stringtranslate.com

Рэнди Рид

Рэнди Джон Рид FRS [9] (родился 9 июня 1957 г.) [4] — главный научный сотрудник Wellcome Trust и профессор кристаллографии белков в Кембриджском университете . [1] [10] [11] [12]

Образование

Рид получил образование в Университете Альберты в Эдмонтоне, Канада, где ему была присуждена степень бакалавра наук в 1979 году, а затем докторская степень в 1986 году [4] за рентгеновскую кристаллографию сериновых протеаз и их белковых ингибиторов под руководством Майкла Н.Г. Джеймса . [2] [3]

Карьера и исследования

После получения докторской степени Рид был назначен доцентом с 1988 по 1993 год и доцентом с 1993 по 1998 год в Университете Альберты. [4] По состоянию на 2017 год исследовательские интересы Рида заключаются в кристаллографии белков и оценке максимального правдоподобия . [1] Его исследования были опубликованы в ведущих рецензируемых научных журналах, включая Nature , [13] [14] [15] Science , [16] the Journal of Applied Crystallography [5] Acta Crystallographica , [7] [17] [18] ] Структура , [19] [20] PNAS , [21] Журнал молекулярной биологии [22] [23] и Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . [24]

Награды и почести

Рид был избран членом Королевского общества (FRS) в 2014 году. Его номинация гласит:

Профессор Рид известен во всем мире своим выдающимся и фундаментальным вкладом в разработку программного обеспечения для макромолекулярной кристаллографии. Его применение алгоритмов , основанных на максимальном правдоподобии , для решения макромолекулярных кристаллических структур путем молекулярной замены (метод, который использует известную структуру гомолога для определения неизвестной структуры), привело к созданию программного обеспечения (Phaser), которое является передовым в этой области. Он также разработал и продемонстрировал улучшенную целевую функцию правдоподобия для уточнения модели, которая была принята во всех основных программах уточнения. Кроме того, профессор Рид руководил структурной работой , которая внесла значительный вклад в понимание механизмов действия белков, вызывающих заболевания ( бактериальные токсины и серпины ). [9]

Рекомендации

  1. ^ abc Рэнди Прочтите публикации, проиндексированные Google Scholar.
  2. ^ аб Фудзинага, Масао; Селецкий, Анита Р.; Прочтите, Рэнди Дж.; Ардельт, Войцех; Ласковский, Майкл; Джеймс, Майкл Н.Г. (1987). «Кристаллические и молекулярные структуры комплекса α-химотрипсина с его ингибитором третьего домена овомукоида Турции при разрешении 1,8 Å». Журнал молекулярной биологии . 195 (2): 397–418. дои : 10.1016/0022-2836(87)90659-0. ISSN  0022-2836. ПМИД  3477645.
  3. ^ ab Рид, Рэнди Джон (1986). Рентгенокристаллографические исследования сериновых протеиназ и их белковых ингибиторов (кандидатская диссертация). дои : 10.7939/R33776175. hdl :10402/era.3098. ПроКвест  250072156.
  4. ^ abcd Анон (2014). «Читайте, профессор Рэнди Джон» . Кто есть кто (онлайн- изд. Oxford University Press  ). А&С Черный. дои : 10.1093/ww/9780199540884.013.43034. (Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании.)
  5. ^ Аб Маккой, AJ; Гросс-Кунстлеве, RW; Адамс, PD; Уинн, доктор медицины; Стороны, ЛК; Прочтите, Р.Дж. (2007). «Кристаллографическое программное обеспечение Phaser». Журнал прикладной кристаллографии . 40 (4): 658–674. Бибкод : 2007JApCr..40..658M. CiteSeerX 10.1.1.322.8550 . дои : 10.1107/S0021889807021206. ПМЦ 2483472 . ПМИД  19461840.  
  6. ^ Адамс, PD; Гросс-Кунстлеве, RW; Хунг, ЛВ; Йоргер, ТР; Маккой, Эй Джей; Мориарти, Северо-Запад; Читай, Р.Дж.; Саккеттини, Дж. К.; Заутер, Северная Каролина; Тервиллигер, TC (2002). «ФЕНИКС: Создание нового программного обеспечения для автоматического определения кристаллографической структуры». Acta Crystallographica Раздел D. 58 (11): 1948–1954. Бибкод : 2002AcCrD..58.1948A. дои : 10.1107/S0907444902016657 . hdl : 1969.1/180215 . ПМИД  12393927.
  7. ^ Аб Адамс, PD; Афонин, П.В.; Бункоци, Великобритания; Чен, В.Б.; Дэвис, штат Айова; Эчолс, Н.; Хедд, Джей-Джей; Хунг, ЛВ; Капрал, Дж.Дж.; Гросс-Кунстлеве, RW; Маккой, Эй Джей; Мориарти, Северо-Запад; Оффнер, Р.; Читай, Р.Дж.; Ричардсон, округ Колумбия; Ричардсон, Дж. С.; Тервиллигер, ТК; Зварт, PH (2010). «ФЕНИКС: Комплексная система на основе Python для решения структуры макромолекул». Acta Crystallographica Раздел D. 66 (2): 213–21. Бибкод : 2010AcCrD..66..213A. дои : 10.1107/S0907444909052925. ПМК 2815670 . ПМИД  20124702. 
  8. ^ Либшнер, Дороти; Афонин Павел Владимирович; Бейкер, Мэтью Л.; Бункоци, Габор; Чен, Винсент Б.; Кролл, Тристан И.; Хинтце, Брэдли; Хун, Ли-Вэй; Джайн, Свати; Маккой, Эйрли Дж.; Мориарти, Найджел В.; Оффнер, Роберт Д.; Пун, Билли К.; Присант, Майкл Г.; Прочтите, Рэнди Дж. (1 октября 2019 г.). «Определение макромолекулярной структуры с использованием рентгеновских лучей, нейтронов и электронов: последние разработки в Фениксе». Acta Crystallographica Раздел D: Структурная биология . 75 (10): 861–877. Бибкод : 2019AcCrD..75..861L. дои : 10.1107/S2059798319011471. ISSN  2059-7983. ПМК 6778852 . ПМИД  31588918. 
  9. ^ аб Анон (2014). «Профессор Рэнди Рид ФРС». Лондон: royalsociety.org. Архивировано из оригинала 5 августа 2014 года.
  10. ^ Публикации Рэнди Рида, индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
  11. ^ Прочтите, Рэнди (2017). «Домашняя страница Рэнди Рида» . Кембриджский университет. Архивировано из оригинала 15 мая 2013 года. [ мертвая ссылка ]
  12. ^ Рэнди Прочтите публикации из Европы PubMed Central.
  13. ^ Чжоу, А.; Каррелл, RW; Мерфи, член парламента; Вэй, З.; Ян, Ю.; Стэнли, ПЛД; Штейн, ЧП; Пипкин, ФБ; Прочтите, Р.Дж. (2010). «Окислительно-восстановительный переключатель в ангиотензиногене модулирует высвобождение ангиотензина». Природа . 468 (7320): 108–11. Бибкод : 2010Natur.468..108Z. дои : 10.1038/nature09505. ПМК 3024006 . ПМИД  20927107. 
  14. ^ Димайо, Ф.; Тервиллигер, ТК; Читай, Р.Дж.; Влодавер, А.; Обердорфер, Г.; Вагнер, Ю.; Вальков Е.; Алон, А.; Фасс, Д.; Аксельрод, Х.Л.; Дас, Д.; Воробьев С.М.; Иваи, Х.; Поккулури, PR; Бейкер, Д. (2011). «Улучшенная молекулярная замена за счет оптимизации структуры белка с учетом плотности и энергии». Природа . 473 (7348): 540–3. Бибкод : 2011Natur.473..540D. дои : 10.1038/nature09964. ПМЦ 3365536 . ПМИД  21532589. 
  15. ^ Цянь, Б.; Раман, С.; Дас, Р.; Брэдли, П.; Маккой, Эй Джей; Читай, Р.Дж.; Бейкер, Д. (2007). «Прогнозирование структуры с высоким разрешением и проблема кристаллографической фазы». Природа . 450 (7167): 259–64. Бибкод : 2007Natur.450..259Q. дои : 10.1038/nature06249. ПМК 2504711 . ПМИД  17934447. 
  16. ^ Джексон, Р.Н.; Золотой, СМ; Ван Эрп, ПБ; Картер, Дж; Вестра, скорая помощь; Браунс, С.Дж.; Ван дер Ост, Дж; Тервиллигер, ТК; Читай, Р.Дж.; Виденхефт, Б (2014). «Структурная биология. Кристаллическая структура надзорного комплекса CRISPR, управляемого РНК, из Escherichia coli». Наука . 345 (6203): 1473–9. дои : 10.1126/science.1256328. ПМК 4188430 . ПМИД  25103409. 
  17. ^ Брюнгер, АТ; Адамс, PD; Клор, генеральный директор; Делано, WL; Грос, П.; Гросс-Кунстлеве, RW; Цзян, Дж. С.; Кушевский Дж.; Нильгес, М.; Панну, Н.С.; Читай, Р.Дж.; Райс, Л.М.; Симонсон, Т.; Уоррен, Г.Л. (1998). «Система кристаллографии и ЯМР: новый пакет программного обеспечения для определения макромолекулярной структуры». Acta Crystallographica Раздел D. 54 (5): 905–21. Бибкод : 1998AcCrD..54..905B. дои : 10.1107/S0907444998003254. PMID  9757107. S2CID  33910776.
  18. ^ Рид, Р.Дж.; Клейвегт, Дж.Дж. (2009). «Проверка структуры, контролируемой регистром». Acta Crystallographica Раздел D. 65 (Часть 2): 140–7. Бибкод : 2009AcCrD..65..140R. дои : 10.1107/S0907444908041085. ПМЦ 2631636 . ПМИД  19171969. 
  19. ^ Рид, Р.Дж.; Адамс, PD; Арендал ВБ, 3-й; Брунгер, АТ; Эмсли, П; Йоостен, Р.П.; Клейвегт, Г.Дж.; Криссинель, Е.Б.; Люттеке, Т; Отвиновский, З; Перракис, А; Ричардсон, Дж. С.; Шеффлер, штат Вашингтон; Смит, Дж. Л.; Тикл, Эй Джей; Вренд, Г; Зварт, PH (2011). «Новое поколение инструментов кристаллографической проверки для банка данных белков». Состав . 19 (10): 1395–412. doi :10.1016/j.str.2011.08.006. ПМЦ 3195755 . ПМИД  22000512. {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  20. ^ Клейвегт, Г.Дж .; Прочтите, Р.Дж. (1997). «Не ваша средняя плотность». Состав . 5 (12): 1557–69. дои : 10.1016/s0969-2126(97)00305-5 . ПМИД  9438862.
  21. ^ Дин, Дж. Э.; Грэм, Южная Каролина; Ким, Н.Н.; Штейн, ЧП; Макнейр, Р.; Качон-Гонсалес, МБ; Кокс, ТМ; Прочтите, Р.Дж. (2011). «Понимание болезни Краббе на основе структур галактоцереброзидазы». Труды Национальной академии наук . 108 (37): 15169–73. дои : 10.1073/pnas.1105639108 . ПМЦ 3174575 . ПМИД  21876145. 
  22. ^ Чжоу, А; Вэй, З; Стэнли, Польша; Читай, Р.Дж.; Штейн, ЧП; Каррелл, RW (2008). «Переход S-R-кортикостероидсвязывающего глобулина и механизм высвобождения гормона». Журнал молекулярной биологии . 380 (1): 244–51. дои : 10.1016/j.jmb.2008.05.012 . ПМИД  18513745.
  23. ^ Ступ, А.А.; Элдеринг, Э; Даффорн, ТР; Читай, Р.Дж.; Паннекук, Х (2001). «Различные структурные требования к ингибитору активатора плазминогена 1 (PAI-1) во время латентного перехода и ингибирования протеиназы, о чем свидетельствуют гипермутированные библиотеки PAI-1, отображаемые на фагах». Журнал молекулярной биологии . 305 (4): 773–83. дои : 10.1006/jmbi.2000.4356. PMID  11162091. Архивировано из оригинала 6 мая 2022 года . Проверено 6 мая 2022 г.
  24. ^ Чан, WL; Каррелл, RW; Чжоу, А; Прочтите, Р.Дж. (2013). «Как изменения в сродстве кортикостероидсвязывающего глобулина модулируют концентрацию свободного кортизола». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 98 (8): 3315–22. дои : 10.1210/jc.2012-4280. ПМЦ 3813945 . ПМИД  23783094.