stringtranslate.com

Питер Г. Шульц

Питер Г. Шульц (родился 23 июня 1956 года) — американский химик. Он является генеральным директором и профессором химии в Научно-исследовательском институте Скриппса [1], основателем и бывшим директором GNF [ 2] и директором-основателем Калифорнийского института биомедицинских исследований (Calibr), созданного в 2012 году. В августе 2014 года журнал Nature Biotechnology назвал Шульца лучшим трансляционным исследователем 2013 года [3].

Академическая карьера

Шульц получил степень бакалавра в Калтехе в 1979 году и продолжил там обучение для получения докторской степени (в 1984 году) у Питера Дервана . Его диссертационная работа была сосредоточена на получении и характеристике 1,1-диазенов и получении селективных к последовательности полипиррольных ДНК-связывающих/расщепляющих молекул. Затем он провел год в Массачусетском технологическом институте у Кристофера Уолша, прежде чем присоединиться к химическому факультету Калифорнийского университета в Беркли . Он стал главным исследователем Национальной лаборатории Лоуренса в Беркли в 1985 году и исследователем Медицинского института Говарда Хьюза в 1994 году. [4] В 1999 году Шульц перешел в Научно-исследовательский институт Скриппса , а также стал директором-основателем Института геномики Исследовательского фонда Novartis (GNF), который был инициирован исключительно как геномный исследовательский филиал Novartis, но который вырос за время пребывания Шульца в должности, включив в себя значительные усилия по открытию лекарств и более чем утроив количество предполагаемых сотрудников (в настоящее время более 500 человек). В марте 2010 года он покинул GNF, чтобы вернуться в некоммерческий сектор, и основал Калифорнийский институт биомедицинских исследований (Calibr) в марте 2012 года. [5] [6] [7] [8] Он обучил более 300 аспирантов и постдокторантов, многие из которых работают на факультетах крупных исследовательских университетов. [9]

Исследовать

Комбинаторная химия и молекулярная эволюция

Большая часть работы Шульца заключается в поиске способов проводить множество похожих экспериментов одновременно, на многих различных соединениях. Он является одним из ведущих пионеров комбинаторной химии , скрининговых молекулярных библиотек и «высокопроизводительной» химии. Его интересы чрезвычайно широки, с приложениями в таких разнообразных областях, как каталитические механизмы, клеточная специализация и другие сложные биологические процессы (обычно изучаемые биологами, а не химиками), базовая фотохимия, биофизические зонды всех мастей от ЯМР до ​​позитронной эмиссии и твердотельное материаловедение.

В начале своей карьеры Шульц показал, что естественное молекулярное разнообразие иммунной системы может быть направлено на создание каталитических антител . Этот метод позволил впоследствии разработать множество новых селективных ферментоподобных катализаторов для реакций, начиная от переноса ацила и окислительно-восстановительных реакций до перициклических и металлированных реакций. Хотя их каталитическая активность лишь изредка бывает достаточно сильной, чтобы иметь практическое применение, каталитические антитела предоставили важные новые идеи в нашем понимании биокатализа, структурной пластичности белков, эволюции биохимической функции и самой иммунной системы.

Затем Шульц применил молекулярное разнообразие — стратегию создания большого сообщества различных молекул, а также метод вылавливания и идентификации тех, которые делают то, что вам нужно, — к ряду проблем в химии, биологии и материаловедении. Вместе с Ричардом Лернером он был одним из важнейших игроков в разработке библиотек фаговых дисплеев и чипов поверхностных библиотек . Для высокопроизводительных биоанализов, требующих свободно растворимых тестовых соединений, он использует микророботизированные системы манипуляции жидкостями, адаптированные для 1536-микролуночных планшетов для культивирования клеток, чтобы отдельно обрабатывать очень маленькие колонии клеток большим количеством (сотни тысяч) различных соединений. [10]

Используя эти различные высокопроизводительные и комбинаторные экспериментальные подходы, Шульц идентифицировал материалы с новыми оптическими, электронными и каталитическими свойствами, а также белки и малые молекулы, которые контролируют важные биологические процессы, такие как старение, рак, аутоиммунитет, а также дифференцировку стволовых клеток и их деспециализацию обратно к плюрипотентности.

