Фактор клетки-хозяина C1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Фактор клетки-хозяина 1 ( HCFC1 , HCF1 или HCF-1 ), также известный как VP16-вспомогательный белок , ^[5] представляет собой белок , который у людей кодируется геном HCFC1 . ^{[6] [7]}

Структура

HCF1 является членом высококонсервативного семейства факторов клеток-хозяев и кодирует белок с пятью повторами Kelch , мотивом, подобным фибронектину , и шестью повторами HCF, каждый из которых содержит высокоспецифичный сигнал расщепления. Этот ядерный корегулятор транскрипции протеолитически расщепляется в одном или нескольких из шести возможных участков, что приводит к созданию N-концевой цепи и соответствующей C-концевой цепи. Окончательная форма этого белка состоит из нековалентно связанных N- и C-концевых цепей, которые взаимодействуют посредством электростатических сил.

Функция

HCF1 участвует в контроле клеточного цикла , а также играет регуляторную роль во множестве процессов, связанных с транскрипцией . Кроме того, работа на модельных организмах указывает на то, что HCF1 является предполагаемым детерминантом долголетия . ^[8] Были описаны альтернативно сплайсированные варианты, которые кодируют различные изоформы белка; однако не все варианты были полностью охарактеризованы. ^[7]

Мутации в этом гене связаны с нарушениями метаболизма кобаламина . ^[9]

Взаимодействия

Было показано, что фактор клетки-хозяина C1 взаимодействует с:

• БАП1 , ^[10]
• CREB3 , ^{[11] [12]}
• ГАБПА , ^[13]
• HDAC1 , ^[14]
• HDAC2 , ^[14]
• МЛЛ , ^[15]
• ОГТ , ^[14]
• PDCD2 , ^[16]
• POU2F1 , ^{[17] [18]}
• PPP1CA , ^[19]
• SIN3A , ^{[14] [15]}
• СП1 , ^{[14] [20]}
• SUDS3 , ^[14]
• WDR5 , ^{[14] [15]} и
• ZBTB17 . ^[21]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000172534 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031386 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Запись GeneCards для HCFC1, http://genecards.org Архивировано 14 октября 2013 г. на Wayback Machine
6. Wilson AC, LaMarco K, Peterson MG, Herr W (июль 1993 г.). «Вспомогательный белок VP16 HCF — это семейство полипептидов, полученных из большого белка-предшественника». Cell . 74 (1): 115–25. doi :10.1016/0092-8674(93)90299-6. PMID  8392914. S2CID  43569318.
7. "Ген Entrez: фактор клетки-хозяина HCFC1 C1 (VP16-вспомогательный белок)".
8. Ли Дж, Эбата А, Донг Й, Ризки Г, Ивата Т, Ли СС (сентябрь 2008 г.). «Caenorhabditis elegans HCF-1 участвует в поддержании долголетия как регулятор DAF-16». ПЛОС Биология . 6 (9): е233. doi : 10.1371/journal.pbio.0060233 . ПМЦ 2553839 . ПМИД  18828672. 
9. Yu HC, Sloan JL, Scharer G, Brebner A, Quintana AM, Achilly NP, Manoli I, Coughlin CR, Geiger EA, Schneck U, Watkins D, Suormala T, Van Hove JL, Fowler B, Baumgartner MR, Rosenblatt DS, Venditti CP, Shaikh TH (сентябрь 2013 г.). «Х-сцепленное нарушение кобаламина, вызванное мутациями в транскрипционном корегуляторе HCFC1». American Journal of Human Genetics . 93 (3): 506–14. doi :10.1016/j.ajhg.2013.07.022. PMC 3769968 . PMID  24011988. 
