Чемпионат Греции 1945–46 был 12-м сезоном высшей футбольной лиги Греции и первым после Второй мировой войны . Клубы, которые участвовали, были чемпионами из трех футбольных ассоциаций-основателей HFF : Афины , Пирей и Македония .
Чемпионат был выигран Aris для их 3-го титула. Первоначально, после завершения всех 6 матчей, Aris занимал первое место в турнирной таблице. Но затем HFF приняла возражения его оппонентов за незаконное использование игрока Siotis (который играл в двух клубах в одном сезоне), присудив 2-0 в их пользу, последние 3 из его 4 игр (выездная ничья с AEK Athens и домашние победы над Olympiacos и AEK), в то же время обнулив клуб из Салоник за эти игры. В течение нескольких дней рейтинг был сформирован с объявлением AEK чемпионом HFF и Aris вынесением вопроса на свое общее собрание. В конце концов, Aris был оправдан в апелляции и выиграл титул. [1] Система очков была следующей: победа: 3 очка - ничья: 2 очка - поражение: 1 очко .