stringtranslate.com

Проект генетики мышей

Проект «Генетика мышей» (MGP) — это крупномасштабная программа по производству и фенотипированию мутантных мышей , направленная на выявление новых модельных организмов болезней. [1] [2] [3] [4]

Проект, основанный в Институте Wellcome Trust Sanger , использует нокаутированных мышей , большинство из которых были созданы Международным консорциумом нокаутированных мышей . Для каждой мутантной линии группы из семи самцов и семи самок мышей проходят через стандартный аналитический конвейер, направленный на выявление признаков, которые отличаются от здоровых мышей C57BL/6 . [1] Конвейер собирает множество измерений жизнеспособности, фертильности, веса тела, инфекции, слуха, морфологии, гематологии, поведения, химии крови и иммунитета и сравнивает их с контрольными образцами дикого типа с помощью статистической смешанной модели . [5] Эти данные немедленно распространяются среди научного и медицинского исследовательского сообщества через специальную базу данных открытого доступа , [6] а резюме отображаются в других онлайн-ресурсах, включая базу данных Mouse Genome Informatics и основанную на Википедии Gene Wiki . [4]

По состоянию на июль 2013 года MGP сообщает о наличии более 900 мутантных линий, находящихся в открытом доступе для международного исследовательского сообщества [4] , и о наличии «практически полного» анализа более 650 мутантных линий, [6] из которых более 75 процентов имеют по крайней мере один аномальный фенотип. [1] Среди них — новые открытия генов, вовлеченных в заболевания, включая обнаружение:

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc Ayadi A, Birling MC, Bottomley J, et al. (октябрь 2012 г.). «Инициативы по крупномасштабному фенотипированию мышей: обзор Европейской клиники болезней мышей (EUMODIC) и проекта по генетике мышей Института Сэнгера Wellcome Trust». Mamm. Genome . 23 (9–10): 600–10. doi :10.1007/s00335-012-9418-y. PMC  3463797 . PMID  22961258.
  2. ^ Gerdin AK (2010). «Программа генетики мышей Сэнгера: высокопроизводительная характеристика нокаутных мышей». Acta Ophthalmologica . 88 (S248). doi :10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  3. ^ ab van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). «Инструментарий генетики мышей: выявление функции и механизма». Genome Biol . 12 (6): 224. doi : 10.1186 /gb-2011-12-6-224 . PMC 3218837. PMID  21722353. 
  4. ^ abc White JK, Gerdin AK, Karp NA, et al. (Июль 2013). «Genome-wide Generation and Systematic Phenotyping of Knockout Mice Reveals New Roles for Many Genes». Cell . 154 (2): 452–64. doi :10.1016/j.cell.2013.06.022. PMC 3717207 . PMID  23870131. 
  5. ^ Карп NA, Мелвин D, Мотт RF (2012). «Надежный и чувствительный анализ фенотипов нокаутированных мышей». PLoS ONE . 7 (12): e52410. Bibcode : 2012PLoSO...752410K. doi : 10.1371/journal.pone.0052410 . PMC 3530558. PMID  23300663 . 
  6. ^ Портал ресурсов для мышей, Wellcome Trust Sanger Institute .
  7. ^ Alderton GK (март 2011 г.). «Геномная нестабильность: расширение анемии Фанкони». Nat. Rev. Cancer . 11 (3): 158–159. doi :10.1038/nrc3027. PMID  21451554. S2CID  26277627.
  8. ^ Crossan GP, ​​van der Weyden L, Rosado IV, Langevin F, Gaillard PH, McIntyre RE, Gallagher F, Kettunen MI, Lewis DY, Brindle K, Arends MJ, Adams DJ, Patel KJ (февраль 2011 г.). «Нарушение работы мышиного Slx4, регулятора структурно-специфических нуклеаз, фенокопии анемии Фанкони». Nat. Genet . 43 (2): 147–52. doi :10.1038/ng.752. PMC 3624090. PMID  21240276 . 
  9. ^ Bassett JH, Gogakos A, White JK, Evans H, Jacques RM, van der Spek AH, Ramirez-Solis R, Ryder E, Sunter D, Boyde A, Campbell MJ, Croucher PI, Williams GR (2012). «Быстрое фенотипирование скелета 100 нокаутных мышей выявляет 9 новых генов, определяющих прочность костей». PLoS Genet. 8 (8): e1002858. doi : 10.1371/journal.pgen.1002858 . PMC 3410859 . PMID  22876197.  
  10. ^ McIntyre RE, Lakshminarasimhan Chavali P, Ismail O, Carragher DM, Sanchez-Andrade G, Forment JV, Fu B, Del Castillo Velasco-Herrera M, Edwards A, van der Weyden L, Yang F, Ramirez-Solis R, Estabel J, Gallagher FA, Logan DW, Arends MJ, Tsang SH, Mahajan VB, Scudamore CL, White JK, Jackson SP, Gergely F, Adams DJ (2012). "Нарушение работы мышиного Cenpj, регулятора биогенеза центриолей, фенокопии синдрома Секкеля". PLOS Genet . 8 (11): e1003022. doi : 10.1371/journal.pgen.1003022 . PMC 3499256 . PMID  23166506. 
  11. ^ Nijnik A, Clare S, Hale C, Chen J, Raisen C, Mottram L, Lucas M, Estabel J, Ryder E, Adissu H, Adams NC, Ramirez-Solis R, White JK, Steel KP, Dougan G, Hancock RE (июль 2012 г.). «Роль транспортера сфингозин-1-фосфата Spns2 в функционировании иммунной системы». J. Immunol. 189 (1): 102–11. doi :10.4049/jimmunol.1200282. PMC 3381845 . PMID  22664872.  
  12. ^ Nijnik A, Clare S, Hale C, Raisen C, McIntyre RE, Yusa K, Everitt AR, Mottram L, Podrini C, Lucas M, Estabel J, Goulding D, Adams N, Ramirez-Solis R, White JK, Adams DJ, Hancock RE, Dougan G (февраль 2012 г.). «Критическая роль гистоновой H2A-деубиквитиназы Mysm1 в гемопоэзе и дифференцировке лимфоцитов». Blood . 119 (6): 1370–9. doi : 10.1182/blood-2011-05-352666 . PMID  22184403.

Внешние ссылки