stringtranslate.com

Термотога

Thermotoga — род типа Thermotogota . Представители Thermotoga — гипертермофильные бактерии , клетки которых обернуты в уникальную наружную мембрану, похожую на оболочку, называемую «тога».

Члены типа окрашиваются в грамотрицательный цвет , поскольку обладают тонким пептидогликаном между двумя липидными бислоями, хотя оба они своеобразны. [2] Пептидогликан необычен, поскольку поперечная связь представляет собой не только мезо-диаминопимелат, как это происходит у Pseudomonadota , но и D-лизин. [NB 1] [3]

Виды являются анаэробами с различной степенью толерантности к кислороду. Они способны восстанавливать элементарную серу (S 0 ) до сероводорода. [2]

Является ли термофилия новшеством линии или наследственным признаком, неясно и не может быть определено.
Геном Thermotoga maritima был секвенирован в 1999 году, что выявило несколько генов архейного происхождения, возможно, обеспечивающих его термофильную адаптацию. [4] Содержание CG (цитозин-гуанин) у T. maritima составляет 46,2%; [2] большинство термофилов на самом деле имеют высокое содержание CG; это привело к предположению, что содержание CG может быть несущественным следствием термофилии, а не движущей силой к термофилии. [5] [6]

Имя

Статья и глава в руководстве Берджи были написаны несколькими авторами, включая микробиологов Карла Штеттера и Карла Вёзе . [2]

Новолатинское женское имя «thermotoga» означает «горячая верхняя одежда» и представляет собой комбинацию греческого существительного θέρμη ( therme , тепло) [7] или, что более правильно , прилагательного θερμός, ή, όν ( thermos, e, on , горячий) [8] и латинского женского существительного toga (римская верхняя одежда). [2]

Члены и родственники

Точное отношение Thermotogota к другим типам является предметом споров ( против бактериальных типов ): несколько исследований обнаружили, что они имеют глубокое ветвление (в руководстве Берджи они фактически появились в «Томе I: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии») [9] , в то время как другие обнаружили, что Firmicutes имеют глубокое ветвление, а Thermotogota группируются вдали от основания.

Типовой вид рода — T. maritima , впервые описанный в 1986 году. [2] В то время это был первый описанный вид типа. Род Thermotoga теперь содержит три официальных вида. [1] Недавно восемь видов были переведены из рода, и большинство из них оказались в пределах рода Pseudothermotoga по версии Bhandari & Gupta 2014. Штамм T. subterranea SL1 был обнаружен в континентальном нефтяном пласте с глубиной 70 °C в Восточно-Парижском бассейне, Франция . [10]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [1] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [11].

Сноски

  1. ^ Все протеиногенные аминокислоты имеют L-конфигурацию; в пептидогликане присутствуют некоторые аминокислоты с D-конфигурацией.
    Лизин синтезируется из мезо-диаминопимелата диаминопимелатдекарбоксилазой

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc JP Euzéby. "Thermotoga". Список названий прокариот со стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 09.09.2022 .
  2. ^ abcdef Huber, R.; TA Langworthy; H. Konig; M. Thomm; CR Woese; UB Sleytr; KO Stetter (1986). "Thermotoga maritima sp. nov. представляет собой новый род уникальных чрезвычайно термофильных эубактерий, растущих до 90°C" (PDF) . Arch. Microbiol . 144 (4): 324–333. doi :10.1007/BF00409880. S2CID  12709437.
  3. ^ Бонифаций, А.; Паркет, К.; Артур, М.; Менгин-Лекрёль, Д.; Бланот, Д. (2009). «Выяснение структуры пептидогликана Thermotoga maritima выявило два новых типа поперечных связей». Журнал биологической химии . 284 (33): 21856–21862. doi : 10.1074/jbc.M109.034363 . PMC 2755910. PMID  19542229 . 
  4. ^ Фрейзер, CM; Клейтон, KE; Гилл, RA; Гвинн, SR; Додсон, ML; Хафт, RJ; Хики, DH; Петерсон, EK; Нельсон, JD; Кетчум, WC; Макдональд, KA; Уттербек, L.; Малек, TR; Линер, JA; Гарретт, KD; Стюарт, MM; Коттон, AM; Пратт, MD; Филлипс, MS; Ричардсон, CA; Гейдельберг, D.; Саттон, J.; Флейшманн, GG; Эйзен, RD; Уайт, JA; Зальцберг, O.; Смит, SL; Вентер, HO; Фрейзер, JC (1999). "Доказательства латерального переноса генов между археями и бактериями из последовательности генома Thermotoga maritima". Nature . 399 (6734): 323–329. Bibcode : 1999Natur.399..323N. doi : 10.1038/20601. PMID  10360571.
  5. ^ Пасамонтес, А.; Гарсия-Вальве, С. (2006). «Использование многофакторного метода для анализа аминокислотного состава консервативной группы ортологичных белков у прокариот». BMC Bioinformatics . 7 : 257. doi : 10.1186/1471-2105-7-257 . PMC 1489954. PMID  16709240 . 
  6. ^ Пуигбо, П.; Пасамонтес, А.; Гарсия-Вальве, С. (2008). «Получение и потеря термофильной адаптации у прокариот». Тенденции в генетике . 24 (1): 10–14. дои :10.1016/j.tig.2007.10.005. ПМИД  18054113.
  7. ^ θέρμη. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  8. ^ θερμός. Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте «Персей»
  9. ^ Бун, Дэвид Р.; Кастенхольц, Ричард У. (18 мая 2001 г.) [1984 (Williams & Wilkins)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии . Руководство Берджи по систематической бактериологии. Том 1 (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer. С. 721. ISBN 978-0-387-98771-2. Британская библиотека № GBA561951.
  10. ^ Li H, Yang SZ, Mu BZ, Rong ZF, Zhang J (2007). «Молекулярное филогенетическое разнообразие микробного сообщества, связанного с высокотемпературным нефтяным резервуаром на морском месторождении». FEMS Microbiol Ecol . 60 (1): 74–84. doi : 10.1111/j.1574-6941.2006.00266.x . PMID  17286581.
  11. ^ Sayers; et al. "Thermotoga". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2022-09-09 .
  12. ^ "The LTP" . Получено 23 февраля 2022 г. .
  13. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 23 февраля 2022 г. .
  14. ^ "LTP_01_2022 Release Notes" (PDF) . Получено 23 февраля 2022 г. .
  15. ^ "GTDB release 07-RS207". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
  16. ^ "bac120_r207.sp_labels". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.
  17. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 20 июня 2022 г.