В молекулярной биологии домен пальца RING (сокращение от Really Interesting New Gene ) представляет собой структурный домен белка типа « цинковый палец », который содержит аминокислотный мотив C 3 HC 4 , который связывает два катиона цинка (семь цистеинов и один гистидин) . расположены непоследовательно). [2] [3] [4] [5] Этот белковый домен содержит от 40 до 60 аминокислот. Многие белки, содержащие RING-палец, играют ключевую роль в пути убиквитинирования .
Домены цинкового пальца (Znf) представляют собой относительно небольшие белковые мотивы , которые связывают один или несколько атомов цинка и которые обычно содержат множество пальцеобразных выступов, которые образуют тандемные контакты с молекулой-мишенью. Они связывают ДНК , РНК , белковые и/или липидные субстраты. [6] [7] [8] [9] [10] Их связывающие свойства зависят от аминокислотной последовательности пальцевых доменов и линкера между пальцами, а также от структур более высокого порядка и количества пальцев. Домены Znf часто встречаются в кластерах, где пальцы могут иметь разную специфичность связывания. Существует множество суперсемейств мотивов Znf, различающихся как по последовательности, так и по структуре. Они демонстрируют значительную универсальность в способах связывания, даже между членами одного и того же класса (например, некоторые связывают ДНК, другие белки), указывая тем самым, что мотивы Znf представляют собой стабильные каркасы, которые развили специализированные функции. Например, Znf-содержащие белки участвуют в транскрипции генов , трансляции, транспортировке мРНК, организации цитоскелета , развитии эпителия, клеточной адгезии , сворачивании белков , ремоделировании хроматина и чувствительности к цинку. [11] Цинк-связывающие мотивы представляют собой стабильные структуры и редко претерпевают конформационные изменения при связывании с мишенью.
Некоторые домены пальцев цинка разошлись так, что они все еще сохраняют свою основную структуру, но утратили способность связывать цинк, используя другие средства, такие как солевые мостики или связывание с другими металлами, для стабилизации пальцеобразных складок.
Многие домены RING-пальцев одновременно связывают ферменты убиквитинирования и их субстраты и, следовательно, функционируют как лигазы . Убиквитинирование, в свою очередь, нацелено на деградацию белка-субстрата. [12] [13] [14]
Домен RING-пальца имеет консенсусную последовательность C -X 2 - C -X [9-39] - C -X [1-3] - H -X [2-3] - C -X 2 - C -X [4] -48] -С - Х 2 - С . [2] где:
Ниже приводится схематическое изображение структуры домена пальца RING: [2]
хххххх хххх хххх хххх CCCC х\/хх\/х х Zn xx Zn x С/\HC/\С хххх ххххххххххх
Примеры генов человека , которые кодируют белки, содержащие домен RING-пальца, включают:
AMFR , BARD1 , BBAP , BFAR, BIRC2 , BIRC3 , BIRC7 , BIRC8, BMI1 , BRAP , BRCA1 , CBL , CBLB , CBLC , CBLL1 , CHFR , CNOT4 , COMMD3, DTX1 , DTX2 , DTX3 , DTX3L , DTX4 , DZIP3 , ХГЧВ , HLTF , HOIL-1 , IRF2BP2 , LNX1 , LNX2, LONRF1, LONRF2, LONRF3, МАРТ1, МАРТ10, МАРТ2 , МАРТ3, МАРТ4, МАРТ5 , МАРТ6 , МАРТ7 , МАРТ8, МАРТ9, MDM2 , MEX3A, MEX3B , MEX3C, 3Д , МГРН1, MIB1 , MID1 , MID2 , MKRN1, MKRN2, MKRN3 , MKRN4, MNAT1 , MYLIP , NFX1 , NFX2, PCGF1 , PCGF2 , PCGF3, PCGF4 , PCGF5 , PCGF6 , PDZRN3 , PDZRN4, PEX10 , PHRF1, PJA1 , PJA2 , МЛ , ПМЛ- RAR, PXMP3 , RAD18 , RAG1 , RAPSN , RBCK1 , RBX1 , RC3H1 , RC3H2, RCHY1 , RFP2, RFPL1, RFPL2, RFPL3, RFPL4B , RFWD2 , RFWD3, RING1 , RNF2 , RNF4 , RNF5 , RNF6, RNF7 , RNF8 , 10 , РНФ11 , РНФ12 , РНФ13 , РНФ14 , РНФ19А , РНФ20 , РНФ24 , РНФ25 , РНФ26 , РНФ32 , РНФ38 , РНФ39 , РНФ40 , РНФ41 , РНФ43 , РНФ44, РНФ55 , РНФ71 , РНФ103,РНФ111 , РНФ113А , РНФ113Б, РНФ121, РНФ122 , РНФ123, РНФ125 , РНФ126, РНФ128, РНФ130 , РНФ133, РНФ135, РНФ138, РНФ139 , РНФ141, РНФ144А , РНФ145, РНФ146, 148 , РНФ149, РНФ150, РНФ151, РНФ152, РНФ157 , РНФ165, RNF166, RNF167, RNF168, RNF169, RNF170, RNF175, RNF180, RNF181, RNF182, RNF185, RNF207, RNF213, RNF215 , RNFT1, SH3MD4, SH3RF1 , SH3RF2 , SYVN1 , TIF1, TMEM118, РС , ТРАФ2 , ТРАФ3 , ТРАФ4 , ТРАФ5 , TRAF6 , TRAF7, TRAIP , TRIM2, TRIM3 , TRIM4 , TRIM5 , TRIM6 , TRIM7 , TRIM8, TRIM9 , TRIM10, TRIM11 , TRIM13 , TRIM15 , TRIM17 , TRIM21 , TRIM22 , TRIM23 , TRIM24 , TRIM25 , TRIM26 , TRIM27 , TRIM28 , ТРИМ31 , TRIM32 , TRIM33 , TRIM34, TRIM35, TRIM36, TRIM38, TRIM39 , TRIM40, TRIM41, TRIM42, TRIM43 , TRIM45, TRIM46 , TRIM47, TRIM48, TRIM49, TRIM50, TRIM52 , TRIM54 , TRIM55 , TRIM56, TRIM59, ТРИМ60, ТРИМ61, TRIM62 , TRIM63 , TRIM65, TRIM67, TRIM68 , TRIM69 , TRIM71, TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIML1, TTC3 , UHRF1 , UHRF2 , VPS11 , VPS8, ZNF179, ZNF294, ZNF313, ZNF364, ZNF451 , , ЗНФБ7, ЗНРФ1 , ЗНРФ2, ZNRF3, ZNRF4 и ZSWIM2.