10. Machida YJ, Machida Y, Vashisht AA, Wohlschlegel JA, Dutta A (декабрь 2009 г.). «Деубиквитинирующий фермент BAP1 регулирует рост клеток посредством взаимодействия с HCF-1». Журнал биологической химии . 284 (49): 34179–88. doi : 10.1074/jbc.M109.046755 . PMC 2797188. PMID  19815555 . 
11. Lu R, Yang P, Padmakumar S, Misra V (август 1998 г.). «Трансактиватор вируса герпеса VP16 имитирует белок человеческой основной доменной лейциновой молнии, luman, при его взаимодействии с HCF». Journal of Virology . 72 (8): 6291–7. doi :10.1128/JVI.72.8.6291-6297.1998. PMC 109766 . PMID  9658067. 
12. Freiman RN, Herr W (декабрь 1997 г.). «Вирусная мимикрия: общий способ ассоциации с HCF VP16 и клеточным белком LZIP». Genes & Development . 11 (23): 3122–7. doi :10.1101/gad.11.23.3122. PMC 316754. PMID  9389645 . 
13. Vogel JL, Kristie TM (февраль 2000 г.). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции GABP». The EMBO Journal . 19 (4): 683–90. doi :10.1093/emboj/19.4.683. PMC 305606. PMID  10675337 . 
14. Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (апрель 2003 г.). "Человеческая деацетилаза Sin3 и метилтрансфераза гистона H3-K4, связанная с тритораксом Set1/Ash2, селективно связаны с фактором пролиферации клеток HCF-1". Genes & Development . 17 (7): 896–911. doi :10.1101/gad.252103. PMC 196026 . PMID  12670868. 
15. Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (июль 2004 г.). «Протоонкопротеин лейкемии MLL образует комплекс метилтрансферазы гистонов типа SET1 с менином для регуляции экспрессии гена Hox». Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5639–49. doi :10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID  15199122 . 
16. Scarr RB, Sharp PA (август 2002 г.). «PDCD2 является отрицательным регулятором HCF-1 (C1)». Oncogene . 21 (34): 5245–54. doi : 10.1038/sj.onc.1205647 . PMID  12149646.
17. La Boissière S, Hughes T, O'Hare P (январь 1999). "HCF-зависимый ядерный импорт VP16". The EMBO Journal . 18 (2): 480–9. doi :10.1093/emboj/18.2.480. PMC 1171141. PMID  9889203 . 
18. Kristie TM, Sharp PA (март 1993). «Очистка клеточного фактора C1, необходимого для стабильного распознавания гомеодомена Oct-1 фактором альфа-транс-индукции вируса простого герпеса (VP16)». Журнал биологической химии . 268 (9): 6525–34. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53282-8 . PMID  8454622.
19. Ajuh PM, Browne GJ, Hawkes NA, Cohen PT, Roberts SG, Lamond AI (февраль 2000 г.). «Связь активности протеинфосфатазы 1 с комплексом человеческого фактора C1 (HCF)». Nucleic Acids Research . 28 (3): 678–86. doi :10.1093/nar/28.3.678. PMC 102561. PMID  10637318 . 
20. Gunther M, Laithier M, Brison O (июль 2000 г.). «Набор белков, взаимодействующих с фактором транскрипции Sp1, выявленный при двухгибридном скрининге». Молекулярная и клеточная биохимия . 210 (1–2): 131–42. doi :10.1023/A:1007177623283. PMID  10976766. S2CID  1339642.
21. Piluso D, Bilan P, Capone JP (ноябрь 2002 г.). «Фактор клеток-хозяев-1 взаимодействует с фактором регуляции клеточного цикла Miz-1 и препятствует его трансактивации». Журнал биологической химии . 277 (48): 46799–808. doi : 10.1074/jbc.M206226200 . PMID  12244100.

