Биосенсор — это аналитическое устройство, используемое для обнаружения химического вещества, которое объединяет биологический компонент с физико-химическим детектором. [1] [2] [3] [4] Чувствительный биологический элемент , например, ткань, микроорганизмы, органеллы , клеточные рецепторы , ферменты , антитела , нуклеиновые кислоты и т. д., представляет собой биологически полученный материал или биомиметический компонент, который взаимодействует с исследуемым аналитом, связывается с ним или распознает его. Биологически чувствительные элементы также могут быть созданы с помощью биологической инженерии . Преобразователь или элемент детектора , который преобразует один сигнал в другой, работает физико-химическим способом: оптическим, пьезоэлектрическим , электрохимическим, электрохемилюминесцентным и т. д., в результате взаимодействия аналита с биологическим элементом, для легкого измерения и количественной оценки. Считывающее устройство биосенсора подключается к соответствующей электронике или процессорам сигналов, которые в первую очередь отвечают за отображение результатов в удобном для пользователя виде. [5] Иногда это составляет самую дорогую часть сенсорного устройства, однако можно создать удобный для пользователя дисплей, включающий преобразователь и чувствительный элемент ( голографический датчик ). Считыватели обычно проектируются и производятся на заказ в соответствии с различными принципами работы биосенсоров.
Биосенсор обычно состоит из биорецептора (фермент/антитело/клетка/нуклеиновая кислота/аптамер), компонента преобразователя (полупроводниковый материал/наноматериал) и электронной системы , которая включает усилитель сигнала , процессор и дисплей. [6] Преобразователи и электроника могут быть объединены, например, в микросенсорных системах на основе КМОП . [7] [8] Компонент распознавания, часто называемый биорецептором, использует биомолекулы из организмов или рецепторов, смоделированных по образцу биологических систем, для взаимодействия с интересующим аналитом. Это взаимодействие измеряется биопреобразователем, который выдает измеримый сигнал, пропорциональный присутствию целевого аналита в образце. Общая цель конструкции биосенсора — обеспечить быстрое и удобное тестирование в точке беспокойства или ухода, где был получен образец. [1] [9] [10]
В биосенсоре биорецептор предназначен для взаимодействия с определенным интересующим аналитом для получения эффекта, измеряемого преобразователем. Высокая селективность к аналиту среди матрицы других химических или биологических компонентов является ключевым требованием к биорецептору. Хотя тип используемой биомолекулы может широко варьироваться, биосенсоры можно классифицировать в соответствии с общими типами взаимодействий биорецепторов, включающими: антитело/антиген, [11] ферменты/лиганды, нуклеиновые кислоты/ДНК, клеточные структуры/клетки или биомиметические материалы. [12] [13]
Иммуносенсор использует очень специфическую связывающую способность антител для определенного соединения или антигена . Специфическая природа взаимодействия антитела с антигеном аналогична замку и ключу в том, что антиген будет связываться с антителом только в том случае, если оно имеет правильную конформацию. События связывания приводят к физико-химическому изменению, которое в сочетании с трассером, таким как флуоресцентные молекулы, ферменты или радиоизотопы, может генерировать сигнал. Существуют ограничения при использовании антител в датчиках: 1. Связывающая способность антитела сильно зависит от условий анализа (например, pH и температуры), и 2. взаимодействие антитела с антигеном, как правило, является надежным, однако связывание может быть нарушено хаотропными реагентами , органическими растворителями или даже ультразвуковым излучением. [14] [15]
Взаимодействия антитело-антиген также могут быть использованы для серологического тестирования или обнаружения циркулирующих антител в ответ на определенное заболевание. Важно отметить, что серологические тесты стали важной частью глобального ответа на пандемию COVID-19 . [16]
Использование антител в качестве компонента биораспознавания биосенсоров имеет несколько недостатков. Они имеют высокую молекулярную массу и ограниченную стабильность, содержат необходимые дисульфидные связи и дороги в производстве. В одном подходе для преодоления этих ограничений были сконструированы рекомбинантные связывающие фрагменты ( Fab , Fv или scFv ) или домены (VH, VHH ) антител. [17] В другом подходе были сконструированы небольшие белковые каркасы с благоприятными биофизическими свойствами для создания искусственных семейств антигенсвязывающих белков (AgBP), способных специфически связываться с различными целевыми белками, сохраняя при этом благоприятные свойства родительской молекулы. Элементы семейства, которые специфически связываются с данным целевым антигеном, часто выбираются in vitro с помощью методов отображения: фаговый дисплей , рибосомный дисплей , дрожжевой дисплей или мРНК-дисплей . Искусственные связывающие белки намного меньше антител (обычно менее 100 аминокислотных остатков), обладают высокой стабильностью, не имеют дисульфидных связей и могут экспрессироваться с высоким выходом в восстановительных клеточных средах, таких как бактериальная цитоплазма, в отличие от антител и их производных. [18] [19] Таким образом, они особенно подходят для создания биосенсоров. [20] [21]
Специфические возможности связывания и каталитическая активность ферментов делают их популярными биорецепторами. Распознавание аналита осуществляется посредством нескольких возможных механизмов: 1) фермент преобразует аналит в продукт, который можно обнаружить с помощью сенсора, 2) обнаруживает ингибирование или активацию фермента аналитом или 3) отслеживает изменение свойств фермента в результате взаимодействия с аналитом. [15] Основными причинами общего использования ферментов в биосенсорах являются: 1) способность катализировать большое количество реакций; 2) потенциальная возможность обнаруживать группу аналитов (субстратов, продуктов, ингибиторов и модуляторов каталитической активности); и 3) пригодность для нескольких различных методов трансдукции для обнаружения аналита. В частности, поскольку ферменты не расходуются в реакциях, биосенсор можно легко использовать непрерывно. Каталитическая активность ферментов также обеспечивает более низкие пределы обнаружения по сравнению с обычными методами связывания. Однако срок службы сенсора ограничен стабильностью фермента.
