В 1896 году была создана должность Верховного комиссара Федеративных Малайских Штатов; Верховный комиссар представлял британское правительство в Федеративных Малайских Штатах , федерации четырех протекционистских британских штатов в Малайе. Официальной резиденцией Верховного комиссара был King's House (теперь часть отеля Carcosa Seri Negara ), расположенный внутри Perdana Lake Gardens в Куала-Лумпуре , столице Федеративных Малайских Штатов. King's House служил важным местом для королевских сановников и почетных гостей.
Губернатор Стрейтс-Сетлментс всегда по должности являлся Верховным комиссаром Федеративных Малайских Штатов; официальная резиденция губернатора находилась в Сингапуре , столице Стрейтс-Сетлментс, и была известна как Дом правительства (ныне Истана , официальная резиденция президента Сингапура ).
В каждом из пяти защищенных штатов Перлис , Кедах , Келантан , Тренгану и Джохор (совместно именуемых Нефедеративными Малайскими Штатами ) британское правительство было представлено советником: советником правительства Перлиса; советником султана Кедаха; советником правительства Келантана; советником Тренгану; и генеральным советником правительства Джохора.
Straits Settlements был распущен в 1946 году. Сингапур стал колонией короны в своем собственном праве. Остальные Straits Settlements (то есть Пенанг и Малакка ) были объединены с Федеративными Малайскими Штатами, Перлисом, Кедахом, Келантаном, Тренгану и Джохором, чтобы сформировать Малайский Союз , еще одну колонию короны. Коренные правители в Федеративных Малайских Штатах, Перлисе, Кедахе, Келантане, Тренгану и Джохоре, уступили свою власть Соединенному Королевству, таким образом превратив эти территории в британские колонии. Новая колония короны Малайского Союза возглавлялась губернатором — губернатором Малайского Союза.
В 1948 году британское правительство вернуло власть местным правителям бывших протекционистских штатов, и Малайский Союз был преобразован в Федерацию Малайи — федерацию протекционистских штатов и колоний Короны (Пенанг и Малакка оставались колониями Короны на протяжении всей эпохи Малайского Союза). Федерацию Малайи возглавил Верховный комиссар Малайи.
Когда Малайя обрела независимость от Соединенного Королевства , должность Верховного комиссара Малайи как фактического главы государства была заменена Верховным правителем, или Янг Ди-Пертуан Агонг , Малайи, назначаемым правителями девяти малайских штатов. Титул « Верховный комиссар » стал титулом старшего британского дипломата в независимой Малайе (а позднее и в Малайзии), как это принято в странах Содружества.