stringtranslate.com

Tristromaviridae

Tristromaviridae — семейство вирусов. [1] Археи родов Thermoproteus и Pyrobaculum служат естественными хозяевами. [2] Tristromaviridae — единственное семейство в порядке Primavirales . В семействе два рода и три вида. [3]

Таксономия

К семейству относятся следующие роды и виды: [3]

Структура

Вирусы рода Tristromaviridae имеют оболочку и стержневидную геометрию. Диаметр составляет около 38 нм, длина — 410 нм. Геномы линейные, длиной около 15,9 кб. Вирион TTV1 содержит четыре белка, кодируемых вирусом, TP1-4. [2] [4] Белки не демонстрируют никакого сходства последовательностей со структурными белками вирусов из других семейств, включая липотриксвирусы. Нуклеокапсидный белок TP1, по-видимому, произошел от эндонуклеазы Cas4, консервативного компонента адаптивного иммунитета CRISPR-Cas, представляя собой первый описанный случай экзаптации фермента для функции белка капсида вируса. [5]

Структура вириона с высоким разрешением была определена с помощью крио-ЭМ для вируса Pyrobaculum filamentous virus 2 (PFV2), вируса, тесно связанного с PFV1, который представляет типовой вид. [6] Структура показала, что нуклеокапсид образован из двух основных капсидных белков (MCP1 и MCP2). MCP1 и MCP2 образуют гетеродимер, который оборачивается вокруг линейного генома dsDNA, превращая его в A-форму. Взаимодействие между геномом и MCP приводит к конденсации генома в суперспираль вириона. [6] Спиральный нуклеокапсид окружен липидной оболочкой и содержит другие вирусные белки, причем VP3 является наиболее распространенным. [7]

Складка MCP, а также организация вирионов тристромавирусов аналогичны таковым у членов семейств Rudiviridae [8] и Lipothrixviridae , [9] [10] , которые вместе составляют порядок Ligamenvirales . Из-за этих структурных сходств было предложено объединить порядок Ligamenvirales и семейство Tristromaviridae в класс «Tokiviricetes» (toki означает «нить» на грузинском языке, а viricetes — официальный суффикс для класса вирусов). [6]

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем адсорбции на клетке-хозяине. Методом транскрипции является транскрипция с использованием ДНК-шаблона. Археи родов Thermoproteus и Pyrobaculum служат естественными хозяевами. Вирионы высвобождаются путем лизиса. Пути передачи — пассивная диффузия. [2]

Ссылки

  1. ^ Prangishvili, D; Rensen, E; Mochizuki, T; Krupovic, M; ICTV Report, Consortium (февраль 2019 г.). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Tristromaviridae". Журнал общей вирусологии . 100 (2): 135–136. doi : 10.1099/jgv.0.001190 . PMID  30540248.
  2. ^ abc "Tristromaviridae". ViralZone . Швейцарский институт биоинформатики . Получено 14 мая 2021 г. .
  3. ^ ab "Virus Taxonomy: 2020 Release". Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 г. Получено 14 мая 2021 г.
  4. ^ Нойманн, Хорст; Швасс, Фолькер; Экерскорн, Кристоф; Циллиг, Вольфрам (1989). «Идентификация и характеристика генов, кодирующих три структурных белка вируса Thermoproteus tenax TTV1». MGG Molecular & General Genetics . 217 (1): 105–110. doi :10.1007/BF00330948. PMID  2505050. S2CID  13335423.
  5. ^ Крупович М., Цвиркайте-Крупович В., Прангишвили Д., Кунин ЕВ. (2015). «Эволюция белка нуклеокапсида архейного вируса из нуклеазы Cas4, ассоциированной с CRISPR». Biol Direct . 10 (1): 65. doi : 10.1186/s13062-015-0093-2 . PMC 4625639. PMID  26514828 . 
  6. ^ abc Wang, F; Baquero, DP; Su, Z; Osinski, T; Prangishvili, D; Egelman, EH; Krupovic, M (январь 2020 г.). «Структура нитевидного вируса раскрывает семейные связи в архейной виросфере». Virus Evolution . 6 (1): veaa023. doi :10.1093/ve/veaa023. PMC 7189273 . PMID  32368353. 
  7. ^ Rensen, EI; Mochizuki, T; Quemin, E; Schouten, S; Krupovic, M; Prangishvili, D (2016). «Вирус гипертермофильных архей с уникальной архитектурой среди ДНК-вирусов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (9): 2478–83. Bibcode : 2016PNAS..113.2478R. doi : 10.1073/pnas.1518929113 . PMC 4780613. PMID  26884161 . 
  8. ^ ДиМайо, Ф.; Ю, Х.; Ренсен, Э.; Крупович, М.; Прангишвили, Д.; Эгельман, Э.Х. (2015). «Вирусология. Вирус, который инфицирует гипертермофил, инкапсулирует А-форму ДНК». Science . 348 (6237): 914–7. doi :10.1126/science.aaa4181. PMC 5512286 . PMID  25999507. 
  9. ^ Kasson, P; DiMaio, F; Yu, X; Lucas-Staat, S; Krupovic, M; Schouten, S; Prangishvili, D; Egelman, EH (2017). "Модель новой мембранной оболочки в нитевидном гипертермофильном вирусе". eLife . 6 . doi : 10.7554/eLife.26268 . PMC 5517147 . PMID  28639939. 
  10. ^ Лю, Y; Осински, T; Ван, F; Крупович, M; Схоутен, S; Кассон, P; Прангишвили, D; Эгельман, EH (2018). «Структурная консервация в мембранно-оболочечном нитчатом вирусе, заражающем гипертермофильный ацидофил». Nature Communications . 9 (1): 3360. Bibcode :2018NatCo...9.3360L. doi :10.1038/s41467-018-05684-6. PMC 6105669 . PMID  30135568. 

Внешние ссылки