ELIXIR (европейская инфраструктура наук о жизни для биологической информации) — это инициатива, которая позволяет лабораториям наук о жизни по всей Европе обмениваться и хранить свои исследовательские данные как часть организованной сети. Ее цель — объединить исследовательские организации и центры обработки данных Европы для координации сбора, контроля качества и хранения больших объемов биологических данных, полученных в ходе экспериментов в области наук о жизни . ELIXIR стремится обеспечить интеграцию биологических данных в федеративную систему, легкодоступную для научного сообщества. [1]
Миссия ELIXIR заключается в создании устойчивой европейской инфраструктуры для биологической информации, поддерживающей исследования в области естественных наук и их внедрение в медицину и окружающую среду, биоиндустрию и общество. [3]
Результаты биологических экспериментов дают огромное количество результатов, которые хранятся в виде данных с использованием компьютерного программного обеспечения . Европейские страны вложили значительные средства в исследования, которые производят, анализируют и хранят биологическую информацию. [4] Однако сбор, хранение, архивирование и интеграция этих больших объемов данных представляет собой проблему, с которой не может справиться одна страна в одиночку. ELIXIR представляет собой объединение независимых биологических научных учреждений для создания интегрированной сети, которая решает сложную проблему хранения и управления биологическими данными. Предоставляя устойчивую и распределенную структуру для обработки данных и инструментов поиска данных, ELIXIR надеется обеспечить общеевропейские инвестиции в биоинформатику , обеспечивая стабильность для проведения исследований во всех областях науки о жизни, как в академических кругах, так и в промышленности. [1]
ELIXIR — это межправительственная организация, которая объединяет существующие биоинформатические ресурсы. Координируется ELIXIR Hub, базирующимся рядом с Европейским институтом биоинформатики Европейской лаборатории молекулярной биологии ( EMBL -EBI) на кампусе Wellcome Trust Genome в Хинкстоне, Кембридж.
Членами консорциума ELIXIR являются европейские страны, представленные их правительствами и министерствами; научное сообщество в каждой стране-участнице развивает свой национальный узел, который управляет услугами и ресурсами, входящими в состав ELIXIR. Каждый узел ELIXIR сам по себе является сетью национальных организаций в области наук о жизни, координируемой ведущим институтом.
Европейская лаборатория молекулярной биологии является межправительственной организацией, поэтому это единственный узел, не связанный с какой-либо страной.
ELIXIR сосредотачивает усилия вокруг пяти основных направлений деятельности, называемых Платформами. Они охватывают Данные, Инструменты, Вычисления, Взаимодействие и Обучение. Работа в этих областях направлена на улучшение доступа к открытым ресурсам данных и инструментам путем улучшения подключения, обнаруживаемости и доступа к вычислительной мощности, а также разработки обучения для пользователей и поставщиков услуг для достижения этих целей.
ELIXIR поддерживает пользователей, решающих Великие проблемы в исследованиях в области естественных наук в различных областях. ELIXIR поддерживает ряд самостоятельно выбранных сообществ, которые фокусируются на темах высокого уровня, таких как «Данные о человеке» и «Науки о растениях», на более конкретных и узконаправленных дисциплинах, таких как «Метаболомика» и «Внутренне неупорядоченные белки», а также сообщество, посвященное ресурсу «Галактика». Эти сообщества созданы для разработки стандартов биоинформатики и данных, услуг и обучения, которые необходимы для содействия этому сообществу в достижении его научных целей.
По состоянию на сентябрь 2023 года следующие страны и EMBL-EBI подписали Соглашение о консорциуме ELIXIR (ECA), чтобы стать членами ELIXIR: Бельгия, Чешская Республика, Дания, Эстония, Финляндия, Франция, Германия, Греция, Венгрия, Ирландия, Израиль, Италия, Люксембург, Нидерланды, Норвегия, Португалия, Словения, Испания, Швеция, Швейцария и Великобритания.
Австрия, Кипр и Румыния являются странами-наблюдателями и работают над ратификацией Соглашения о сотрудничестве в ближайшем будущем.
Страны, подписавшие ECA, получают представительство в Совете директоров ELIXIR.
Подготовительный этап ELIXIR координировала профессор Джанет Торнтон из EMBL-EBI .
Директор-основатель ELIXIR, доктор Никлас Бломберг, занял свою должность в новом центре ELIXIR в Кембридже в мае 2013 года. [5] Он покинул ELIXIR в декабре 2023 года, и профессор Тим Хаббард был назначен новым директором с марта 2024 года. [6]
К концу 2012 года ELIXIR завершил пятилетнюю подготовительную фазу, финансируемую Седьмой рамочной программой ЕС [7] в рамках процесса Европейского стратегического форума по исследовательским инфраструктурам (ESFRI).
В 2015 году ELIXIR получила финансирование HORIZON 2020 в размере 19 миллионов евро для запуска проекта EXCELERATE, за которым в 2020 году последовал проект CONVERGE. [8] [9] Оба проекта позволили ELIXIR координировать и расширять национальные и международные ресурсы данных. [10] ELIXIR также наладила сотрудничество для подачи заявок на другое крупномасштабное финансирование других проектов ЕС, в которых она также участвует в организационном качестве, например, для проектов CORBEL, FAIRplus, EOSC-Life, B1MG, GDI и BY-COVID.
Каждое государство-член совместно вносит вклад в финансирование ELIXIR Hub пропорционально своему ВВП. Некоторые страны выделили новые средства для внесения вклада в свой ELIXIR Node. Услуги и деятельность ELIXIR Node будут по-прежнему финансироваться национальными агентствами. Коллективно члены ELIXIR подадут заявку на дополнительное внешнее финансирование.
В 2024 году ELIXIR начнет свою четвертую пятилетнюю научную программу. [11]