Антитела имеют высокую константу связывания , превышающую 10^8 л/моль, что означает почти необратимую ассоциацию после того, как пара антиген-антитело образовалась. Для некоторых молекул аналита, таких как глюкоза , существуют белки с аффинным связыванием, которые связывают свой лиганд с высокой специфичностью , как антитело, но с гораздо меньшей константой связывания порядка 10^2–10^4 л/моль. Ассоциация между аналитом и рецептором тогда носит обратимый характер, и рядом с парой между ними также встречаются их свободные молекулы в измеримой концентрации. Например, в случае глюкозы конканавалин А может функционировать как аффинный рецептор, демонстрируя константу связывания 4x10^2 л/моль. [22] Использование аффинно-связывающих рецепторов для целей биосенсорики было предложено Шульцем и Симсом в 1979 году [23] и впоследствии было реализовано в флуоресцентном анализе для измерения глюкозы в соответствующем физиологическом диапазоне от 4,4 до 6,1 ммоль/л. [24] Принцип сенсора имеет то преимущество, что он не потребляет аналит в химической реакции, как это происходит в ферментативных анализах.
Биосенсоры, использующие рецепторы на основе нуклеиновых кислот, могут быть основаны либо на комплементарном взаимодействии пар оснований, называемом геносенсорами, либо на специфических имитаторах антител на основе нуклеиновых кислот (аптамерах), называемых аптасенсорами. [25] В первом случае процесс распознавания основан на принципе комплементарно спаренных оснований , аденин:тимин и цитозин:гуанин в ДНК . Если известна целевая последовательность нуклеиновой кислоты, комплементарные последовательности могут быть синтезированы, помечены и затем иммобилизованы на сенсоре. Событие гибридизации может быть оптически обнаружено, а наличие целевой ДНК/РНК установлено. Во втором случае аптамеры, созданные против цели, распознают ее посредством взаимодействия специфических нековалентных взаимодействий и индуцированной подгонки. Эти аптамеры могут быть легко помечены флуорофором/металлическими наночастицами для оптического обнаружения или могут быть использованы для безметковых электрохимических или консольных платформ обнаружения для широкого спектра целевых молекул или сложных целей, таких как клетки и вирусы. [26] [27] Кроме того, аптамеры могут быть объединены с ферментами нуклеиновых кислот, такими как РНК-расщепляющие ДНКзимы, обеспечивая как распознавание цели, так и генерацию сигнала в одной молекуле, что показывает потенциальные возможности применения в разработке мультиплексных биосенсоров. [28]
Было высказано предположение, что правильно оптимизированные интегрированные оптические резонаторы могут быть использованы для обнаружения эпигенетических модификаций (например, метилирования ДНК, посттрансляционных модификаций гистонов) в жидкостях организма пациентов, страдающих раком или другими заболеваниями. [29] Фотонные биосенсоры с ультрачувствительностью в настоящее время разрабатываются на исследовательском уровне для легкого обнаружения раковых клеток в моче пациента. [30] Различные исследовательские проекты направлены на разработку новых портативных устройств, которые используют дешевые, экологически чистые, одноразовые картриджи, требующие только простого обращения без необходимости дальнейшей обработки, промывки или манипуляций со стороны опытных техников. [31]
Органеллы образуют отдельные отсеки внутри клеток и обычно выполняют функции независимо. Различные виды органелл имеют различные метаболические пути и содержат ферменты для выполнения своей функции. Обычно используемые органеллы включают лизосому, хлоропласт и митохондрии. Пространственно-временной характер распределения кальция тесно связан с повсеместным сигнальным путем. Митохондрии активно участвуют в метаболизме ионов кальция, чтобы контролировать функцию, а также модулировать сигнальные пути, связанные с кальцием. Эксперименты доказали, что митохондрии обладают способностью реагировать на высокие концентрации кальция, образующиеся в их непосредственной близости, открывая кальциевые каналы. [32] Таким образом, митохондрии можно использовать для определения концентрации кальция в среде, и это определение очень чувствительно благодаря высокому пространственному разрешению. Другое применение митохондрий — определение загрязнения воды. Токсичность моющих соединений повреждает клетки и субклеточную структуру, включая митохондрии. Моющие средства вызывают эффект набухания, который можно измерить по изменению поглощения. Экспериментальные данные показывают, что скорость изменения пропорциональна концентрации моющего средства, что обеспечивает высокий стандарт точности обнаружения. [33]
Клетки часто используются в биорецепторах, поскольку они чувствительны к окружающей среде и могут реагировать на все виды стимуляторов. Клетки имеют тенденцию прикрепляться к поверхности, поэтому их можно легко иммобилизовать. По сравнению с органеллами они остаются активными в течение более длительного периода, а воспроизводимость делает их пригодными для повторного использования. Они обычно используются для обнаружения глобальных параметров, таких как стрессовое состояние, токсичность и органические производные. Их также можно использовать для мониторинга лечебного эффекта лекарств. Одним из применений является использование клеток для определения гербицидов, которые являются основными водными загрязнителями. [34] Микроводоросли улавливаются на кварцевом микроволокне , а флуоресценция хлорофилла, модифицированная гербицидами, собирается на кончике оптоволоконного жгута и передается на флуориметр. Водоросли непрерывно культивируются для получения оптимизированных измерений. Результаты показывают, что предел обнаружения определенного гербицида может достигать уровня концентрации ниже ppb. Некоторые клетки также можно использовать для мониторинга микробной коррозии. [35] Pseudomonas sp. изолирован от поверхности корродированного материала и иммобилизован на ацетилцеллюлозной мембране. Активность дыхания определяется путем измерения потребления кислорода. Существует линейная зависимость между генерируемым током и концентрацией серной кислоты . Время отклика связано с нагрузкой клеток и окружающей среды и может контролироваться не более чем до 5 мин.
