stringtranslate.com

рентгеновская кристаллография

Порошковый рентгеновский дифрактометр в движении

Рентгеновская кристаллография — это экспериментальная наука об определении атомной и молекулярной структуры кристалла , в которой кристаллическая структура заставляет пучок падающих рентгеновских лучей дифрагировать в определенных направлениях. Измеряя углы и интенсивности дифракции рентгеновских лучей , кристаллограф может получить трехмерную картину плотности электронов внутри кристалла и положения атомов, а также их химических связей , кристаллографического беспорядка и другой информации.

Рентгеновская кристаллография сыграла основополагающую роль в развитии многих научных областей. В первые десятилетия своего использования этот метод определял размер атомов, длину и тип химических связей, а также различия в атомном масштабе между различными материалами, особенно минералами и сплавами . Метод также выявил структуру и функцию многих биологических молекул, включая витамины , лекарства, белки и нуклеиновые кислоты, такие как ДНК . Рентгеновская кристаллография по-прежнему является основным методом для характеристики атомной структуры материалов и дифференциации материалов, которые кажутся похожими в других экспериментах. Рентгеновские кристаллические структуры также могут помочь объяснить необычные электронные или упругие свойства материала, пролить свет на химические взаимодействия и процессы или служить основой для разработки фармацевтических препаратов против болезней .

Современная работа включает в себя ряд этапов, каждый из которых важен. Предварительные этапы включают подготовку образцов хорошего качества, тщательную регистрацию дифрагированных интенсивностей и обработку данных для удаления артефактов. Затем для получения оценки атомной структуры используются различные методы, которые в общем называются прямыми методами. После первоначальной оценки для завершения структуры используются дальнейшие вычислительные методы, такие как те, которые включают карты разностей. Заключительный этап — численное уточнение атомных позиций по сравнению с экспериментальными данными, иногда с помощью вычислений ab-initio . Почти во всех случаях новые структуры размещаются в базах данных, доступных международному сообществу.

История

Кристаллы, хотя и долгое время восхищались своей регулярностью и симметрией, не были исследованы с научной точки зрения до 17 века. Иоганн Кеплер в своей работе Strena seu de Nive Sexangula (Новогодний подарок в виде шестиугольного снега) (1611) выдвинул гипотезу, что гексагональная симметрия кристаллов снежинок обусловлена ​​регулярной упаковкой сферических частиц воды. [1] Датский ученый Николас Стено (1669) был пионером экспериментальных исследований симметрии кристаллов. Стено показал, что углы между гранями одинаковы в каждом образце определенного типа кристалла. [2] Рене Жюст Гаюи (1784) обнаружил, что каждая грань кристалла может быть описана простыми схемами укладки блоков одинаковой формы и размера. Таким образом, Уильям Хэллоус Миллер в 1839 году смог дать каждой грани уникальную метку из трех небольших целых чисел, индексов Миллера , которые до сих пор используются для идентификации граней кристаллов. Исследование Гаюи привело к идее, что кристаллы представляют собой регулярный трехмерный массив ( решетку Браве ) атомов и молекул ; отдельная элементарная ячейка повторяется бесконечно вдоль трех основных направлений. В 19 веке полный каталог возможных симметрий кристалла был разработан Иоганном Гесселем [3] , Огюстом Браве [4] , Евграфом Федоровым [5] , Артуром Шенфлисом [6] и (с опозданием) Уильямом Барлоу (1894). Барлоу предложил несколько кристаллических структур в 1880-х годах, которые были подтверждены позже рентгеновской кристаллографией; [7] однако, доступные данные были слишком скудны в 1880-х годах, чтобы принять его модели как окончательные.

Модель расположения молекул воды во льду, показывающая водородные связи (1), удерживающие твердое тело вместе.

Вильгельм Рентген открыл рентгеновские лучи в 1895 году. [8] Физики не были уверены в природе рентгеновских лучей, но подозревали, что они являются волнами электромагнитного излучения . Теория электромагнитного излучения Максвелла была хорошо принята, и эксперименты Чарльза Гловера Барклы показали, что рентгеновские лучи демонстрируют явления, связанные с электромагнитными волнами, включая поперечную поляризацию и спектральные линии, родственные тем, которые наблюдаются в видимых длинах волн. Баркла создал рентгеновскую нотацию для резких спектральных линий, отметив в 1909 году две отдельные энергии, сначала назвав их «A» и «B», а затем предположив, что могут быть линии до «A», он начал алфавитную нумерацию, начинающуюся с «K». [9] [10] Эксперименты с одной щелью в лаборатории Арнольда Зоммерфельда показали, что рентгеновские лучи имеют длину волны около 1 ангстрема . [11] Рентгеновские лучи — это не только волны, но и частицы, из-за чего Зоммерфельд придумал название «тормозное излучение» для непрерывных спектров, которые образовывались при бомбардировке материала электронами. [10] Альберт Эйнштейн ввел концепцию фотона в 1905 году, [12] но она не была широко принята до 1922 года, [13] [14] когда Артур Комптон подтвердил ее путем рассеяния рентгеновских лучей электронами. [15] Корпускулярные свойства рентгеновских лучей, такие как ионизация газов, побудили Уильяма Генри Брэгга в 1907 году утверждать, что рентгеновские лучи не являются электромагнитным излучением. [16] [17] [18] [19] Точка зрения Брэгга оказалась непопулярной, и наблюдение дифракции рентгеновских лучей Максом фон Лауэ в 1912 году [20] подтвердило, что рентгеновские лучи являются формой электромагнитного излучения.

Одна из рентгенограмм интерференции медного купороса, опубликованная в статье фон Лауэ 1912 года [20] .

Идея о том, что кристаллы можно использовать в качестве дифракционной решетки для рентгеновских лучей, возникла в 1912 году в беседе между Паулем Петером Эвальдом и Максом фон Лауэ в Английском саду в Мюнхене. Эвальд предложил резонаторную модель кристаллов для своей диссертации, но эта модель не могла быть проверена с использованием видимого света , поскольку длина волны была намного больше, чем расстояние между резонаторами. Фон Лауэ понял, что необходимо электромагнитное излучение с более короткой длиной волны, и предположил, что рентгеновские лучи могут иметь длину волны, сопоставимую с расстоянием между элементарными ячейками в кристаллах. Фон Лауэ работал с двумя техниками, Вальтером Фридрихом и его помощником Паулем Книппингом, чтобы просвечивать рентгеновским лучом через кристалл сульфата меди и регистрировать его дифракцию на фотографической пластине . После проявления пластина показала большое количество четко определенных пятен, расположенных в узоре пересекающихся кругов вокруг пятна, созданного центральным лучом. Результаты были представлены Баварской академии наук и гуманитарных наук в июне 1912 года под названием «Interferenz-Erscheinungen bei Röntgenstrahlen» (Явления интерференции в рентгеновских лучах). [20] [21] Фон Лауэ разработал закон, связывающий углы рассеяния, а также размер и ориентацию промежутков между элементарными ячейками в кристалле, за что в 1914 году он был удостоен Нобелевской премии по физике. [22]

Хотя алмазы (вверху слева) и графит (вверху справа) идентичны по химическому составу — оба являются чистым углеродом — рентгеновская кристаллография выявила расположение их атомов (внизу). В алмазе атомы углерода расположены тетраэдрически и удерживаются вместе одинарными ковалентными связями . Напротив, графит состоит из сложенных листов. Внутри листа связь ковалентная и имеет гексагональную симметрию, но между листами нет ковалентных связей.

После пионерских исследований фон Лауэ эта область быстро развивалась, в первую очередь физиками Уильямом Лоуренсом Брэггом и его отцом Уильямом Генри Брэггом . В 1912–1913 годах младший Брэгг разработал закон Брэгга , который связывает рассеяние с равномерно расположенными плоскостями внутри кристалла. [8] [23] [ 24] [25] Брэгги, отец и сын, разделили Нобелевскую премию по физике 1915 года за свою работу в области кристаллографии. Самые ранние структуры были, как правило, простыми; по мере того, как вычислительные и экспериментальные методы совершенствовались в течение следующих десятилетий, стало возможным выводить надежные атомные позиции для более сложных расположений атомов.

Самые ранние структуры были простыми неорганическими кристаллами и минералами, но даже они раскрыли фундаментальные законы физики и химии. Первой структурой с атомным разрешением, которая была «решена» (т. е. определена) в 1914 году, была структура поваренной соли . [26] [27] [28] Распределение электронов в структуре поваренной соли показало, что кристаллы не обязательно состоят из ковалентно связанных молекул, и доказало существование ионных соединений . [29] Структура алмаза была решена в том же году, [30] [31] доказав тетраэдрическое расположение его химических связей и показав, что длина одинарной связи C–C составляет около 1,52 ангстрем. Другие ранние структуры включали медь, [32] фторид кальция (CaF 2 , также известный как флюорит ), кальцит (CaCO 3 ) и пирит (FeS 2 ) [33] в 1914 году; шпинель (MgAl 2 O 4 ) в 1915 году; [34] [ 35] рутил и анатаз формы диоксида титана (TiO 2 ) в 1916 году; [36] пирохроит (Mn(OH) 2 ) и, как следствие, брусит (Mg(OH) 2 ) в 1919 году. [37] [38] Также в 1919 году нитрат натрия (NaNO 3 ) и дихлориодид цезия (CsICl 2 ) были определены Ральфом Уолтером Грейстоуном Вайкоффом , а структура вюрцита (гексагональная ZnS) была определена в 1920 году. [39]

Структура графита была решена в 1916 году [40] с помощью родственного метода порошковой дифракции , [41] который был разработан Питером Дебаем и Полом Шеррером и, независимо, Альбертом Халлом в 1917 году. [42] Структура графита была определена с помощью монокристаллической дифракции в 1924 году двумя группами независимо. [43] [44] Халл также использовал порошковый метод для определения структур различных металлов, таких как железо [45] и магний. [46]

