Складка смерти — это мотив третичной структуры, обычно встречающийся в белках, участвующих в апоптозе или процессах, связанных с воспалением . Этот мотив обычно встречается в доменах, которые участвуют во взаимодействиях белок-белок, приводящих к образованию крупных функциональных комплексов. Примерами доменов складки смерти являются домен смерти (DD), эффекторный домен смерти (DED), домен рекрутирования каспазы (CARD) и домен пирина (PYD).
Домены складки смерти — это эволюционно консервативное суперсемейство доменов, которые опосредуют апоптотическую сигнализацию. Два типа апоптоза , внешний и внутренний, жестко регулируются взаимодействием активирующих и ингибирующих путей. Взаимодействия между четырьмя различными мотивами складки смерти являются объединяющим механизмом в обоих типах апоптоза.
Существует большое различие в первичной аминокислотной последовательности четырех различных мотивов death-fold, но каждый из них имеет схожую трехмерную структуру. Мотивы death-fold характеризуются шестью-семью плотно скрученными альфа-спиралями, расположенными в складке "Greek-key". Мотивы допускают специфические взаимодействия с белками, содержащими правильный гомотипический домен death-fold. [1]
Белки, содержащие CARD, встречаются во всем животном мире. Домены CARD присутствуют в нескольких прокаспазах млекопитающих и выполняют функции в апоптозе , обработке цитокинов , иммунной защите и активации NF-κB . У насекомых и нематод CARD, по-видимому, пока ограничены апоптотическими белками.
DD в основном встречаются у позвоночных (хотя они также присутствуют у некоторых других животных). DD содержатся в рецепторах цитокинов семейства рецепторов TNF . Белки DD функционируют в апоптозе и передаче сигналов NF-κB у млекопитающих, но только в передаче сигналов NF-κB у Drosophila .
DED присутствуют на каспазах и участвуют в активации каспаз. DED-содержащие каспазы функционируют в апоптозе, вызванном рецептором смерти, у млекопитающих, но отличаются у насекомых, где они участвуют в передаче сигналов NF-κB и антибактериальных реакциях.
ПИРИНЫ являются недавно обнаруженными доменами складки смерти, и их функции и взаимодействия еще предстоит четко выяснить.
Мотивы Death-fold , как полагают, оказывают свое действие исключительно посредством моновалентных гомотипических взаимодействий. В этих взаимодействиях death-fold связываются с другим доменом, содержащим death-fold, через тот же тип домена взаимодействия с белком. Эти взаимодействия являются высокоспецифичными, и не известны взаимодействия между различными типами доменов death-fold — в каждом известном случае партнеры по связыванию имеют гомологичный домен (DD-DD, CARD-CARD, DED-DED). Считается, что роль этих гомотипических взаимодействий заключается в самосборке. [1] Это приводит к образованию крупных многосубъединичных структур, состоящих только из одного типа белка.