ФКБП1А

Белок и кодирующий ген у человека

Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза FKBP1A — это фермент , который у человека кодируется геном FKBP1A . ^[5] Его также часто называют FKBP-12 или FKBP12, и он является членом семейства FK506- связывающих белков ( FKBP ).

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков иммунофилинов , которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включающих сворачивание и транспортировку белка. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс-пролилизомеразу, которая связывает иммунодепрессанты FK506 (такролимус) и рапамицин (сиролимус). Он взаимодействует с несколькими белками внутриклеточной передачи сигналов, включая рецептор TGF-бета I типа. Он также взаимодействует с многочисленными внутриклеточными каналами высвобождения кальция, включая тетрамерный рианодиновый рецептор скелетных мышц . У мышей делеция этого гомологичного гена вызывает врожденное заболевание сердца, известное как некомпактность миокарда левого желудочка. Было идентифицировано множество альтернативно сплайсированных вариантов, кодирующих один и тот же белок. Геном человека содержит пять псевдогенов, связанных с этим геном, по крайней мере один из которых транскрибируется. ^[6]

Взаимодействия

Было показано, что FKBP1A взаимодействует с:

• ГЛМН , ^{[7] [8]}
• ITPR1 ^{[9] [10]}
• КИАА1303 , ^{[11] [12]}
• Мишень рапамицина для млекопитающих , ^{[11] [12] [13] [14] [15] [16]}
• RYR1 , ^{[17] [18] [19]} и
• Бета-рецептор TGF 1 . ^{[20] [21]}