Вклад в различных областях

Химия

Рентгеновская кристаллография привела к лучшему пониманию химических связей и нековалентных взаимодействий . Первоначальные исследования выявили типичные радиусы атомов и подтвердили многие теоретические модели химических связей, такие как тетраэдрическая связь углерода в структуре алмаза [30] , октаэдрическая связь металлов, наблюдаемая в гексахлороплатинате аммония (IV), [47] и резонанс, наблюдаемый в плоской карбонатной группе [33] и в ароматических молекулах. [48] Структура гексаметилбензола Кэтлин Лонсдейл 1928 года [49] установила гексагональную симметрию бензола и показала четкую разницу в длине связи между алифатическими связями C–C и ароматическими связями C–C; это открытие привело к идее резонанса между химическими связями, которая имела глубокие последствия для развития химии. [50] Ее выводы были предвосхищены Уильямом Генри Брэггом , который опубликовал модели нафталина и антрацена в 1921 году на основе других молекул, раннюю форму молекулярного замещения . [48] [51]

Первая структура органического соединения, гексаметилентетрамина , была решена в 1923 году. [52] За этим быстро последовало несколько исследований различных длинноцепочечных жирных кислот , которые являются важным компонентом биологических мембран . [53] [54] [55 ] [56] [57] [58] [59] [60] [61] В 1930-х годах начали решаться структуры гораздо более крупных молекул с двумерной сложностью. Значительным достижением стала структура фталоцианина , [62] большой плоской молекулы, которая тесно связана с молекулами порфиринов, важными в биологии, такими как гем , коррин и хлорофилл .

В 1920-х годах Виктор Мориц Гольдшмидт , а позднее Лайнус Полинг разработали правила исключения химически маловероятных структур и определения относительных размеров атомов. Эти правила привели к структуре брукита (1928) и пониманию относительной стабильности рутильной , брукитовой и анатазной форм диоксида титана .

Расстояние между двумя связанными атомами является чувствительной мерой прочности связи и ее порядка ; таким образом, рентгеновские кристаллографические исследования привели к открытию еще более экзотических типов связей в неорганической химии , таких как двойные связи металл-металл, [63] [64] [65] четверные связи металл-металл, [66] [67] [68] и трехцентровые двухэлектронные связи. [69] Рентгеновская кристаллография — или, строго говоря, эксперимент по неупругому комптоновскому рассеянию — также предоставила доказательства частично ковалентного характера водородных связей . [70] В области металлоорганической химии рентгеновская структура ферроцена инициировала научные исследования сэндвичевых соединений , [71] [72], в то время как структура соли Цейзе стимулировала исследования «обратной связи» и комплексов металл-пи. [73] [74] [75] [76] Наконец, рентгеновская кристаллография сыграла новаторскую роль в развитии супрамолекулярной химии , в частности, в прояснении структур краун -эфиров и принципов химии хозяин-гость . [ необходима ссылка ]

Материаловедение и минералогия

Первое рентгеновское дифракционное изображение марсианского грунта – анализ CheMin выявил полевой шпат , пироксены , оливин и многое другое ( марсоход Curiosity в « Рокнесте », 17 октября 2012 г.). [77]

Применение рентгеновской кристаллографии в минералогии началось со структуры граната , которая была определена в 1924 году Менцером. Систематическое рентгеновское кристаллографическое исследование силикатов было предпринято в 1920-х годах. Это исследование показало, что при изменении соотношения Si / O кристаллы силикатов демонстрируют значительные изменения в своих атомных расположениях. Махачки распространил эти идеи на минералы, в которых алюминий заменяет атомы кремния силикатов . Первое применение рентгеновской кристаллографии в металлургии также произошло в середине 1920-х годов. [78] [ 79] [80] [81] [82] [83] В частности, структура сплава Mg 2 Sn, разработанная Лайнусом Полингом [84], привела к его теории стабильности и структуры сложных ионных кристаллов. [85] Многие сложные неорганические и металлоорганические системы были проанализированы с использованием методов монокристаллов, таких как фуллерены , металлопорфирины и другие сложные соединения. Дифракция монокристаллов также используется в фармацевтической промышленности . Кембриджская структурная база данных содержит более 1 000 000 структур по состоянию на июнь 2019 года; большинство из этих структур были определены с помощью рентгеновской кристаллографии. [86]

17 октября 2012 года марсоход Curiosity на планете Марс в « Рокнесте » выполнил первый рентгеновский дифракционный анализ марсианского грунта . Результаты анализатора CheMin марсохода показали наличие нескольких минералов, включая полевой шпат , пироксены и оливин , и предположили, что марсианский грунт в образце был похож на «выветренные базальтовые почвы » гавайских вулканов . [77]

Трехмерная структура пенициллина , решенная Дороти Кроуфут Ходжкин в 1945 году. Зеленые, красные, желтые и синие сферы представляют атомы углерода , кислорода , серы и азота соответственно. Белые сферы представляют водород , который был определен математически, а не с помощью рентгеновского анализа.

Биологическая макромолекулярная кристаллография

Рентгеновская кристаллография биологических молекул началась с Дороти Кроуфут Ходжкин , которая расшифровала структуры холестерина (1937), пенициллина (1946) и витамина B12 ( 1956), за что в 1964 году ей была присуждена Нобелевская премия по химии . В 1969 году ей удалось расшифровать структуру инсулина , над чем она работала более тридцати лет. [87]

Ленточная диаграмма структуры миоглобина , показывающая альфа-спирали . Такие белки представляют собой длинные линейные молекулы с тысячами атомов; однако относительное положение каждого атома было определено с субатомным разрешением с помощью рентгеновской кристаллографии. Поскольку трудно визуализировать все атомы одновременно, лента показывает грубый путь остова белка от его N-конца до его C-конца.

Кристаллические структуры белков (которые нерегулярны и в сотни раз больше холестерина) начали решать в конце 1950-х годов, начиная со структуры миоглобина кашалота сэром Джоном Каудери Кендрю , [88] за которую он разделил Нобелевскую премию по химии с Максом Перуцем в 1962 году . [89] С тех пор было определено более 130 000 рентгеновских кристаллических структур белков, нуклеиновых кислот и других биологических молекул. [90] Ближайшим конкурирующим методом по количеству проанализированных структур является спектроскопия ядерного магнитного резонанса (ЯМР) , которая разрешила менее одной десятой от этого количества. [91] Кристаллография может решать структуры произвольно больших молекул, тогда как ЯМР в состоянии раствора ограничен относительно малыми (менее 70 кДа ) . Рентгеновская кристаллография обычно используется для определения того, как фармацевтический препарат взаимодействует с его белковой мишенью и какие изменения могут его улучшить. [92] Однако внутренние мембранные белки по-прежнему трудно кристаллизовать, поскольку для их изолированного растворения требуются детергенты или другие денатурирующие вещества , а такие детергенты часто мешают кристаллизации. Мембранные белки являются крупным компонентом генома и включают в себя множество белков, имеющих большое физиологическое значение, таких как ионные каналы и рецепторы . [93] [94] Криогеника гелия используется для предотвращения радиационного повреждения кристаллов белков. [95]

Методы

Обзор

Рабочий процесс определения структуры молекулы методом рентгеновской кристаллографии.

Часто используются два предельных случая рентгеновской кристаллографии — «малая молекула» (которая включает непрерывные неорганические твердые тела) и «макромолекулярная» кристаллография. Малая молекулярная кристаллография обычно включает кристаллы с менее чем 100 атомами в их асимметричной единице ; такие кристаллические структуры обычно настолько хорошо разрешены, что атомы можно различить как изолированные «капли» электронной плотности. Напротив, макромолекулярная кристаллография часто включает десятки тысяч атомов в элементарной ячейке. Такие кристаллические структуры, как правило, менее хорошо разрешены; атомы и химические связи выглядят как трубки электронной плотности, а не как изолированные атомы. В целом, малые молекулы также легче кристаллизовать, чем макромолекулы; однако рентгеновская кристаллография оказалась возможной даже для вирусов и белков с сотнями тысяч атомов благодаря улучшенной кристаллографической визуализации и технологии. [96]

Методика рентгеновской кристаллографии монокристаллов состоит из трех основных этапов. Первый и часто самый сложный этап — получение адекватного кристалла исследуемого материала. Кристалл должен быть достаточно большим (обычно больше 0,1 мм во всех измерениях), чистым по составу и регулярной по структуре, без существенных внутренних дефектов, таких как трещины или двойникование . [ необходима цитата ]

На втором этапе кристалл помещают в интенсивный пучок рентгеновских лучей, обычно одной длины волны ( монохроматические рентгеновские лучи ), создавая регулярную картину отражений. Измеряются углы и интенсивности дифрагированных рентгеновских лучей, причем каждое соединение имеет уникальную картину дифракции. [97] По мере постепенного вращения кристалла предыдущие отражения исчезают и появляются новые; интенсивность каждого пятна регистрируется при каждой ориентации кристалла. Может потребоваться собрать несколько наборов данных, причем каждый набор покрывает немного больше половины полного оборота кристалла и обычно содержит десятки тысяч отражений. [ необходима цитата ]

На третьем этапе эти данные объединяются вычислительным путем с дополнительной химической информацией для создания и уточнения модели расположения атомов внутри кристалла. Окончательная, уточненная модель расположения атомов — теперь называемая кристаллической структурой — обычно хранится в общедоступной базе данных. [ необходима цитата ]

Кристаллизация

Кристалл белка под микроскопом . Кристаллы, используемые в рентгеновской кристаллографии, могут быть меньше миллиметра в поперечнике.