Ткани используются для биосенсора для изобилия существующих ферментов. Преимущества тканей как биосенсоров включают в себя следующее: [36]
Существуют также некоторые недостатки тканей, такие как отсутствие специфичности из-за вмешательства других ферментов и более длительное время реакции из-за транспортного барьера.
Микробные биосенсоры используют реакцию бактерий на данное вещество. Например, мышьяк можно обнаружить с помощью оперона ars , обнаруженного в нескольких бактериальных таксонах. [37]
Важной частью биосенсора является присоединение биологических элементов (малых молекул/белков/клеток) к поверхности сенсора (будь то металл, полимер или стекло). Самый простой способ — функционализировать поверхность , чтобы покрыть ее биологическими элементами. Это можно сделать с помощью полилизина, аминосилана, эпоксисилана или нитроцеллюлозы в случае кремниевых чипов/силикатного стекла. Впоследствии связанный биологический агент также может быть зафиксирован, например, путем послойного нанесения альтернативно заряженных полимерных покрытий. [38]
В качестве альтернативы, трехмерные решетки ( гидрогель / ксерогель ) могут быть использованы для химического или физического захвата этих элементов (при этом химический захват означает, что биологический элемент удерживается на месте прочной связью, в то время как физически они удерживаются на месте, не имея возможности пройти через поры гелевой матрицы). Наиболее часто используемый гидрогель - это золь-гель , стеклообразный кремнезем, полученный путем полимеризации силикатных мономеров (добавленных в виде тетраалкилортосиликатов, таких как ТМОС или ТЭОС ) в присутствии биологических элементов (вместе с другими стабилизирующими полимерами, такими как ПЭГ ) в случае физического захвата. [39]
Другая группа гидрогелей, которые застывают в условиях, подходящих для клеток или белка, — это акрилатный гидрогель, который полимеризуется при радикальной инициации . Одним из типов радикального инициатора является пероксидный радикал, обычно генерируемый путем объединения персульфата с TEMED ( полиакриламидный гель также обычно используется для электрофореза белков ), [40] в качестве альтернативы свет может использоваться в сочетании с фотоинициатором, таким как DMPA ( 2,2-диметокси-2-фенилацетофенон ). [41] Умные материалы, которые имитируют биологические компоненты датчика, также могут быть классифицированы как биосенсоры, использующие только активный или каталитический сайт или аналогичные конфигурации биомолекулы. [42]
Биосенсоры можно классифицировать по типу биопреобразователя . Наиболее распространенные типы биопреобразователей, используемые в биосенсорах:
Электрохимические биосенсоры обычно основаны на ферментативном катализе реакции, которая производит или потребляет электроны (такие ферменты справедливо называются окислительно-восстановительными ферментами). Подложка сенсора обычно содержит три электрода : опорный электрод , рабочий электрод и противоэлектрод. Целевой аналит участвует в реакции, которая происходит на активной поверхности электрода, и реакция может вызвать либо перенос электронов через двойной слой (создавая ток), либо может способствовать потенциалу двойного слоя (создавая напряжение). Мы можем либо измерить ток (скорость потока электронов теперь пропорциональна концентрации аналита) при фиксированном потенциале, либо потенциал может быть измерен при нулевом токе (это дает логарифмический отклик). Обратите внимание, что потенциал рабочего или активного электрода чувствителен к пространственному заряду, и это часто используется. Кроме того, возможно прямое электрическое обнаружение без меток небольших пептидов и белков за счет их собственных зарядов с использованием биофункционализированных ионно-чувствительных полевых транзисторов . [43]
Другой пример — потенциометрический биосенсор (потенциал, создаваемый при нулевом токе) — дает логарифмический отклик с высоким динамическим диапазоном. Такие биосенсоры часто изготавливаются путем трафаретной печати электродных рисунков на пластиковой подложке, покрытой проводящим полимером, а затем прикрепленным некоторым белком (ферментом или антителом). Они имеют всего два электрода и чрезвычайно чувствительны и надежны. Они позволяют обнаруживать аналиты на уровнях, которые ранее были достижимы только с помощью ВЭЖХ и ЖХ/МС и без тщательной подготовки образцов. Все биосенсоры обычно требуют минимальной подготовки образцов, поскольку биологический чувствительный компонент является высокоселективным для соответствующего аналита. Сигнал создается электрохимическими и физическими изменениями в проводящем полимерном слое из-за изменений, происходящих на поверхности сенсора. Такие изменения можно отнести к ионной силе, pH, гидратации и окислительно-восстановительным реакциям, причем последняя обусловлена тем, что ферментная метка поворачивает субстрат. [44] Полевые транзисторы, в которых область затвора модифицирована ферментом или антителом, также могут обнаруживать очень низкие концентрации различных аналитов, поскольку связывание аналита с областью затвора полевого транзистора вызывает изменение тока сток-исток.
Развитие биосенсоров на основе импедансной спектроскопии в настоящее время набирает обороты, и многие такие устройства/разработки можно найти в академических кругах и промышленности. Одно такое устройство, основанное на 4-электродной электрохимической ячейке, использующей нанопористую мембрану из оксида алюминия, как было показано, обнаруживает низкие концентрации человеческого альфа-тромбина в присутствии высокого фона сывороточного альбумина. [45] Также для импедансных биосенсоров использовались встречно-штыревые электроды. [46]
Использование ионных каналов, как было показано, обеспечивает высокочувствительное обнаружение целевых биологических молекул. [47] Встраивая ионные каналы в поддерживаемые или привязанные двухслойные мембраны (t-BLM), прикрепленные к золотому электроду, создается электрическая цепь. Молекулы захвата, такие как антитела, могут быть связаны с ионным каналом, так что связывание целевой молекулы контролирует поток ионов через канал. Это приводит к измеримому изменению электропроводности, которое пропорционально концентрации цели.