Дальнейшее чтение

• Oehler T, Angel P (декабрь 1992 г.). «Общий промежуточный фактор (p52/54), распознающий домены типа «кислотной капли», необходим для активации транскрипции белками Jun». Молекулярная и клеточная биология . 12 (12): 5508–15. doi :10.1128/mcb.12.12.5508. PMC  360488. PMID  1448082 .
• Wilson AC, Peterson MG, Herr W (октябрь 1995 г.). «Повтор HCF — необычный сигнал протеолитического расщепления». Genes & Development . 9 (20): 2445–58. doi : 10.1101/gad.9.20.2445 . PMID  7590226.
• Klemm RD, Goodrich JA, Zhou S, Tjian R (июнь 1995 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия субъединицы 32-кДа человеческого TFIID выявляет взаимодействия с VP16 и TFIIB, которые опосредуют активацию транскрипции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (13): 5788–92. Bibcode : 1995PNAS...92.5788K. doi : 10.1073/pnas.92.13.5788 . PMC  41586. PMID  7597030 .
• Фраттини А., Фаранда С., Редольфи Э., Зукки И., Вилла А, Патроссо М.С., Стрина Д., Сусани Л., Веццони П. (сентябрь 1994 г.). «Геномная организация вспомогательного белка VP16 человека, гена домашнего хозяйства (HCFC1), картируемого Xq28». Геномика . 23 (1): 30–5. дои : 10.1006/geno.1994.1455. ПМИД  7829097.
• Kristie TM, Pomerantz JL, Twomey TC, Parent SA, Sharp PA (март 1995). «Клеточный фактор C1 комплекса усилителя вируса простого герпеса представляет собой семейство полипептидов». Журнал биологической химии . 270 (9): 4387–94. doi : 10.1074/jbc.270.9.4387 . PMID  7876203.
• Kristie TM, Sharp PA (март 1993). "Очистка клеточного фактора C1, необходимого для стабильного распознавания гомеодомена Oct-1 фактором альфа-транс-индукции вируса простого герпеса (VP16)". Журнал биологической химии . 268 (9): 6525–34. doi : 10.1016/S0021-9258(18)53282-8 . PMID  8454622.
• Zoppè M, Frattini A, Faranda S, Vezzoni P (май 1996 г.). «Полная последовательность гена фактора клетки-хозяина 1 (HCFC1) и его промотора: роль фактора транскрипции YY1 в регуляции его экспрессии». Genomics . 34 (1): 85–91. doi :10.1006/geno.1996.0244. PMID  8661027.
• Wilson AC, Freiman RN, Goto H, Nishimoto T, Herr W (октябрь 1997 г.). «VP16 нацелен на аминоконцевой домен HCF, участвующий в прогрессии клеточного цикла». Молекулярная и клеточная биология . 17 (10): 6139–46. doi :10.1128/mcb.17.10.6139. PMC 232464.  PMID 9315674  .
• Freiman RN, Herr W (декабрь 1997 г.). «Вирусная мимикрия: общий способ ассоциации с HCF VP16 и клеточным белком LZIP». Genes & Development . 11 (23): 3122–7. doi :10.1101/gad.11.23.3122. PMC  316754 . PMID  9389645.
• Lu R, Yang P, Padmakumar S, Misra V (август 1998 г.). «Трансактиватор вируса герпеса VP16 имитирует белок человеческой основной доменной лейциновой молнии, luman, при его взаимодействии с HCF». Журнал вирусологии . 72 (8): 6291–7. doi :10.1128/JVI.72.8.6291-6297.1998. PMC 109766.  PMID 9658067  .
• Ge H, Si Y, Roeder RG (ноябрь 1998 г.). «Выделение кДНК, кодирующих новые коактиваторы транскрипции p52 и p75, раскрывает альтернативный регуляторный механизм активации транскрипции». The EMBO Journal . 17 (22): 6723–9. doi :10.1093/emboj/17.22.6723. PMC  1171017 . PMID  9822615.
• La Boissière S, Hughes T, O'Hare P (январь 1999). "HCF-зависимый ядерный импорт VP16". The EMBO Journal . 18 (2): 480–9. doi :10.1093/emboj/18.2.480. PMC  1171141. PMID  9889203 .
• Лу Р., Мисра В. (январь 2000 г.). «Потенциальная роль люмана, клеточного гомолога вируса простого герпеса VP16 (фактор трансиндуцирования альфа-гена), в латентной стадии вируса герпеса». Журнал вирусологии . 74 (2): 934–43. doi : 10.1128/JVI.74.2.934-943.2000. ПМЦ  111614 . ПМИД  10623756.
• Mahajan SS, Wilson AC (февраль 2000 г.). «Мутации в факторе клетки-хозяина 1 разделяют его роль в пролиферации клеток от привлечения VP16 и LZIP». Молекулярная и клеточная биология . 20 (3): 919–28. doi : 10.1128 /MCB.20.3.919-928.2000. PMC  85209. PMID  10629049.
• Ajuh PM, Browne GJ, Hawkes NA, Cohen PT, Roberts SG, Lamond AI (февраль 2000 г.). «Связь активности протеинфосфатазы 1 с комплексом человеческого фактора C1 (HCF)». Nucleic Acids Research . 28 (3): 678–86. doi :10.1093/nar/28.3.678. PMC  102561. PMID  10637318 .
• Vogel JL, Kristie TM (февраль 2000 г.). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции GABP». The EMBO Journal . 19 (4): 683–90. doi :10.1093/emboj/19.4.683. PMC  305606 . PMID  10675337.
• Scarr RB, Smith MR, Beddall M, Sharp PA (май 2000 г.). «Новый 50-килодальтонный фрагмент фактора клетки-хозяина 1 (C1) в клетках G(0)». Молекулярная и клеточная биология . 20 (10): 3568–75. doi :10.1128/MCB.20.10.3568-3575.2000. PMC  85649. PMID  10779346 .
• Choi Y, Asada S, Uesugi M (май 2000 г.). «Расходящиеся мотивы связывания hTAFII31, скрытые в доменах активации». Журнал биологической химии . 275 (21): 15912–6. doi : 10.1074/jbc.275.21.15912 . PMID  10821850.
• Lu R, Misra V (июнь 2000 г.). «Zhangfei: второй клеточный белок взаимодействует с фактором HCF вируса простого герпеса способом, аналогичным Luman и VP16». Nucleic Acids Research . 28 (12): 2446–54. doi :10.1093/nar/28.12.2446. PMC  102720 . PMID  10871379.