Хотя кристаллография может быть использована для характеристики беспорядка в нечистом или нерегулярном кристалле, кристаллография обычно требует чистого кристалла высокой регулярности для решения структуры сложного расположения атомов. Чистые, регулярные кристаллы иногда могут быть получены из природных или синтетических материалов, таких как образцы металлов, минералов или других макроскопических материалов. Регулярность таких кристаллов иногда может быть улучшена с помощью отжига макромолекулярного кристалла [98] [99] [100] и других методов. Однако во многих случаях получение кристалла дифракционного качества является главным препятствием для решения его структуры с атомным разрешением. [101]

Кристаллография малых молекул и макромолекул отличается диапазоном возможных методов, используемых для получения кристаллов дифракционного качества. Малые молекулы обычно имеют несколько степеней конформационной свободы и могут быть кристаллизованы широким спектром методов, таких как химическое осаждение из паровой фазы и перекристаллизация . Напротив, макромолекулы обычно имеют много степеней свободы, и их кристаллизация должна проводиться таким образом, чтобы поддерживать стабильную структуру. Например, белки и более крупные молекулы РНК не могут быть кристаллизованы, если их третичная структура была развернута ; поэтому диапазон условий кристаллизации ограничен условиями раствора, в которых такие молекулы остаются свернутыми. [ необходима цитата ]

Три метода приготовления кристаллов: A: Висячая капля. B: Сидячая капля. C: Микродиализ

Кристаллы белка почти всегда выращиваются в растворе. Наиболее распространенный подход заключается в очень постепенном снижении растворимости его молекул-компонентов; если это сделать слишком быстро, молекулы выпадут в осадок из раствора, образуя бесполезную пыль или аморфный гель на дне контейнера. Рост кристаллов в растворе характеризуется двумя этапами: зарождением микроскопического кристаллита (возможно, имеющего всего 100 молекул), за которым следует рост этого кристаллита, в идеале до кристалла дифракционного качества. [102] [103] Условия раствора, которые благоприятствуют первому этапу (зарождению), не всегда являются теми же условиями, которые благоприятствуют второму этапу (последующему росту). Условия раствора должны не благоприятствовать первому этапу (зарождению), но благоприятствовать второму (росту), так что на каплю образуется только один большой кристалл. Если зарождение слишком благоприятствует, в капле образуется ливень мелких кристаллитов, а не один большой кристалл; если же благоприятствует слишком мало, кристалл вообще не образуется. Другие подходы включают кристаллизацию белков под маслом, где водные растворы белков распределяются под жидким маслом, и вода испаряется через слой масла. Различные масла имеют различную проницаемость испарения, поэтому дают изменения в скоростях концентрации из-за различных смесей перципиент/белок. [104]

Трудно предсказать хорошие условия для зародышеобразования или роста хорошо упорядоченных кристаллов. [105] На практике благоприятные условия определяются путем скрининга ; готовится очень большая партия молекул и тестируется широкий спектр растворов для кристаллизации. [106] Обычно перебираются сотни, даже тысячи условий раствора, прежде чем находят удачное. Различные условия могут использовать один или несколько физических механизмов для снижения растворимости молекулы; например, некоторые могут изменять pH, некоторые содержат соли ряда Гофмейстера или химикаты, которые снижают диэлектрическую проницаемость раствора, а другие содержат крупные полимеры, такие как полиэтиленгликоль , которые вытесняют молекулу из раствора за счет энтропийных эффектов. Также обычно пробуют несколько температур для стимуляции кристаллизации или постепенно понижают температуру, чтобы раствор стал перенасыщенным. Эти методы требуют больших количеств целевой молекулы, поскольку они используют высокую концентрацию молекулы(молекул), которые должны быть кристаллизованы. Из-за сложности получения таких больших количеств ( миллиграммов ) кристаллизационного белка были разработаны роботы, способные точно дозировать капли кристаллизационного испытания, имеющие объем порядка 100 нанолитров . Это означает, что в 10 раз меньше белка используется на эксперимент по сравнению с кристаллизационными испытаниями, проводимыми вручную (порядка 1 микролитра ). [107]

Известно, что несколько факторов ингибируют кристаллизацию. Растущие кристаллы обычно поддерживают при постоянной температуре и защищают от ударов или вибраций, которые могут нарушить их кристаллизацию. Примеси в молекулах или в растворах для кристаллизации часто неблагоприятны для кристаллизации. Конформационная гибкость молекулы также имеет тенденцию делать кристаллизацию менее вероятной из-за энтропии. Молекулы, которые имеют тенденцию к самоорганизации в правильные спирали, часто не желают собираться в кристаллы. [ необходима цитата ] Кристаллы могут быть испорчены двойникованием , которое может происходить, когда элементарная ячейка может одинаково благоприятно упаковываться в нескольких ориентациях; хотя недавние достижения в вычислительных методах могут позволить решить структуру некоторых двойниковых кристаллов. Не сумев кристаллизовать целевую молекулу, кристаллограф может попробовать еще раз со слегка измененной версией молекулы; даже небольшие изменения в молекулярных свойствах могут привести к большим различиям в поведении кристаллизации. [ необходима цитата ]

Сбор данных

Монтаж кристалла

Анимация, демонстрирующая пять возможных движений с помощью четырехкругового каппа-гониометра. Вращения вокруг каждого из четырех углов φ, κ, ω и 2θ оставляют кристалл в рентгеновском пучке, но изменяют ориентацию кристалла. Детектор (красный ящик) можно сдвигать ближе или дальше от кристалла, что позволяет получать данные с более высоким разрешением (если он ближе) или лучше различать пики Брэгга (если он дальше).

Кристалл устанавливается для измерений так, чтобы его можно было удерживать в рентгеновском луче и вращать. Существует несколько методов установки. Раньше кристаллы загружали в стеклянные капилляры с раствором для кристаллизации ( маточным раствором ). Кристаллы малых молекул обычно прикрепляли маслом или клеем к стеклянному волокну или петле, которая сделана из нейлона или пластика и прикреплена к твердому стержню. Белковые кристаллы захватываются петлей, затем мгновенно замораживаются жидким азотом . [108] Такое замораживание уменьшает радиационное повреждение рентгеновских лучей, а также тепловое движение (эффект Дебая-Уоллера). Однако необработанные белковые кристаллы часто трескаются при мгновенной заморозке; поэтому их обычно предварительно замачивают в растворе криопротектора перед замораживанием. [109] Это предварительное замачивание само по себе может привести к растрескиванию кристалла, что делает его непригодным для кристаллографии. Как правило, успешные криоусловия определяются методом проб и ошибок. [ необходима цитата ]

Капилляр или петля устанавливаются на гониометре , что позволяет точно позиционировать его в рентгеновском пучке и вращать. Поскольку и кристалл, и пучок часто очень малы, кристалл должен быть центрирован в пучке с точностью ~25 микрометров, чему способствует камера, сфокусированная на кристалле. Наиболее распространенным типом гониометра является «каппа-гониометр», который предлагает три угла вращения: угол ω, который вращается вокруг оси, перпендикулярной пучку; угол κ, вокруг оси под углом ~50° к оси ω; и, наконец, угол φ вокруг оси петли/капилляра. Когда угол κ равен нулю, оси ω и φ совмещены. Вращение κ обеспечивает удобную установку кристалла, поскольку рычаг, в котором установлен кристалл, может быть повернут в сторону кристаллографа. Колебания, выполняемые во время сбора данных (упомянутые ниже), включают только ось ω. Более старый тип гониометра — это четырехкружный гониометр и его родственники, такие как шестикружный гониометр. [ необходима ссылка ]

Запись размышлений

Рентгеновская дифракционная картина кристаллизованного фермента. Картина пятен ( отражения ) и относительная сила каждого пятна ( интенсивность ) могут быть использованы для определения структуры фермента.

Относительная интенсивность отражений дает информацию для определения расположения молекул внутри кристалла в атомных деталях. Интенсивность этих отражений может быть зарегистрирована с помощью фотопленки , детектора площади (например, пиксельного детектора ) или датчика изображения с зарядовой связью (ПЗС). Пики при малых углах соответствуют данным с низким разрешением, тогда как при больших углах представляют данные с высоким разрешением; таким образом, верхний предел возможного разрешения структуры может быть определен из первых нескольких изображений. Некоторые меры качества дифракции могут быть определены на этом этапе, такие как мозаичность кристалла и его общий беспорядок, как это наблюдается в ширине пиков. Некоторые патологии кристалла, которые сделали бы его непригодным для решения структуры, также могут быть быстро диагностированы на этом этапе. [ необходима цитата ]

Одного набора пятен недостаточно для реконструкции всего кристалла; он представляет собой лишь небольшой срез полного трехмерного набора. Чтобы собрать всю необходимую информацию, кристалл необходимо вращать шаг за шагом на 180°, записывая изображение на каждом шаге; на самом деле, для покрытия обратного пространства требуется немного больше 180° из-за кривизны сферы Эвальда . Однако, если кристалл имеет более высокую симметрию, может быть записан меньший угловой диапазон, такой как 90° или 45°. Ось вращения следует изменить по крайней мере один раз, чтобы избежать развития «слепого пятна» в обратном пространстве вблизи оси вращения. Обычно кристалл слегка покачивают (на 0,5–2°), чтобы захватить более широкую область обратного пространства. [ необходима цитата ]

Для некоторых методов фазирования могут потребоваться множественные наборы данных . Например, многоволновое аномальное дисперсионное фазирование требует, чтобы рассеяние регистрировалось по крайней мере на трех (и обычно на четырех, для избыточности) длинах волн входящего рентгеновского излучения. Один кристалл может слишком сильно деградировать во время сбора одного набора данных из-за радиационного повреждения; в таких случаях необходимо брать наборы данных на нескольких кристаллах. [110]

Симметрия кристалла, элементарная ячейка и масштабирование изображения

Записанная серия двумерных дифракционных картин, каждая из которых соответствует различной ориентации кристалла, преобразуется в трехмерный набор. Обработка данных начинается с индексации отражений. Это означает определение размеров элементарной ячейки и того, какой пик изображения соответствует какой позиции в обратном пространстве. Побочным продуктом индексации является определение симметрии кристалла, т. е. его пространственной группы . Некоторые пространственные группы могут быть исключены с самого начала. Например, симметрии отражения не могут наблюдаться в хиральных молекулах; таким образом, для молекул белка, которые почти всегда являются хиральными, разрешено только 65 пространственных групп из 230 возможных. Индексация обычно выполняется с помощью процедуры автоиндексации . [111] После назначения симметрии данные затем интегрируются . Это преобразует сотни изображений, содержащих тысячи отражений, в один файл, состоящий из (как минимум) записей индекса Миллера каждого отражения и интенсивности для каждого отражения (в этом состоянии файл часто также включает оценки ошибок и меры частичности (какая часть данного отражения была записана на этом изображении)).

