stringtranslate.com

Джеффри Чанг

Джеффри Чанг — профессор Школы фармацевтики и фармацевтических наук Скаггса Калифорнийского университета в Сан-Диего и кафедры фармакологии Медицинской школы. Его лаборатория занимается структурной биологией интегральных мембранных белков , в частности, изучает методы рентгеновской кристаллографии для определения третичных структур мембранных белков, которые, как известно, устойчивы к кристаллизации . Лаборатория специализируется на структурах белков-транспортеров множественной лекарственной устойчивости у бактерий . В 2001 году, будучи преподавателем Научно-исследовательского института Скриппса , Чанг был награжден премией Бекмана для молодых исследователей [1] , призванной поддерживать исследователей на ранних этапах их академической карьеры, за его работу по структурной биологии множественной лекарственной устойчивости. [2] Чанг объявил о переходе из Скриппса в соседний Калифорнийский университет в Сан-Диего в 2012 году. [3]

В 2007 году Чанг и соавторы отозвали пять ранее опубликованных статей, описывающих структуры трех белков-транспортеров множественных лекарственных средств, после того, как другая исследовательская группа опубликовала совершенно иную структуру, что привело к обнаружению критической ошибки в специальных программных инструментах группы Чанга. [4] Однако с тех пор Чанг опубликовал другие статьи в области структурной биологии, [5] [6] и получил грант EUREKA от Национальных институтов здравоохранения «за исключительно инновационные исследовательские проекты, которые могут оказать чрезвычайно значительное влияние на многие области науки». [7]

Отозванные статьи

Чанг и соавторы опубликовали статьи о структурах транспортеров множественной лекарственной устойчивости, известных как EmrE и MsbA. Хотя первоначальные структуры широко считались загадочными в этой области из-за их неожиданного размещения их сайтов связывания АТФ в собранном димере , [8] публикация дополнительной структуры в том же семействе белков показала, что структуры Чанга вряд ли представляют биологически активную конформацию молекул. [9] Чанг и соавторы выпустили ретракции своих структурных статей по EmrE и MsbA, сославшись на ошибку во внутренней программной утилите как на источник неверной интерпретации данных, которая привела к появлению неправильно собранных димеров. [4] [10] Применение популярного инструмента проверки структуры белка к одной из отозванных структур MsbA приводит к оценкам, которые указывают на серьезные ошибки в этой структуре. [11]

Следующие статьи были отозваны в 2007 году: [10] [12]

Этот эпизод упоминался как в научных [13] , так и в популярных СМИ [14] как пример, мотивирующий к совершенствованию методов разработки программного обеспечения в вычислительной биологии .

Недавние работы

В 2009 году Чанг опубликовал статью в журнале Science [ 5], в которой описал белок, который удерживает определенные вещества, включая многие лекарства, вне клеток. Этот белок, называемый P-гликопротеином или сокращенно P-gp, является одной из главных причин устойчивости раковых клеток к химиотерапевтическим препаратам. [15] В 2010 году он возглавил исследование, опубликованное в журнале Nature, в котором подробно описывалась структура транспортера семейства MATE ( Multi antimicrobial extrusion protein ) NorM, который принадлежит к единственному оставшемуся классу транспортеров с множественной лекарственной устойчивостью, который еще предстоит описать ученым. [6] Эта работа имеет значение для борьбы с опасными штаммами бактерий, устойчивыми к антибиотикам, а также для разработки устойчивых штаммов сельскохозяйственных культур. [16]

Ссылки

  1. ^ "Джеффри Чанг". Фонд Арнольда и Мейбл Бекман . Получено 1 августа 2018 г.
  2. ^ Новости и мнения Института исследований Скриппса. In Brief 1(9): 2 апреля 2001 г. Дата доступа 17 января 2001 г.
  3. ↑ Роббинс, Гэри (9 октября 2012 г.). «Scripps Research теряет пятого талантливого ученого». San Diego Union-Tribune . Получено 10 февраля 2015 г.
  4. ^ ab Miller, G (2006). «Научные публикации. Кошмар ученого: проблема с программным обеспечением приводит к пяти отзывам». Science . 314 (5807): 1856–7. doi : 10.1126/science.314.5807.1856 . PMID  17185570. S2CID  34054520.
  5. ^ ab Aller, S.; et al. (2009). «Структура P-гликопротеина раскрывает молекулярную основу для полиспецифического связывания лекарств». Science . 323 (5922): 1718–1722. Bibcode :2009Sci...323.1718A. doi :10.1126/science.1168750. PMC 2720052 . PMID  19325113. 
  6. ^ ab He et al., «Структура катион-связанного транспортера экструзии множественных лекарственных средств и токсичных соединений», http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature09408.html
  7. ^ Исследовательский институт Скриппса Джеффри Чанг выигрывает премию EUREKA http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20100920/etc.html
  8. ^ Хиггинс, CF; Линтон, KJ (2001). «Структурная биология. Xyz транспортеров ABC». Science . 293 (5536): 1782–4. doi :10.1126/science.1065588. PMID  11546861. S2CID  83363016.
  9. ^ Доусон, Р. Дж.; Лохер, К. П. (2006). «Структура бактериального многокомпонентного транспортера ABC». Nature . 443 (7108): 180–5. Bibcode :2006Natur.443..180D. doi :10.1038/nature05155. PMID  16943773. S2CID  27132450.
  10. ^ ab Chang, G; Roth, CB; Reyes, CL; Pornillos, O; Chen, YJ; Chen, AP (2006). "Retraction". Science . 314 (5807): 1875. doi :10.1126/science.314.5807.1875b. PMID  17185584. S2CID  220093343.
  11. ^ Видерштейн, М; Сиппл, МДж (2007). «ProSA-web: интерактивный веб-сервис для распознавания ошибок в трехмерных структурах белков». Nucleic Acids Res . 35 (выпуск веб-сервера): W407–10. doi :10.1093/nar/gkm290. PMC 1933241. PMID  17517781 . 
  12. ^ Гаврилевский А. (2006). Опровержения расстраивают структурную биографию: Недавние открытия переворачивают выводы из пяти высокоцитируемых статей The Scientist 4 января 2007 г. Дата бесплатного доступа к полному тексту 17 января 2007 г.
  13. ^ Перкель, Джеффри М. (29 июня 2011 г.). «Кодирование вашего пути выхода из проблемы». Nature Methods . 8 (7): 541–543. doi : 10.1038/nmeth.1631 . PMID  21716280. S2CID  13175560.
  14. ↑ Tenner, Edward (7 декабря 2012 г.). «Ошибочное программное обеспечение: ахиллесова пята науки, основанной на больших данных?». The Atlantic . Получено 10 февраля 2015 г.
  15. ^ Ученые обнаружили структуру белка, который делает раковые клетки устойчивыми к химиотерапии http://www.scripps.edu/newsandviews/e_20090330/chang.html
  16. ^ Научно-исследовательский институт Скриппса http://www.scripps.edu/news/press/20100922 Архивировано 28 сентября 2010 г. на Wayback Machine

Внешние ссылки