Биосенсор переключения ионного канала (ICS) может быть создан с использованием грамицидина, димерного пептидного канала, в связанной двухслойной мембране. [48] Один пептид грамицидина с прикрепленным антителом является подвижным, а другой — фиксированным. Разрыв димера останавливает ионный ток через мембрану. Величина изменения электрического сигнала значительно увеличивается при отделении мембраны от металлической поверхности с помощью гидрофильной прокладки.
Количественное обнаружение обширного класса целевых видов, включая белки, бактерии, наркотики и токсины, было продемонстрировано с использованием различных конфигураций мембран и захвата. [49] [50] Европейский исследовательский проект Greensense разрабатывает биосенсор для проведения количественного скрининга наркотических веществ, таких как ТГК, морфин и кокаин [51], в слюне и моче.
Безреагентный биосенсор может контролировать целевой аналит в сложной биологической смеси без дополнительного реагента. Поэтому он может функционировать непрерывно, если иммобилизован на твердой подложке. Флуоресцентный биосенсор реагирует на взаимодействие с целевым аналитом изменением своих флуоресцентных свойств. Безреагентный флуоресцентный биосенсор (RF-биосенсор) может быть получен путем интеграции биологического рецептора, который направлен против целевого аналита, и сольватохромного флуорофора, свойства излучения которого чувствительны к природе его локального окружения, в одну макромолекулу. Флуорофор преобразует событие распознавания в измеримый оптический сигнал. Использование внешних флуорофоров, свойства излучения которых значительно отличаются от свойств внутренних флуорофоров белков, триптофана и тирозина, позволяет немедленно обнаруживать и количественно определять аналит в сложных биологических смесях. Интеграция флуорофора должна осуществляться в месте, где он чувствителен к связыванию аналита, не нарушая при этом сродства рецептора.
Антитела и искусственные семейства антигенсвязывающих белков (AgBP) хорошо подходят для обеспечения модуля распознавания RF-биосенсоров, поскольку они могут быть направлены против любого антигена (см. параграф о биорецепторах). Описан общий подход к интеграции сольватохромного флуорофора в AgBP, когда известна атомная структура комплекса с его антигеном, и, таким образом, превращению его в RF-биосенсор. [20] Остаток AgBP идентифицируется по соседству с антигеном в их комплексе. Этот остаток изменяется на цистеин путем сайт-направленного мутагенеза. Флуорофор химически связывается с мутантным цистеином. Когда дизайн успешен, связанный флуорофор не препятствует связыванию антигена, это связывание защищает флуорофор от растворителя, и его можно обнаружить по изменению флуоресценции. Эта стратегия также действительна для фрагментов антител. [52] [53]
Однако при отсутствии конкретных структурных данных необходимо применять другие стратегии. Антитела и искусственные семейства AgBP состоят из набора гипервариабельных (или рандомизированных) позиций остатков, расположенных в уникальной подобласти белка и поддерживаемых постоянным полипептидным каркасом. Остатки, которые образуют сайт связывания для данного антигена, выбираются среди гипервариабельных остатков. Можно преобразовать любой AgBP из этих семейств в RF-биосенсор, специфичный для целевого антигена, просто связав сольватохромный флуорофор с одним из гипервариабельных остатков, которые имеют малое или совсем не имеют значения для взаимодействия с антигеном, после изменения этого остатка на цистеин путем мутагенеза. Более конкретно, стратегия заключается в индивидуальном изменении остатков гипервариабельных позиций на цистеин на генетическом уровне, в химическом связывании сольватохромного флуорофора с мутантным цистеином, а затем в сохранении полученных конъюгатов, которые имеют самую высокую чувствительность (параметр, который включает как сродство, так и вариацию сигнала флуоресценции). [21] Этот подход также применим к семействам фрагментов антител. [54]
Исследования a posteriori показали, что наилучшие безреагентные флуоресцентные биосенсоры получаются, когда флуорофор не вступает в нековалентные взаимодействия с поверхностью биорецептора, что увеличило бы фоновый сигнал, и когда он взаимодействует со связывающим карманом на поверхности целевого антигена. [55] Радиочастотные биосенсоры, полученные вышеуказанными методами, могут функционировать и обнаруживать целевые аналиты внутри живых клеток. [56]
Магнитные биосенсоры используют парамагнитные или супрапарамагнитные частицы или кристаллы для обнаружения биологических взаимодействий. Примерами могут быть катушка индуктивности, сопротивление или другие магнитные свойства. Обычно используют магнитные нано- или микрочастицы. На поверхности таких частиц находятся биорецепторы, которые могут быть ДНК (комплементарными последовательности или аптамерам), антителами или другими. Связывание биорецептора повлияет на некоторые свойства магнитных частиц, которые могут быть измерены с помощью сусцептометрии переменного тока, [57] датчика эффекта Холла, [58] гигантского магниторезистивного устройства, [59] или других.
Пьезоэлектрические датчики используют кристаллы, которые подвергаются упругой деформации при приложении к ним электрического потенциала. Переменный потенциал (AC) создает стоячую волну в кристалле на характерной частоте. Эта частота сильно зависит от упругих свойств кристалла, так что если кристалл покрыт биологическим элементом распознавания, связывание (большого) целевого аналита с рецептором вызовет изменение резонансной частоты, что даст сигнал связывания. В режиме, который использует поверхностные акустические волны (SAW), чувствительность значительно увеличивается. Это специализированное применение кварцевых кристаллических микровесов в качестве биосенсора
Электрохемилюминесценция (ECL) в настоящее время является ведущей технологией в биосенсорах. [60] [61] [62] Поскольку возбужденные виды производятся с помощью электрохимического стимула, а не источника светового возбуждения, ECL демонстрирует улучшенное отношение сигнал/шум по сравнению с фотолюминесценцией с минимизированными эффектами из-за рассеяния света и люминесцентного фона. В частности, кореактант ECL, работающий в буферном водном растворе в области положительных потенциалов (окислительно-восстановительный механизм), определенно усилил ECL для иммуноанализа, что подтверждается многими исследовательскими приложениями и, что еще больше, присутствием важных компаний, которые разработали коммерческое оборудование для высокопроизводительного иммуноанализа на рынке стоимостью в миллиарды долларов каждый год.