Полный набор данных может состоять из сотен отдельных изображений, полученных при разных ориентациях кристалла. Их необходимо объединить и масштабировать с помощью пиков, появляющихся на двух или более изображениях ( объединение ) и масштабирования, чтобы получить согласованную шкалу интенсивности. Оптимизация шкалы интенсивности имеет решающее значение, поскольку относительная интенсивность пиков является ключевой информацией, из которой определяется структура. Повторяющаяся техника сбора кристаллографических данных и часто высокая симметрия кристаллических материалов заставляют дифрактометр регистрировать множество эквивалентных по симметрии отражений несколько раз. Это позволяет вычислить связанный с симметрией R-фактор , индекс надежности, основанный на том, насколько похожи измеренные интенсивности эквивалентных по симметрии отражений, [ необходимо разъяснение ], таким образом оценивая качество данных.

Начальная фазировка

Интенсивность каждого дифракционного «пятна» пропорциональна квадрату модуля структурного фактора . Структурный фактор — это комплексное число , содержащее информацию, касающуюся как амплитуды , так и фазы волны . Для того чтобы получить интерпретируемую карту электронной плотности , должны быть известны как амплитуда, так и фаза (карта электронной плотности позволяет кристаллографу построить начальную модель молекулы). Фазу нельзя напрямую записать во время дифракционного эксперимента: это известно как фазовая проблема . Начальные оценки фазы можно получить различными способами:

Построение модели и уточнение фаз

Структура альфа-спирали белка с контурными фигурами ковалентной связи в электронной плотности для кристаллической структуры со сверхвысоким разрешением (0,91 Å). Контуры плотности обозначены серым цветом, остов спирали — белым, боковые цепи — голубым, атомы O — красным, атомы N — синим, а водородные связи — зелеными пунктирными линиями. [116]
Трехмерное изображение электронной плотности (синего цвета) лиганда (оранжевого цвета), связанного с сайтом связывания в белке (желтого цвета). [117] Электронная плотность получена из экспериментальных данных, а лиганд моделируется в этой электронной плотности.

Получив начальные фазы, можно построить начальную модель. Атомные позиции в модели и соответствующие им факторы Дебая-Валлера (или B -факторы, учитывающие тепловое движение атома) можно уточнить для соответствия наблюдаемым данным дифракции, в идеале получая лучший набор фаз. Затем можно подогнать новую модель к новой карте электронной плотности и выполнить последовательные раунды уточнения. Этот итеративный процесс продолжается до тех пор, пока корреляция между данными дифракции и моделью не будет максимизирована. Согласие измеряется R - фактором, определяемым как

где F — структурный фактор . Похожий критерий качества — R free , который рассчитывается из подмножества (~10%) отражений, которые не были включены в уточнение структуры. Оба фактора R зависят от разрешения данных. Как правило, R free должен быть приблизительно равен разрешению в ангстремах, деленному на 10; таким образом, набор данных с разрешением 2 Å должен давать окончательное значение R free ~ 0,2. Характеристики химических связей, такие как стереохимия, водородные связи и распределение длин связей и углов, являются дополнительными мерами качества модели. При итеративном построении моделей часто встречаются смещение фазы или смещение модели: поскольку оценки фазы исходят из модели, каждый раунд вычисленной карты имеет тенденцию показывать плотность везде, где модель имеет плотность, независимо от того, есть ли на самом деле плотность. Эту проблему можно смягчить с помощью взвешивания с максимальным правдоподобием и проверки с помощью карт опущений . [118]

Может оказаться невозможным наблюдать каждый атом в асимметричной единице. Во многих случаях кристаллографический беспорядок размывает карту электронной плотности. Слабо рассеивающие атомы, такие как водород, обычно невидимы. Также возможно, что один атом появляется несколько раз на карте электронной плотности, например, если боковая цепь белка имеет несколько (<4) разрешенных конформаций. В других случаях кристаллограф может обнаружить, что ковалентная структура, выведенная для молекулы, была неправильной или измененной. Например, белки могут расщепляться или подвергаться посттрансляционным модификациям, которые не были обнаружены до кристаллизации.

Расстройство

Распространенная проблема в уточнении кристаллических структур возникает из-за кристаллографического беспорядка. Беспорядок может принимать различные формы, но в целом подразумевает сосуществование двух или более видов или конформаций. Неспособность распознать беспорядок приводит к ошибочной интерпретации. Ловушки неправильного моделирования беспорядка иллюстрируются дисконтированной гипотезой изомерии растяжения связей . [119] Беспорядок моделируется относительно относительной популяции компонентов, часто только двух, и их идентичности. В структурах больших молекул и ионов растворитель и противоионы часто неупорядочены.

Прикладной вычислительный анализ данных

Использование вычислительных методов для анализа данных порошковой рентгеновской дифракции в настоящее время обобщено. Обычно оно сравнивает экспериментальные данные с моделированной дифрактограммой модельной структуры с учетом инструментальных параметров и уточняет структурные или микроструктурные параметры модели с использованием алгоритма минимизации на основе наименьших квадратов . Большинство доступных инструментов, позволяющих идентифицировать фазы и уточнять структуру , основаны на методе Ритвельда [120] [121], некоторые из них являются открытым и бесплатным программным обеспечением, например, FullProf Suite, [122] [123] Jana2006, [124] MAUD, [125] [126] [127] Rietan, [128] GSAS, [129] и т. д., в то время как другие доступны по коммерческим лицензиям, например, Diffrac.Suite TOPAS, [130] Match!, [131] и т. д. Большинство этих инструментов также допускают уточнение по Ле Бейлю (также называемое сопоставлением профилей), то есть уточнение параметров ячейки на основе положений пиков Брэгга и профилей пиков, без учета кристаллографической структуры как таковой. Более современные инструменты позволяют уточнять как структурные, так и микроструктурные данные, например, программа FAULTS, включенная в пакет FullProf Suite, [132], которая позволяет уточнять структуры с плоскими дефектами (например, дефекты упаковки, двойникования, срастания).

Нанесение структуры

После завершения разработки модели структуры молекулы она часто помещается в кристаллографическую базу данных , например, в Cambridge Structural Database (для малых молекул), Inorganic Crystal Structure Database (ICSD) (для неорганических соединений) или Protein Data Bank (для белков и иногда нуклеиновых кислот). Многие структуры, полученные в частных коммерческих проектах по кристаллизации белков, имеющих медицинское значение, не помещаются в публичные кристаллографические базы данных.

Вклад женщин в рентгеновскую кристаллографию

Ряд женщин были пионерами в рентгеновской кристаллографии в то время, когда они были исключены из большинства других разделов физической науки. [133]

Кэтлин Лонсдейл была аспиранткой Уильяма Генри Брэгга , у которого было 11 женщин-учениц из 18. Она известна как своими экспериментальными, так и теоретическими работами. Лонсдейл присоединилась к его исследовательской группе по кристаллографии в Королевском институте в Лондоне в 1923 году, а после замужества и рождения детей вернулась к работе с Брэггом в качестве исследователя. Она подтвердила структуру бензольного кольца, провела исследования алмаза, была одной из первых двух женщин, избранных в Королевское общество в 1945 году, а в 1949 году была назначена первой женщиной-штатным профессором химии и заведующей кафедрой кристаллографии в Университетском колледже Лондона . [134] Лонсдейл всегда выступал за более широкое участие женщин в науке и сказал в 1970 году: «Любая страна, которая хочет в полной мере использовать всех своих потенциальных ученых и технологов, могла бы сделать это, но она не должна ожидать, что получит женщин так же просто, как она получает мужчин.  ... Тогда было бы утопией предполагать, что любая страна, которая действительно хочет, чтобы замужние женщины вернулись к научной карьере, когда ее дети больше не нуждаются в ее физическом присутствии, должна принять специальные меры, чтобы побудить ее сделать это?». [135] В этот период Лонсдейл начал сотрудничать с Уильямом Т. Эстбери над набором из 230 таблиц пространственных групп, который был опубликован в 1924 году и стал важным инструментом для кристаллографов.

Молекулярная модель пенициллина Дороти Ходжкин, 1945 г.

В 1932 году Дороти Ходжкин присоединилась к лаборатории физика Джона Десмонда Бернала, бывшего студента Брэгга, в Кембридже, Великобритания. Они с Берналом сделали первые рентгеновские фотографии кристаллических белков. Ходжкин также сыграла роль в основании Международного союза кристаллографии . Она была удостоена Нобелевской премии по химии в 1964 году за свою работу с использованием рентгеновских методов для изучения структур пенициллина, инсулина и витамина B12. Ее работа над пенициллином началась в 1942 году во время войны, а над витамином B12 — в 1948 году. Хотя ее группа медленно росла, их основное внимание было сосредоточено на рентгеновском анализе натуральных продуктов. Она является единственной британской женщиной, когда-либо получившей Нобелевскую премию по научной теме.

Фотография ДНК (фото 51), Розалинд Франклин, 1952 г.

