stringtranslate.com

Домен смерти

Домен смерти ( DD ) представляет собой модуль взаимодействия белков , состоящий из пучка из шести альфа-спиралей . DD представляет собой подкласс белкового мотива, известного как складка смерти , и связан по последовательности и структуре с эффекторным доменом смерти ( DED ) и доменом рекрутирования каспазы ( CARD ), которые работают аналогичными путями и демонстрируют аналогичные свойства взаимодействия. [2] DD связываются друг с другом, образуя олигомеры. У млекопитающих есть многочисленные и разнообразные белки, содержащие DD. [3] В этих белках домены DD можно обнаружить в сочетании с другими доменами, включая: CARD, DED, анкириновые повторы , каспазоподобные складки, домены киназы , лейциновые молнии , лейцин-богатые повторы (LRR), домены TIR и домены ZU5. [4]

Некоторые белки, содержащие DD, участвуют в регуляции апоптоза и воспаления посредством активации каспаз и NF-κB , что обычно подразумевает взаимодействие с рецепторами цитокинов TNF (фактор некроза опухоли) . [5] [6] У людей восемь из более чем 30 известных рецепторов TNF содержат DD в своих цитоплазматических хвостах; несколько из этих рецепторов TNF используют активацию каспазы в качестве сигнального механизма. DD опосредует самоассоциацию этих рецепторов, тем самым подавая сигнал нижестоящим событиям, которые приводят к апоптозу. Другие белки, содержащие DD, такие как анкирин , MyD88 и pelle , вероятно, не участвуют напрямую в сигнализации клеточной смерти. Белки, содержащие DD, также связаны с врожденным иммунитетом , взаимодействуя с Toll-подобными рецепторами через двусоставные адаптерные белки, такие как MyD88. [7]

Суперсемейство DD является одним из крупнейших и наиболее изученных суперсемейств доменов. В настоящее время оно включает четыре подсемейства: подсемейство домена смерти (DD), подсемейство домена эффектора смерти (DED), подсемейство домена набора каспазы (CARD) и подсемейство домена пирина (PYD). Эти белки эволюционно сохраняются во многих многоклеточных организмах, таких как млекопитающие, Drosophila и C. elegans . [8] Согласно анализу генома, в геноме человека есть 32 DD, 7 DED, 28 CARD и 19 PYD. [9]

Из-за большого размера суперсемейства белков семейства доменов смерти некоторые белки доменов смерти могут играть роль в раке и многих других инфекциях через несколько семейств DD-белков и специфических изменений генов, которые имеют нисходящую функцию для индукции апоптоза клеток. Многие из этих изменений происходят в генах, кодирующих медиаторы апоптоза или некроптоза , потенциально позволяя развивать устойчивость к клеточной смерти, важный признак рака. Многие виды рака содержат онкоген, который будет ингибировать главный комплекс гистосовместимости (MHC) на поверхности клетки от представления антигенов иммунным клеткам. Многие из этих злокачественных новообразований имеют подмножество случаев, скрывающих геномные изменения в компонентах внутренних или внешних путей гибели клеток, включая амплификацию и сверхэкспрессию Fas -ассоциированного домена смерти (FADD) и ингибитора белков апоптоза (IAP), а также мутации в генах, кодирующих каспазы. Один из примеров этого можно увидеть в плоскоклеточных карциномах головы и шеи . Плоскоклеточные карциномы головы и шеи относятся к раковым заболеваниям с самой высокой частотой нарушения регуляции генов, кодирующих компоненты пути гибели клеток, причем почти в половине всех случаев наблюдаются такие геномные изменения. [10]

Помимо рака, дерегуляция сигнализации белка рецептора смерти и набор домена смерти, как полагают, влияют на многие другие заболевания человека. В частности, домен смерти Fas может иметь мутации, которые приводят к аутоиммунному лимфопролиферативному синдрому (ALPS), раку легких и плоскоклеточной карциноме . [11] Дефект в сигнализации Fas может привести к нарушению функции комплекса сигнализации, индуцирующего смерть (DISC).

