stringtranslate.com

Дансил хлорид

Дансилхлорид или 5-(диметиламино)нафталин-1-сульфонилхлорид — это реагент, который реагирует с первичными аминогруппами как в алифатических, так и в ароматических аминах, образуя стабильные сине- или сине-зеленые флуоресцентные сульфонамидные аддукты. Его также можно заставить реагировать со вторичными аминами. Дансилхлорид широко используется для модификации аминокислот; в частности, для секвенирования белков и аминокислотного анализа. [2] [3] Дансилхлорид также может обозначаться как DNSC . Аналогично, похожее производное, дансиламид , известно как DNSA.

Кроме того, эти конъюгаты белок-ДНКС чувствительны к своему непосредственному окружению. Это, в сочетании с их способностью принимать энергию (как при флуоресцентном резонансном переносе энергии ) от аминокислоты триптофана , позволяет использовать эту технику маркировки для исследования сворачивания и динамики белка.

Флуоресценцию этих сульфонамидных аддуктов можно усилить путем добавления альфа-циклодекстрина . [4] Дансилхлорид нестабилен в диметилсульфоксиде , который никогда не следует использовать для приготовления растворов реагента. [5]

Коэффициент экстинкции производных дансила важен для измерения их концентрации в растворе. Дансилхлорид является одним из простейших производных сульфонамида, поэтому он обычно служит исходным реагентом для получения других производных. Экзотические производные могут иметь очень разные коэффициенты экстинкции, но другие, такие как дансиламид , похожи на дансилхлорид по абсорбционным и флуоресцентным характеристикам. Но даже для дансилхлорида существует множество значений коэффициента экстинкции, о которых сообщалось. Некоторые из значений используются для оценки степени успешности попыток конъюгации красителя с белком. Другие значения могут использоваться для определения точной концентрации исходного раствора. Конкретные значения и их применение см. в таблице ниже.

Для всех исследований ниже значение поглощения всегда берется в максимуме , который появляется между 310 нм и 350 нм. Пик широкий, поэтому измерение не очень чувствительно к раскалибровке длины волны спектрофотометра, и ошибки из-за раскалибровки можно избежать, взяв значение в максимуме вместо строгого использования 330 нм.

Подготовка

Это соединение может быть получено путем реакции соответствующей сульфоновой кислоты с избытком оксихлорида фосфора (POCl 3 ) при комнатной температуре. [10]

Ссылки

  1. ^ "MSDS". Sigma-Aldrich . Архивировано из оригинала 2007-12-27 . Получено 2007-12-02 .
  2. ^ Walker JM (1994). "Метод Дансила для идентификации N-концевых аминокислот". Basic Protein and Peptide Protocols . Methods Mol. Biol. Vol. 32. pp. 321–8. doi :10.1385/0-89603-268-X:321. ISBN 0-89603-268-X. PMID  7951732.
  3. ^ Walker JM (1994). "Метод Дэнсила-Эдмана для секвенирования пептидов". Basic Protein and Peptide Protocols . Methods Mol. Biol. Vol. 32. pp. 329–34. doi :10.1385/0-89603-268-X:329. ISBN 0-89603-268-X. PMID  7951733.
  4. ^ Киносита Т., Иинума Ф., Цудзи А. (1974). «Микроанализ белков и пептидов. I. Усиление интенсивности флуоресценции дансиловых аминокислот и дансиловых белков в водных средах и его применение для анализа аминокислот и белков». Chem. Pharm. Bull . 22 (10): 2413–20. doi : 10.1248/cpb.22.2413 . PMID  4468087.
  5. ^ Boyle, RE (1966). «Реакция диметилсульфоксида и 5-диметиламинонафталин-1-сульфонилхлорида». Журнал органической химии . 31 (11): 3880–3882. doi :10.1021/jo01349a529.
  6. ^ Hartley, BS; V Massey (1956). «Активный центр химотрипсина: 1. Маркировка флуоресцентным красителем». Biochimica et Biophysica Acta . 21 (1): 58–70. doi :10.1016/0006-3002(56)90093-2. PMID  13363860.
  7. ^ Чен, РФ (1968). «Дансилмеченые белки». Аналитическая биохимия . 25 (1): 412–416. doi :10.1016/0003-2697(68)90116-4. PMID  5704757.
  8. ^ ab Вебер, Г. (1952). «Поляризованная флуоресценция белковых конъюгатов». Biochemical Journal . 51 (2): 145–155. doi :10.1042/bj0510145. PMC 1197814. PMID  14944566 . 
  9. ^ "Справочник по молекулярным зондам: кумарины, пирены и другие возбуждаемые ультрафиолетовым светом флуорофоры (раздел 1.7)" . Получено 12 июня 2009 г. .
  10. ^ Артур Мендель (1970). «Улучшенное приготовление 5-диметиламино-1-нафталинсульфонилхлорида». J. Chem. Eng. Data . 15 (2): 340–341. doi :10.1021/je60045a010.