stringtranslate.com

Джон М. Джампер

Джон Майкл Джампер (родился в 1985 году) [1] — американский химик и компьютерный учёный. В настоящее время он занимает должность директора в Google DeepMind . [2] [3] [4] Джампер и его коллеги создали AlphaFold , [5] модель искусственного интеллекта (ИИ) для высокоточного предсказания структур белков по их аминокислотной последовательности . [6] Джампер заявил, что команда AlphaFold планирует выпустить 100 миллионов структур белков. [7]

Научный журнал Nature включил Джампера в число десяти «людей, которые имели значение» в науке в своем ежегодном списке « 10 по версии Nature » в 2021 году. [6] [8] Джампер и Демис Хассабис были удостоены половины Нобелевской премии по химии 2024 года за свои предсказания структур белков. [9] [10]

Образование

Джампер получил степень бакалавра наук по специальности «физика и математика» в Университете Вандербильта в 2007 году, [11] степень магистра философии по теоретической физике конденсированного состояния в Кембриджском университете в 2010 году по стипендии Маршалла , [12] степень магистра наук по теоретической химии в Чикагском университете в 2012 году и степень доктора философии по теоретической химии в Чикагском университете в 2017 году. [13] Его научными руководителями в Чикагском университете были Тобин Р. Сосник и Карл Фрид . [14]

Карьера

Исследования Джампера посвящены алгоритмам прогнозирования структуры белка . [2]

AlphaFold

На этом изображении представлен конечный продукт AlphaFold, на котором его результаты сравниваются с результатами других участников конкурса CASP.

AlphaFold [5] [15] — это алгоритм глубокого обучения, разработанный Джампером и его командой в DeepMind, исследовательской лаборатории, приобретенной материнской компанией Google Alphabet Inc. Это программа искусственного интеллекта, которая выполняет прогнозирование структуры белка . [16]

Награды и почести

В ноябре 2020 года AlphaFold был назван победителем 14-го конкурса Critical Assessment of Structure Prediction (CASP). [17] [18] [19] Этот международный конкурс сравнивает алгоритмы, чтобы определить, какой из них может лучше всего предсказать трехмерную структуру белков. AlphaFold выиграл конкурс, превзойдя другие алгоритмы, набрав более 90 баллов для примерно двух третей белков в глобальном тесте расстояния CASP (GDT), тесте, который измеряет степень, в которой предсказанная вычислительной программой структура похожа на определенную в лабораторном эксперименте структуру, при этом 100 означает полное совпадение в пределах расстояния, используемого для расчета GDT. [20] [21]

В 2021 году Джампер был награжден премией BBVA Foundation Frontiers of Knowledge Award в категории «Биология и биомедицина». [22] В 2022 году Джампер получил премию Wiley Prize в области биомедицинских наук [23] , а в 2023 году — премию Breakthrough Prize в области наук о жизни за разработку AlphaFold, который точно предсказывает структуру белка. [24] В 2023 году он был награжден премией Canada Gairdner International Award [25] и премией Albert Lasker Award за фундаментальные медицинские исследования . [26]

В 2024 году Джампер и Демис Хассабис разделили половину Нобелевской премии по химии за предсказания сворачивания белков, другая половина досталась Дэвиду Бейкеру за вычислительный дизайн белков . [9] [10]

