ПРПФ6

Белкокодирующий ген у вида Homo sapiens

Фактор процессинга пре-мРНК 6 представляет собой белок , который у человека кодируется геном PRPF6 . ^{[5] [6] [7]}

Белок, кодируемый этим геном, по-видимому, участвует в сплайсинге пре-мРНК, возможно, действуя как связующий фактор между мяРНП U5 и U4/U6 при формировании сплайсосомы. Кодируемый белок также может связываться с рецептором андрогена, обеспечивая связь между активацией транскрипции и сплайсингом. ^[7]

Взаимодействия

Было показано, что PRPF6 взаимодействует с TXNL4B , ^[8] ARAF ^{[9] [10]} и андрогенным рецептором . ^[11]

Рекомендации

1. GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000101161 — Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002455 — Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Нисикими А, Мукаи Дж, Киока Н, Ямада М (январь 2000 г.). «Новый ядерный белок млекопитающих, аналогичный факторам сплайсинга пре-мРНК Schizosaccharomyces pombe Prp1p/Zer1p и Saccharomyces cerevisiae Prp6p». Биохим Биофиз Акта . 1435 (1–2): 147–52. дои : 10.1016/s0167-4838(99)00203-4. ПМИД  10561546.
6. Макаров Е.М., Макарова О.В., Аксель Т., Лурманн Р. (июнь 2000 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора сплайсинга prp6p содержит несколько элементов TPR и стабильно связан с мяРНП U5 посредством белок-белковых взаимодействий». Дж Мол Биол . 298 (4): 567–75. дои : 10.1006/jmbi.2000.3685. ПМИД  10788320.
7. «Ген Entrez: гомолог фактора 6 процессинга пре-мРНК PRPF6 PRP6 (S. cerevisiae)» .
8. Сунь, Сяоцзин; Чжан Хуа; Ван Дэн; Ма Далонг; Шэнь Янь; Шан Юнфэн (июль 2004 г.). «DLP, новый белок семейства Dim1, участвующий в сплайсинге пре-мРНК и развитии клеточного цикла». Ж. Биол. Хим . 279 (31). США: 32839–47. дои : 10.1074/jbc.M402522200 . ISSN  0021-9258. ПМИД  15161931.
9. Юрьев, Антон; Венногл Лоуренс П. (февраль 2003 г.). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2). США: 112–25. дои : 10.1016/S0888-7543(02)00008-3. ISSN  0888-7543. ПМИД  12620389.
10. Юрьев, А; Оно М; Гофф С.А.; Макалузо Ф; Венногл LP (июль 2000 г.). «Изоформ-специфическая локализация A-RAF в митохондриях». Мол. Клетка. Биол . 2013 ). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 4870–8. дои : 10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000. ISSN  0270-7306. ПМК 85938 . ПМИД  10848612. 
11. Чжао, Юэ; Гото Киминобу; Сайто Масаюки; Янасэ Тошихико; Номура Масатоши; Окабе Тайджиро; Такаянаги Рёичи; Навата Хадзиме (август 2002 г.). «Домен функции активации-1 андрогенного рецептора способствует взаимодействию между отсеком субъядерного фактора сплайсинга и отсеком ядерного рецептора. Идентификация белка, связывающего малые ядерные рибонуклеопротеиновые частицы p102 U5, в качестве коактиватора рецептора». Ж. Биол. Хим . 277 (33). США: 30031–9. дои : 10.1074/jbc.M203811200 . ISSN  0021-9258. ПМИД  12039962.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8. ПМИД  8125298.
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3. ПМИД  9373149.
• Юрьев А, Оно М, Гофф С.А. и др. (2000). «Изоформ-специфическая локализация A-RAF в митохондриях». Мол. Клетка. Биол . 20 (13): 4870–8. дои : 10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000. ПМК  85938 . ПМИД  10848612.
• Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20 хромосомы человека». Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D. дои : 10.1038/414865a . ПМИД  11780052.
• Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа». РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088. ПМК  1370266 . ПМИД  11991638.
• Чжао Ю., Гото К., Сайто М. и др. (2002). «Домен функции активации-1 андрогенного рецептора способствует взаимодействию между отсеком субъядерного фактора сплайсинга и отсеком ядерного рецептора. Идентификация белка, связывающего малые ядерные рибонуклеопротеиновые частицы p102 U5, в качестве коактиватора рецептора». Ж. Биол. Хим . 277 (33): 30031–9. дои : 10.1074/jbc.M203811200 . ПМИД  12039962.
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M. дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК  139241 . ПМИД  12477932.
• Юрьев А, Венногле Л.П. (2003). «Новые белок-белковые взаимодействия киназы raf, обнаруженные с помощью исчерпывающего двухгибридного анализа дрожжей». Геномика . 81 (2): 112–25. дои : 10.1016/S0888-7543(02)00008-3. ПМИД  12620389.
• Гото К., Чжао Ю., Сайто М. и др. (2003). «Домен функции активации-1 андрогенного рецептора способствует взаимодействию между двумя отдельными субъядерными компартментами». J. Стероидная биохимия. Мол. Биол . 85 (2–5): 201–8. дои : 10.1016/S0960-0760(03)00196-1. PMID  12943705. S2CID  46683850.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД  14702039.
• Уилл С.Л., Шнайдер С., Хоссбах М. и др. (2004). «Человеческий 18S U11/U12 snRNP содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме». РНК . 10 (6): 929–41. дои : 10.1261/rna.7320604. ПМЦ  1370585 . ПМИД  15146077.
• Сунь X, Чжан Х, Ван Д и др. (2004). «DLP, новый белок семейства Dim1, участвующий в сплайсинге пре-мРНК и развитии клеточного цикла». Ж. Биол. Хим . 279 (31): 32839–47. дои : 10.1074/jbc.M402522200 . ПМИД  15161931.
• Сузуки Ю., Ямашита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора». Геном Рез . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604. ПМК  515316 . ПМИД  15342556.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504. ПМК  528928 . ПМИД  15489334.
• Лаггербауэр Б., Лю С., Макаров Е. и др. (2005). «Белок 52K snRNP U5 человека (CD2BP2) взаимодействует с U5-102K (hPrp6), мостиковым белком три-snRNP U4/U6.U5, но диссоциирует при образовании три-snRNP». РНК . 11 (5): 598–608. дои : 10.1261/rna.2300805. ПМК  1370748 . ПМИД  15840814.
• Батше Э., Янив М., Мухард С. (2006). «Субъединица Brm человека SWI/SNF является регулятором альтернативного сплайсинга». Нат. Структура. Мол. Биол . 13 (1): 22–9. дои : 10.1038/nsmb1030. PMID  16341228. S2CID  11587161.
• Фан С., Гото К., Чен Г. и др. (2006). «Идентификация функциональных доменов ANT-1, нового коактиватора андрогенного рецептора». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 341 (1): 192–201. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.12.167. ПМИД  16414017.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии». Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134. ПМЦ  1847948 . ПМИД  17353931.

Внешние ссылки

• Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW об обзоре пигментного ретинита