Розалинд Франклин сделала рентгеновскую фотографию волокна ДНК, которая оказалась ключевой для открытия Джеймсом Уотсоном и Фрэнсисом Криком двойной спирали, за что они оба получили Нобелевскую премию по физиологии и медицине в 1962 году. Уотсон признался в своем автобиографическом отчете об открытии структуры ДНК, «Двойная спираль» , [136] , что он использовал рентгеновскую фотографию Франклин без ее разрешения. Франклин умерла от рака в возрасте 30 лет, до того, как Уотсон получила Нобелевскую премию. Франклин также провел важные структурные исследования углерода в угле и графите, а также вирусов растений и животных.

Изабелла Карле из Военно-морской исследовательской лаборатории США разработала экспериментальный подход к математической теории кристаллографии. Ее работа улучшила скорость и точность химического и биомедицинского анализа. Однако только ее муж Джером разделил Нобелевскую премию по химии 1985 года с Гербертом Хауптманом «за выдающиеся достижения в разработке прямых методов определения кристаллических структур». Другие организации, присуждающие награды, осыпали Изабеллу наградами по ее собственному праву.

Женщины написали множество учебников и исследовательских работ в области рентгеновской кристаллографии. В течение многих лет Лонсдейл редактировала Международные таблицы по кристаллографии , которые предоставляют информацию о кристаллических решетках, симметрии и пространственных группах, а также математические, физические и химические данные о структурах. Ольга Кеннард из Кембриджского университета основала и руководила Кембриджским центром кристаллографических данных , международно признанным источником структурных данных о малых молекулах, с 1965 по 1997 год. Дженни Пикворт Глускер , британский ученый, была соавтором книги «Анализ структуры кристаллов: учебник для начинающих» [137] , впервые опубликованной в 1971 году и в третьем издании в 2010 году. Элеанор Додсон , австралийский биолог, которая начинала как техник Дороти Ходжкин, была главным инициатором CCP4 , проекта совместных вычислений, который в настоящее время делится более чем 250 программными инструментами с кристаллографами белков по всему миру.

Нобелевские премии по рентгеновской кристаллографии

Смотрите также

Примечания

  1. ^ Край поглощения первоначально был известен из рентгеновской абсорбционной спектроскопии . См. "Аномальное рассеяние рентгеновских лучей". skuld.bmsc.washington.edu .для руководства по аномальному рассеянию.

