TACK — это группа архей , ее название является аббревиатурой от Thaumarchaeota (ныне Nitrososphaerota ), Aigarchaeota , Crenarchaeota (ныне Thermoproteota ) и Korarchaeota — первых обнаруженных групп. Они встречаются в различных средах от ацидофильных термофилов до мезофилов и психрофилов и имеют разные типы метаболизма , преимущественно анаэробный и хемосинтетический. [4] ТЭК — это клада , являющаяся сестрой ветви Асгарда , давшей начало эукариотам . Было предложено классифицировать кладу TACK как Crenarchaeota , а традиционную «Crenarchaeota» (Thermoproteota) классифицировать как класс под названием «Sulfolobia» вместе с другими типами с классовым рангом или порядком. [5] После включения категории королевства в ICNP предложенное название этой группы — Королевство Термопротеати Гай и Эттема 2024 . [6]
Классификация
Термопротеота (ранее Crenarchaeota). Это самый известный край и самая многочисленная архея в морской экосистеме. Раньше их называли сульфобактериями из-за их зависимости от серы и они важны как фиксаторы углерода. Гипертермофилы встречаются в гидротермальных источниках, а другие группы наиболее многочисленны на глубинах менее 100 м.
« Айгархеота ». Это тип, предложенный на основе генома вида-кандидата Caldiarchaeum subterraneum, найденного глубоко в золотом руднике в Японии . Геномные последовательности этой группы также были обнаружены в геотермальных средах, как наземных, так и морских.
« Геоархеота ». К нему относятся термофильные организмы, обитающие в кислой среде, восстанавливающие трехвалентное железо. В качестве альтернативы было высказано предположение, что эта и более ранние группы на самом деле принадлежат типу Nitrososphaerota.
Нитрозосфаэрота (ранее Таумархеота). К нему относятся мезофильные или психрофильные организмы (средние и низкие температуры), обладающие аммиачно-окислительным хемолитоавтотрофным метаболизмом (нитрифицирующие) и способные играть важную роль в биохимических циклах, таких как циклы азота и углерода.
« Батиархеота ». Его много в отложениях морского дна с недостатком питательных веществ. По крайней мере, некоторые линии развиваются посредством гомоацетогенеза, типа метаболизма, который до сих пор считался уникальным для бактерий.
« Корархеота ». Они были обнаружены только в гидротермальных условиях и в низкой численности. Они кажутся разнообразными на разных филогенетических уровнях в зависимости от температуры, солености (пресная или морская вода) и географического положения.
Одним из доказательств, подтверждающих тесную связь между TACK и эукариотами, является наличие гомолога субъединицы РНК-полимеразы Rbp-8 у Thermoproteota, но не у Euryarchaea. [16]
^ Кастель, CJ; Банфилд, Дж. Ф. (2018). «Основные новые группы микробов расширяют разнообразие и меняют наше понимание древа жизни». Клетка . 172 (6): 1181–1197. дои : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . ПМИД 29522741.
^ Лейк, Дж.А.; Хендерсон, Э.; Оукс, М. (Кларк, М.В.) (1984). «Эоциты: новая структура рибосом указывает на царство, имеющее близкое родство с эукариотами». ПНАС . 81 (12): 3786–3790. Бибкод : 1984PNAS...81.3786L. дои : 10.1073/pnas.81.12.3786 . ПМК 345305 . ПМИД 6587394.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Лейк, JA (2015). «Эукариотическое происхождение». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 370 (1678): 20140321. doi :10.1098/rstb.2014.0321. ПМЦ 4571561 . ПМИД 26323753.
^ Гай, Лайонел; Эттема, Тейс Дж.Г. (2011). «Архейный супертип TACK и происхождение эукариот». Тенденции в микробиологии . 19 (12): 580–587. дои : 10.1016/j.tim.2011.09.002. ПМИД 22018741.
^ Гёкер, Маркус; Орен, Аарон (22 января 2024 г.). «Действительная публикация названий двух доменов и семи царств прокариот». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 74 (1). дои : 10.1099/ijsem.0.006242. ISSN 1466-5026. ПМИД 38252124.
^ Маккей, Л.Дж., Длакич, М., Филдс, М.В. и др. У корархеот обнаружена совместная геномная способность к анаэробному метаболизму метана и диссимиляционному метаболизму серы. Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4