Домен RhoGEF

Домен белка

Домен RhoGEF описывает два различных структурных домена с активностью фактора обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для регуляции малых ГТФаз в семействе Rho . Малые ГТФазы Rho неактивны при связывании с GDP , но активны при связывании с GTP ; домены RhoGEF в белках способны способствовать высвобождению GDP и связыванию GTP для активации определенных членов семейства Rho, включая RhoA , Rac1 и Cdc42 .

Самый большой класс RhoGEF состоит из белков, содержащих домен « Dbl -гомологии» ( DH ), который почти всегда обнаруживается вместе с доменом плекстрин-гомологии (PH), образуя комбинированную структуру домена DH/PH. ^{[2] [3]}

Отдельный класс RhoGEFs — это белки, содержащие домен DOCK/CZH/DHR-2 . Эта структура не имеет сходства последовательностей с доменами DBL-гомологии. ^[4]

Белки человека, содержащие домен DH/PH RhoGEF

ABR; AKAP13/ARHGEF13/Lbc ; ALS2 ; ALS2CL; ARHGEF1/p115-RhoGEF ; ARHGEF10 ; ARHGEF10L; ARHGEF11/PDZ-RhoGEF. ; ARHGEF12/LARG ; ARHGEF15; ARHGEF16; ARHGEF17; ARHGEF18; ARHGEF19; ARHGEF2 ; ARHGEF25; ARHGEF26; ARHGEF28; ARHGEF3 ; ARHGEF33; ARHGEF35 ; ARHGEF37; ARHGEF38; ARHGEF39; ARHGEF4 ; ARHGEF40; ARHGEF5 ; ARHGEF6/альфа-PIX ; ARHGEF7/бета-PIX ; ARHGEF9 ; BCR ; DNMBP; ECT2 ; ECT2L ; FARP1 ; FARP2 ; FGD1 ; FGD2 ; FGD3 ; FGD4 ; FGD5 ; FGD6; ITSN1/Интерсектин 1 ; ITSN2/Интерсектин 2 ; KALRN/Калирин ; MCF2 ; MCF2L ; MCF2L2; NET1 ; NGEF ; OBSCN ; PLEKHG1; PLEKHG2 ; PLEKHG3; PLEKHG4 ; PLEKHG4B; PLEKHG5 ; PLEKHG6; PREX1 ; PREX2 ; RASGRF1 ; RASGRF2 ; SPATA13 ; TIAM1 ; TIAM2; ТРИО ; VAV1 ; VAV2 ; VAV3 .

Белки человека, содержащие домен DOCK/CZH RhoGEF

DOCK1/DOCK180 ; DOCK2 ; DOCK3/MOCA ; DOCK4 ; DOCK5 ; DOCK6/ZIR1 ; DOCK7/ZIR2 ; DOCK8/ZIR3 ; DOCK9/Зизимин1 ; DOCK10/Зизимин2 ; DOCK11/Зизимин3

Смотрите также

• ГТФаза
• Малая ГТФаза
• Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов
• Семейство Rho ГТФаз

Ссылки

1. Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура доменов гомологии Dbl и плекстрина из человеческого белка Son of sevenless». Cell . 95 (2): 259–68. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . PMID  9790532. S2CID  11868669.
2. Форт П., Бланжи А. (июнь 2017 г.). «Эволюционный ландшафт Dbl-подобных семейств RhoGEF: адаптация эукариотических клеток к сигналам окружающей среды». Genome Biology and Evolution . 9 (6): 1471–1486. ​​doi :10.1093/gbe/evx100. PMC 5499878. PMID 28541439  . 
3. Cerione RA, Zheng Y (апрель 1996 г.). «Семейство онкогенов Dbl». Current Opinion in Cell Biology . 8 (2): 216–22. doi : 10.1016/s0955-0674(96)80068-8 . PMID  8791419.
4. Коте Дж. Ф., Вуори К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства белков, связанных с DOCK180, с активностью обмена гуаниновыми нуклеотидами». Журнал клеточной науки . 115 (ч. 24): 4901–13. doi : 10.1242/jcs.00219 . PMID  12432077.

Дальнейшее чтение

• Hart MJ, Eva A, Evans T, Aaronson SA, Cerione RA (ноябрь 1991 г.). «Катализ обмена гуаниновых нуклеотидов на белке CDC42Hs продуктом онкогена dbl». Nature . 354 (6351): 311–4. doi :10.1038/354311a0. PMID  1956381. S2CID  4240053.
• Tan EC, Leung T, Manser E, Lim L (декабрь 1993 г.). «Ген, связанный с кластером активных точек разрыва человека, кодирует белок мозга с гомологией с белками обмена гуаниновых нуклеотидов и белками, активирующими ГТФазу». Журнал биологической химии . 268 (36): 27291–8. doi : 10.1016/S0021-9258(19)74248-3 . PMID  8262969.
• Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (октябрь 1998 г.). "Кристаллическая структура доменов гомологии Dbl и плекстрина из человеческого белка Son of sevenless". Cell . 95 (2): 259–68. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81756-0 . PMID  9790532. S2CID  11868669.