Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens
Белок 4, связывающий хромодомен-геликазу-ДНК, представляет собой фермент , который у человека кодируется геном CHD4 . [5] [6] [7] CHD4 является основным компонентом ремоделирования нуклеосомы комплекса ремоделирования нуклеосом и деацетилазы ( NuRD ). [8] [9] [10]
Функция
Продукт этого гена принадлежит к семейству геликаз SNF2/RAD54. Он представляет собой основной компонент комплекса ремоделирования нуклеосом и деацетилазы и играет важную роль в эпигенетической репрессии транскрипции. У пациентов с дерматомиозитом вырабатываются антитела против этого белка. [7]
Взаимодействия
Было показано, что CHD4 взаимодействует с HDAC1 , [11] [12] [13] деацетилазой гистонов 2 , [13] [14] [15] MTA2 , [11] SATB1 [16] и атаксией телеангиэктазии и связанными с Rad3 . [15]
Клинический
Мутации в этом гене связаны с состоянием, известным как синдром Сифрима-Хитца-Вейсса. [17] Это состояние характеризуется
Рекомендации
- ^ abc GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000111642 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063870 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Зеелиг Х.П., Моосбругер I, Эрфельд Х., Финк Т., Ренц М., Гент Э. (октябрь 1995 г.). «Основной специфичный для дерматомиозита аутоантиген Ми-2 представляет собой предполагаемую хеликазу, участвующую в активации транскрипции». Артрит и ревматизм . 38 (10): 1389–1399. дои :10.1002/арт.1780381006. ПМИД 7575689.
- ^ Зеелиг Х.П., Ренц М., Таргофф И.Н., Ге К., Фрэнк М.Б. (октябрь 1996 г.). «Две формы основного антигенного белка специфичного для дерматомиозита аутоантигена Ми-2». Артрит и ревматизм . 39 (10): 1769–1771. дои :10.1002/арт.1780391029. ПМИД 8843877.
- ^ ab «Ген Entrez: ДНК-связывающий белок 4 хромодомен-хеликазы CHD4» .
- ^ Тонг Дж.К., Хассиг Калифорния, Шницлер Г.Р., Кингстон Р.Э., Шрайбер С.Л. (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина с помощью АТФ-зависимого комплекса ремоделирования нуклеосом». Природа . 395 (6705): 917–921. Бибкод : 1998Natur.395..917T. дои : 10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
- ^ Сюэ Ю, Вонг Дж, Морено Г.Т., Янг МК, Коте Дж, Ван В (декабрь 1998 г.). «NURD, новый комплекс, обладающий как АТФ-зависимой ремоделированием хроматина, так и активностью гистондеацетилазы». Молекулярная клетка . 2 (6): 851–861. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80299-3 . ПМИД 9885572.
- ^ Чжан Ю., Лерой Г., Силиг Х.П., Лейн В.С., Рейнберг Д. (октябрь 1998 г.). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего деацетилазу гистонов и активность ремоделирования нуклеосом». Клетка . 95 (2): 279–289. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . ПМИД 9790534.
- ^ Аб Яо YL, Ян WM (октябрь 2003 г.). «Связанные с метастазами белки 1 и 2 образуют отдельные белковые комплексы с активностью деацетилазы гистонов». Журнал биологической химии . 278 (43): 42560–42568. дои : 10.1074/jbc.M302955200 . ПМИД 12920132.
- ^ Грозингер CM, Хассиг CA, Шрайбер С.Л. (апрель 1999 г.). «Три белка определяют класс деацетилаз гистонов человека, родственных дрожжевым Hda1p». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (9): 4868–4873. Бибкод : 1999PNAS...96.4868G. дои : 10.1073/pnas.96.9.4868 . ПМК 21783 . ПМИД 10220385.
- ^ Аб Тонг Дж. К., Хассиг К. А., Шницлер Г. Р., Кингстон Р. Е., Шрайбер С. Л. (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина с помощью АТФ-зависимого комплекса ремоделирования нуклеосом». Природа . 395 (6705): 917–921. Бибкод : 1998Natur.395..917T. дои : 10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
- ^ Хакими М.А., Донг Ю., Лейн В.С., Спайчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидатный X-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–7239. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763.
- ^ аб Шмидт Д.Р., Шрайбер С.Л. (ноябрь 1999 г.). «Молекулярная связь между ATR и двумя компонентами комплекса ремоделирования и деацетилирования нуклеосом, HDAC2 и CHD4». Биохимия . 38 (44): 14711–14717. CiteSeerX 10.1.1.559.7745 . дои : 10.1021/bi991614n. ПМИД 10545197.
- ^ Ясуи Д., Мияно М., Цай С., Варга-Вайс П., Кохви-Сигемацу Т. (октябрь 2002 г.). «SATB1 нацелен на ремоделирование хроматина, чтобы регулировать работу генов на больших расстояниях». Природа . 419 (6907): 641–645. Бибкод : 2002Natur.419..641Y. дои : 10.1038/nature01084. PMID 12374985. S2CID 25822700.
