Парварчеота

Тип архей

Парвархеота — тип архей , принадлежащий к археям DPANN . Они были обнаружены в кислых дренажных водах шахт, а затем и в морских отложениях . Клетки этих организмов чрезвычайно малы, что соответствует небольшим геномам . Метагеномные методы позволяют получить геномные последовательности некультивируемых организмов, которые были применены для определения этого типа. ^[1]

Типовой вид — Candidatus Parvarchaeum acidiphilum . У них очень маленькие клетки , около 400-500 нм, и уменьшенные геномы, состоящие примерно из 1000 генов . Архея аналогичного размера, обнаруженная в той же кислой среде, — это Candidatus Microarcheum из филума Micrarchaeota . ^{[1] [2]}

Согласно филогенетическим деревьям, Parvarchaeota может быть сестринской группой Thermoplasmata внутри Euryarchaeota ^[3] или принадлежать к DPANN ^[1] , хотя также было высказано предположение, что все археи DPANN филогенетически принадлежат Euryarchaeota. ^{[3] [4]}

Таксономия

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) ^[5] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI). ^[6]

• Семейство « Acidifodinimicrobiaceae » Luo et al. 2020 год
  • Род «Candidatus Acidifodinimicrobium» Luo et al. 2020 год
    • «Ca. A. mancum» Луо и др. 2020 год
• Семейство « Parvarchaeaceae » Rinke et al. 2020 год
  • Род «Candidatus Parvarchaeum» Baker et al. 2010 год
    • «Ca.P. acidiphilum» Baker et al. 2010 год
    • «Ca. P. paracidiphilum» корриг. Бейкер и др. 2010 год

Смотрите также

• Список родов архей

Рекомендации

1. Ринке С, Швентек П, Щирба А, Иванова Н.Н., Андерсон И.Дж., Ченг Дж.Ф., Дарлинг А., Малфатти С., Свон Б.К., Гис Э.А., Додсворт Дж.А., Хедлунд Б.П., Циамис Г., Зиверт С.М., Лю В.Т., Эйзен Дж.А., Халлам С.Дж., Кирпидес Н.К., Степанаускас Р., Рубин Э.М., Хугенхольц П., Войк Т. (25 июля 2013 г.). «Понимание филогении и кодирующего потенциала микробной темной материи». Природа . 499, 431–437 (2013) (7459): 431–437. Бибкод :2013Natur.499..431R. дои : 10.1038/nature12352 . hdl : 10453/27467 . ПМИД  23851394.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
2. Бретт Дж. Бейкер, Грегори Дж. Дик. Омик, «Подходы к микробной экологии: составление карты неизвестного». Анализ данных о последовательностях всего сообщества раскрывает разнообразие и функции конкретных микробных групп внутри некультивируемых типов и во всех микробных экосистемах. Академия.edu.
3. Петижан, К.; Дешам, П.; Лопес-Гарсия, П.; Морейра, Д. (2014). «Укоренение домена Archaea с помощью филогеномного анализа поддерживает основу нового царства Proteoarchaeota». Геном Биол. Эвол . 7 (1): 191–204. дои : 10.1093/gbe/evu274. ПМЦ 4316627 . ПМИД  25527841. 
4. Кавалер-Смит, Томас; Чао, Эма Э-Юнг (2020). «Мультидоменные рибосомальные белковые деревья и планктобактериальное происхождение неомуры (эукариоты, архебактерии)». Протоплазма . 257 (3): 621–753. дои : 10.1007/s00709-019-01442-7. ПМК 7203096 . ПМИД  31900730. 
5. Дж. П. Эзеби. «Парварчеота». Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 27 июня 2021 г.
6. Сэйерс; и другие. «Парварчеота». База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2021 г.