Неприродные аминокислоты

Шульц был пионером метода добавления новых строительных блоков , помимо обычных двадцати аминокислот , в генетические коды прокариотических и эукариотических организмов. Это достигается путем скрининга библиотек мутантных аминоацил-тРНК-синтетаз на предмет мутантов, которые заряжают бессмысленно-кодоновые тРНК желаемой неприродной аминокислотой. Организм, который экспрессирует такую ​​синтетазу, затем может быть генетически запрограммирован на включение неприродной аминокислоты в желаемый белок обычным способом , с бессмысленным кодоном, теперь кодирующим неприродную аминокислоту. Обычно сама неприродная аминокислота должна быть синтезирована в лаборатории и предоставлена ​​организму путем добавления ее в питательную среду организма. Неприродная аминокислота также должна иметь возможность проходить через клеточную мембрану организма во внутреннюю часть организма.

Более семидесяти неприродных аминокислот были генетически закодированы в бактериях, дрожжах и клетках млекопитающих, включая фотореактивные, химически реактивные, флуоресцентные, спин-активные, сульфатированные, префосфорилированные и связывающие металл аминокислоты. Эта технология позволяет химикам исследовать и изменять свойства белков in vitro или in vivo , направляя новые, синтезированные в лаборатории химические фрагменты специально в любой выбранный участок любого интересующего белка.

Был создан бактериальный организм, который биосинтезирует новую, ранее не встречающуюся в природе аминокислоту (п-аминофенилаланин) из основных источников углерода и включает эту аминокислоту в свой генетический код. [11] [12] Это первый пример создания автономного организма, состоящего из двадцати одной аминокислоты.

Неестественная генетическая информация

Группа Шульца недавно создала бактерии, хромосомы которых включают неестественные основания ДНК, и бактерии, хромосомы которых являются гибридами, включающими как РНК, так и ДНК. [13] [14]

Происхождение митохондрий

Для того чтобы исследовать детали традиционно принятой гипотезы о том, что митохондрии возникли, когда независимые бактерии, способные к дыхательному (кислородзависимому) метаболизму, поселились внутри клеток-хозяев, которые ранее были способны только к ферментации (метаболизму без использования кислорода), и эволюционировали, чтобы установить симбиотические отношения с ними, [15] группа Шульца создала бактерии, способные выживать внутри клеток дрожжей и поддерживать симбиотические отношения с клетками-хозяевами дрожжей, выполняя реакции, которые клетки дрожжей не могут катализировать без бактерий. [16] Одной из целей этой работы является культивирование гибридов дрожжей и бактерий и наблюдение за тем, эволюционирует ли бактериальный геном, чтобы увеличить взаимную выгоду от его химических взаимодействий с клетками-хозяевами, как это произошло с митохондриями с течением времени. [17]

Коммерческая деятельность

Он является основателем Affymax Research Institute, Symyx Technologies , Syrrx, Kalypsys, Phenomix, Ilypsa, Ambrx и Wildcat Discovery Technologies. [ необходима ссылка ]

Публикации и опровержения

Шульц является автором около 500 статей. [9]

Одна из его статей в PNAS 2013 года о создании более стабильных антител была отозвана из-за подозрительных данных от соавтора Шиладитьи Сена:

Две статьи из его лаборатории, опубликованные в 2004 году, одна в Science и одна в Journal of the American Chemical Society , были отозваны в 2009 году и касались работы в лаборатории Шульца постдока Чживэня Чжана по включению неродных гликозилированных аминокислот в белки. Если бы это удалось, этот метод мог бы стать важным инструментом для исследования функций прикрепления углеводов к белкам; однако, работа не могла быть воспроизведена, и когда лаборатория отправилась на поиски соответствующих блокнотов, они пропали. В ходе расследования Чжан получал электронные письма и телефонные звонки с шантажом, и в какой-то момент человек, делавший это, написал в несколько учреждений и Science, что он или она собирается совершить самоубийство. В конечном итоге лаборатория определила проблему как непонимание функции ключевого фермента, используемого в экспериментах. [18] Статьи были следующими:

Награды

Шульц является членом Американской национальной академии наук (1993), Института медицины Национальной академии наук (1998). [4]

