Трехчастная семья мотивов

Семейство трехкомпонентных мотивов ( TRIM ) представляет собой семейство белков . ^[1]

Функция

Многие белки TRIM индуцируются интерферонами , которые являются важным компонентом устойчивости к патогенам, и известно, что несколько белков TRIM необходимы для ограничения заражения лентивирусами . Белки TRIM участвуют в распознавании патогенов и регуляции транскрипционных путей в защите хозяина. ^[2]

Структура

Трехкомпонентный мотив всегда присутствует на N-конце белков TRIM. Мотив TRIM включает следующие три домена: ^[1]

• (1) домен RING-пальца
• (2) один или два домена цинковых пальцев B-box
  • когда присутствует только один B-box, это всегда B-box типа 2
  • когда присутствуют два B-box'а, B-Box типа 1 всегда предшествует B-Box типа 2
• (3) область спиральной спирали

С -конец белков TRIM содержит:

• Белки группы 1 : С-концевой домен, выбранный из следующего списка:
  • Домены NHL и IGFLMN, как в сочетании, так и по отдельности
  • Домен PHD, связанный с бромодоменом
  • Домен MATH (например, TRIM37 )
  • Домен ARF (например, TRIM23 )
  • Домен EXOIII (например, TRIM19 ) или
• Группа 2 белков : С-концевой домен SPRY
  • например TRIM21

Члены семьи

Семейство TRIM делится на две группы, которые различаются по структуре домена и геномной организации: ^[3]

• Члены группы 1 обладают различными С-концевыми доменами и представлены как у позвоночных, так и у беспозвоночных.
• Группа 2 отсутствует у беспозвоночных, имеет С-концевой домен SPRY ^[4]

В состав семьи входят:

• Группа 1
  • Домен PHD-BROMO, содержащий: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ) – действуют как корепрессоры
  • 1-10: TRIM1 , TRIM2, TRIM3 , TRIM8, TRIM9
  • 11-20: TRIM12, TRIM13, TRIM14 , TRIM16 , TRIM18 , TRIM19
  • 21-30: ТРИМ23 , ТРИМ25 , ТРИМ29 , ТРИМ30
  • 31-40: ТРИМ32 , ТРИМ36, ТРИМ37
  • 41-50: TRIM42, TRIM44, TRIM45 , TRIM46, TRIM47
  • 51-60: ТРИМ51, ТРИМ53, ТРИМ54, ТРИМ55 , ТРИМ56, ТРИМ57, ТРИМ59
  • 61-70: TRIM62 , TRIM63 , TRIM65, TRIM66, TRIM67, TRIM69 , TRIM70
  • 71-75: ТРИМ71
• Группа 2
  • 1-10: TRIM4, TRIM5 , TRIM6 , TRIM7, TRIM10
  • 11-20: ТРИМ11 , ТРИМ12, ТРИМ15 , ТРИМ17, ТРИМ20
  • 21-30: ТРИМ21 , ТРИМ22 , ТРИМ26, ТРИМ27 , ТРИМ30
  • 31-40: TRIM31 , TRIM34, TRIM35, TRIM38 , TRIM39, TRIM40
  • 41-50: TRIM41 , TRIM43, TRIM48, TRIM49, TRIM50
  • 51-60: ТРИМ51, ТРИМ52 , ТРИМ53, ТРИМ57, ТРИМ58, ТРИМ60
  • 61-70: ТРИМ61, ТРИМ64, ТРИМ68 , ТРИМ69 , ТРИМ70
  • 71-75: ТРИМ72, ТРИМ73, ТРИМ74, ТРИМ75

Ссылки

1. Реймонд А, Мерони Г, Фантоцци А, Мерла Г, Каир С, Лузи Л, Риганелли Д, Занария Е, Мессали С, Кайнарка С, Гуффанти А, Минуччи С, Пеличчи П.Г., Баллабио А (май 2001 г.). «Семейство трехсторонних мотивов идентифицирует клеточные отсеки». ЭМБО Дж . 20 (9): 2140–51. дои : 10.1093/emboj/20.9.2140. ПМК  125245 . ПМИД  11331580.
2. Ozato K, Shin DM, Chang TH, Morse HC (ноябрь 2008 г.). «Белки семейства TRIM и их новые роли во врожденном иммунитете». Nat. Rev. Immunol . 8 (11): 849–60. doi :10.1038/nri2413. PMC 3433745. PMID 18836477  . 
3. Sardiello M, Cairo S, Fontanella B, Ballabio A, Meroni G (2008). «Геномный анализ семейства TRIM выявляет две группы генов с различными эволюционными свойствами». BMC Evol. Biol . 8 (1): 225. Bibcode :2008BMCEE...8..225S. doi : 10.1186/1471-2148-8-225 . PMC 2533329 . PMID  18673550. 
4. Ponting C, Schultz J, Bork P (июнь 1997 г.). "SPRY-домены в рианодиновых рецепторах (каналы высвобождения Ca(2+))". Trends Biochem. Sci . 22 (6): 193–4. doi :10.1016/S0968-0004(97)01049-9. PMID  9204703.