Рекомендации

1. GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000088832 — Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032966 — Ensembl , май 2017 г.
3. "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. DiLella AG (сентябрь 1991 г.). «Хромосомное назначение гена иммунофилина человека FKBP-12». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 179 (3): 1427–33. дои : 10.1016/0006-291X(91)91732-R. ПМИД  1930186.
6. «Ген Энтрез: FKBP1A FK506-связывающий белок 1A, 12 кДа» .
7. Шамбро Б., Радани С., Камонис Дж. Х., Шазанд К., Райковски К., Баули Э. Э. (декабрь 1996 г.). «FAP48, новый белок, образующий специфические комплексы как с иммунофилинами FKBP59, так и с FKBP12. Профилактика с помощью иммунодепрессантов FK506 и рапамицина». Журнал биологической химии . 271 (51): 32923–9. дои : 10.1074/jbc.271.51.32923 . ПМИД  8955134.
8. Ней Х (март 2001 г.). «Мутация белка 48, связанного с FKBP (FAP48), по пролину 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды . 97 (2–3): 147–52. дои : 10.1016/s0167-0115(00)00206-8. PMID  11164950. S2CID  20617551.
9. Макмиллан Д., Карри С., Брэдли К.Н., Мьюир Т.К., Маккаррон Дж.Г. (декабрь 2005 г.). «В гладких мышцах FK506-связывающий белок модулирует высвобождение Ca2+, вызванное рецептором IP3, с помощью mTOR и кальциневрина». Журнал клеточной науки . 118 (Часть 23): 5443–51. дои : 10.1242/jcs.02657 . ПМИД  16278292.
10. Кэмерон AM, Nucifora FC, Fung ET, Ливингстон DJ, Aldape RA, Росс CA, Снайдер SH (октябрь 1997 г.). «FKBP12 связывает инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор в положении лейцин-пролин (1400-1401) и прикрепляет кальциневрин к этому FK506-подобному домену». Журнал биологической химии . 272 (44): 27582–8. дои : 10.1074/jbc.272.44.27582 . ПМИД  9346894.
11. Хасинто Э, Ловит Р, Шмидт А, Лин С, Рюэгг М.А., Зал А, Зал Миннесота (ноябрь 2004 г.). «Комплекс 2 TOR млекопитающих контролирует актиновый цитоскелет и нечувствителен к рапамицину». Природная клеточная биология . 6 (11): 1122–8. дои : 10.1038/ncb1183. PMID  15467718. S2CID  13831153.
12. Сарбасов Д.Д., Али С.М., Ким Д.Х., Гертин Д.А., Латек Р.Р., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Сабатини Д.М. (июль 2004 г.). «Rictor, новый партнер по связыванию mTOR, определяет нечувствительный к рапамицину и независимый от хищников путь, который регулирует цитоскелет». Современная биология . 14 (14): 1296–302. Бибкод : 2004CBio...14.1296D. дои : 10.1016/j.cub.2004.06.054 . PMID  15268862. S2CID  4658268.
13. Чой Дж., Чен Дж., Шрайбер С.Л., Кларди Дж. (июль 1996 г.). «Структура комплекса FKBP12-рапамицин, взаимодействующего со связывающим доменом FRAP человека». Наука . 273 (5272): 239–42. Бибкод : 1996Sci...273..239C. дои : 10.1126/science.273.5272.239. PMID  8662507. S2CID  27706675.
14. Люкер К.Э., Смит MC, Люкер Г.Д., Гаммон С.Т., Пивиника-Вормс Х, Пивиника-Вормс Д (август 2004 г.). «Кинетика регулируемых белок-белковых взаимодействий, выявленная с помощью визуализации комплементации люциферазы светлячков в клетках и живых животных». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12288–93. Бибкод : 2004PNAS..10112288L. дои : 10.1073/pnas.0404041101 . ПМК 514471 . ПМИД  15284440. 
15. Банашински Л.А., Лю К.В., Wandless TJ (апрель 2005 г.). «Характеристика тройного комплекса FKBP.рапамицин.FRB». Журнал Американского химического общества . 127 (13): 4715–21. дои : 10.1021/ja043277y. ПМИД  15796538.
16. Sabers CJ, Мартин ММ, Брунн Г.Дж., Уильямс Дж.М., Дюмон Ф.Дж., Видеррехт Г., Абрахам RT (январь 1995 г.). «Выделение белка-мишени комплекса FKBP12-рапамицин в клетках млекопитающих». Журнал биологической химии . 270 (2): 815–22. дои : 10.1074/jbc.270.2.815 . ПМИД  7822316.
17. Авила Г., Ли Э.Х., Перес С.Ф., Аллен П.Д., Дирксен РТ (июнь 2003 г.). «Связывание FKBP12 с RyR1 модулирует связь возбуждения-сокращения в скелетных мышечных трубках мыши». Журнал биологической химии . 278 (25): 22600–8. дои : 10.1074/jbc.M205866200 . ПМИД  12704193.
18. Бултынк Г., Де Смет П., Росси Д., Каллеварт Г., Миссиен Л., Соррентино В., Де Смедт Х., Парис Дж.Б. (март 2001 г.). «Характеристика и картирование сайта связывания FK506-связывающего белка (FKBP12) массой 12 кДа на различных изоформах рианодинового рецептора и инозитол-1,4,5-трифосфатного рецептора». Биохимический журнал . 354 (Часть 2): 413–22. дои : 10.1042/bj3540413. ПМК 1221670 . ПМИД  11171121. 
19. Габурякова М, Габурякова Дж, Рейкен С, Хуанг Ф, Маркс С.О., Роземблит Н., Маркс А.Р. (май 2001 г.). «Связывание FKBP12 модулирует открытие каналов рианодиновых рецепторов». Журнал биологической химии . 276 (20): 16931–5. дои : 10.1074/jbc.M100856200 . ПМИД  11279144.
20. Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов I типа семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука . 265 (5172): 674–6. Бибкод : 1994Sci...265..674W. дои : 10.1126/science.7518616. ПМИД  7518616.
21. Лю Ф, Вентура Ф, Дуди Дж, Массаге Дж (июль 1995 г.). «Человеческий рецептор типа II для костных морфогенных белков (BMP): расширение модели двухкиназного рецептора на BMP». Молекулярная и клеточная биология . 15 (7): 3479–86. дои : 10.1128/mcb.15.7.3479. ПМК 230584 . ПМИД  7791754. 