Ссылки

  1. ^ Кеплер Дж (1611). Strena seu de Nive Sexangula. Франкфурт: Г. Тампак. ISBN 3-321-00021-0. Архивировано из оригинала 2011-09-19 . Получено 2008-08-25 .
  2. ^ Стено Н (1669). De Solido Intra Solidum Naturaliter Contento Dissertationis Prodromus . Флорентии.
  3. ^ Хессель Дж. Ф. (1831). Кристаллометрия или кристаллономия и кристаллография . Лейпциг.
  4. ^ Браве А (1850). «Мемуар о системах, формирующихся по точкам, регулирующим распределение по плану или в пространстве». Журнал Политехнической школы . 19 :1.
  5. ^ Шафрановский II, Белов НВ (1962). Пауль Эвальд (ред.). "ES Fedorov" (PDF) . 50 лет рентгеновской дифракции . Springer: 351. ISBN 90-277-9029-9. Архивировано (PDF) из оригинала 2007-09-28 . Получено 2007-09-25 .
  6. ^ Шенфлис А (1891). Кристаллсистема и Кристаллструктура . Лейпциг.
  7. ^ Barlow W (1883). "Вероятная природа внутренней симметрии кристаллов". Nature . 29 (738): 186. Bibcode :1883Natur..29..186B. doi : 10.1038/029186a0 . Архивировано из оригинала 29-03-2020 . Получено 10-09-2019 .См. также Barlow W (1883). "Вероятная природа внутренней симметрии кристаллов". Nature . 29 (739): 205. Bibcode :1883Natur..29..205B. doi : 10.1038/029205a0 . Sohncke L (1884). "Вероятная природа внутренней симметрии кристаллов". Nature . 29 (747): 383. Bibcode :1884Natur..29..383S. doi :10.1038/029383a0. S2CID  4072817. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 . Barlow WM (1884). "Вероятная природа внутренней симметрии кристаллов". Nature . 29 (748): 404. Bibcode :1884Natur..29..404B. doi : 10.1038/029404b0 . S2CID  4016086. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  8. ^ ab Stoddart C (1 марта 2022 г.). «Структурная биология: как белки получили свой крупный план». Knowable Magazine . doi : 10.1146/knowable-022822-1 . Архивировано из оригинала 7 апреля 2022 г. . Получено 25 марта 2022 г. .
  9. ^ Баркла, Чарльз Г. (1911). "XXXIX. Спектры флуоресцентного рентгеновского излучения". Philosophical Magazine. Серия 6. 22 (129): 396–412. doi:10.1080/14786440908637137.
  10. ^ ab Михаэль Экерт, Спорное открытие: начало рентгеновской дифракции в кристаллах в 1912 году и его последствия, январь 2011 г., Acta crystallographica. Раздел A, Основы кристаллографии 68(1):30–39 Эта статья, посвященная столетию Лауэ, также была опубликована в Zeitschrift für Kristallographie [Экерт (2012). Z. Kristallogr. 227, 27–35].
  11. ^ Нисио, Сигеко. «Формирование квантовой теории Зоммерфельда 1916 года». (1974) JSHS, № 12. стр. 39-78.
  12. ^ Эйнштейн А (1905). «Über einen die Erzeugung und Verwandlung des Lichtes betreffenden heuristischen Gesichtspunkt» [Эвристическая модель создания и трансформации света]. Аннален дер Физик (на немецком языке). 17 (6): 132. Бибкод : 1905АнП...322..132Е. дои : 10.1002/andp.19053220607 .Английский перевод доступен в Wikisource .
  13. ^ Сравните: Эйнштейн А (1909). «Über die Entwicklung unserer Anschauungen über das Wesen und die Konstitution der Strahlung» [Развитие наших взглядов на состав и сущность радиации]. Physikalische Zeitschrift (на немецком языке). 10 :817.Английский перевод доступен в Wikisource .
  14. ^ Pais A (1982). Тонкий Господь: Наука и жизнь Альберта Эйнштейна. Oxford University Press . ISBN 0-19-853907-X.
  15. ^ Комптон А. (1923). "Квантовая теория рассеяния рентгеновских лучей легкими элементами" (PDF) . Phys. Rev . 21 (5): 483. Bibcode :1923PhRv...21..483C. doi : 10.1103/PhysRev.21.483 . Архивировано (PDF) из оригинала 2020-08-10 . Получено 2019-09-15 .
  16. ^ Брэгг WH (1907). «Природа рентгеновских лучей». Труды Королевского научного общества Австралии . 31 : 94.
  17. ^ Bragg WH (1908). "Природа γ- и рентгеновских лучей". Nature . 77 (1995): 270. Bibcode :1908Natur..77..270B. doi :10.1038/077270a0. S2CID  4020075. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .См. также Bragg WH (1908). "Природа γ- и рентгеновских лучей". Nature . 78 (2021): 271. Bibcode :1908Natur..78..271B. doi : 10.1038/078271a0 . S2CID  4039315. Архивировано из оригинала 27.03.2021 . Получено 03.06.2020 . Брэгг WH (1908). "Природа γ- и рентгеновских лучей". Nature . 78 (2022): 293. Bibcode :1908Natur..78..293B. doi :10.1038/078293d0. S2CID  3993814. Bragg WH (1908). "Природа рентгеновских лучей". Nature . 78 (2035): 665. Bibcode :1908Natur..78R.665B. doi : 10.1038/078665b0 . S2CID  4024851. Архивировано из оригинала 2021-03-27 . Получено 2020-08-27 .
  18. ^ Bragg WH (1910). «Следствия корпускулярной гипотезы γ- и рентгеновских лучей и диапазон β-лучей». Phil. Mag . 20 (117): 385. doi :10.1080/14786441008636917. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  19. ^ Bragg WH (1912). «О прямой или косвенной природе ионизации рентгеновскими лучами». Phil. Mag . 23 (136): 647. doi :10.1080/14786440408637253.
  20. ^ abc Фридрих В., Книппинг П., фон Лауэ М. (1912). «Interferenz-Erscheinungen bei Röntgenstrahlen» (PDF) . Sitzungsberichte der Mathematisch-Physikalischen Classe der Königlich-Bayerischen Akademie der Wissenschaften zu München [ Явления интерференции в рентгеновских лучах ]. 1912 : 303. Архивировано (PDF) из оригинала 21 мая 2024 г. Проверено 14 июля 2024 г.
  21. ^ фон Лауэ М (1914). «Об обнаружении рентгеновских интерференций» (PDF) . Нобелевские лекции по физике . 1901–1921. Архивировано (PDF) из оригинала 2010-12-07 . Получено 2009-02-18 .
  22. ^ Dana ES, Ford WE (1932). Учебник минералогии (четвертое изд.). Нью-Йорк: John Wiley & Sons. стр. 28.
  23. ^ Bragg WL (1912). "Зеркальное отражение рентгеновских лучей". Nature . 90 (2250): 410. Bibcode :1912Natur..90..410B. doi : 10.1038/090410b0 . S2CID  3952319. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  24. ^ Брэгг У. Л. (1913). «Дифракция коротких электромагнитных волн на кристалле». Труды Кембриджского философского общества . 17 : 43.
  25. ^ Брэгг В.Л. (1914). «Отражение Рентгенстрахлена». Jahrbuch der Radioaktivität und Elektronik . 11 :350.
  26. ^ Bragg WL (1913). «Структура некоторых кристаллов, определяемая их дифракцией рентгеновских лучей». Proc. R. Soc. Lond . A89 (610): 248–277. Bibcode : 1913RSPSA..89..248B. doi : 10.1098/rspa.1913.0083 . JSTOR  93488.
  27. ^ Bragg WL, James RW, Bosanquet CH (1921). "Интенсивность отражения рентгеновских лучей каменной солью". Phil. Mag . 41 (243): 309. doi :10.1080/14786442108636225. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  28. ^ Bragg WL, James RW, Bosanquet CH (1921). "Интенсивность отражения рентгеновских лучей каменной солью. Часть II". Phil. Mag . 42 (247): 1. doi :10.1080/14786442108633730. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  29. ^ Bragg WL, James RW, Bosanquet CH (1922). «Распределение электронов вокруг ядра в атомах натрия и хлора». Phil. Mag . 44 (261): 433. doi :10.1080/14786440908565188. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  30. ^ ab Bragg WH, Bragg WL (1913). "Структура алмаза". Nature . 91 (2283): 557. Bibcode :1913Natur..91..557B. doi : 10.1038/091557a0 . S2CID  3987932. Архивировано из оригинала 2021-03-26 . Получено 2020-08-27 .
  31. ^ Bragg WH, Bragg WL (1913). "Структура алмаза". Proc. R. Soc. Lond . A89 (610): 277. Bibcode :1913RSPSA..89..277B. doi : 10.1098/rspa.1913.0084 .
  32. ^ Bragg WL (1914). "Кристаллическая структура меди". Phil. Mag . 28 (165): 355. doi :10.1080/14786440908635219. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  33. ^ ab Bragg WL (1914). "Анализ кристаллов с помощью рентгеновского спектрометра". Proc. R. Soc. Lond . A89 (613): 468. Bibcode :1914RSPSA..89..468B. doi : 10.1098/rspa.1914.0015 .
  34. ^ Bragg WH (1915). "Структура кристаллов группы шпинели". Phil. Mag . 30 (176): 305. doi :10.1080/14786440808635400. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  35. ^ Нишикава С. (1915). «Структура некоторых кристаллов группы шпинели». Proc. Tokyo Math. Phys. Soc . 8 : 199.
  36. ^ Vegard L (1916). "Результаты анализа кристаллов". Phil. Mag . 32 (187): 65. doi :10.1080/14786441608635544. Архивировано из оригинала 29.03.2020 . Получено 10.09.2019 .
  37. ^ Аминофф Г (1919). «Кристаллическая структура пирохроита». Стокгольмская геол. Фёрен. Фёр . 41 : 407. дои : 10.1080/11035891909447000. Архивировано из оригинала 29 марта 2020 г. Проверено 10 сентября 2019 г.
  38. ^ Аминофф Г (1921). «Über die Struktur des Magnesiumгидроксиды». З. Кристаллогр . 56 :505.
  39. ^ Bragg WL (1920). "Кристаллическая структура оксида цинка". Phil. Mag . 39 (234): 647. doi :10.1080/14786440608636079. Архивировано из оригинала 25.10.2021 . Получено 03.06.2020 .
  40. ^ Дебие П. , Шеррер П. (1916). «Вмешательство в ориентацию ориентировочных тел в Рентгенлихте I». Physikalische Zeitschrift . 17 : 277.
  41. ^ Фридрих В. (1913). «Eine neue Interferenzerscheinung bei Röntgenstrahlen». Physikalische Zeitschrift . 14 : 317.
  42. ^ Халл AW (1917). "Новый метод рентгеновского анализа кристаллов". Phys. Rev. 10 ( 6): 661. Bibcode :1917PhRv...10..661H. doi :10.1103/PhysRev.10.661.
  43. ^ Бернал Дж. Д. (1924). «Структура графита». Proc. R. Soc. Lond . A106 (740): 749–773. JSTOR  94336.
  44. ^ Хассель О, Мак Х (1924). «Über die Kristallstruktur des Graphits». Zeitschrift für Physik . 25 (1): 317. Бибкод : 1924ZPhy...25..317H. дои : 10.1007/BF01327534. S2CID  121157442.
  45. ^ Халл AW (1917). "Кристаллическая структура железа". Phys. Rev. 9 ( 1): 84. Bibcode :1917PhRv....9...83.. doi :10.1103/PhysRev.9.83.
  46. ^ Hull AW (июль 1917 г.). «Кристаллическая структура магния». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 3 (7): 470–473. Bibcode :1917PNAS....3..470H. doi : 10.1073/pnas.3.7.470 . PMC 1091290 . PMID  16576242. 
  47. ^ Wyckoff RW, Posnjak E (1921). "Кристаллическая структура хлороплатината аммония". J. Am. Chem. Soc . 43 (11): 2292. doi :10.1021/ja01444a002. Архивировано из оригинала 2021-04-13 . Получено 2020-06-03 .
  48. ^ ab Bragg WH (1921). "Структура органических кристаллов". Proc. R. Soc. Lond . 34 (1): 33. Bibcode :1921PPSL...34...33B. doi :10.1088/1478-7814/34/1/306. S2CID  4098112. Архивировано из оригинала 2021-04-13 . Получено 2020-08-27 .
