stringtranslate.com

Цитозин

Цитозин ( / ˈ s t ə ˌ s n , - ˌ z n , - ˌ s ɪ n / [2] [3] ) ( символ C или Cyt ) — одно из четырех нуклеиновых оснований , обнаруженных в ДНК и РНК , наряду с аденином , гуанином и тимином ( урацил в РНК). Это производное пиримидина с гетероциклическим ароматическим кольцом и двумя присоединенными заместителями ( аминогруппа в положении 4 и кетогруппа в положении 2). Нуклеозид цитозина — цитидин . В спаривании оснований Уотсона-Крика он образует три водородные связи с гуанином .

История

Цитозин был открыт и назван Альбрехтом Косселем и Альбертом Нейманом в 1894 году, когда он был гидролизован из тканей тимуса теленка . [4] [5] Структура была предложена в 1903 году и была синтезирована (и, таким образом, подтверждена) в лаборатории в том же году.

В 1998 году цитозин использовался в ранней демонстрации квантовой обработки информации, когда исследователи Оксфордского университета реализовали алгоритм Дойча-Йожсы на двухкубитном квантовом компьютере ядерного магнитного резонанса (NMRQC) . [6]

В марте 2015 года ученые НАСА сообщили об образовании цитозина, наряду с урацилом и тимином, из пиримидина в космических лабораторных условиях, что представляет интерес, поскольку пиримидин был обнаружен в метеоритах, хотя его происхождение неизвестно. [7]

Химические реакции

Цитозин и гуанин с указанием направления водородных связей (стрелка указывает на положительный или отрицательный заряд).
Метилирование цитозина происходит по углероду номер 5.

Цитозин можно найти в составе ДНК, в составе РНК или в составе нуклеотида . Как цитидинтрифосфат (ЦТФ), он может действовать как кофактор ферментов и может переносить фосфат для превращения аденозиндифосфата (АДФ) в аденозинтрифосфат (АТФ).

В ДНК и РНК цитозин соединен с гуанином . Однако он по своей природе нестабилен и может превращаться в урацил ( спонтанное дезаминирование ). Это может привести к точечной мутации, если ее не исправить ферментами репарации ДНК , такими как урацилгликозилаза, которая расщепляет урацил в ДНК.

Цитозин также может быть метилирован в 5-метилцитозин с помощью фермента, называемого ДНК-метилтрансферазой , или метилирован и гидроксилирован с образованием 5-гидроксиметилцитозина . Разница в скорости дезаминирования цитозина и 5-метилцитозина (до урацила и тимина ) лежит в основе бисульфитного секвенирования . [8]

Биологическая функция

Цитозин , находящийся третьим в кодоне РНК , является синонимом урацила , поскольку они взаимозаменяемы в качестве третьего основания. Если третье основание кодона находится в качестве второго основания, оно всегда взаимозаменяемо. Например, UCU, UCC, UCA и UCG являются сериновыми , независимо от третьего основания.

Активное ферментативное дезаминирование цитозина или 5-метилцитозина цитозиндезаминазами семейства APOBEC может иметь как полезные, так и вредные последствия для различных клеточных процессов, а также для эволюции организма. [9] С другой стороны, последствия дезаминирования 5-гидроксиметилцитозина остаются менее изученными.

Теоретические аспекты

До октября 2021 года цитозин не обнаруживался в метеоритах, а это означало, что первым нитям РНК и ДНК пришлось искать где-то еще, чтобы получить этот строительный блок. Цитозин, вероятно, образовался в некоторых родительских телах метеоритов, однако не сохранялся внутри этих тел из-за эффективной реакции дезаминирования в урацил . [10]

В октябре 2021 года было объявлено, что цитозин был обнаружен в метеоритах исследователями в рамках совместного проекта Японии и НАСА, в котором использовались новые методы обнаружения, позволяющие избежать повреждения нуклеотидов при их извлечении из метеоритов. [11]

Рекомендации

  1. ^ Доусон, RMC; и другие. (1959). Данные для биохимических исследований . Оксфорд: Кларендон Пресс.
  2. ^ «Цитозин». Dictionary.com Полный (онлайн). nd
  3. ^ «Цитозин». Словарь Merriam-Webster.com .
  4. ^ А. Коссель и Альберт Нойман (1894) «Darstellung und Spaltungsprodukte der Nucleïnsäure (Adenylsäure)» (Получение и продукты расщепления нуклеиновых кислот (аденовая кислота)), Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft zu Berlin , 27  : 2215–2222. Название «цитозин» придумано на странице 2219: «… ein Produkt von basechen Eigenschaften, für welches wir den Namen «Cytosin» vorschlagen». (…продукт с основными свойствами, для которого мы предлагаем название «цитозин».)
  5. ^ Коссель, А.; Штойдель, ХЦ (1903). «Weitere Untersuchungen über das Cytosin». Физиол. Хим . 38 (1–2): 49–59. дои : 10.1515/bchm2.1903.38.1-2.49.
  6. ^ Джонс, Дж.А.; М. Моска (1 августа 1998 г.). «Реализация квантового алгоритма на квантовом компьютере ядерного магнитного резонанса». Дж. Хим. Физ . 109 (5): 1648–1653. arXiv : Quant-ph/9801027 . Бибкод : 1998JChPh.109.1648J. дои : 10.1063/1.476739. S2CID  19348964. Архивировано из оригинала 12 июня 2008 г. Проверено 18 октября 2007 г.
  7. Марлэр, Рут (3 марта 2015 г.). «НАСА Эймс воспроизводит строительные блоки жизни в лаборатории». НАСА . Архивировано из оригинала 5 марта 2015 года . Проверено 5 марта 2015 г.
  8. ^ Хаяцу, Хикоя (2008). «Открытие бисульфит-опосредованного превращения цитозина в урацил, ключевой реакции для анализа метилирования ДНК - личный отчет». Труды Японской академии. Серия Б, Физические и биологические науки . 84 (8): 321–330. Бибкод : 2008PJAB...84..321H. дои : 10.2183/pjab.84.321. ISSN  0386-2208. ПМК 3722019 . ПМИД  18941305. 
  9. ^ Чахван Р.; Вонтакал С.Н.; Роа С. (2010). «Перекресток между генетической и эпигенетической информацией посредством дезаминирования цитозина». Тенденции в генетике . 26 (10): 443–448. дои :10.1016/j.tig.2010.07.005. ПМИД  20800313.
  10. ^ Таскер, Элизабет. «Пришли ли семена жизни из космоса?». Сеть блогов Scientific American . Проверено 24 ноября 2016 г.
  11. ^ Ясухиро Оба; Ёсинори Такано; Ёсихиро Фурукава; Тошики Кога; Дэниел П. Главин; Джейсон П. Дворкин; Хироши Нараока. «Идентификация широкого разнообразия внеземных пуриновых и пиримидиновых азотистых оснований в углеродистых метеоритах». Журнал Nature Communications . Nature.com . Проверено 7 июля 2022 г.

Внешние ссылки и цитаты