stringtranslate.com

Селеномонадалес

Selenomonadales — это отряд бактерий в классе Negativicutes ; в отличие от большинства других членов Bacillota , они грамотрицательные . Филогения этого отряда изначально была определена путем сравнения 16S рРНК . [1] Совсем недавно были обнаружены молекулярные маркеры в форме консервативных сигнатурных инделей (CSI), специфичные для всех видов Selenomonadales. [2] На основании этих маркеров Selenomonadales включают два отдельных семейства и больше не являются единственным отрядом в Negativicutes . Также было обнаружено несколько CSI, специфичных для обоих семейств, Sporomusaceae и Selenomonadceae. [2] Образцы штаммов бактерий в этом отряде были выделены из корневых каналов здоровых человеческих зубов. [3]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих постоянное место в номенклатуре (LPSN) [4] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [5].

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Маршандин, Х.; Тейссье, К.; Кампос, Ж.; Жан-Пьер, Х.; Роджер, Ф.; Гей, Б.; Карлье, Ж.-П.; Жюмас-Билак, Э. (10 августа 2009 г.). «Negativicoccus succinicivorans gen. nov., sp. nov., выделенный из клинических образцов человека, исправил описание семейства Veillonellaceae и описание Negativicutes classis nov., Selenomonadales ord. nov. и Acidaminococcaceae fam. nov. в бактериальном типе Firmicutes». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (6): 1271–1279. doi : 10.1099/ijs.0.013102-0 . PMID  19667386.
  2. ^ ab Campbell C, Adeolu M, Gupta RS (2015). «Геномная таксономическая структура для класса Negativicutes: разделение класса Negativicutes на порядки Selenomonadales emend., Acidaminococcales ord. nov. и Veillonellales ord. nov». Int J Syst Evol Microbiol . 65 (9): 3203–3215. doi : 10.1099/ijs.0.000347 . PMID  25999592.
  3. ^ Рибейро, Адриана К.; Матараццо, Флавия; Фавери, Марсело; Зезелл, Дениз М.; Майер, Марсия ПА (21 июня 2011 г.). «Изучение бактериального разнообразия эндодонтической микробиоты путем клонирования и секвенирования 16S рРНК». Журнал эндодонтии . 37 (7): 922–926. doi :10.1016/j.joen.2011.04.007. PMID  21689545.
  4. ^ JP Euzéby. "Negativicutes". Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре (LPSN) . Получено 09.09.2022 .
  5. ^ Sayers; et al. "Negativicutes". База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Получено 2022-09-09 .
  6. ^ "The LTP" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  7. ^ "Дерево LTP_all в формате newick" . Получено 20 ноября 2023 г. .
  8. ^ "LTP_08_2023 Release Notes" (PDF) . Получено 20 ноября 2023 г.
  9. ^ "GTDB release 08-RS214". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  10. ^ "bac120_r214.sp_label". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.
  11. ^ "История таксона". База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 г.

Внешние ссылки

  • в
  • т
  • е