stringtranslate.com

Pyrolobus fumarii

Pyrolobus fumarii (лат. «огненная доля дымохода» [1] ) — вид архей, известный тем, что живет и размножается при чрезвычайно высоких температурах, которые убивают большинство организмов. [1] [2] P. fumarii известен как гипертермофил, облигатно хемолитоавтотроф . Проще говоря, эта архея лучше всего растет при теплых температурах от 80 °C до 115 °C. [3] [4] Она также использует готовые молекулы в качестве источника энергии, а не свет, неорганические вещества в качестве донора электронов, а CO 2 используется в качестве источника углерода. Впервые она была обнаружена в 1997 году в гидротермальном источнике «черный курильщик» на Срединно-Атлантическом хребте , установив верхний температурный порог для существования известной жизни на уровне 113 °C (235,4 °F) с оптимальной температурой 106 °C. [1] Этот вид «замерзает» или затвердевает и прекращает рост при температуре 90 °C (194 °F) и ниже. [3]

Метаболизм

Pyrolobus fumarii способны к клеточному росту и выживанию в диапазоне температур от 90 °C до 113 °C, при этом их оптимальная температура составляет около 106 °C. Известно лишь несколько видов, которые выживают при этой температуре. Им требуется диапазон pH около 4 - 6,5, который является относительно более кислым, чем нейтральным, для роста. [5] В дополнение к этому для оптимального роста и выживания микроба требуется 1% - 4% NaCl для поддержания правильной осмолярности клетки. Высокое давление не является проблемой для роста, поскольку метаболизм был обнаружен при 25 000 кПа в течение 22 часов. [2] Важное отличие, которое следует сделать в отношении этой археи, заключается в том, что она не растет в средах, содержащих ацетат , пируват , глюкозу, крахмал и элементарную серу. Ее единственным конечным акцептором электронов является нитрат, NO3-. Нитрат не является наиболее желаемым конечным акцептором электронов из-за того, что он имеет гораздо меньший выход АТФ. Исследование показало, что P. fumarii обладает способностью к росту за счет восстановления тиосульфата, однако в присутствии NH4 Cl рост архей приводит к пятикратному увеличению выхода [2]. Для P. fumarii восстановление сукцинил-КоА , которое используется в процессе генерации энергии в клетке, не зависит от НАД(п)Н , а вместо этого требует восстановленного метилвиологена. Предполагается, что термостабильность P. fumarii обусловлена ​​накоплением необычных органических растворенных веществ. Предполагается, что одно из этих растворенных веществ играет роль в димио-инозитолфосфате (ДИП), поскольку оно связано с реакцией на тепловой стресс. [1] Некоторые исследования показали, что аналогичный вид архей P. furiosus увеличился в 20 раз при изменении температуры с 95 °C до 101 °C в присутствии ДИП. [4]

Электронно-микроскопические изображения Pyrolobus fumarii после заливки в Эпон и замораживания-замещения.

Структура

Сканирующая электронная микрофотография Pyrolobus fumarii

Структура P. fumarii содержит S-слой , обычно встречающийся в нелабораторных прокариотических штаммах, который стимулирует пору с углублением в середине. Археи также содержат цитоплазматическую мембрану и периплазматическое пространство. Основные основные липиды этого штамма - нециклизированный глицерин-диалкил-глицерин-тетраэфир ( ГДГТ ) и следы 2,3-ди-о-фитанил-sn-глицерина ( диэфир ). Они описываются как кокки правильной неправильной формы, что означает, что они относительно круглые и сгруппированы поодиночке, а не связаны цепочкой. [5] По форме P. fumarii имеет коккообразную форму, однако не образует идеально круглую форму, а скорее дольчатую с диаметром от 0,7 до 2,5 мкм. [6]

Приложение

Понимание способности P. fumarii выдерживать высокие температуры и способности его генома быть термостабильным и термоустойчивым приводит к множеству фармацевтических, сельскохозяйственных и промышленных применений. Продукты, которые могут использовать термостабильный микроорганизм, включают ферменты для обработки сельскохозяйственной продукции, приложения для биоремедиации , промышленные и потребительские ферменты и даже фармацевтические приложения, где необходим высокотермостабильный организм. [3] При работе с этой культурой рекомендуется работать в условиях ниже 85 °C, поскольку ниже этой температуры рост P. fumarii отсутствует . [6] Важно помнить, что это предотвращает рост, но не убивает археи. Это понимание может быть включено в лабораторную практику при работе с видами.

Ссылки

  1. ^ abcd Армстронг, Джозеф Э. (2014). Как Земля стала зеленой: краткая история растений длиной в 3,8 миллиарда лет . Издательство Чикагского университета. ISBN 978-0-226-06980-7.[ нужна страница ]
  2. ^ ab C.Michael Hogan. 2010. Extremophile. ред. E.Monosson и C.Cleveland. Encyclopedia of Earth. Национальный совет по науке и окружающей среде, Вашингтон, округ Колумбия
  3. ^ abc "Diversa объявляет о завершении секвенирования генома Pyrolobus fumarii; секвенирована генетическая информация самого высокотемпературного организма в мире" (пресс-релиз). Diversa Corporation. 25 сентября 2001 г. ProQuest  447100182.
  4. ^ ab Mohanty, Anee; Shilpa; Meena, Sumer Singh (2022). «Микробная адаптация к экстремальным температурам: обзор молекулярных механизмов для промышленного применения». Экстремозимы и их промышленное применение . стр. 115–139. doi :10.1016/B978-0-323-90274-8.00009-5. ISBN 978-0-323-90274-8.
  5. ^ Аб Андерсон, Иэн; Гёкер, Маркус; Нолан, Мэтт; Лукас, Сьюзен; Хэммон, Нэнси; Дешпанде, Света; Ченг, Ян-Фан; Тапиа, Роксана; Хан, Клифф; Гудвин, Линн; Питлак, Сэм; Хантеманн, Марсель; Лиолиос, Константинос; Иванова, Наталья; Пагани, Иоанна; Мавроматис, Константинос; Овчиникова Галина; Пати, Амрита; Чен, Эми; Паланиаппан, Кришна; Земля, Мириам; Хаузер, Лорен; Брамбилла, Эвелин-Мари; Хубер, Харальд; Ясавонг, Монтри; Роде, Манфред; Весна, Стефан; Абт, Бирте; Сикорский, Йоханнес; Вирт, Рейнхард; Деттер, Джон К.; Войке, Таня; Бристоу, Джеймс; Эйзен, Джонатан А.; Марковиц, Виктор; Хугенхольц, Филипп; Кирпидес, Никос К.; Кленк, Ханс-Петер; Лапидус, Алла (июль 2011 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильного хемолитоавтотрофного штамма Pyrolobus fumarii (1AT)» . Стандарты в геномных науках . 4 (3): 381–392. doi :10.4056/sigs.2014648. PMC 3156397 . PMID  21886865. 
  6. ^ аб Блёхль, Элизабет; Рэйчел, Рейнхард; Бургграф, Зигфрид; Хафенбрадль, Дорис; Яннаш, Хольгер В.; Стеттер, Карл О. (1 февраля 1997 г.). «Pyrolobus fumarii, gen. и sp. nov., представляет собой новую группу архей, расширяющую верхний температурный предел жизни до 113°C». Экстремофилы . 1 (1): 14–21. дои : 10.1007/s007920050010. ISSN  1431-0651. ПМИД  9680332.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

fr:Pyrolobus fumarii