Сезон 2003–04 стал 89-м сезоном Истмийской лиги — английского футбольного турнира, в котором участвуют полупрофессиональные и любительские клубы из Лондона, Восточной и Юго-Восточной Англии .
Это был последний сезон для Истмийской лиги в качестве фидера для Конференции Премьер. В конце сезона Премьер-дивизион был заменен как лига уровня 6 (вместе с Премьер-дивизионом Северной Премьер-лиги и Премьер-дивизионом Южной футбольной лиги ) на недавно сформированные Конференция Север и Конференция Юг . Премьер-дивизион потерял более половины своих клубов в недавно сформированных дивизионах, а два региональных дивизиона получили ряд своих клубов, переведенных в Премьер-дивизион, чтобы заменить их. Таким образом, дивизионы Истмийской лиги были понижены до 7-9 уровней.
В Премьер-дивизион вошло 24 клуба, включая 19 клубов предыдущего сезона и пять новых клубов:
Canvey Island выиграл дивизион и был повышен до Conference National. Клубы, занявшие места выше 14-го, должны были перейти в недавно созданные дивизионы Conference North и South, а клубы, занявшие места выше 21-го, а также победители Division One должны были участвовать в плей-офф за два финальных места в Conference North/South. После проведения плей-офф Hendon решили не использовать свой вариант вступления в Conference, их место занял Basingstoke Town. В конце сезона Ford United были переименованы в Redbridge .
В этом сезоне не было ни одного вылета из Премьер-дивизиона, хотя из-за реформы лиги клубы остались в дивизионе, опустившись с шестого на седьмое место.
В состав первого дивизиона «Север» вошли 24 клуба, в том числе 18 клубов из предыдущего сезона и шесть новых клубов:
Перед началом сезона «Лейтон Пеннант» был переименован в «Уолтем Форест».
Yeading выиграл дивизион, но проиграл в плей-офф за место в недавно созданной конференции Север и Юг и был помещен в Премьер-дивизион вместе с Leyton и Cheshunt. Chesham United, Dunstable Town и Hemel Hempstead Town были переведены в Премьер-дивизион Южной футбольной лиги. За ними последовал Wealdstone, который победил Dulwich Hamlet из первого южного дивизиона. Enfield закончил турнирную таблицу внизу и вылетел во второй дивизион, опустившись с шестого на девятое место за два года из-за реформы системы лиг.
В конце сезона дивизионы One были объединены, все оставшиеся клубы Северного дивизиона One были переведены в Первый дивизион Южной футбольной лиги.
В состав первого южного дивизиона вошли 24 клуба, в том числе 21 клуб из предыдущего сезона и три новых клуба:
Lewes выиграл дивизион и последующие плей-офф и был повышен до Конференции Юг. Клубы, занявшие второе-шестое места, были переведены в Премьер-дивизион. Epsom & Ewell заняли последнее место в таблице и были переведены в низшую лигу, оставшиеся клубы должны были начать следующий сезон в объединенном Первом дивизионе Истмийской лиги, опустившись вместе с ним с седьмого на девятый уровень из-за создания Конференции Север/Юг.
После того, как «Хангерфорд Таун» вышел из лиги, во Второй дивизион вошло 15 клубов, включая 12 клубов предыдущего сезона и три новых клуба:
Leighton Town выиграл дивизион и был переведен в Southern Football League Division One, в то время как занявшие второе место Dorking были переведены в объединенный Isthmian League Division One. В конце сезона Wokingham Town объединился с Emmbrook Sports (9° Reading League Premier Division), чтобы создать новый клуб Wokingham & Emmbrook FC , который присоединился к Hellenic League Division One East .