Генеральная Ассамблея Пресвитерианской Церкви Ирландии является суверенным и высшим судом Пресвитерианской Церкви Ирландии и, таким образом, руководящим органом Церкви. Генеральная Ассамблея обычно собирается ежегодно, в течение первой полной недели июня.
Как и другие пресвитерианские церкви, пресвитерианская церковь в Ирландии управляется судами старейшин. То есть она управляется пресвитерианским политизмом . Внизу иерархии судов находится Kirk Session , суд отдельных местных церквей; представители нескольких Kirk Sessions образуют Presbytery , местный суд. Как и во многих других пресвитерианских церквях, Синод, или региональный уровень, теперь исключен. Синод имел власть над группой пресвитерий. На уровне острова Ирландия Генеральная Ассамблея стоит на вершине этой структуры.
Каждый служитель является членом, и каждая община посылает одного мирянина-старейшину. Женские и молодежные организации, диакониссы и сестринские церкви также имеют право посылать делегатов, что дает общее количество членов около 1300.
Заседающая Ассамблея сначала назначает нового модератора пресвитерианской церкви в Ирландии , который выступает в качестве председательствующего должностного лица на оставшуюся часть сессии. После того, как Ассамблея поднимается в конце недели, модератор проводит большую часть оставшейся части года в качестве ее посла.