Ссылки

  1. ^ abc "Джон М. Джампер: Факты". Нобелевская премия . Nobel Prize Outreach AB. 2024. Получено 9 октября 2024 г.
  2. ^ ab Публикации Джона М. Джампера, проиндексированные Google Scholar
  3. ^ Публикации Джона М. Джампера из Европы PubMed Central
  4. ^ Эйзенштейн, Майкл (2021). «Искусственный интеллект обеспечивает предсказания сворачивания белков». Nature . 599 (7886). Springer Nature: 706–708. doi :10.1038/d41586-021-03499-y. S2CID  244528561 . Получено 24 декабря 2021 г. .
  5. ^ ab Джон Джампер; Ричард Эванс; Александр Притцель; и др. (15 июля 2021 г.). «Высокоточное предсказание структуры белка с помощью AlphaFold». Nature . Bibcode :2021Natur.596..583J. doi :10.1038/S41586-021-03819-2. ISSN  1476-4687. PMC 8371605 . Wikidata  Q107555821. 
  6. ^ ab Maxmen, Amy (2021). «Nature's 10: Джон Джампер: предсказатель белков». Nature . 600 (7890). Springer Nature: 591–604. doi : 10.1038/d41586-021-03621-0 . PMID  34912110. S2CID  245256541.
  7. ^ Браун, Грейс (2021). «ИИ DeepMind наконец показал, насколько он может быть полезен». wired.com . Получено 24 декабря 2021 г. .
  8. ^ Джон М. Джампер на LinkedIn
  9. ^ ab "Нобелевская премия по химии 2024 года". Nobel Media AB . Получено 9 октября 2024 г. .
  10. ^ ab "Пресс-релиз: Нобелевская премия по химии 2024 года". NobelPrize.org . Получено 9 октября 2024 г. .
  11. ^ Достер, Стивен. «Джон Джампер, разработчик AlphaFold, выступит с лекцией Apex 30 августа». Университет Вандербильта . Получено 9 октября 2024 г.
  12. ^ "Выпускники Кембриджского университета награждены Нобелевской премией по химии 2024 года | Кембриджский университет". www.cam.ac.uk . 9 октября 2024 г. . Получено 9 октября 2024 г. .
  13. ^ "Выпускник Чикагского университета Джон Джампер разделяет Нобелевскую премию за модель для предсказания структур белков | Новости Чикагского университета". news.uchicago.edu . 9 октября 2024 г. . Получено 9 октября 2024 г. .
  14. ^ Джампер, Джон Майкл (2017). Новые методы с использованием строгого машинного обучения для крупнозернистого сворачивания белков и динамики. chicago.edu (диссертация). Чикагский университет. doi : 10.6082/M1BZ647N. OCLC  1237239279. ProQuest  1883866286.
  15. ^ Эндрю В. Сениор; Ричард Эванс; Джон Джампер; и др. (15 января 2020 г.). «Улучшенное предсказание структуры белка с использованием потенциалов глубокого обучения». Nature . 577 (7792): 706–710. doi :10.1038/S41586-019-1923-7. ISSN  1476-4687. PMID  31942072. Wikidata  Q92669549.
  16. ^ "AlphaFold". Deepmind . Получено 30 ноября 2020 г. .
  17. ^ "AlphaFold: решение 50-летней грандиозной проблемы в биологии". Deepmind . 30 ноября 2020 г. Получено 30 ноября 2020 г.
  18. ^ Сэмпл, Ян (2 декабря 2018 г.). «Google DeepMind предсказывает трехмерные формы белков». The Guardian . Получено 30 ноября 2020 г. .
  19. ^ Шеад, Сэм (30 ноября 2020 г.). «DeepMind решает 50-летнюю «грандиозную задачу» с помощью ИИ по сворачиванию белков» CNBC . Получено 30 ноября 2020 г.
  20. ^ «Искусственный интеллект DeepMind, сворачивающий белки, решил 50-летнюю грандиозную задачу биологии». MIT Technology Review . Получено 30 ноября 2020 г.
  21. ^ Роберт Ф. Сервис, «Игра изменилась». ИИ торжествует в решении структур белков, Science , 30 ноября 2020 г.
  22. ^ "Премия BBVA Foundation Frontiers of Knowledge Award 2022". frontiersofknowledgeawards-fbbva.es .
  23. ^ "Премия Wiley 2022". wiley.com .
  24. ^ "Breakthrough Prizes 2023". breakingprize.org . Получено 22 сентября 2022 г. .
  25. ↑ Фонд, The Gairdner (30 марта 2023 г.). «Объявлены победители премии Gairdner Award 2023 в Канаде». Фонд Gairdner . Получено 9 октября 2024 г.
  26. ^ Админ, Ласкер. «AlphaFold — для предсказания структур белков». Фонд Ласкера . Получено 9 октября 2024 г.

Внешние ссылки

В Scholia есть профиль Джона Майкла Джампера (Q89620738).