Термометрические биосенсоры встречаются редко.
MOSFET был изобретен в Bell Labs между 1955 и 1960 годами, [63] [64] [65] [66] [67] [68] Позже, в 1962 году, Лиланд К. Кларк и Чемп Лайонс изобрели первый биосенсор. [69] [70] Биосенсорные MOSFET (BioFET) были разработаны позже, и с тех пор они широко используются для измерения физических , химических , биологических и экологических параметров. [71]
Первым BioFET был ионно-чувствительный полевой транзистор (ISFET), изобретенный Питом Бергвельдом для электрохимических и биологических применений в 1970 году. [72] [73] адсорбционный полевой транзистор (ADFET) был запатентован П. Ф. Коксом в 1974 году, а водород -чувствительный MOSFET был продемонстрирован И. Лундстромом, М. С. Шивараманом, К. С. Свенсоном и Л. Лундквистом в 1975 году. [71] ISFET — это особый тип MOSFET с затвором на определенном расстоянии, [71] и где металлический затвор заменен ионно -чувствительной мембраной , раствором электролита и эталонным электродом . [74] ISFET широко используется в биомедицинских приложениях, таких как обнаружение гибридизации ДНК , обнаружение биомаркеров в крови , обнаружение антител , измерение глюкозы , определение pH и генная технология . [74]
К середине 1980-х годов были разработаны другие BioFET, включая газовый сенсорный FET (GASFET), сенсорный FET давления (PRESSFET), химический полевой транзистор (ChemFET), эталонный ISFET (REFET), модифицированный ферментом FET (ENFET) и иммунологически модифицированный FET (IMFET). [71] К началу 2000-х годов были разработаны BioFET, такие как ДНК-полевой транзистор (DNAFET), генно-модифицированный FET (GenFET) и клеточно-потенциальный BioFET (CPFET). [74]
Соответствующее размещение биосенсоров зависит от области их применения, которую можно условно разделить на биотехнологию , сельское хозяйство , пищевые технологии и биомедицину .
В биотехнологии анализ химического состава бульона для культивирования может проводиться в режиме in-line, on-line, at-line и off-line. Как указано Управлением по контролю за продуктами и лекарствами США ( FDA ), образец не удаляется из технологического потока для датчиков in-line, в то время как он отвлекается от производственного процесса для измерений on-line. Для датчиков at-line образец может быть удален и проанализирован в непосредственной близости от технологического потока. [75] Примером последнего является мониторинг лактозы на заводе по переработке молока. [76] Автономные биосенсоры сравниваются с биоаналитическими методами , которые работают не в полевых условиях, а в лаборатории. Эти методы в основном используются в сельском хозяйстве, пищевых технологиях и биомедицине.
В медицинских приложениях биосенсоры обычно классифицируются как системы in vitro и in vivo . Измерение in vitro биосенсора происходит в пробирке, чашке для культивирования, микротитровальном планшете или в другом месте вне живого организма. Датчик использует биорецептор и преобразователь, как описано выше. Примером биосенсора in vitro является ферментно-кондуктометрический биосенсор для мониторинга уровня глюкозы в крови . Существует проблема создания биосенсора, который работает по принципу тестирования в месте оказания помощи , т. е. в том месте, где требуется тест. [77] [78] Разработка носимых биосенсоров входит в число таких исследований. [79] Устранение лабораторного тестирования может сэкономить время и деньги. Применение биосенсора POCT может быть для тестирования ВИЧ в областях, где пациентам сложно пройти тестирование. Биосенсор можно отправить непосредственно на место, и можно использовать быстрый и простой тест.
Биосенсор in vivo — это имплантируемое устройство , работающее внутри тела. Конечно, имплантаты биосенсоров должны соответствовать строгим правилам стерилизации , чтобы избежать первоначальной воспалительной реакции после имплантации. Вторая проблема связана с долгосрочной биосовместимостью , т. е. безвредным взаимодействием с окружающей средой организма в течение предполагаемого периода использования. [81] Другая проблема, которая возникает, — это отказ. В случае отказа устройство необходимо удалить и заменить, что потребует дополнительной операции. Примером применения биосенсора in vivo может служить мониторинг инсулина внутри тела, который пока недоступен.
Большинство современных биосенсорных имплантатов были разработаны для непрерывного мониторинга уровня глюкозы. [82] [83] На рисунке показано устройство, для которого используется корпус из титана и батарея, как установлено для сердечно-сосудистых имплантатов, таких как кардиостимуляторы и дефибрилляторы . [80] Его размер определяется батареей, которая требуется для срока службы в один год. Измеренные данные о глюкозе будут передаваться по беспроводной сети из тела в диапазоне MICS 402–405 МГц, одобренном для медицинских имплантатов.
Биосенсоры также могут быть интегрированы в системы мобильных телефонов, что делает их удобными и доступными для большого числа пользователей. [84]
Существует множество потенциальных применений биосенсоров различных типов. Главными требованиями к биосенсорному подходу, чтобы быть ценным с точки зрения исследований и коммерческих приложений, являются идентификация целевой молекулы, наличие подходящего элемента биологического распознавания и возможность использования одноразовых портативных систем обнаружения вместо чувствительных лабораторных методов в некоторых ситуациях. Вот несколько примеров:
Распространенным примером коммерческого биосенсора является биосенсор глюкозы в крови , который использует фермент глюкозооксидазу для расщепления глюкозы в крови. При этом он сначала окисляет глюкозу и использует два электрона для восстановления FAD (компонента фермента) до FADH 2 . Он, в свою очередь, окисляется электродом в несколько этапов. Результирующий ток является мерой концентрации глюкозы. В этом случае электрод является преобразователем, а фермент — биологически активным компонентом.
