ФКБП3

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

FK506-связывающий белок 3, также известный как FKBP25, представляет собой белок , который у людей кодируется геном FKBP3 . [ ^{5] [6] [7]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства иммунофилиновых белков, которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включающих сворачивание и транспортировку белков. Этот кодируемый белок является цис-транс-пролил-изомеразой , которая связывает иммунодепрессанты FK506 и рапамицин . Он имеет более высокое сродство к рапамицину, чем к FK506, и, таким образом, может быть важной целевой молекулой для иммуносупрессии рапамицином. ^{[8] [7]}

Взаимодействия

Было показано, что FKBP3 взаимодействует с YY1 , ^[9] HDAC1 , ^[9] гистондеацетилазой 2 , ^[9] ДНК , ^[10] и Mdm2 . ^[11] Кристаллическая структура FKBP25 с FK506 и ЯМР-структура полноразмерного FKBP25 были опубликованы с идентификаторами PDB 5D75 и 2MPH соответственно. ^{[8] [12]}

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000100442 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020949 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Hung DT, Schreiber SL (июнь 1992 г.). «cDNA cloning of a human 25 kDa FK506 and rapamycin binding protein». Biochem. Biophys. Res. Commun . 184 (2): 733–8. doi :10.1016/0006-291X(92)90651-Z. PMID  1374240.
6. Porat R, Poutsiaka DD, Miller LC, Granowitz EV, Dinarello CA (май 1992). «Блокада рецептора интерлейкина-1 (ИЛ-1) снижает синтез эндотоксина и стимулированного Borrelia burgdorferi ИЛ-8 в мононуклеарных клетках человека». FASEB J . 6 (7): 2482–6. doi : 10.1096/fasebj.6.7.1532945 . PMID  1532945. S2CID  29899093.
7. "Ген Entrez: FKBP3 FK506 связывающий белок 3, 25kDa".
8. Prakash A, Rajan S, Yoon HS (апрель 2016 г.). «Кристаллическая структура домена связывания FK506 человеческого FKBP25 в комплексе с FK506». Protein Science . 25 (4): 905–910. doi :10.1002/pro.2875. ISSN  1469-896X. PMC 4941220 . PMID  26749369. 
9. Yang WM, Yao YL, Seto E (сентябрь 2001 г.). «Связывающий белок FK506 25 функционально ассоциируется с гистондеацетилазами и фактором транскрипции YY1». EMBO J . 20 (17): 4814–25. doi :10.1093/emboj/20.17.4814. PMC 125595 . PMID  11532945. 
10. Prakash A, Shin J, Rajan S, Yoon HS (2016). «Структурная основа распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином». Nucleic Acids Res . 44 (6): 2909–25. doi :10.1093/nar/gkw001. PMC 4824100. PMID  26762975 . 
11. Ochocka AM, Kampanis P, Nicol S, Allende-Vega N, Cox M, Marcar L, Milne D, Fuller-Pace F, Meek D (февраль 2009 г.). "FKBP25, новый регулятор пути p53, вызывает деградацию MDM2 и активацию p53". FEBS Lett . 583 (4): 621–6. doi :10.1016/j.febslet.2009.01.009. PMID  19166840. S2CID  6110.
12. Prakash A, Shin J, Rajan S, Yoon HS (2016-04-07). "Структурная основа распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином". Nucleic Acids Research . 44 (6): 2909–2925. doi :10.1093/nar/gkw001. ISSN  0305-1048. PMC 4824100. PMID  26762975 . 

Дальнейшее чтение

• Jin YJ, Burakoff SJ, Bierer BE (1992). "Молекулярное клонирование белка FKBP25 с высокой аффинностью связывания рапамицина массой 25 кДа". J. Biol. Chem . 267 (16): 10942–5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)49856-6 . PMID  1375932.
• Видеррехт Г., Мартин М.М., Сигал Н.Х., Секерка Дж.Дж. (1992). «Выделение кДНК человека, кодирующей белок FK-506 массой 25 кДа и рапамицин». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 185 (1): 298–303. дои : 10.1016/S0006-291X(05)80990-8. ПМИД  1376117.
• Jin YJ, Burakoff SJ (1993). "25-кДа FK506-связывающий белок локализуется в ядре и ассоциируется с казеинкиназой II и нуклеолином". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (16): 7769–73. Bibcode :1993PNAS...90.7769J. doi : 10.1073/pnas.90.16.7769 . PMC  47224 . PMID  7689229.
• Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (1994). «Очистка CpG-островков с использованием колонки связывания метилированной ДНК». Nat. Genet . 6 (3): 236–44. doi :10.1038/ng0394-236. PMID  8012384. S2CID  12847618.
• Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Meng X, Chen J, Yang Q, Wang S, Chao Y, Ying K, Xie Y, Mao Y (2002). «Клонирование и идентификация новой кДНК, которая может быть связана с FKBP25». Biochem. Genet . 40 (9–10): 303–10. doi :10.1023/A:1020256718720. PMID  12392168. S2CID  24265377.
• Руаль Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Цевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

Внешние ссылки

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческой пептидилпролилцис-транс-изомеразы FKBP3.
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для мышиной пептидилпролилцис-транс-изомеразы FKBP3.