stringtranslate.com

Белок, инактивирующий рибосомы

Белок , инактивирующий рибосомы ( RIP ), представляет собой ингибитор синтеза белка , который действует на рибосому эукариот . [2] Это семейство белков описывает большое семейство таких белков, которые действуют как N-гликозилаза рРНК (EC 3.2.2.22). Они инактивируют субъединицы рибосомы 60S путем N-гликозидного расщепления, в результате чего из сахарофосфатного остова 28S рРНК высвобождается специфическое адениновое основание . [3] [4] [5] RIP существуют у бактерий и растений. [6]

Члены этого семейства включают шига-токсины , а также белки, инактивирующие рибосомы (RIP), типа I (например, трихосантин и люффин) и типа II (например, рицин , агглютинин и абрин ). Все эти токсины структурно родственны. RIPs представляют значительный интерес из-за их потенциального использования, конъюгированного с моноклональными антителами , в качестве иммунотоксинов для лечения рака. Кроме того, было показано, что трихосантин обладает мощной активностью против ВИЧ-1- инфицированных Т-клеток и макрофагов . [7] Таким образом, выяснение структурно-функциональных отношений RIP стало серьезной исследовательской задачей. Теперь известно, что RIP структурно связаны. Консервативный глутаминовый остаток участвует в каталитическом механизме; [8] это находится вблизи консервативного остатка аргинина , который также играет роль в катализе. [9]

Лишь небольшая часть RIP токсичны для человека при употреблении, а белки этого семейства обнаруживаются в подавляющем большинстве растений, используемых в пищу человеком, таких как рис, кукуруза и ячмень. Считается, что у растений они защищают от патогенов и насекомых. [10]

Классификация

Белки, инактивирующие рибосомы (RIP), делятся на следующие типы в зависимости от состава белковых доменов: [11]

Примеры

Примеры включают в себя:

Рекомендации

  1. ^ Монзинго А.Ф., Коллинз Э.Дж., Эрнст С.Р., Ирвин Дж.Д., Робертус Дж.Д. (октябрь 1993 г.). «Структура 2,5 А противовирусного белка рябины». Журнал молекулярной биологии . 233 (4): 705–15. дои : 10.1006/jmbi.1993.1547. ПМИД  8411176.
  2. ^ Рибосома + инактивация + белки в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  3. ^ Эндо Ю, Цуруги К, Юцудо Т, Такеда Ю, Огасавара Т, Игараси К (январь 1988 г.). «Место действия токсина Веро (VT2) из ​​Escherichia coli O157:H7 и токсина Шига на эукариотические рибосомы. РНК-N-гликозидазная активность токсинов». Европейский журнал биохимии . 171 (1–2): 45–50. дои : 10.1111/j.1432-1033.1988.tb13756.x . ПМИД  3276522.
  4. ^ Мэй М.Дж., Хартли М.Р., Робертс Л.М., Криг П.А., Осборн Р.В., Лорд Дж.М. (январь 1989 г.). «Инактивация рибосом цепью А рицина: чувствительный метод оценки активности полипептидов дикого типа и мутантных». Журнал ЭМБО . 8 (1): 301–8. doi :10.1002/j.1460-2075.1989.tb03377.x. ПМК 400803 . ПМИД  2714255. 
  5. ^ Фунацу Г., Ислам М.Р., Минами Ю., Сунг-Сил К., Кимура М. (1991). «Консервативные аминокислотные остатки в инактивирующих рибосомы белках растений». Биохимия . 73 (7–8): 1157–61. дои : 10.1016/0300-9084(91)90160-3. ПМИД  1742358.
  6. ^ Мак А.Н., Вонг Ю.Т., Ан Ю.Дж., Ча СС, Сзе К.Х., Ау С.В. и др. (2007). «Исследование структуры и функции белка, инактивирующего рибосомы кукурузы: значение для внутренней области инактивации и единственного глутамата в активном центре». Исследования нуклеиновых кислот . 35 (18): 6259–67. doi : 10.1093/nar/gkm687. ПМК 2094058 . ПМИД  17855394. 
  7. ^ Чжоу К., Фу З., Чен М., Линь Ю., Пан К. (май 1994 г.). «Структура трихосантина при разрешении 1,88 А». Белки . 19 (1): 4–13. дои : 10.1002/prot.340190103. PMID  8066085. S2CID  21524411.
  8. ^ Ховде CJ, Колдервуд С.Б., Мекаланос Дж.Дж., Коллиер Р.Дж. (апрель 1988 г.). «Доказательства того, что глутаминовая кислота 167 является остатком активного центра шигаподобного токсина I». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (8): 2568–72. Бибкод : 1988PNAS...85.2568H. дои : 10.1073/pnas.85.8.2568 . ПМК 280038 . ПМИД  3357883. 
  9. ^ Монзинго А.Ф., Коллинз Э.Дж., Эрнст С.Р., Ирвин Дж.Д., Робертус Дж.Д. (октябрь 1993 г.). «Структура 2,5 А противовирусного белка рябины». Журнал молекулярной биологии . 233 (4): 705–15. дои : 10.1006/jmbi.1993.1547. ПМИД  8411176.
  10. ^ Чжу, Фэн; Чжоу, Ян-Кай; Цзи, Чжао-Линь; Чен, Сяо-Рен (9 февраля 2018 г.). «Белки, инактивирующие рибосомы растений, играют важную роль в защите от патогенов и атак насекомых-вредителей». Границы в науке о растениях . 9 : 146. дои : 10.3389/fpls.2018.00146 . ПМК 5811460 . ПМИД  29479367. 
  11. ^ abcd Lapadula WJ, Аюб MJ (сентябрь 2017 г.). «Белки, инактивирующие рибосомы, с эволюционной точки зрения». Токсикон . 136 : 6–14. doi :10.1016/j.токсикон.2017.06.012. PMID  28651991. S2CID  9814488.
  12. ^ Фредрикссон, Стен-Оке; Артурссон, Элизабет; Бергстрем, Томас; Остин, Андерс; Нильссон, Калле; Остот, Кристер (декабрь 2014 г.). «Идентификация токсинов RIP-II путем аффинного обогащения, ферментативного расщепления и ЖХ-МС». Аналитическая химия . 87 (2): 967–974. дои : 10.1021/ac5032918. ISSN  0003-2700. ПМИД  25496503.
  13. ^ Гамильтон П.Т., Пэн Ф., Буланже М.Дж., Перлман С.Дж. (январь 2016 г.). «Белок, инактивирующий рибосомы, в защитном симбионте дрозофилы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (2): 350–5. Бибкод : 2016PNAS..113..350H. дои : 10.1073/pnas.1518648113 . ПМЦ 4720295 . ПМИД  26712000. 
  14. ^ Домашевский А.В., Госс-диджей (январь 2015 г.). «Противовирусный белок рябины, белок, инактивирующий рибосомы: активность, ингибирование и перспективы». Токсины . 7 (2): 274–98. дои : 10.3390/toxins7020274 . ПМЦ 4344624 . ПМИД  25635465.  
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001574.