Канарейку в клетке , которую шахтеры используют для предупреждения о газе, можно считать биосенсором. Многие из современных биосенсорных приложений похожи, поскольку они используют организмы, которые реагируют на токсичные вещества в гораздо более низких концентрациях, чем люди могут обнаружить, чтобы предупредить об их присутствии. Такие устройства можно использовать в мониторинге окружающей среды , [86] обнаружении следов газа и на водоочистных сооружениях.
Коммерчески доступные мониторы глюкозы полагаются на амперометрическое зондирование глюкозы с помощью глюкозооксидазы , которая окисляет глюкозу, производя перекись водорода, которая обнаруживается электродом. Чтобы преодолеть ограничение амперометрических датчиков, проводится множество исследований в области новых методов зондирования, таких как флуоресцентные биосенсоры глюкозы . [88]
Интерферометрический датчик отражательной визуализации (IRIS) основан на принципах оптической интерференции и состоит из кремний-кремниевой оксидной подложки, стандартной оптики и маломощных когерентных светодиодов. Когда свет освещается через объектив с малым увеличением на слоистую кремний-кремниевую оксидную подложку, создается интерферометрическая сигнатура. По мере того, как биомасса, имеющая аналогичный показатель преломления, как оксид кремния, накапливается на поверхности подложки, происходит изменение интерферометрической сигнатуры, и это изменение можно соотнести с количественно определяемой массой. Даабул и др. использовали IRIS для получения чувствительности без метки приблизительно 19 нг/мл. [89] Ан и др. улучшили чувствительность IRIS с помощью техники маркировки масс. [90]
С момента первой публикации IRIS был адаптирован для выполнения различных функций. Во-первых, IRIS интегрировал возможность флуоресцентной визуализации в инструмент интерферометрической визуализации в качестве потенциального способа решения проблемы изменчивости микроматриц флуоресцентных белков. [91] Вкратце, вариации в микроматрицах флуоресценции в основном возникают из-за непоследовательной иммобилизации белка на поверхностях и могут привести к неправильной диагностике в микроматрицах аллергии. [92] Чтобы скорректировать любые вариации в иммобилизации белка, данные, полученные в модальности флуоресценции, затем нормализуются с помощью данных, полученных в модальности без метки. [92] IRIS также был адаптирован для выполнения подсчета отдельных наночастиц путем простого переключения объектива с низким увеличением, используемого для количественной оценки биомассы без метки, на объектив с большим увеличением. [93] [94] Эта модальность позволяет различать размеры в сложных биологических образцах человека. Monroe et al. использовали IRIS для количественной оценки уровней белка, введенного в цельную кровь и сыворотку человека, и определяли сенсибилизацию аллергенов в характерных образцах крови человека с использованием нулевой обработки образцов. [95] Другие практические применения этого устройства включают обнаружение вирусов и патогенов. [96]
Существует несколько применений биосенсоров в анализе пищевых продуктов. [97] [98] [99] [100] В пищевой промышленности оптика, покрытая антителами, обычно используется для обнаружения патогенов и пищевых токсинов. Обычно световая система в этих биосенсорах является флуоресцентной, поскольку этот тип оптического измерения может значительно усиливать сигнал.
Разработан ряд иммуно- и лиганд-связывающих анализов для обнаружения и измерения малых молекул, таких как водорастворимые витамины и химические загрязнители ( остатки лекарств ), такие как сульфаниламиды и бета-агонисты , для использования в сенсорных системах на основе SPR , часто адаптированных из существующих ИФА или других иммунологических анализов. Они широко используются в пищевой промышленности.
Биосенсоры могут использоваться для мониторинга загрязняющих веществ в воздухе , воде и почве, таких как пестициды, потенциально канцерогенные, мутагенные и/или токсичные вещества, а также химикаты, нарушающие работу эндокринной системы. [101] [102]
Например, бионанотехнологи разработали жизнеспособный биосенсор ROSALIND 2.0 , который может определять уровни различных загрязняющих веществ в воде . [103] [104]
Поскольку озон отфильтровывает вредное ультрафиолетовое излучение, открытие дыр в озоновом слое земной атмосферы вызвало беспокойство по поводу того, сколько ультрафиолетового света достигает поверхности Земли. Особую озабоченность вызывают вопросы о том, насколько глубоко проникает ультрафиолетовое излучение в морскую воду и как оно влияет на морские организмы , особенно планктон (плавающие микроорганизмы) и вирусы , которые атакуют планктон. Планктон составляет основу морских пищевых цепей и, как полагают, влияет на температуру и погоду нашей планеты, поглощая CO2 для фотосинтеза.
Денеб Каренц, исследователь из Лаборатории радиобиологии и охраны окружающей среды ( Калифорнийский университет, Сан-Франциско ), разработала простой метод измерения проникновения и интенсивности ультрафиолета. Работая в Антарктическом океане, она погружала на разные глубины тонкие пластиковые пакеты, содержащие особые штаммы E. coli , которые почти полностью неспособны восстанавливать повреждения ДНК, нанесенные ультрафиолетовым излучением. Показатели смертности бактерий в этих пакетах сравнивались с показателями в контрольных пакетах того же организма, не подвергавшихся воздействию. Бактериальные «биосенсоры» показывали постоянное значительное повреждение ультрафиолетом на глубине 10 м и часто на глубине 20 и 30 м. Каренц планирует дополнительные исследования того, как ультрафиолет может влиять на сезонное цветение планктона (скачки роста) в океанах. [105]
Метастазирование — это распространение рака из одной части тела в другую через кровеносную или лимфатическую систему. [106] В отличие от рентгенологических тестов визуализации (маммографии), которые посылают формы энергии (рентгеновские лучи, магнитные поля и т. д.) через тело, чтобы сделать только внутренние снимки, биосенсоры имеют потенциал для непосредственного тестирования злокачественной силы опухоли. Сочетание биологического и детекторного элемента обеспечивает небольшие требования к образцу, компактную конструкцию, быстрые сигналы, быстрое обнаружение, высокую селективность и высокую чувствительность для изучаемого аналита. По сравнению с обычными рентгенологическими тестами визуализации биосенсоры имеют преимущество не только в том, что они определяют, насколько далеко распространился рак, и проверяют, эффективно ли лечение, но и являются более дешевыми, более эффективными (по времени, стоимости и производительности) способами оценки метастазирования на ранних стадиях рака.
Исследователи биологической инженерии создали онкологические биосенсоры для рака молочной железы. [107] Рак молочной железы является наиболее распространенным видом рака среди женщин во всем мире. [108] Примером могут служить микровесы на основе трансферрина и кварца (QCM). В качестве биосенсора микровесы на основе кварца производят колебания частоты стоячей волны кристалла от переменного потенциала для обнаружения изменений массы в нанограммах. Эти биосенсоры специально разработаны для взаимодействия и обладают высокой селективностью к рецепторам на поверхностях клеток (раковых и нормальных). В идеале это обеспечивает количественное обнаружение клеток с этим рецептором на единицу площади поверхности вместо качественного обнаружения картины, которое дают маммограммы.
Седа Атай, исследователь биотехнологий в Университете Хаджеттепе, экспериментально наблюдала эту специфичность и селективность между QCM и клетками молочной железы MDA-MB 231 , клетками MCF 7 и голодающими клетками MDA-MB 231 in vitro. [107] Совместно с другими исследователями она разработала метод промывания этих различных метастатических выровненных клеток над датчиками для измерения сдвигов массы из-за разного количества рецепторов трансферрина. В частности, метастатическую силу клеток рака молочной железы можно определить с помощью кварцевых кристаллических микровесов с наночастицами и трансферрином, которые потенциально прикрепляются к рецепторам трансферрина на поверхности раковых клеток. Существует очень высокая селективность для рецепторов трансферрина, поскольку они сверхэкспрессируются в раковых клетках. Если клетки имеют высокую экспрессию рецепторов трансферрина, что показывает их высокую метастатическую силу, они имеют более высокое сродство и больше связываются с QCM, который измеряет увеличение массы. В зависимости от величины изменения массы в нанограммах можно определить метастатическую силу.
Кроме того, в последние годы значительное внимание было сосредоточено на обнаружении биомаркеров рака легких без биопсии. В этом отношении биосенсоры являются очень привлекательными и применимыми инструментами для обеспечения быстрого, чувствительного, специфического, стабильного, экономически эффективного и неинвазивного обнаружения для ранней диагностики рака легких. Таким образом, биосенсоры рака состоят из специфических молекул биораспознавания, таких как антитела, комплементарные зонды нуклеиновых кислот или другие иммобилизованные биомолекулы на поверхности преобразователя. Молекулы биораспознавания специфически взаимодействуют с биомаркерами (мишенями), и генерируемые биологические ответы преобразуются преобразователем в измеримый аналитический сигнал. В зависимости от типа биологического ответа, при изготовлении биосенсоров рака используются различные преобразователи, такие как электрохимические, оптические и массовые преобразователи. [109]
Биосенсоры могут быть использованы для обнаружения патогенных организмов. [102]
Разработаны встроенные биосенсоры для определения патогенных сигнатур, таких как SARS-CoV-2 , которые можно носить , например, маски для лица со встроенными тестами . [110] [111] См. также: Исследования и разработки в области общественного транспорта COVID-19
Новые типы биосенсорных чипов могут позволить использовать новые методы, «такие как датчики патогенов, развертываемые с помощью дронов, активно исследующие воздух или сточные воды». Белково-связывающие аптамеры могут использоваться для тестирования на наличие возбудителей инфекционных заболеваний. [112] Системы электронных кож (или роботизированных кож) со встроенными биосенсорами (или химическими сенсорами) и человеко-машинными интерфейсами могут позволить как носимые, так и дистанционно чувствительное устройство или роботизированное обнаружение патогенов (а также нескольких опасных материалов и тактильных ощущений ). [113] [ необходимы дополнительные ссылки ]
Многие оптические биосенсоры основаны на явлении методов поверхностного плазмонного резонанса (SPR). [114] [115] Это использует свойство золота и других материалов (металлов); [116] в частности, что тонкий слой золота на стеклянной поверхности с высоким показателем преломления может поглощать лазерный свет, производя электронные волны (поверхностные плазмоны) на поверхности золота. Это происходит только при определенном угле и длине волны падающего света и сильно зависит от поверхности золота, так что связывание целевого аналита с рецептором на поверхности золота производит измеримый сигнал.
Датчики поверхностного плазмонного резонанса работают с использованием сенсорного чипа, состоящего из пластиковой кассеты, поддерживающей стеклянную пластину, одна сторона которой покрыта микроскопическим слоем золота. Эта сторона контактирует с оптическим детекторным устройством прибора. Противоположная сторона затем контактирует с микрофлюидной системой потока. Контакт с системой потока создает каналы, по которым реагенты могут передаваться в растворе. Эта сторона стеклянного сенсорного чипа может быть модифицирована несколькими способами, чтобы обеспечить легкое присоединение интересующих молекул. Обычно она покрыта карбоксиметилдекстраном или аналогичным соединением.
Показатель преломления на стороне потока поверхности чипа оказывает прямое влияние на поведение света, отраженного от золотой стороны. Связывание с стороной потока чипа оказывает влияние на показатель преломления , и таким образом биологические взаимодействия могут быть измерены с высокой степенью чувствительности с помощью некоторого вида энергии. Показатель преломления среды вблизи поверхности изменяется, когда биомолекулы прикрепляются к поверхности, и угол SPR изменяется в зависимости от этого изменения.