В частности, при ALPS апоптоз клеток, происходящий через путь CD95, оказывается жизненно важным для контроля пролиферации активированных лимфоцитов и регулирования гомеостаза лимфоцитов. Примечательно, что двухточечная мутация, которая происходит в участках A1009G и E256G, может вызывать дефект в апоптотических путях у людей с ALPS (Peters, 1999). Большинство пациентов с ALPS имеют мутации в гене Fas, и более 70 мутаций были сопоставлены с его внутриклеточным DD. [9]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Huang B, Eberstadt M, Olejniczak ET, Meadows RP, Fesik SW (1996). "ЯМР-структура и мутагенез домена смерти Fas (APO-1/CD95)". Nature . 384 (6610): 638–41. Bibcode :1996Natur.384..638H. doi :10.1038/384638a0. PMID  8967952. S2CID  2492303.
  2. ^ Вебер CH, Винченц C (август 2001 г.). «Суперсемейство доменов смерти: история двух интерфейсов?». Trends Biochem. Sci . 26 (8): 475–81. doi :10.1016/S0968-0004(01)01905-3. PMID  11504623.
  3. ^ Feinstein E, Kimchi A, Wallach D, Boldin M, Varfolomeev E (сентябрь 1995 г.). «Домен смерти: модуль, общий для белков с различными клеточными функциями». Trends Biochem. Sci . 20 (9): 342–4. doi :10.1016/S0968-0004(00)89070-2. PMID  7482697.
  4. ^ Reed JC, Doctor KS, Godzik A (июнь 2004 г.). «Домены апоптоза: перспектива геномики». Sci. STKE . 2004 (239): re9. doi :10.1126/stke.2392004re9. PMID  15226512. S2CID  40047696.
  5. ^ Wajant H (2003). «Рецепторы смерти». Essays Biochem . 39 : 53–71. doi :10.1042/bse0390053. PMID  14585074.
  6. ^ Bhardwaj A, Aggarwal BB (сентябрь 2003 г.). «Рецепторно-опосредованная хореография жизни и смерти». J. Clin. Immunol . 23 (5): 317–32. doi :10.1023/A:1025319031417. PMID  14601641. S2CID  9856850.
  7. ^ O'Neill LA, Dunne A, Edjeback M, Gray P, Jefferies C, Wietek C (2003). «Mal и MyD88: адаптерные белки, участвующие в передаче сигнала Toll-подобными рецепторами». J. Endotoxin Res . 9 (1): 55–9. doi :10.1179/096805103125001351. PMID  12691620.
  8. ^ Georgel P, Naitza S, Kappler C, Ferrandon D и др. (2001). «Иммунодефицит дрозофилы (IMD) — это белок домена смерти, который активирует антибактериальную защиту и может способствовать апоптозу». Developmental Cell . 1 (4): 503–514. doi : 10.1016/S1534-5807(01)00059-4 . ISSN  1534-5807. PMID  11703941.
  9. ^ ab Park HH, Lo YC, Lin SC, Wang L, Yang JK, Wu H (2007). «Суперсемейство доменов смерти во внутриклеточной сигнализации апоптоза и воспаления». Annual Review of Immunology . 25 : 561–86. doi :10.1146/annurev.immunol.25.022106.141656. PMC 2904440. PMID  17201679 . 
  10. ^ Derakhshan A, Chen Z, Van Waes C (2017). «Терапевтические малые молекулы нацелены на ингибиторы белков апоптоза при раке с дерегуляцией внешних и внутренних путей гибели клеток». Clinical Cancer Research . 23 (6): 1379–1387. doi :10.1158/1078-0432.CCR-16-2172. PMC 5354945. PMID  28039268 . 
  11. ^ "Сводка по заболеванию". Death Domain.org . Архивировано из оригинала 28 апреля 2016 года . Получено 30 мая 2017 года .
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR000488