дальнейшее чтение

• Шиене-Фишер С., Ю. С. (апрель 2001 г.). «Вспомогательные ферменты сворачивания дополнительных рецепторов: функциональная роль пептидилпролил-цис/транс-изомераз». Письма ФЭБС . 495 (1–2): 1–6. дои : 10.1016/S0014-5793(01)02326-2 . PMID  11322937. S2CID  42263861.
• ДиЛелла А.Г., Хокинс А., Крейг Р.Дж., Шрайбер С.Л., Гриффин Калифорния (декабрь 1992 г.). «Назначение хромосомных полос генов, кодирующих FKBP12 и FKBP13 человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 189 (2): 819–23. дои : 10.1016/0006-291X(92)92276-4. ПМИД  1281998.
• Джаяраман Т., Бриллантес А.М., Тимерман А.П., Флейшер С., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Маркс А.Р. (май 1992 г.). «FK506-связывающий белок, связанный с каналом высвобождения кальция (рианодиновый рецептор)». Журнал биологической химии . 267 (14): 9474–7. дои : 10.1016/S0021-9258(19)50114-4 . ПМИД  1374404.
• Лепре К.А., Томсон Дж.А., Мур Дж.М. (май 1992 г.). «Структура раствора FK506, связанного с FKBP-12». Письма ФЭБС . 302 (1): 89–96. дои : 10.1016/0014-5793(92)80292-О . PMID  1375171. S2CID  41469360.
• Маки Н., Секигути Ф., Нисимаки Дж., Мива К., Хаяно Т., Такахаши Н., Судзуки М. (июль 1990 г.). «Комплементарная ДНК, кодирующая белок, связывающий FK506 Т-клеток человека, пептидилпролил-цис-транс-изомеразу, отличную от циклофилина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (14): 5440–3. Бибкод : 1990PNAS...87.5440M. дои : 10.1073/pnas.87.14.5440 . ПМК  54340 . ПМИД  1695378.
• Штандарт РФ, Галат А, Вердин Г.Л., Шрайбер С.Л. (август 1990 г.). «Молекулярное клонирование и сверхэкспрессия человеческого FK506-связывающего белка FKBP». Природа . 346 (6285): 671–4. Бибкод : 1990Natur.346..671S. дои : 10.1038/346671a0. PMID  1696686. S2CID  4368221.
• Секерка Дж.Дж., Видеррехт Г., Грейлих Х., Бултон Д., Хунг Ш.Х., Крайан Дж., Ходжес П.Дж., Сигал Н.Х. (декабрь 1990 г.). «Цитозольно-связывающий белок иммунодепрессанта FK-506 представляет собой одновременно широко распространенную и высококонсервативную пептидил-пролил-цис-транс-изомеразу». Журнал биологической химии . 265 (34): 21011–5. дои : 10.1016/S0021-9258(17)45319-1 . ПМИД  1701173.
• Мичник С.В., Розен М.К., Уандлесс Т.Дж., Карплюс М., Шрайбер С.Л. (май 1991 г.). «Структура раствора FKBP, фермента ротамазы и рецептора FK506 и рапамицина». Наука . 252 (5007): 836–9. Бибкод : 1991Sci...252..836M. дои : 10.1126/science.1709301. PMID  1709301. S2CID  28289138.
• Ван Дуйн Г.Д., Стандарт Р.Ф., Карплюс П.А., Шрайбер С.Л., Кларди Дж. (май 1991 г.). «Атомная структура FKBP-FK506, комплекса иммунофилин-иммунодепрессант». Наука . 252 (5007): 839–42. Бибкод : 1991Sci...252..839В. дои : 10.1126/science.1709302. PMID  1709302. S2CID  32539611.
