Желтый флуоресцентный белок ( YFP ) представляет собой генетический мутант зеленого флуоресцентного белка (GFP), первоначально полученного из медузы Aequorea victoria . [1] Его пик возбуждения составляет 513 нм, а пик эмиссии — 527 нм. [2] Как и родительский GFP, YFP является полезным инструментом в клеточной и молекулярной биологии, поскольку пики возбуждения и эмиссии YFP отличаются от GFP, что позволяет изучать несколько процессов/белков в рамках одного и того же эксперимента.
Три улучшенные версии YFP — это Citrine, Venus и Ypet. Они имеют пониженную чувствительность к хлоридам, более быстрое созревание и повышенную яркость (определяемую как произведение коэффициента экстинкции и квантового выхода ). Обычно YFP служит акцептором для генетически закодированных сенсоров FRET , из которых наиболее вероятным донором FP является мономерный голубой флуоресцентный белок (mCFP). Красное смещение относительно GFP вызвано стэкинг-взаимодействием Pi-Pi в результате замены T203Y, внесенной мутацией, которая существенно увеличивает поляризуемость локального окружения хромофора , а также обеспечивает дополнительную электронную плотность в хромофоре.
«Венера» содержит новую аминокислотную замену – F46L–, которая ускоряет окисление хромофора при 37 ° C, стадии, лимитирующей скорость созревания. В белке есть и другие замены (F64L/M153T/V163A/S175G), позволяющие Венере хорошо сворачиваться и придающие ей относительную толерантность к ацидозу и Cl- . [3]
Для создания мутанта YFP потребовались четыре белковые мутации GFP дикого типа, обнаруженные у медузы Aequorea Victoria. Наиболее важной мутацией стала замена треонина на тирозин в положении остатка 203 [1] (замена обозначена T203Y, где T и Y представляют собой однобуквенный код аминокислот треонина и тирозина соответственно).