- ^ Вайс К., Лазар Х.П., Куролап А., Мартинес А.Ф., Паперна Т., Коэн Л., Смеланд М.Ф., Валлен С., Сольвейг Х., Керен Б., Терхал П., Ирвинг М., Такаку М., Робертс Дж.Д., Петрович Р.М., Шриер Вергано SA11, 12, Кенни А11, Хоув H13, ДеШен Е, Хинонес СК, Колин Е, Зиглер А, Румпель М, Джейн М, Монтейл Д, Редер ЭР, Ньюджент К, ван Херинген А, Гамбелло М, Сантани А, Медне Л, Крок Б , Скрабан СМ, Закай Э.Х., Даббс Х.А., Смол Т., Гумид Дж., Паркер М., Райт М., Тернпенни П., Клейтон-Смит Дж., Меткалф К., Курумизака Х., Гелб Б.Д., Барис Фельдман Х., Кампо PM34, Мюнке М5, Уэйд П.А., Лахлан К. (2019)Синдром, связанный с CHD4: всестороннее исследование клинического спектра, корреляций генотип-фенотип и молекулярной основы. Генет Мед
Внешние ссылки
дальнейшее чтение
- Денслоу С.А., Уэйд П.А. (август 2007 г.). «Комплекс Mi-2/NuRD человека и регуляция генов». Онкоген . 26 (37): 5433–5438. дои : 10.1038/sj.onc.1210611. PMID 17694084. S2CID 26445975.
- Ге К., Ниласена Д.С., О'Брайен К.А., Фрэнк М.Б., Таргофф И.Н. (октябрь 1995 г.). «Молекулярный анализ основной антигенной области белка массой 240 кДа аутоантигена Ми-2». Журнал клинических исследований . 96 (4): 1730–1737. дои : 10.1172/JCI118218. ПМК 185809 . ПМИД 7560064.
- Вудэдж Т., Басрай М.А., Баксеванис А.Д., Хитер П., Коллинз Ф.С. (октябрь 1997 г.). «Характеристика белков семейства CHD». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (21): 11472–11477. Бибкод : 1997PNAS...9411472W. дои : 10.1073/pnas.94.21.11472 . ПМК 23509 . ПМИД 9326634.
- Чжан Ю., Лерой Дж., Силиг Х.П., Лейн В.С., Рейнберг Д. (октябрь 1998 г.). «Специфический для дерматомиозита аутоантиген Mi2 является компонентом комплекса, содержащего деацетилазу гистонов и активность ремоделирования нуклеосом». Клетка . 95 (2): 279–289. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID 9790534. S2CID 18786866.
- Тонг Дж.К., Хассиг К.А., Шницлер Г.Р., Кингстон Р.Э., Шрайбер С.Л. (октябрь 1998 г.). «Деацетилирование хроматина с помощью АТФ-зависимого комплекса ремоделирования нуклеосом». Природа . 395 (6705): 917–921. Бибкод : 1998Natur.395..917T. дои : 10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
- Чжан Ю, Нг Х.Х., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Бёрд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD обнаруживает основной комплекс деацетилазы гистонов и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие . 13 (15): 1924–1935. дои :10.1101/гад.15.13.1924. ПМК 316920 . ПМИД 10444591.
- Шмидт Д.Р., Шрайбер С.Л. (ноябрь 1999 г.). «Молекулярная связь между ATR и двумя компонентами комплекса ремоделирования и деацетилирования нуклеосом, HDAC2 и CHD4». Биохимия . 38 (44): 14711–14717. CiteSeerX 10.1.1.559.7745 . дои : 10.1021/bi991614n. ПМИД 10545197.
- Хамфри Г.В., Ван Ю., Руссанова В.Р., Хираи Т., Цинь Дж., Накатани Ю., Ховард Б.Х. (март 2001 г.). «Стабильные комплексы гистондеацетилазы, отличающиеся наличием белков домена SANT CoREST/kiaa0071 и Mta-L1». Журнал биологической химии . 276 (9): 6817–6824. дои : 10.1074/jbc.M007372200 . ПМИД 11102443.
- Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х. и др. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Современная биология . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
- Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). «Молекулярное вскрытие схемы подавления Икароса». Журнал биологической химии . 277 (31): 27697–27705. дои : 10.1074/jbc.M201694200 . ПМИД 12015313.
- Сайто М., Исикава Ф. (сентябрь 2002 г.). «Домен mCpG-связывания человеческого MBD3 не связывается с mCpG, но взаимодействует с компонентами NuRD/Mi2 HDAC1 и MTA2». Журнал биологической химии . 277 (38): 35434–35439. дои : 10.1074/jbc.M203455200 . ПМИД 12124384.
- Хакими М.А., Донг Ю., Лейн В.С., Спейчер Д.В., Шихаттар Р. (февраль 2003 г.). «Кандидатный X-сцепленный ген умственной отсталости является компонентом нового семейства комплексов, содержащих гистондеацетилазу». Журнал биологической химии . 278 (9): 7234–7239. дои : 10.1074/jbc.M208992200 . ПМИД 12493763.
- Кван А.Х., Гелл Д.А., Вергер А., Кроссли М., Мэтьюз Дж.М., Маккей Дж.П. (июль 2003 г.). «Создание белкового каркаса из пальца доктора философии». Состав . 11 (7): 803–813. дои : 10.1016/S0969-2126(03)00122-9 . ПМИД 12842043.
- Симоно Ю., Мураками Х., Каваи К., Уэйд П.А., Симоката К., Такахаши М. (декабрь 2003 г.). «Ми-2 бета ассоциируется с белком пальца BRG1 и RET в отдельных областях, обладающих способностью активировать и подавлять транскрипцию». Журнал биологической химии . 278 (51): 51638–51645. дои : 10.1074/jbc.M309198200 . ПМИД 14530259.
- Уильямс С.Дж., Найто Т., Арко П.Г., Сивитт Дж.Р., Кэшман С.М., Де Соуза Б. и др. (июнь 2004 г.). «Ремоделер хроматина Mi-2beta необходим для экспрессии CD4 и развития Т-клеток». Иммунитет . 20 (6): 719–733. doi : 10.1016/j.immuni.2004.05.005 . ПМИД 15189737.
- Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Геномные исследования . 14 (7): 1315–1323. дои :10.1101/гр.2122004. ПМК 442147 . ПМИД 15231747.