Свет фиксированной длины волны отражается от золотой стороны чипа под углом полного внутреннего отражения и обнаруживается внутри прибора. Угол падающего света варьируется для того, чтобы согласовать скорость распространения затухающей волны со скоростью распространения поверхностных плазмонных поляритонов. [117] Это заставляет затухающую волну проникать через стеклянную пластину и на некоторое расстояние в жидкость, текущую по поверхности.
Другие оптические биосенсоры в основном основаны на изменениях поглощения или флуоресценции соответствующего индикаторного соединения и не нуждаются в геометрии полного внутреннего отражения. Например, был изготовлен полностью рабочий прототип устройства, обнаруживающего казеин в молоке. Устройство основано на обнаружении изменений поглощения золотого слоя. [118] Широко используемый исследовательский инструмент, микроматрица, также может считаться биосенсором.
Биологические биосенсоры, также известные как оптогенетические сенсоры , часто включают генетически модифицированную форму нативного белка или фермента. Белок настроен на обнаружение определенного аналита, а полученный сигнал считывается прибором обнаружения, таким как флуорометр или люминометр. Примером недавно разработанного биосенсора является датчик для обнаружения цитозольной концентрации аналита цАМФ (циклический аденозинмонофосфат), вторичного мессенджера, участвующего в клеточной сигнализации, запускаемой лигандами, взаимодействующими с рецепторами на клеточной мембране. [119] Аналогичные системы были созданы для изучения клеточных реакций на нативные лиганды или ксенобиотики (токсины или ингибиторы малых молекул). Такие «анализы» обычно используются при разработке лекарственных препаратов фармацевтическими и биотехнологическими компаниями. Большинство анализов цАМФ, используемых в настоящее время, требуют лизиса клеток перед измерением цАМФ. Биосенсор на основе живых клеток для определения цАМФ можно использовать в нелизированных клетках с дополнительным преимуществом многократного считывания для изучения кинетики реакции рецептора.
Нанобиосенсоры используют иммобилизованный биорецепторный зонд, который селективен для целевых молекул аналита. Наноматериалы являются исключительно чувствительными химическими и биологическими сенсорами. Наномасштабные материалы демонстрируют уникальные свойства. Их большое отношение площади поверхности к объему позволяет достигать быстрых и недорогих реакций, используя различные конструкции. [120]
Другие биосенсоры с затухающими волнами были коммерциализированы с использованием волноводов, где постоянная распространения через волновод изменяется за счет поглощения молекул на поверхности волновода. Одним из таких примеров является интерферометрия с двойной поляризацией, в которой в качестве эталона используется заглубленный волновод, относительно которого измеряется изменение постоянной распространения. Другие конфигурации, такие как Маха-Цендера, имеют опорные плечи, литографически определенные на подложке. Более высокие уровни интеграции могут быть достигнуты с использованием геометрий резонаторов, где резонансная частота кольцевого резонатора изменяется при поглощении молекул. [121] [122]
Недавно массивы из множества различных молекул-детекторов были применены в так называемых устройствах «электронный нос» , где модель реакции детекторов используется для идентификации вещества. [123] В детекторе запахов Wasp Hound механическим элементом является видеокамера, а биологическим элементом — пять паразитических ос, которые были приучены собираться в рою в ответ на присутствие определенного химического вещества. [124] Однако современные коммерческие электронные носы не используют биологические элементы.
ДНК может быть аналитом биосенсора, обнаруживаемым с помощью специальных средств, но ее также можно использовать как часть биосенсора или, теоретически, даже как целый биосенсор.
Существует множество методов обнаружения ДНК, что обычно является средством обнаружения организмов, имеющих эту конкретную ДНК. Последовательности ДНК также могут использоваться, как описано выше. Но существуют и более перспективные подходы, в которых ДНК может быть синтезирована для удержания ферментов в биологическом, стабильном геле. [125] Другие приложения — это разработка аптамеров, последовательностей ДНК, которые имеют определенную форму для связывания желаемой молекулы. Самые инновационные процессы используют для этого ДНК-оригами , создавая последовательности, которые складываются в предсказуемую структуру, полезную для обнаружения. [126] [127]
Ученые создали прототипы датчиков для обнаружения ДНК животных во всасываемом воздухе, «воздушной eDNA». [128]
«Наноантенны», изготовленные из ДНК – новый тип наномасштабной оптической антенны – могут быть прикреплены к белкам и производить сигнал посредством флуоресценции , когда они выполняют свои биологические функции, в частности, при определенных конформационных изменениях . [129] [130]
Графен — это двумерное вещество на основе углерода с превосходными оптическими, электрическими, механическими, термическими и механическими свойствами. Способность поглощать и иммобилизовать различные белки, особенно некоторые с углеродными кольцевыми структурами, доказала, что графен является отличным кандидатом в качестве биосенсорного преобразователя. В результате в последнее время были исследованы и разработаны различные биосенсоры на основе графена. [14] [131] Графен использовался в качестве биосенсора в различных форматах, особенно в электрохимических датчиках и полевых транзисторах. Среди них графеновые полевые транзисторы (GFET) особенно показали превосходную производительность в качестве быстрой диагностики в точке оказания помощи (PoC), что было отмечено в результате всплеска числа исследовательских статей, сообщающих о диагностике COVID-19 с использованием GFET. Сообщалось, что они имеют один из самых низких пределов обнаружения, а также имеют быстрое время выполнения в несколько секунд вместе с возможностями мультиплексирования. [132] Эти возможности позволяют немедленно выявлять заболевания, особенно в случаях с перекрывающимися симптомами, которые трудно различить на начальном этапе, что позволяет добиться лучших результатов для пациентов, особенно в условиях ограниченных ресурсов медицинских учреждений.
{{cite web}}
: CS1 maint: архивная копия как заголовок ( ссылка )(дата обращения: 30 января 2013 г.).