Flaviviridae — это семейство вирусов с положительной цепью РНК , которые в основном заражают млекопитающих и птиц . [1] Они в основном распространяются через членистоногих переносчиков (в основном клещей и комаров ). [2] Семейство получило свое название от вируса желтой лихорадки ; flavus на латыни означает «желтый», а желтая лихорадка, в свою очередь, была названа из-за своей склонности вызывать желтуху у жертв. [3] В семействе насчитывается 89 видов, разделенных на четыре рода. [2] Заболевания, связанные с этой группой, включают: гепатит ( гепацивирусы ), геморрагические синдромы , фатальное заболевание слизистых оболочек ( пестивирусы ), геморрагическую лихорадку , энцефалит и врожденный дефект микроцефалии ( флавивирусы ). [4]
Вирусные частицы имеют оболочку и сферическую форму с икосаэдрической геометрией, которая имеет псевдосимметрию T = 3. Их диаметр составляет около 40–60 нм . [2] [4]
Члены семейства Flaviviridae имеют моночастные, линейные, одноцепочечные РНК- геномы положительной полярности и общую длину от 9,6 до 12,3 килобаз. 5'-концы флавивирусов несут метилированный нуклеотидный колпачок, в то время как другие члены этого семейства не имеют колпачка и кодируют внутренний сайт входа рибосомы.
Геном кодирует один полипротеин с несколькими трансмембранными доменами, который расщепляется как протеазами хозяина, так и вирусными протеазами на структурные и неструктурные белки. Среди неструктурных белковых продуктов (NS) местоположения и последовательности NS3 и NS5, которые содержат мотивы, необходимые для процессинга полипротеина и репликации РНК соответственно, относительно хорошо сохраняются в пределах семейства и могут быть полезны для филогенетического анализа.
Репликация вируса цитоплазматическая. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем прикрепления белка вирусной оболочки E к рецепторам хозяина, что опосредует эндоцитоз, опосредованный клатрином . Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК является методом транскрипции. Трансляция происходит путем вирусной инициации. Вирион собирается путем почкования через внутриклеточные мембраны и покидает клетку-хозяина путем экзоцитоза. [2] [4] [5]
Различные члены Flaviviridae используют широкий спектр естественных хозяев , включая рыб, млекопитающих, включая людей, и различных беспозвоночных, таких как специфичные для моллюсков и ракообразных. [6] Геномы этих флавивирусов демонстрируют тесную синтению с геномом вида типа флавивируса, вируса желтой лихорадки. [7] Один флавивирус, флавивирус акул Вэньчжоу, заражает как тихоокеанских акул-спаденоз ( Scoliodon macrorhynchos ), так и крабов Газами ( Portunus trituberculatus ) с перекрывающимися ареалами, что повышает вероятность двуххозяинного морского жизненного цикла. [6] Однако другая клада флавивирусов, специфичные для насекомых, имеют геномы, которые не демонстрируют сильной синтении ни с одной из этих групп, что предполагает сложную эволюционную историю. [2] [8]
Эндогенные вирусные элементы флавивируса , следы геномов флавивируса, интегрированные в ДНК хозяина, обнаружены у многих видов, включая креветку-головастика Lepidurus articus , водяную блоху Daphnia magna и пресноводную медузу Craspedacusta sowerbii [7] , что предполагает древнюю коэволюцию между животными и линиями флавивирусов. [6] [7] Многие из известных членов семейства, вызывающих заболевания у позвоночных, передаются через членистоногих переносчиков (клещей и комаров). [2] [4] [7]
Flaviviridae являются частью супергруппы РНК-вирусов II, которая включает некоторые вирусы растений и бактериальные вирусы. [ 2]
Семейство насчитывает четыре рода: [1] [2]
Известны и другие ортофлавивирусы, которые еще предстоит классифицировать. К ним относится вирус акулы Венлинга.
Jingmenvirus — это группа неклассифицированных вирусов в семействе, которое включает в себя вирус Alongshan , вирус Guaico Culex, вирус клещей Jingmen и вирус клещей Mogiana. Эти вирусы имеют сегментированный геном из четырех или пяти частей. Два из этих сегментов получены из флавивирусов. [ необходима цитата ]
Ряд вирусов могут быть связаны с флавивирусами, но имеют черты, нетипичные для флавивирусов. К ним относятся вирус цитрусовых Jingmen-like, вирус соевой цистообразующей нематоды 5, агент личинки Toxocara canis, вирус сверчка Ухань и, возможно, вирус, ассоциированный с Gentian Kobu-sho. [ необходима цитата ]
К основным заболеваниям, вызываемым представителями семейства Flaviviridae, относятся: