stringtranslate.com

Рибонуклеаза Т1

Рибонуклеаза T 1 ( EC 4.6.1.24, гуанилорибонуклеаза , рибонуклеаза Aspergillus oryzae , РНКаза N1 , РНКаза N2 , рибонуклеаза N3 , рибонуклеаза U1 , рибонуклеаза F1 , рибонуклеаза Ch , рибонуклеаза PP1 , рибонуклеаза SA , РНКаза F1 , рибонуклеаза C2 , биназа , РНКаза Sa , гуанил-специфическая РНКаза , РНКаза G , РНКаза T 1 , рибонуклеаза гуаниннуклеотид-2'-трансфераза (циклизирующая) , рибонуклеаза N3 , рибонуклеаза N1 ) — эндонуклеаза грибов , которая расщепляет одноцепочечную РНК после гуанина. остатков, т. е. на их 3' конце; наиболее часто изучаемая форма этого фермента - версия, обнаруженная в плесени Aspergillus oryzae . Благодаря своей специфичности к гуанину, РНКаза T 1 часто используется для переваривания денатурированной РНК перед секвенированием. Подобно другим рибонуклеазам, таким как барназа и РНКаза A , рибонуклеаза T 1 была популярна для исследований фолдинга. [2]

Структурно рибонуклеаза T 1 представляет собой небольшой белок α+β (104 аминокислоты ) с четырехцепочечным антипараллельным бета-слоем , покрывающим длинную альфа-спираль (почти пять витков). РНКаза T 1 имеет две дисульфидные связи, Cys2-Cys10 и Cys6-Cys103, из которых последняя вносит больший вклад в стабильность ее сворачивания; [3] полное восстановление обоих дисульфидов обычно разворачивает белок, хотя его сворачивание можно спасти с помощью высоких концентраций соли. [4]

РНКаза T 1 также имеет четыре пролина , два из которых (Pro39 и Pro55) имеют цис- изомеры своих пептидных связей X-Pro . Неродные изомеры этих пролинов могут значительно замедлить конформационное сворачивание, [5] сворачиваясь в характерном временном масштабе 7000 секунд (почти два часа) при 10 °C и pH 5. [6]

Ссылки

  1. ^ PDB : 1ygw ​; Pfeiffer S, Karimi-Nejad Y, Rüterjans H (1997). «Пределы определения структуры ЯМР с использованием расчетов переменной целевой функции: рибонуклеаза T 1 , исследование случая». Журнал молекулярной биологии . 266 (2): 400–423. doi :10.1006/jmbi.1996.0784. PMID  9047372.
  2. ^ Pace CN, Heinemann U, Hahn U, Saenger W (1991). «Рибонуклеаза T 1 : структура, функция и стабильность». Angewandte Chemie . 30 (4): 343–360. doi :10.1002/anie.199103433.
  3. ^ Pace CN, Grimsley GR, Thomson JA, Barnett BJ (1988). «Конформационная стабильность и активность рибонуклеазы T1 с нулем, одной и двумя неповрежденными дисульфидными связями». Журнал биологической химии . 263 (24): 11820–11825. doi : 10.1016/S0021-9258(18)37859-1 . PMID  2457027.
  4. ^ Oobatake M, Takahashi S, Ooi T (1979). «Конформационная стабильность рибонуклеазы T 1 . II. Ренатурация, вызванная солью». Журнал биохимии . 86 : 65–70.
  5. ^ Mayr LM, Odefey CO, Schutkowski M, Schmid FX (1996). «Кинетический анализ разворачивания и повторного складывания рибонуклеазы T 1 методом двойного смешивания с остановленным потоком». Биохимия . 35 (17): 5550–5561. doi :10.1021/bi953035y. PMID  8611546.
  6. ^ Mullins LS, Pace CN, Raushel FM (1997). «Конформационная стабильность рибонуклеазы T1, измеренная с помощью обмена водорода и дейтерия». Protein Science . 6 (7): 1387–1395. doi :10.1002/pro.5560060702. PMC 2143755 . PMID  9232639. 

Внешние ссылки


  • в
  • т
  • е