Ссылки

  1. ^ «Исследовательский институт Скриппса назначает Питера Шульца генеральным директором, Стива Кея — президентом».
  2. ^ "Xconomy: Питер Шульц покидает руководящую должность в Институте геномики исследовательского фонда Novartis". 2010-07-14.
  3. ^ Хаггетт, Брэди; Пайснер, Кэтрин (7 августа 2014 г.). «20 лучших исследователей трансляционной науки в 2013 г.». Nature Biotechnology . 32 (8): 720. doi : 10.1038/nbt.2986 . PMID  25101739.
  4. ^ ab "Лектор Карла Шиппа Марвела 2008-09 - Питер Г. Шульц | Химия в Иллинойсе".
  5. ^ "calibr | Калифорнийский институт биомедицинских исследований>". Архивировано из оригинала 2012-03-19.
  6. ^ «Merck создаст институт и наймет 150 человек в Ла-Хойе». 2012-03-15.
  7. ^ «Новая модель сотрудничества Merck». Новости химии и машиностроения .
  8. Service, RF (15 марта 2012 г.). «Новый институт стремится помочь ученым создавать лекарства». Science . 335 (6074): 1288–1289. Bibcode :2012Sci...335.1288S. doi :10.1126/science.335.6074.1288. PMID  22422951.
  9. ^ ab Curriculum Vitae Архивировано 28.03.2008 на Wayback Machine
  10. ^ Lyssiotis, Costas A.; Foreman, Ruth K.; Staerk, Judith; Garcia, Michael; Mathur, Divya; Markoulaki, Styliani; Hanna, Jacob; Lairson, Luke L.; Charette, Bradley D.; Bouchez, Laure C.; Bollong, Michael; Kunick, Conrad; Brinker, Achim; Cho, Charles Y.; Schultz, Peter G.; Jaenisch, Rudolf (2 июня 2009 г.). «Перепрограммирование мышиных фибробластов в индуцированные плюрипотентные стволовые клетки с химической комплементарностью Klf4». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (22): 8912–8917. Bibcode : 2009PNAS..106.8912L. doi : 10.1073/pnas.0903860106 . PMC 2690053. PMID  19447925 . 
  11. ^ "Лаборатория Питера Г. Шульца". Архивировано из оригинала 2010-05-23.}
  12. ^ «Контекст :: Бактерии из 21 аминокислоты: Расширение генетического кода».
  13. ^ «Исследования».
  14. ^ Мехта, Ангад П.; Ван, Иян; Рид, Шон А.; Супекова, Любица; Джавахишвили, Цотне; Чапут, Джон К.; Шульц, Питер Г. (30 августа 2018 г.). «Бактериальный геном, содержащий химерные последовательности ДНК-РНК». Журнал Американского химического общества . 140 (36): 11464–11473. doi : 10.1021/jacs.8b07046. PMID  30160955. S2CID  52132524.
  15. ^ Мартин, Уильям Ф.; Ментель, Марек (2010). «Происхождение митохондрий». Nature Education . 3 (9): 58.
  16. ^ Mehta, Angad P.; Supekova, Lubica; Chen, Jian-Hua; Pestonjamasp, Kersi; Webster, Paul; Ko, Yeonjin; Henderson, Scott C.; McDermott, Gerry; Supek, Frantisek; Schultz, Peter G. (13 ноября 2018 г.). «Инженерные дрожжевые эндосимбионты как шаг к эволюции митохондрий». Труды Национальной академии наук . 115 (46): 11796–11801. Bibcode : 2018PNAS..11511796M. doi : 10.1073/pnas.1813143115 . PMC 6243291. PMID  30373839 . 
  17. ^ Mehta, Angad P.; Ko, Yeonjin; Supekova, Lubica; Pestonjamasp, Kersi; Li, Jack; Schultz, Peter G. (16 августа 2019 г.). «К синтетическому дрожжевому эндосимбионту с минимальным геномом». Журнал Американского химического общества . 141 (35): 13799–13802. doi :10.1021/jacs.9b08290. PMC 6999831. PMID 31419116  . 
  18. ^ Сервис, Роберт Ф. (2009). «Темная история двух ретракций». Science . 326 (5960): 1610–1611. Bibcode :2009Sci...326.1610S. doi :10.1126/science.326.5960.1610. JSTOR  27736671. PMID  20019260.
  19. ^ «Питер Шульц получил премию Тетраэдр за креативность в органической химии».
  20. ^ "Йельский университет присуждает девять почетных степеней на церемонии вручения дипломов 2015 года". 2015-05-15.
  21. ^ «Питер Шульц получит премию Сольвея | Новости химии и машиностроения».
  22. ^ "Почетные докторские степени - Уппсальский университет, Швеция". 9 июня 2023 г.

Внешние ссылки