SEC22B

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

Белок SEC22b, транспортирующий везикулы, — это белок , который у людей кодируется геном SEC22B . [ ^{5] [6] [7]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков везикулярного транспорта SEC22. Он ассоциируется с другими белками SNARE, образуя комплекс SNARE, и считается, что он играет роль в транспорте белков ER - Golgi . Он необходим для биогенеза альфа-гранул тромбоцитов в мегакариоцитах ^[8] и необходим для удлиненной морфологии телец Вейбеля-Паладе эндотелиальных клеток . ^[9] Этот белок имеет сильное сходство с белками Mus musculus и Cricetulus griseus . Имеются данные об использовании множественных участков полиаденилирования для транскрипта. ^[7] Было показано, что SEC22B взаимодействует с синтаксином 18 ^[10] и синтаксином 5 ^[11 ]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000265808 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027879 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Hay JC, Chao DS, Kuo CS, Scheller RH (апрель 1997 г.). «Взаимодействия белков, регулирующие транспорт везикул между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи в клетках млекопитающих». Cell . 89 (1): 149–58. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80191-9 . PMID  9094723. S2CID  8682509.
6. Okumura AJ, Hatsuzawa K, Tamura T, Nagaya H, Saeki K, Okumura F, Nagao K, Nishikawa M, Yoshimura A, Wada I (февраль 2006 г.). «Участие нового Q-SNARE, D12, в контроле качества эндомембранной системы». Журнал биологической химии . 281 (7): 4495–506. doi : 10.1074/jbc.M509715200 . PMID  16354670.
7. "Ген Entrez: гомолог белка B везикулярного транспорта SEC22B SEC22 (S. cerevisiae)".
8. Lo, Richard W.; Li, Ling; Pluthero, Fred G.; Leung, Richard; Eto, Koji; Kahr, Walter HA (2020-08-06). «Белок эндоплазматического ретикулума SEC22B взаимодействует с NBEAL2 и необходим для биогенеза α-гранул мегакариоцитов». Blood . 136 (6): 715–725. doi :10.1182/blood.2019004276. ISSN  0006-4971.
9. Элли Карампини; Петра Э. Бюргиссер; Дженни Олинс; Аат А. Малдер; Каролина Р. Йост; Дирк Гертс; Ян Ворберг; Рубен Бирингс (26 марта 2020 г.). «Sec22b определяет длину тела Вейбеля-Палада путем контроля антероградного транспорта ER-Гольджи». Гематологическая . 106 (4): 1138–1147. doi :10.3324/haematol.2019.242727. ISSN  1592-8721. ПМК 8018124 . ПМИД  32336681. 
10. Хацудзава, Киётака; Хиросе, Хиденори; Тани, Кацуко; Ямамото, Акицугу; Шеллер, Ричард Х.; Тагайя, Мицуо (май 2000 г.). «Синтаксин 18, рецептор SNAP, функционирующий в эндоплазматическом ретикулуме, промежуточном компартменте и транспортировке везикул цис-Гольджи». Журнал биологической химии . 275 (18): 13713–13720. doi : 10.1074/jbc.275.18.13713 . ISSN  0021-9258. PMID  10788491.
11. Кэт, Марие; Карампини, Элли; Хугендейк, Ари Дж.; Бюргиссер, Петра Э.; Малдер, Аат А.; Альфен, Флорис Пи Джей ван; Олинс, Дженни; Гертс, Дирк; Биггелаар, Маартье ван ден; Маргадант, Корт; Ворберг, Ян; Бирингс, Рубен (27 января 2022 г.). «Синтаксин 5 определяет размер тела Вейбеля-Палада и секрецию фактора фон Виллебранда, контролируя архитектуру Гольджи». Гематологическая . 107 (8): 1827–1839. doi : 10.3324/haematol.2021.280121. ISSN  1592-8721. ПМЦ 9335113 . ПМИД  35081689. 

Дальнейшее чтение

• Чи А, Валенсия Х.К., Ху ЗЗ, Ватабе Х., Ямагути Х., Мангини Н.Дж., Хуан Х., Кэнфилд В.А., Ченг К.К., Ян Ф., Абэ Р., Ямагиши С., Шабановиц Дж., Херинг В.Дж., Ву С., Аппелла Е., Хант Д.Ф. (ноябрь 2006 г.). «Протеомная и биоинформационная характеристика биогенеза и функции меланосом». Журнал исследований протеома . 5 (11): 3135–44. дои : 10.1021/pr060363j. ПМИД  17081065.
• Breuza L, Halbeisen R, Jenö P, Otte S, Barlowe C, Hong W, Hauri HP (ноябрь 2004 г.). «Протеомика мембран промежуточного компартмента эндоплазматического ретикулума-Гольджи (ERGIC) из обработанных брефельдином А клеток HepG2 идентифицирует ERGIC-32, новый циклический белок, который взаимодействует с человеческим Erv46». Журнал биологической химии . 279 (45): 47242–53. doi : 10.1074/jbc.M406644200 . PMID  15308636.
• Накадзима К., Хиросе Х., Танигучи М., Курашина Х., Арасаки К., Нагахама М., Тани К., Ямамото А., Тагая М. (август 2004 г.). «Участие BNIP1 в апоптозе и слиянии мембран эндоплазматической сети». Журнал ЭМБО . 23 (16): 3216–26. дои : 10.1038/sj.emboj.7600333. ПМК  514507 . ПМИД  15272311.
• Fu GK, Wang JT, Yang J, Au-Young J, Stuve LL (июль 2004 г.). «Круговая быстрая амплификация концов кДНК для высокопроизводительного клонирования частичных генов». Genomics . 84 (1): 205–10. doi :10.1016/j.ygeno.2004.01.011. PMID  15203218.
• Хиросе Х., Арасаки К., Домаэ Н., Такио К., Хацудзава К., Нагахама М., Тани К., Ямамото А., Тохьяма М., Тагая М. (март 2004 г.). «Роль ZW10 в мембранном транспорте между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи». Журнал ЭМБО . 23 (6): 1267–78. doi : 10.1038/sj.emboj.7600135. ПМК  381410 . ПМИД  15029241.
• Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в гемопоэтических стволовых/прогениторных клетках CD34+». Genome Research . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC  310934 . PMID  11042152.
• Xu D, Joglekar AP, Williams AL, Hay JC (декабрь 2000 г.). «Структура субъединиц комплекса ER/Golgi SNARE млекопитающих». Журнал биологической химии . 275 (50): 39631–9. doi : 10.1074/jbc.M007684200 . PMID  11035026.
• Parlati F, McNew JA, Fukuda R, Miller R, Söllner TH, Rothman JE (сентябрь 2000 г.). «Топологическое ограничение слияния мембран, зависящего от SNARE». Nature . 407 (6801): 194–8. Bibcode :2000Natur.407..194P. doi :10.1038/35025076. PMID  11001058. S2CID  4410803.
• Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих гемопоэтических стволовых/прогениторных клетках CD34(+) с помощью экспрессируемых последовательностей меток и эффективного клонирования полноразмерной кДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (14): 8175–80. Bibcode : 1998PNAS...95.8175M. doi : 10.1073 /pnas.95.14.8175 . PMC  20949. PMID  9653160.