  49. ^ Лонсдейл К (1928). "Структура бензольного кольца". Nature . 122 (3082): 810. Bibcode :1928Natur.122..810L. doi : 10.1038/122810c0 . S2CID  4105837.
  50. ^ Полинг Л. (1960). Природа химической связи (3-е изд.). Итака, Нью-Йорк: Cornell University Press . ISBN 0-8014-0333-2.
  51. ^ Bragg WH (1922). "Кристаллическая структура антрацена". Proc. R. Soc. Lond . 35 (1): 167. Bibcode :1922PPSL...35..167B. doi :10.1088/1478-7814/35/1/320. Архивировано из оригинала 2021-04-13 . Получено 2020-08-27 .
  52. ^ Dickinson RG, Raymond AL (1923). "Кристаллическая структура гексаметилентетрамина" (PDF) . J. Am. Chem. Soc. 45 : 22. doi :10.1021/ja01654a003. Архивировано (PDF) из оригинала 2020-08-11 . Получено 2019-09-10 .
  53. ^ Мюллер А (1923). «Рентгеновское исследование жирных кислот». Журнал химического общества . 123 : 2043. doi : 10.1039/ct9232302043.
  54. ^ Saville WB, Shearer G (1925). "Рентгеновское исследование насыщенных алифатических кетонов". Журнал химического общества . 127 : 591. doi : 10.1039/ct9252700591.
  55. ^ Брэгг WH (1925). "Исследование тонких пленок с помощью рентгеновских лучей". Nature . 115 (2886): 266. Bibcode :1925Natur.115..266B. doi : 10.1038/115266a0 .
  56. ^ де Бройль М. , Триллат Дж. Дж. (1925). «Sur l'interpretation Physique des Specters X d'acides gras». Comptes rendus hebdomadaires des séances de l'Académie des Sciences . 180 : 1485.
  57. ^ Триллат JJ (1926). «Rayons X et Composeés Organiques à Longe Chaine. Spectrographiques Sue Leurs Structures et Leurs Orientations». Анналы тела . 10 (6): 5. Бибкод : 1926АнФ...10....5Т. дои : 10.1051/anphys/192610060005.
  58. ^ Caspari WA (1928). «Кристаллография алифатических дикарбоновых кислот». Журнал химического общества . ? ​​: 3235. doi :10.1039/jr9280003235.
  59. ^ Мюллер А (1928). "Рентгеновское исследование соединений с длинной цепью (сущ. углеводороды)". Proc. R. Soc. Lond. 120 (785): 437. Bibcode :1928RSPSA.120..437M. doi : 10.1098/rspa.1928.0158 .
  60. ^ Piper SH (1929). «Некоторые примеры информации, получаемой из длинных интервалов жирных кислот». Труды Фарадейского общества . 25 : 348. doi :10.1039/tf9292500348.
  61. ^ Мюллер А (1929). «Связь между зигзагообразной структурой углеводородной цепи и чередованием свойств соединений с нечетными и четными цепями». Proc. R. Soc. Lond . 124 (794): 317. Bibcode :1929RSPSA.124..317M. doi : 10.1098/rspa.1929.0117 .
  62. ^ Робертсон Дж. М. (1936). "Рентгеновское исследование фталоцианинов, часть II". Журнал химического общества : 1195. doi : 10.1039/jr9360001195.
  63. ^ Powell HM, Ewens RV (1939). «Кристаллическая структура эннеакарбонила железа». J. Chem. Soc. : 286. doi :10.1039/jr9390000286.
  64. ^ Bertrand JA, Cotton FA, Dollase WA (1963). "Металл-металл-связанный полинуклеарный комплексный анион в CsReCl 4 ". J. Am. Chem. Soc . 85 (9): 1349. doi :10.1021/ja00892a029.
  65. ^ Робинсон ВТ, Фергюссон ДЖЕ, Пенфолд Б.Р. (1963). "Конфигурация аниона в CsReCl4 " . Труды Лондонского химического общества : 116.
  66. ^ Коттон ФА , Кертис НФ, Харрис КБ, Джонсон БФ, Липпард СДж, Маг ДжТ и др. (сентябрь 1964 г.). «Моноядерная и полиядерная химия рения (III): его выраженная гомофильность». Science . 145 (3638): 1305–1307. Bibcode :1964Sci...145.1305C. doi :10.1126/science.145.3638.1305. PMID  17802015. S2CID  29700317.
  67. ^ Коттон ФА , Харрис КБ (1965). «Кристаллическая и молекулярная структура дигидрата октахлородирената(III) дикалия». Неорганическая химия . 4 (3): 330. doi :10.1021/ic50025a015.
  68. ^ Коттон ФА (1965). «Связь металл-металл в ионах [Re 2 X 8 ] 2− и других кластерах атомов металлов». Неорганическая химия . 4 (3): 334. doi :10.1021/ic50025a016.
  69. ^ Eberhardt WH, Crawford Jr W, Lipscomb WN (1954). "Валентная структура гидридов бора". J. Chem. Phys . 22 (6): 989. Bibcode :1954JChPh..22..989E. doi :10.1063/1.1740320.
  70. ^ Мартин TW, Деревенда ZS (май 1999). «Имя — связь — водородная связь». Nature Structural Biology . 6 (5): 403–406. doi :10.1038/8195. PMID  10331860. S2CID  27195273.
  71. ^ Дуниц Дж. Д., Оргел Л. Э., Рич А. (1956). «Кристаллическая структура ферроцена». Acta Crystallographica . 9 (4): 373. Bibcode : 1956AcCry...9..373D. doi : 10.1107/S0365110X56001091 .
  72. ^ Seiler P, Dunitz JD (1979). "Новая интерпретация неупорядоченной кристаллической структуры ферроцена". Acta Crystallographica B. 35 ( 5): 1068. Bibcode : 1979AcCrB..35.1068S. doi : 10.1107/S0567740879005598.
  73. ^ Wunderlich JA, Mellor DP (1954). "Заметка о кристаллической структуре соли Цейзе". Acta Crystallographica . 7 (1): 130. Bibcode :1954AcCry...7..130W. doi : 10.1107/S0365110X5400028X .
  74. ^ Jarvis JA, Kilbourn BT, Owston PG (1970) . "Повторное определение кристаллической и молекулярной структуры соли Цейзе, KPtCl3.C2H4.H2O . Исправление " . Acta Crystallographica B. 26 ( 6): 876. Bibcode : 1970AcCrB..26..876J. doi : 10.1107 /S056774087000328X .
  75. ^ Jarvis JA, Kilbourn BT, Owston PG (1971). "Повторное определение кристаллической и молекулярной структуры соли Цейзе, KPtCl3.C2H4.H2O". Acta Crystallographica B . 27 (2): 366. Bibcode :1971AcCrB..27..366J. doi : 10.1107/S0567740871002231 .
  76. ^ Love RA, Koetzle TF, Williams GJ, Andrews LC, Bau R (1975). "Нейтронное дифракционное исследование структуры соли Цейзе, KPtCl 3 (C 2 H 4 ).H 2 O". Неорганическая химия . 14 (11): 2653. doi :10.1021/ic50153a012.
  77. ^ ab Brown D (30 октября 2012 г.). "Первые исследования почвы марсохода NASA помогли идентифицировать марсианские минералы". NASA . Архивировано из оригинала 3 июня 2016 г. Получено 31 октября 2012 г.
  78. ^ Вестгрен А, Фрагмен Г (1925). «Рентгеновский анализ сплавов Cu-Zn, Ag-Zn и Au-Zn». Фил. Маг . 50 : 311. дои : 10.1080/14786442508634742.
  79. ^ Брэдли А. Дж., Тьюлис Дж. (1926). «Структура γ-латуни». Proc. R. Soc. Lond . 112 (762): 678. Bibcode :1926RSPSA.112..678B. doi : 10.1098/rspa.1926.0134 .
  80. ^ Хьюм-Розери В. (1926). «Исследования природы, свойств и условий образования интерметаллических соединений (с особым акцентом на некоторые соединения олова)». Журнал Института металлов . 35 : 295.
  81. ^ Брэдли А. Дж., Грегори СН (1927). "Структура некоторых тройных сплавов". Nature . 120 (3027): 678. Bibcode :1927Natur.120..678.. doi : 10.1038/120678a0 .
  82. ^ Вестгрен А (1932). «Zur Chemie der Legierungen». Ангеванде Хеми . 45 (2): 33. Бибкод : 1932АнгЧ..45...33В. дои : 10.1002/ange.19320450202.
  83. ^ Бернал Дж. Д. (1935). «Электронная теория металлов». Ежегодные отчеты о прогрессе химии . 32 : 181. doi :10.1039/AR9353200181.
  84. ^ Полинг Л. (1923). «Кристаллическая структура станнида магния». J. Am. Chem. Soc . 45 (12): 2777. doi :10.1021/ja01665a001.
  85. ^ Полинг Л. (1929). «Принципы, определяющие структуру сложных ионных кристаллов». J. Am. Chem. Soc . 51 (4): 1010. doi :10.1021/ja01379a006.
  86. ^ "The Cambridge Structural Database | CCDC". www.ccdc.cam.ac.uk . Архивировано из оригинала 2024-05-07 . Получено 2024-05-07 .
  87. ^ Hodgkin DC (1935). "Рентгеновские фотографии монокристаллов инсулина". Nature . 135 (3415): 591. Bibcode :1935Natur.135..591C. doi : 10.1038/135591a0 . S2CID  4121225.
  88. ^ Kendrew JC , Bodo G, Dintzis HM, Parrish RG, Wyckoff H, Phillips DC (март 1958). "Трехмерная модель молекулы миоглобина, полученная с помощью рентгеновского анализа". Nature . 181 (4610): 662–666. Bibcode :1958Natur.181..662K. doi :10.1038/181662a0. PMID  13517261. S2CID  4162786.
  89. ^ "Нобелевская премия по химии 1962 года". www.nobelprize.org . Архивировано из оригинала 2018-01-31 . Получено 2018-01-31 .
  90. ^ "Таблица записей в PDB, организованная экспериментальным методом". Архивировано из оригинала 2017-07-11 . Получено 2017-07-24 .
  91. ^ "PDB Statistics". RCSB Protein Data Bank. Архивировано из оригинала 2009-09-05 . Получено 2010-02-09 .
  92. ^ Scapin G (2006). «Структурная биология и открытие лекарств». Current Pharmaceutical Design . 12 (17): 2087–2097. doi :10.2174/138161206777585201. PMID  16796557.
  93. ^ Lundstrom K (ноябрь 2006 г.). «Структурная геномика мембранных белков». Cellular and Molecular Life Sciences . 63 (22): 2597–2607. doi : 10.1007/s00018-006-6252-y . PMC 11136435. PMID  17013556. S2CID  13432321. 
  94. ^ Lundstrom K (август 2004). «Структурная геномика мембранных белков: мини-обзор». Комбинаторная химия и высокопроизводительный скрининг . 7 (5): 431–439. doi :10.2174/1386207043328634. PMID  15320710.
  95. ^ Chinte U, Shah B, Chen YS, Pinkerton AA, Schall CA, Hanson BL (апрель 2007 г.). «Криогенное (<20 К) охлаждение гелием смягчает радиационное повреждение кристаллов белка». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография . 63 (Pt 4): 486–492. Bibcode :2007AcCrD..63..486C. doi :10.1107/s0907444907005264. PMID  17372353.
  96. ^ Джонс Н. (январь 2014 г.). «Кристаллография: атомные секреты». Nature . 505 (7485): 602–603. Bibcode :2014Natur.505..602J. doi : 10.1038/505602a . PMID  24476871.
  97. ^ "Анализ морфологии рентгеновской дифракции | IMR TEST LABS". www.imrtest.com . Получено 30.04.2018 .[ постоянная мертвая ссылка ]
  98. ^ Harp JM, Timm DE, Bunick GJ (июль 1998 г.). «Отжиг макромолекулярных кристаллов: преодоление повышенной мозаичности, связанной с криокристаллографией». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография . 54 (Pt 4): 622–628. Bibcode :1998AcCrD..54..622H. doi :10.1107/S0907444997019008. PMID  9761858.
  99. ^ Harp JM, Hanson BL, Timm DE, Bunick GJ (июль 1999). «Отжиг макромолекулярных кристаллов: оценка методов и переменных». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография . 55 (Pt 7): 1329–1334. Bibcode :1999AcCrD..55.1329H. doi :10.1107/S0907444999005442. PMID  10393299.
  100. ^ Hanson BL, Harp JM, Bunick GJ (2003). "Хорошо темперированный кристалл белка: отжиг макромолекулярных кристаллов". Macromolecular Crystallography, Часть C. Methods in Enzymology. Vol. 368. pp. 217–35. doi :10.1016/S0076-6879(03)68012-2. ISBN 978-0-12-182271-2. PMID  14674276.
