Тэнди Уорнов — американский учёный-компьютерщик и заслуженный профессор кафедры инженерии имени Грейнджера в Иллинойсском университете в Урбане-Шампейне . [4] [5] Она известна своими работами по реконструкции эволюционных деревьев , как в биологии, так и в исторической лингвистике , а также методами выравнивания множественных последовательностей. [6]
Уорнов получила степень бакалавра и магистра по математике в Калифорнийском университете в Беркли , получив степень бакалавра в 1984 году и степень доктора философии [2] в 1991 году под руководством Юджина Лоулера . Другими членами ее диссертационного комитета были Ричард Карп , Мануэль Блюм , Дэн Гасфилд и Дэвид Гейл . [2]
После постдокторских исследований в Университете Южной Калифорнии с 1991 по 1992 год (руководители постдокторантов Майкл Уотерман и Саймон Таваре ) и в Национальных лабораториях Сандия в Альбукерке с 1992 по 1993 год она заняла должность преподавателя в Университете Пенсильвании , где она оставалась до переезда в Техасский университет в 1999 году. В 2014 году Уорнов присоединилась к преподавательскому составу Иллинойсского университета в Урбане-Шампейне (UIUC), где она является заслуженным заведующим кафедрой инженерии имени Грейнджера и заместителем заведующего кафедрой компьютерных наук. Уорнов имеет любезные назначения на кафедрах биологии животных, биоинженерии, электротехники и компьютерной инженерии, энтомологии, математики, биологии растений и статистики. [5] [7]
В 1995 году исследования Уорноу, Дональда Ринге и Энн Тейлор в Университете Пенсильвании, основанные на совершенных вычислениях филогении , предоставили всеобъемлющую теорию для определения времени ранних подразделений в индоевропейских языках . Их вычисления подтвердили индо-хеттскую гипотезу, согласно которой первыми из этих подразделений, отделившимися от остальных индоевропейских языков, были анатолийские языки . Их результаты также подтверждают греко-армянскую гипотезу, согласно которой армянский язык и греческий язык образуют подсемью индоевропейских языков. Они вписывают германские языки в эволюционное древо индоевропейских языков, ранее считавшееся проблематичным, выдвинув гипотезу, что протогерманский язык был тесно связан с балто-славянскими языками , но затем был изменен миграциями германских племен на запад, что привело их к контакту с италийскими и кельтскими носителями. [8] Этот идеальный подход к филогении был позднее расширен Уорновом и его коллегами, чтобы допустить необнаруженные заимствования между языками, так что эволюция языка моделируется с помощью сети, а не дерева. [9]
В 2009 году Уорнов и ее коллеги выпустили свое программное обеспечение SATé для совместной оценки биологических множественных последовательностей выравниваний и эволюционных деревьев. [10] Их программное обеспечение основано на менее жестких математических принципах, чем некоторые предыдущие методы совместной оценки (такие как BAli-Phy [11] ), но оно значительно быстрее, позволяя быстро строить высокоточные деревья и выравнивания для тысяч видов. Для сравнения, медленная производительность предыдущих методов ограничивала их только сравнением десятков видов за раз. [12] [13]
Ее работа с 2014 года была сосредоточена на трех темах: масштабирование множественных выравниваний последовательностей до сверхбольших наборов данных, оценка дерева видов с использованием нескольких генов (и решение проблемы гетерогенности генного дерева из-за неполной сортировки по линиям ) и метагеномика. Ее основные вклады в эти темы включают метод PASTA для совместной оценки выравниваний и деревьев, который улучшает SATé и может производить высокоточные выравнивания с использованием до 1 000 000 последовательностей. [14] Она также разработала метод ASTRAL для оценки дерева видов, который является статистически последовательным методом построения деревьев видов при наличии неполной сортировки по линиям. [15]
Уорнов была названа почетным заведующим кафедрой инженерии имени Грейнджера в 2020 году и профессором-основателем инженерии в 2014 году (оба в UIUC), а также профессором Дэвида Брутона-младшего в области компьютерных наук в Техасском университете в Остине в 2010 году. [5] Уорнов также получила стипендию Фонда Джона Саймона Гуггенхайма в 2011 году, стипендию Института Рэдклиффа в 2003 году, стипендию Фонда Дэвида и Люсиль Паккард в 1996 году и премию NSF Young Investigator Award в 1994 году. [5] В 2015 году она была названа членом Ассоциации вычислительной техники (ACM) «за вклад в математическую теорию, алгоритмы и программное обеспечение для крупномасштабной молекулярной филогенетики и исторической лингвистики». [16] В 2017 году она была избрана членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [17] Она была включена в число членов Американской ассоциации содействия развитию науки 2021 года . [18]
Мать Уорнов была известным архивариусом Джоан Уорнов-Блеветт , а ее отцом был Мортон Уорнов, сын лидера группы Марка Уорнова и племянник композитора Рэймонда Скотта . [19] Ее сестра-близнец — Киммен Сьоландер , исследователь биоинформатики и почетный преподаватель Калифорнийского университета. Она замужем за Джорджем Чако, научным сотрудником по компьютерным наукам в инженерном колледже Грейнджера UIUC , [20] . У Уорнов двое детей: дочери Кристин и Менака. [19]