Транспортер, связанный с процессингом антигена ( TAP ), белковый комплекс принадлежит к семейству АТФ-связывающих кассетных транспортеров . [1] Он доставляет цитозольные пептиды в эндоплазматический ретикулум (ЭР), где они связываются с формирующимися молекулами MHC класса I. [2]
Структура TAP образована двумя белками: TAP-1 и TAP-2 , которые имеют по одному гидрофобному региону и одному АТФ-связывающему региону каждый. Они собираются в гетеродимер, что приводит к образованию четырехдоменного транспортера. [3]
Транспортер TAP находится в просвете ER, связанном с комплексом загрузки пептидов (PLC). Этот комплекс β2-микроглобулина , кальретикулина , ERp57, TAP, тапазина и MHC класса I удерживает молекулы MHC до тех пор, пока они не будут полностью загружены пептидами. [4]
TAP-опосредованный транспорт пептидов является многоступенчатым процессом. Пептидсвязывающий карман формируется TAP-1 и TAP-2. Ассоциация с TAP является АТФ-независимым событием, «на этапе быстрой бимолекулярной ассоциации пептид связывается с TAP, за которым следует медленная изомеризация комплекса TAP». [5] Предполагается, что конформационное изменение структуры запускает гидролиз АТФ и, таким образом, инициирует транспорт пептидов. [6]
Оба домена связывания нуклеотидов (NBD) необходимы для транслокации пептидов, поскольку каждый NBD не может гидролизовать АТФ в одиночку. Точный механизм транспорта неизвестен; однако, результаты показывают, что связывание АТФ с TAP-1 является начальным этапом в процессе транспорта, и что АТФ, связанный с TAP-1, индуцирует связывание АТФ в TAP-2. Также было показано, что расстыковка загруженного MHC класса I связана с транспортным циклом TAP, вызванным сигналами от субъединицы TAP-1. [7]
Дрожжевой белок Mex67p и человеческий NXF1, также называемый TAP, являются двумя наиболее охарактеризованными NXF (ядерными транспортными факторами). TAP опосредуют взаимодействие частицы мРНК (мРНП) и комплекса ядерной поры (NPC). NXF не имеют никакого сходства с прототипическими ядерными транспортными рецепторами семейства импортин-экспортин (кариоферин) и не имеют характерного Ran-связывающего домена, обнаруженного во всех кариоферинах.
Активность АТФазы ТАП сильно зависит от наличия правильного субстрата, а связывание пептида является предпосылкой для гидролиза АТФ. Это предотвращает потерю АТФ через пептид-независимый гидролиз. [6]
Специфичность белков TAP была впервые исследована путем захвата пептидов в ER с помощью гликозилирования. TAP связывается с пептидами из 8–16 остатков с одинаковой аффинностью, в то время как транслокация наиболее эффективна для пептидов длиной от 8 до 12 остатков. Эффективность снижается для пептидов длиной более 12 остатков. [8] Однако пептиды с более чем 40 остатками были транслоцированы, хотя и с низкой эффективностью. Пептиды с низкой аффинностью к молекуле MHC класса I транспортируются из ER эффективным АТФ-зависимым экспортным белком. Эти описанные механизмы могут представлять собой механизм, гарантирующий, что только пептиды с высокой аффинностью связываются с MHC класса I. [9]