  101. ^ Geerlof A, Brown J, Coutard B, Egloff MP, Enguita FJ, Fogg MJ и др. (октябрь 2006 г.). «Влияние характеристики белка на структурную протеомику». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография . 62 (Pt 10): 1125–1136. Bibcode :2006AcCrD..62.1125G. doi : 10.1107/S0907444906030307 . PMC 7161605 . PMID  17001090. 
  102. ^ Чернов АА (апрель 2003). "Белковые кристаллы и их рост". Журнал структурной биологии . 142 (1): 3–21. doi :10.1016/S1047-8477(03)00034-0. PMID  12718915.
  103. ^ Bergfors T (2016). "Protein crystallization Tutorial". Архивировано из оригинала 2019-12-25 . Получено 2020-01-17 .
  104. ^ Chayen N (1997). «Ограничения кристаллизации под маслом». Cell . 5 (10): 1269–1274. doi : 10.1016/s0969-2126(97)00279-7 . PMID  9351804.
  105. ^ Rupp B, Wang J (ноябрь 2004 г.). «Прогностические модели кристаллизации белков». Методы . 34 (3): 390–407. doi :10.1016/j.ymeth.2004.03.031. PMID  15325656.
  106. ^ Chayen NE (июль 2005 г.). «Методы разделения зародышеобразования и роста при кристаллизации белков». Progress in Biophysics and Molecular Biology . 88 (3): 329–337. doi : 10.1016/j.pbiomolbio.2004.07.007 . PMID  15652248.
  107. ^ Stock D, Perisic O, Löwe J (июль 2005 г.). «Роботизированная нанолитровая кристаллизация белка в лаборатории молекулярной биологии MRC». Progress in Biophysics and Molecular Biology . 88 (3): 311–327. doi : 10.1016/j.pbiomolbio.2004.07.009 . PMID  15652247.
  108. ^ Jeruzalmi D (2006). "Первый анализ макромолекулярных кристаллов: биохимия и рентгеновская дифракция". Протоколы макромолекулярной кристаллографии, том 2. Методы в молекулярной биологии. Том 364. стр. 43–62. doi :10.1385/1-59745-266-1:43. ISBN 1-59745-266-1. PMID  17172760.
  109. ^ Helliwell JR (июнь 2005 г.). «Совершенство кристаллов белка и его применение». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография . 61 (Pt 6): 793–798. Bibcode :2005AcCrD..61..793H. doi : 10.1107/S0907444905001368 . PMID  15930642.
  110. ^ Равелли Р.Б., Гарман Э.Ф. (октябрь 2006 г.). «Радиационные повреждения в макромолекулярной криокристаллографии». Current Opinion in Structural Biology . 16 (5): 624–629. doi :10.1016/j.sbi.2006.08.001. PMID  16938450.
  111. ^ Powell HR (октябрь 1999). «Алгоритм автоиндексации Фурье Россмана в MOSFLM». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография . 55 (Pt 10): 1690–1695. Bibcode :1999AcCrD..55.1690P. doi : 10.1107/S0907444999009506 . PMID  10531518.
  112. ^ Хауптман Х (октябрь 1997). «Фазовые методы для кристаллографии белков». Current Opinion in Structural Biology . 7 (5): 672–680. doi :10.1016/S0959-440X(97)80077-2. PMID  9345626.
  113. ^ Usón I, Sheldrick GM (октябрь 1999). «Достижения в прямых методах кристаллографии белков». Current Opinion in Structural Biology . 9 (5): 643–648. doi : 10.1016/S0959-440X(99)00020-2 . PMID  10508770.
  114. ^ ab Taylor G (ноябрь 2003 г.). «Проблема фаз». Acta Crystallographica. Раздел D, Биологическая кристаллография . 59 (Pt 11): 1881–1890. Bibcode :2003AcCrD..59.1881T. doi : 10.1107/S0907444903017815 . PMID  14573942.
  115. ^ Ealick SE (октябрь 2000 г.). «Достижения в области многоволновой аномальной дифракционной кристаллографии». Current Opinion in Chemical Biology . 4 (5): 495–499. doi : 10.1016/S1367-5931(00)00122-8 . PMID  11006535.
  116. ^ Из файла PDB 2NRL, остатки 17–32.
  117. ^ "Garman lab: Взаимопревращение специфичностей лизосомальных ферментов – Proteopedia, жизнь в 3D". proteopedia.org . Архивировано из оригинала 2018-11-28 . Получено 2018-11-28 .
  118. ^ Лэмб, АЛ; Каппок, ТДж; Сильваджи, НР (апрель 2015 г.). «Вы потерялись без карты: навигация по морю белковых структур». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1854 (4): 258–68. doi :10.1016/j.bbapap.2014.12.021. PMC 5051661. PMID  25554228 . 
  119. ^ Паркин Г. (1993). «Изомерия растяжения связей в комплексах переходных металлов: переоценка кристаллографических данных». Chem. Rev. 93 ( 3): 887–911. doi :10.1021/cr00019a003.
  120. ^ Ритвельд ХМ (1969-06-02). "Метод уточнения профиля для ядерных и магнитных структур". Журнал прикладной кристаллографии . 2 (2): 65–71. Bibcode :1969JApCr...2...65R. doi : 10.1107/S0021889869006558 .
  121. ^ Young RA (1993). Метод Ритвельда . [Честер, Англия]: Международный союз кристаллографии. ISBN 0198555776. OCLC  26299196.
  122. ^ "IUCr". www.iucr.org . Архивировано из оригинала 2019-04-06 . Получено 2019-04-06 .
  123. ^ "Fullprof". www.ill.eu . Архивировано из оригинала 2019-04-02 . Получено 2019-04-06 .
  124. ^ Петршичек В., Душек М., Палатинус Л. (01.01.2014). «Кристаллографическая вычислительная система JANA2006: Общие характеристики». Zeitschrift für Kristallographie – Кристаллические материалы . 229 (5): 345–352. дои : 10.1515/zkri-2014-1737. ISSN  2196-7105. S2CID  101692863.
  125. ^ Lutterotti L (февраль 2010 г.). "Полная подгонка шаблона для комбинированного определения размера–деформации–напряжения–текстуры в дифракции тонких пленок". Ядерные приборы и методы в исследованиях физики, раздел B: Взаимодействие пучка с материалами и атомами . 268 (3–4): 334–340. Bibcode : 2010NIMPB.268..334L. doi : 10.1016/j.nimb.2009.09.053. ISSN  0168-583X.
  126. ^ Луттеротти Л., Бортолотти М., Искья Г., Лонарделли И., Венк Х.Р. (2007), «Анализ текстуры Ритвельда на основе дифракционных изображений», Десятая Европейская конференция по порошковой дифракции , OLDENBOURG WISSENSCHAFTSVERLAG, стр. 125–130, doi : 10.1524/9783486992540-020 , ISBN 9783486992540
  127. ^ Lutterotti L, Matthies S, Wenk HR, Schultz AS, Richardson Jr JW (1997-01-15). «Комбинированный анализ текстуры и структуры деформированного известняка с использованием спектров дифракции нейтронов во времени пролета». Журнал прикладной физики . 81 (2): 594–600. Bibcode : 1997JAP....81..594L. doi : 10.1063/1.364220. ISSN  0021-8979.
  128. ^ "Файлы дистрибутива для пакета RIETAN-FP-VENUS". fujioizumi.verse.jp . Архивировано из оригинала 2019-08-10 . Получено 2019-04-06 .
  129. ^ Toby BH, Von Dreele RB (2013-03-14). «GSAS-II: генезис современного программного пакета для кристаллографии с открытым исходным кодом». Журнал прикладной кристаллографии . 46 (2): 544–549. Bibcode : 2013JApCr..46..544T. doi : 10.1107/s0021889813003531. ISSN  0021-8898.
  130. ^ "DIFFRAC.SUITE TOPAS - XRD Software, рентгеновская дифракция". Bruker.com . Архивировано из оригинала 2019-04-02 . Получено 2019-04-06 .
  131. ^ "Match! – Phase Identification from Powder Diffraction". www.crystalimpact.com . Архивировано из оригинала 2019-04-02 . Получено 2019-04-06 .
  132. ^ Casas-Cabanas M, Reynaud M, Rikarte J, Horbach P, Rodríguez-Carvajal J (2016-12-01). "FAULTS: программа для уточнения структур с протяженными дефектами". Journal of Applied Crystallography . 49 (6): 2259–2269. Bibcode : 2016JApCr..49.2259C. doi : 10.1107/S1600576716014473. ISSN  1600-5767.
  133. ^ Кар, Барт (2015). «Более широкое влияние женщин в кристаллографии». Crystal Growth & Design . 15 (10): 4715–4730. doi :10.1021/acs.cgd.5b00457. ISSN  1528-7483.
  134. ^ Ферри, Джорджина (2014). «История: Женщины в кристаллографии». Nature . 505 (7485): 609–611. Bibcode :2014Natur.505..609F. doi : 10.1038/505609a . ISSN  1476-4687. PMID  24482834.
  135. ^ Санс-Апарисио, Джулия (2015). «Вид на Эль-легадо-де-лас-мухерес а-ля кристаллография | Беседка». Беседка . 191 (772): а216. дои : 10.3989/arbor.2015.772n2002 . hdl : 10261/130728 . Архивировано из оригинала 7 сентября 2015 г.
  136. ^ Уотсон, Джеймс Д. (2000), Открытие двойной спирали, Лаборатория Колд Спринг Харбор, ISBN 978-0-87969-622-1, OCLC  48554849
  137. ^ Глускер, Дженни Пикворт; Трублад, Кеннет Н; Международный союз кристаллографии (2020). Анализ кристаллической структуры: учебник. ISBN 978-0-19-191790-5. OCLC  1241842166.
  138. ^ "Нобелевская премия по физике 1914 года". Nobel Foundation. Архивировано из оригинала 2008-09-15 . Получено 2008-10-09 .
  139. ^ "Нобелевская премия по физике 1915 года". Nobel Foundation. Архивировано из оригинала 2008-10-19 . Получено 2008-10-09 .
  140. ^ "Нобелевская премия по химии 1962 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2008-09-24 . Получено 2008-10-06 .
  141. ^ "Нобелевская премия по физиологии и медицине 1962 года". Nobel Foundation. Архивировано из оригинала 2018-12-26 . Получено 2007-07-28 .
  142. ^ "Нобелевская премия по химии 1964 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2008-10-15 . Получено 2008-10-06 .
  143. ^ "Нобелевская премия по химии 1972 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2008-10-11 . Получено 2008-10-06 .
  144. ^ "Нобелевская премия по химии 1976 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2008-12-25 . Получено 2008-10-06 .
  145. ^ "Нобелевская премия по химии 1985 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2008-12-25 . Получено 2008-10-06 .
  146. ^ "Нобелевская премия по химии 1988 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2008-12-25 . Получено 2008-10-06 .
  147. ^ "Нобелевская премия по химии 1997 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 21.10.2008 . Получено 06.10.2008 .
  148. ^ ab "Нобелевская премия по химии 2003 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 29-09-2008 . Получено 06-10-2008 .
  149. ^ "Нобелевская премия по химии 2006 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2008-10-17 . Получено 2008-10-06 .
  150. ^ "Нобелевская премия по химии 2009". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2009-10-10 . Получено 2009-10-07 .
  151. ^ "Нобелевская премия по химии 2012 года". Nobelprize.org. Архивировано из оригинала 2012-10-13 . Получено 2012-10-13 .

Дальнейшее чтение

Международные таблицы по кристаллографии

Сборники статей в переплете

Учебники

Прикладной вычислительный анализ данных

Исторический

Внешние ссылки

Библиотечные ресурсы по
рентгеновской кристаллографии
  • Ресурсы в вашей библиотеке
  • Ресурсы в других библиотеках
В Wikibooks есть книга по теме: Рентгеновская кристаллография

Учебники

Первичные базы данных

Производные базы данных

Структурная проверка