• Розен М.К., Михник С.В., Карплюс М., Шрайбер С.Л. (май 1991 г.). «Последовательное распределение протонов и азота и определение вторичной структуры человеческого FK506 и белка, связывающего рапамицин». Биохимия . 30 (19): 4774–89. CiteSeerX  10.1.1.559.2890 . дои : 10.1021/bi00233a020. ПМИД  1709363.
• Джин Ю.Дж., Альберс М.В., Лейн В.С., Бирер Б.Е., Шрайбер С.Л., Буракофф С.Дж. (август 1991 г.). «Молекулярное клонирование мембраносвязанного человеческого FK506- и рапамицинсвязывающего белка, FKBP-13». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (15): 6677–81. Бибкод : 1991PNAS...88.6677J. дои : 10.1073/pnas.88.15.6677 . ПМК  52151 . ПМИД  1713687.
• ДиЛелла АГ, Крейг Р.Дж. (сентябрь 1991 г.). «Организация экзонов гена FKBP-12 человека: корреляция со структурными и функциональными белковыми доменами». Биохимия . 30 (35): 8512–7. дои : 10.1021/bi00099a002. ПМИД  1716149.
• Хардинг М.В., Галат А., Юлинг Д.Е., Шрайбер С.Л. (октябрь 1989 г.). «Рецептор иммунодепрессанта FK506 представляет собой цис-транс-пептидилпролилизомеразу». Природа . 341 (6244): 758–60. Бибкод : 1989Natur.341..758H. дои : 10.1038/341758a0. PMID  2477715. S2CID  4349152.
• Ван Т., Донахью П.К., Зервос А.С. (июль 1994 г.). «Специфическое взаимодействие рецепторов I типа семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука . 265 (5172): 674–6. Бибкод : 1994Sci...265..674W. дои : 10.1126/science.7518616. ПМИД  7518616.
• Питти Д.А., Сяо К., Бенасутти М., Липпке Дж.А. (декабрь 1994 г.). «Три различные информационные РНК могут кодировать человеческий иммунодепрессант-связывающий белок FKBP12». Джин . 150 (2): 251–7. дои : 10.1016/0378-1119(94)90434-0. ПМИД  7529739.
• Ян В.М., Иноуе С.Дж., Сето Э. (июнь 1995 г.). «Циклофилин А и FKBP12 взаимодействуют с YY1 и изменяют его транскрипционную активность». Журнал биологической химии . 270 (25): 15187–93. дои : 10.1074/jbc.270.25.15187 . ПМИД  7541038.
• Кавамура А., Су М.С. (июнь 1995 г.). «Взаимодействие FKBP12-FK506 с кальциневрином А в домене, связывающем субъединицу B». Журнал биологической химии . 270 (26): 15463–6. дои : 10.1074/jbc.270.26.15463 . ПМИД  7541044.
• Гриффит Дж.П., Ким Дж.Л., Ким Э.Э., Синчак М.Д., Томсон Дж.А., Фицгиббон ​​М.Дж., Флеминг М.А., Кэрон П.Р., Сяо К., Навиа М.А. (август 1995 г.). «Рентгеновская структура кальциневрина, ингибируемая комплексом иммунофилин-иммунодепрессант FKBP12-FK506». Клетка . 82 (3): 507–22. дои : 10.1016/0092-8674(95)90439-5 . PMID  7543369. S2CID  15502270.
• Ван Дуйн Г.Д., Стандарт Р.Ф., Карплюс П.А., Шрайбер С.Л., Кларди Дж. (январь 1993 г.). «Атомные структуры комплексов иммунофилина человека FKBP-12 с FK506 и рапамицином». Журнал молекулярной биологии . 229 (1): 105–24. дои : 10.1006/jmbi.1993.1012. ПМИД  7678431.