Тэнди Уорноу — американский ученый-компьютерщик и заслуженный профессор кафедры инженерных наук Грейнджера в Университете Иллинойса в Урбане-Шампейне . [4] [5] Она известна своей работой по реконструкции эволюционных деревьев , как в биологии, так и в исторической лингвистике , а также методами множественного выравнивания последовательностей. [6]
Уорноу училась в бакалавриате и аспирантуре по математике в Калифорнийском университете в Беркли , получив степень бакалавра в 1984 году и степень доктора философии [2] в 1991 году под руководством Юджина Лоулера . Другими членами ее диссертационного комитета были Ричард Карп , Мануэль Блюм , Дэн Гасфилд и Дэвид Гейл . [2]
После постдокторских исследований в Университете Южной Калифорнии с 1991 по 1992 год (постдокторские руководители Майкл Уотерман и Саймон Таваре ) и в Национальных лабораториях Сандиа в Альбукерке с 1992 по 1993 год она заняла должность преподавателя в Пенсильванском университете , где оставалась до переезда. в 1999 году в Техасский университет. В 2014 году Варнов присоединилась к профессорско-преподавательскому составу Университета Иллинойса в Урбане-Шампейне (UIUC), где она является почетным заведующим кафедрой инженерных наук Грейнджера и заместителем заведующего кафедрой компьютерных наук. Варнов имеет любезные назначения на кафедрах биологии животных, биоинженерии, электротехники и вычислительной техники, энтомологии, математики, биологии растений и статистики. [5] [7]
В 1995 году исследования Варноу, Дональда Ринге и Энн Тейлор из Пенсильванского университета, основанные на точных филогенетических вычислениях, предоставили комплексную теорию времени возникновения ранних подразделений индоевропейских языков . Их расчеты подтвердили индо-хеттскую гипотезу , согласно которой первым из этих подразделений, отделившихся от остальных индоевропейских языков, были анатолийские языки . Их результаты также подтверждают греко-армянскую гипотезу, согласно которой армянский язык и греческий язык образуют подсемейство индоевропейских. Они вписывают германские языки в эволюционное древо индоевропейских языков, которое ранее считалось проблематичным, предполагая, что протогерманский язык был тесно связан с балто-славянскими языками , но затем был изменен в результате миграции на запад германских племен, которые их привели. в контакте с носителями италийского и кельтского языков. [8] Этот идеальный подход к филогении позже был расширен Варновом и его коллегами, чтобы обеспечить возможность необнаруженных заимствований между языками, так что эволюция языка моделируется с помощью сети, а не дерева. [9]
В 2009 году Варнов и ее коллеги выпустили свое программное обеспечение SATé для совместной оценки выравнивания множественных биологических последовательностей и эволюционных деревьев. [10] Их программное обеспечение менее строго основано на твердых математических принципах, чем некоторые предыдущие методы совместной оценки (например, BAli-Phy [11] ), но работает значительно быстрее, позволяя быстро строить высокоточные деревья и выравнивания для тысяч видов. . Для сравнения, медленная работа предыдущих методов ограничивала их сравнением только десятков видов одновременно. [12] [13]
Ее работа с 2014 года была сосредоточена на трех темах: масштабирование множественных выравниваний последовательностей для сверхбольших наборов данных, оценка дерева видов с использованием нескольких генов (и решение проблемы гетерогенности дерева генов из-за неполной сортировки линий ) и метагеномика. Ее основной вклад в эти темы включает метод PASTA для совместной оценки выравниваний и деревьев, который улучшает SATé и может производить высокоточные выравнивания до 1 000 000 последовательностей. [14] Она также разработала метод ASTRAL для оценки дерева видов, который является статистически последовательным методом построения деревьев видов при наличии неполной сортировки линий. [15]
Уорноу был назван почетным профессором инженерных наук Грейнджера в 2020 году и профессором-основателем инженерных наук в 2014 году (оба в UIUC), а также удостоен звания профессора компьютерных наук Дэвида Брутона-младшего в Техасском университете в Остине в 2010 году. получила стипендию Фонда Джона Саймона Гуггенхайма в 2011 году, стипендию Института Рэдклиффа в 2003 году, стипендию Фонда Дэвида и Люсиль Паккард в 1996 году и премию молодого исследователя NSF в 1994 году . Вычислительная техника (ACM) «За вклад в математическую теорию, алгоритмы и программное обеспечение для крупномасштабной молекулярной филогенетики и исторической лингвистики». [16] В 2017 году она была избрана членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [17] Она была включена в список членов Американской ассоциации содействия развитию науки 2021 года . [18]
Матерью Уорноу была известный архивариус Джоан Уорноу-Блюетт , а отцом — Мортон Уорноу, сын лидера группы Марка Уорноу и племянник композитора Рэймонда Скотта . [19] Ее сестра-близнец — Киммен Шоландер , исследователь биоинформатики и почетный преподаватель Калифорнийского университета. Она замужем за Джорджем Чакко, доцентом-исследователем в области компьютерных наук в Инженерном колледже Грейнджера UIUC , [20] и у них двое детей, дочери Кристин и Менака. [19]