Б3ГАТ2

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Галактозилгалактозилксилозилпротеин 3-бета-глюкуронозилтрансфераза 2 — это фермент , который у человека кодируется геном B3GAT2 . [ ^{5] [6]}

Продукт этого гена — трансмембранный белок, принадлежащий к семейству глюкуронилтрансфераз, и катализирует перенос бета-1,3-связанной глюкуроновой кислоты к терминальной галактозе в различных гликопротеинах или гликолипидах, содержащих остаток Gal-beta-1-4GlcNAc или Gal-beta-1-3GlcNAc. Кодируемый белок участвует в синтезе углеводного эпитопа человеческого естественного киллера-1 (HNK-1), сульфатированного трисахарида, участвующего в клеточной миграции и адгезии в нервной системе. ^[6]

Использование антитела HNK-1 для исследования нервного гребня

Антитела, полученные против эпитопа HNK-1, сыграли большую роль в исследованиях нервного гребня , особенно у эмбриона птиц. ^[7] Первым антителом, полученным против этого эпитопа, было NC-1, ^[8] , что позволило значительно упростить анализ путей миграции нервного гребня. У птиц, и особенно у других позвоночных, результаты окрашивания HNK-1 следует интерпретировать с осторожностью, поскольку эпитоп не является уникальным для нервного гребня.

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000112309 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000026156 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Имия К, Ишизаки Т, Сейки Т, Сайто Ф, Инадзава Дж, Ока С, Кавасаки Т (октябрь 2002 г.). «cDNA cloning, genomy structure and chromosomal mapping of the mouse glucuronyltransferase-S takes in biosynthesis of the HNK-1 carbon epitope». Gene . 296 (1–2): 29–36. doi :10.1016/S0378-1119(02)00840-5. PMID  12383500.
6. "Ген Энтреза: B3GAT2 бета-1,3-глюкуронилтрансфераза 2 (глюкуронозилтрансфераза S)".
7. Броннер-Фрейзер М (май 1986). «Анализ ранних стадий миграции нервного гребня туловища у эмбрионов птиц с использованием моноклональных антител HNK-1». Dev. Biol . 115 (1): 44–55. doi :10.1016/0012-1606(86)90226-5. PMID  3516760.
8. Vincent M, Thiery JP (июнь 1984). «Маркер клеточной поверхности для нервного гребня и плакодных клеток: дальнейшая эволюция в периферической и центральной нервной системе». Dev. Biol . 103 (2): 468–81. doi :10.1016/0012-1606(84)90334-8. PMID  6202575.

Внешние ссылки

• Расположение генома человека B3GAT2 и страница с подробностями гена B3GAT2 в браузере геномов UCSC .
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческой галактозилгалактозилксилозилпротеин 3-бета-глюкуронозилтрансферазы 2 (B3GAT2)

Дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Кикуно Р., Охара О. (2002). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XXII. Полные последовательности 50 новых клонов кДНК, кодирующих большие белки». DNA Res . 8 (6): 319–27. doi : 10.1093/dnares/8.6.319 . PMID  11853319.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH и др. (2003). «Создание и начальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей ДНК человека и мыши». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Marcos I, Galán JJ, Borrego S, Antiñolo G (2003). «Клонирование, характеристика и картирование хромосом человеческого гена GlcAT-S». J. Hum. Genet . 47 (12): 677–80. doi : 10.1007/s100380200103 . PMID  12522689.
• Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ человеческой хромосомы 6». Nature . 425 (6960): 805–11. Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID  14574404.
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК». Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Какуда С., Ока С., Кавасаки Т. (2004). «Очистка и характеристика двух рекомбинантных человеческих глюкуронилтрансфераз, участвующих в биосинтезе углевода HNK-1 в Escherichia coli». Protein Expr. Purif . 35 (1): 111–9. doi :10.1016/j.pep.2003.12.021. PMID  15039073.
• Kakuda S, Sato Y, Tonoyama Y и др. (2005). «Различные акцепторные специфичности двух глюкуронилтрансфераз, участвующих в биосинтезе углевода HNK-1». Glycobiology . 15 (2): 203–10. doi : 10.1093/glycob/cwi001 . PMID  15470230.
• Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Й и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов». Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC  1356129. PMID  16344560 .
• Shiba T, Kakuda S, Ishiguro M и др. (2006). «Кристаллическая структура GlcAT-S, человеческой глюкуронилтрансферазы, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Proteins . 65 (2): 499–508. doi :10.1002/prot.21118. PMID  16897771. S2CID  31290955.