Субъединицы комплекса TF II D включают: [2]
- TBP (белок, связывающий ТАТА), или:
- Факторы, связанные с TBP у животных ( TBPL1 ; TBPL2 ) [6]
- TAF1 (TAFII250)
- TAF2 (CIF150)
- TAF3 (TAFII140)
- TAF4 (TAFII130/135)
- TAF4B (TAFII105)
- TAF5 (TAFII100)
- TAF6 (TAFII70/80)
- TAF7 (TAFII55)
- TAF8 (TAFII43)
- TAF9 (TAFII31/32)
- TAF9B (TAFII31L)
- TAF10 (TAFII30)
- TAF11 (TAFII28)
- TAF12 (TAFII20/15)
- TAF13 (TAFII18)
- TAF15 (TAFII68)
Смотрите также
Ссылки
- ^ ab Louder, RK; He, Y; López-Blanco, JR; Fang, J; Chacón, P; Nogales, E (2016). «Структура TFIID, связанного с промотором, и модель сборки преинициативного комплекса человека». Nature . 531 (7596): 604–609. Bibcode :2016Natur.531..604L. doi :10.1038/nature17394. PMC 4856295 . PMID 27007846.
- ^ ab Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000). «Транскрипция генов, кодирующих эукариотические белки». Annu. Rev. Genet . 34 : 77–137. doi :10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.
- ^ Dynlacht, Brian David; Hoey, Timothy; Tjian, Robert (август 1991 г.). «Выделение коактиваторов, связанных с белком связывания TATA, которые опосредуют активацию транскрипции». Cell . 66 (3): 563–576. doi :10.1016/0092-8674(81)90019-2. PMID 1907890. S2CID 5000858.
- ^ "NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, ассоциированная с фактором транскрипции B-TFIID, 170 кДа (гомолог Mot1, S. cerevisiae)".
- ^ ab
- ^ Даттке, SH (март 2015 г.). «Эволюция и диверсификация базального аппарата транскрипции». Тенденции в биохимических науках . 40 (3): 127–9. doi :10.1016/j.tibs.2015.01.005. PMC 4410091. PMID 25661246 .
Внешние ссылки
